Нуклеопорин 43

НУП43
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4I79, 5A9Q
Идентификаторы
Псевдонимы	NUP43 , bA350J20.1, p42, нуклеопорин 43 кДа, нуклеопорин 43
Внешние идентификаторы	Опустить : 608141 ; МГИ : 1917162 ; Гомологен : 11639 ; Генные карты : NUP43 ; ОМА : NUP43 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	149,749,665 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 10 (mouse)
End	7,554,645 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	oocyte; ; secondary oocyte; ; seminal vesicula; ; oral cavity; ; pylorus; ; hair follicle; ; parietal pleura; ; visceral pleura; ; renal medulla; ; germinal epithelium;
	Top expressed in
	epiblast; ; primary oocyte; ; tail of embryo; ; embryo; ; genital tubercle; ; secondary oocyte; ; embryo; ; morula; ; blastocyst; ; zygote;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding;
Cellular component	cytosol; nuclear envelope; nuclear pore; chromosome; chromosome, centromeric region; nucleus; kinetochore; nuclear pore outer ring; host cell;
Biological process	mRNA transport; chromosome segregation; cell division; protein transport; cell cycle; viral process; mRNA export from nucleus; regulation of glycolytic process; tRNA export from nucleus; protein sumoylation; viral transcription; regulation of gene silencing by miRNA; intracellular transport of virus; regulation of cellular response to heat;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	348995
	69912
	ENSG00000120253
	ENSMUSG00000040034
	Q8NFH3
	P59235
	НМ_024647 ; НМ_198887
	НМ_145706
	НП_942590
	НП_663752
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Нуклеопорин 43 ( Nup43 ) представляет собой белок , который у человека кодируется NUP43 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Двунаправленный транспорт макромолекул между цитоплазмой и ядром происходит через комплексы ядерных пор (NPC), встроенные в ядерную оболочку. NPC состоят из субкомплексов, и NUP43 является частью одного из таких субкомплексов, Nup107-160 (Loiodice et al., 2004). [предоставлено OMIM] ^{[ 6 ]} Наряду с другими нуклеопоринами.

Структура

Он сворачивается в канонический повторяющийся домен WD40 . ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

Ассоциация заболеваний

Высокая экспрессия NUP43 при раке молочной железы связана с плохой общей выживаемостью . ^{[ 9 ]} При хроническом миелогенном лейкозе (ХМЛ) снижение микроРНК-409-5p увеличивает экспрессию NUP43, что, в свою очередь, усиливает пролиферативный потенциал, прогрессирование клеточного цикла и устойчивость к иматинибу . ^{[ 10 ]}

Некоторые варианты Nup43 были охарактеризованы как причины возникновения сердечно-сосудистых заболеваний (ССЗ). ^{[ 11 ]} в то время как экспрессия Nup43 была связана с синдромом дефицита внимания и гиперактивности . ^{[ 12 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000120253 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040034 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Кроншоу Дж.М., Крутчинский А.Н., Чжан В., Чайт Б.Т., Матунис М.Дж. (сентябрь 2002 г.). «Протеомный анализ комплекса ядерных пор млекопитающих» . J Клеточная Биол . 158 (5): 915–27. дои : 10.1083/jcb.200206106 . ПМК 2173148 . ПМИД 12196509 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: нуклеопорин NUP43 43 кДа» .
^ Лоиодице И., Алвес А., Рабут Г., Ван Овербек М., Элленберг Дж., Сибарита Дж. Б., Дой В. (июль 2004 г.). «Весь комплекс Nup107-160, включая трех новых членов, как единое целое нацелен на кинетохоры в митозе» . Молекулярная биология клетки . 15 (7): 3333–44. дои : 10.1091/mbc.e03-12-0878 . ПМЦ 452587 . ПМИД 15146057 .
^ Сюй С, Хэ Х и др. (2015). «Кристаллическая структура компонента ядерного порового комплекса человека NUP43» . ФЭБС Летт . 589 (21): 3247–3253. дои : 10.1016/j.febslet.2015.09.008 . ПМИД 26391640 . S2CID 8089347 .
^ Тянь С., Чжоу С., И С. (июнь 2018 г.). «Высокая экспрессия NUP43 может независимо предсказывать плохую общую выживаемость при раке молочной железы А и HER2+». Будущая онкология . 14 (15). Лондон, Англия: 1431–1442 гг. дои : 10.2217/фон-2017-0690 . ПМИД 29402145 . S2CID 46780926 .
^ Лю Ю, Цзяо Вайоминг, Ли Т, Бао Юй (октябрь 2019 г.). «Нарушение регуляции микроРНК-409-5p способствует устойчивости к иматинибу и прогрессированию заболевания у детей с хроническим миелолейкозом». Европейский обзор медицинских и фармакологических наук . 23 (19): 8468–8475. дои : 10.26355/eurrev_201910_19159 . PMID 31646577 . S2CID 204865406 .
^ Хаскелл Г.Т., Дженсен Б.С., Самса Л.А., Марчук Д., Хуанг В., Скшиня С., Тилли С., Зайферт Б.А., Ривера-Муньос Э.А., Коллер Б., Вильгельмсен К.С., Лю Дж., Алхосаини Х., Век К.Е., Эванс Дж.П., Берг Дж.С. ( июнь 2017 г.). «Секвенирование всего экзома идентифицирует укороченные варианты генов ядерной оболочки у пациентов с сердечно-сосудистыми заболеваниями» . Кровообращение: сердечно-сосудистая генетика . 10 (3). doi : 10.1161/CIRCGENETICS.116.001443 . ПМЦ 5497793 . ПМИД 28611029 .
^ Фахира А, Ли З, Лю Н, Ши Ю (май 2019 г.). «Прогнозирование причинных генов и анализ экспрессии генов синдрома дефицита внимания с гиперактивностью в различных областях мозга, комплексный интегративный анализ СДВГ». Поведенческие исследования мозга . 364 : 183–192. дои : 10.1016/j.bbr.2019.02.010 . ПМИД 30738099 . S2CID 72334804 .

Дальнейшее чтение

Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш М.А. (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геном Рез . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Геном Рез . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК 311072 . ПМИД 11230166 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Виман С., Арлт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики» . Геном Рез . 14 (10Б): 2136–44. дои : 10.1101/гр.2576704 . ПМК 528930 . ПМИД 15489336 .
Мерле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году» . Нуклеиновые кислоты Рез . 34 (Проблема с базой данных): D415–8. дои : 10.1093/nar/gkj139 . ПМЦ 1347501 . ПМИД 16381901 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q8NFH3 (Человеческий нуклеопорин Nup43) на PDBe-KB .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 6 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000120253 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040034 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid12196509-5] Кроншоу Дж.М., Крутчинский А.Н., Чжан В., Чайт Б.Т., Матунис М.Дж. (сентябрь 2002 г.). «Протеомный анализ комплекса ядерных пор млекопитающих» . J Клеточная Биол . 158 (5): 915–27. дои : 10.1083/jcb.200206106 . ПМК 2173148 . ПМИД 12196509 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: нуклеопорин NUP43 43 кДа» .

[pmid15146057-7] Лоиодице И., Алвес А., Рабут Г., Ван Овербек М., Элленберг Дж., Сибарита Дж. Б., Дой В. (июль 2004 г.). «Весь комплекс Nup107-160, включая трех новых членов, как единое целое нацелен на кинетохоры в митозе» . Молекулярная биология клетки . 15 (7): 3333–44. дои : 10.1091/mbc.e03-12-0878 . ПМЦ 452587 . ПМИД 15146057 .

[8] Сюй С, Хэ Х и др. (2015). «Кристаллическая структура компонента ядерного порового комплекса человека NUP43» . ФЭБС Летт . 589 (21): 3247–3253. дои : 10.1016/j.febslet.2015.09.008 . ПМИД 26391640 . S2CID 8089347 .

[pmid29402145-9] Тянь С., Чжоу С., И С. (июнь 2018 г.). «Высокая экспрессия NUP43 может независимо предсказывать плохую общую выживаемость при раке молочной железы А и HER2+». Будущая онкология . 14 (15). Лондон, Англия: 1431–1442 гг. дои : 10.2217/фон-2017-0690 . ПМИД 29402145 . S2CID 46780926 .

[pmid31646577-10] Лю Ю, Цзяо Вайоминг, Ли Т, Бао Юй (октябрь 2019 г.). «Нарушение регуляции микроРНК-409-5p способствует устойчивости к иматинибу и прогрессированию заболевания у детей с хроническим миелолейкозом». Европейский обзор медицинских и фармакологических наук . 23 (19): 8468–8475. дои : 10.26355/eurrev_201910_19159 . PMID 31646577 . S2CID 204865406 .

[pmid28611029-11] Хаскелл Г.Т., Дженсен Б.С., Самса Л.А., Марчук Д., Хуанг В., Скшиня С., Тилли С., Зайферт Б.А., Ривера-Муньос Э.А., Коллер Б., Вильгельмсен К.С., Лю Дж., Алхосаини Х., Век К.Е., Эванс Дж.П., Берг Дж.С. ( июнь 2017 г.). «Секвенирование всего экзома идентифицирует укороченные варианты генов ядерной оболочки у пациентов с сердечно-сосудистыми заболеваниями» . Кровообращение: сердечно-сосудистая генетика . 10 (3). doi : 10.1161/CIRCGENETICS.116.001443 . ПМЦ 5497793 . ПМИД 28611029 .

[pmid30738099-12] Фахира А, Ли З, Лю Н, Ши Ю (май 2019 г.). «Прогнозирование причинных генов и анализ экспрессии генов синдрома дефицита внимания с гиперактивностью в различных областях мозга, комплексный интегративный анализ СДВГ». Поведенческие исследования мозга . 364 : 183–192. дои : 10.1016/j.bbr.2019.02.010 . ПМИД 30738099 . S2CID 72334804 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

v т и Аутоантигены
Dehydrogenase	Branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex Oxoglutarate dehydrogenase Pyruvate dehydrogenase
Transglutaminase	Epidermal transglutaminase Tissue transglutaminase
Nucleoporins	NUP35 NUP37 NUP43 NUP50 NUP54 NUP62 NUP85 NUP88 NUP93 NUP98 NUP107 NUP133 NUP153 NUP155 NUP160 NUP188 NUP210 NUP205 NUP214
Other	Acetylcholine receptor Actin Apolipoprotein H Cardiolipin Centromere Filaggrin (Citrullinate) Gangliosides Sp100 nuclear antigen Thrombin Topoisomerase