C6ORF201

C6ORF201
Идентификаторы
Псевдонимы	C6ORF201 , DJ1013A10,5, хромосома 6 открытая кадр считывания 201, белок MGC87625
Внешние идентификаторы	MGI : 1914011 ; Гомологен : 23555 ; GeneCards : C6ORF201 ; OMA : C6ORF201 - Ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 6 (human)
End	4,130,951 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 13 (mouse)
End	35,139,858 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	testicle; ; body of pancreas; ; fundus; ; Achilles tendon;
	Top expressed in
	seminiferous tubule; ; spermatid; ; spermatocyte; ; right kidney; ; proximal tubule; ; human kidney; ; duodenum; ; jejunum; ; islet of Langerhans;
	More reference expression data
	n/a
hideОртологи
	404220
	66761
	ENSG00000185689
	EMSMUSM0000000021415
	Q7Z4U5
	Q497N7
	NM_001085401 ; NM_206834
	NM_025750
	NP_001078870
	NP_080026
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Hromosome 6 Open Rame 2010 , C6ORF201, является белком , который у людей кодируется C6ORF201 геном . ^{[ 5 ]} У людей этот ген кодирует для ядерного белка , который в основном экспрессируется в яичке . ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Ген

У людей ген длиной 51 558 пары оснований . Транскрипт переводится , который продуцирует самый длинный белок из 140 аминокислот, из необработанной мРНК , которая имеет шесть экзонов и 1664 нуклеотидов . длиной ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

Псевдонимы

Хромосома 6 открытого кадров чтения 201 (C6ORF201) также называется AS: DJ1013A10.5, MGC87625, RP5-1013A10.5 и LOC404220. ^{[ 10 ]}

Локус

C6ORF201 расположен на хромосоме 6 в положении 6P25.2 и кодируется на плюс. ^{[ 11 ]} C6ORF201 расположен рядом с геном FAM217A и геном ECI2 . ^{[ 12 ]}

Сохранение

C6ORF201 высоко консервативен у приматов , умеренно сохраняется у других млекопитающих , а также существует сохранение в нескольких рептилиях . ^{[ 13 ]} gallinarum достаточно сохранения, В Mycoplasma могло произойти горизонтальное событие передачи генов чтобы предположить, что во время эволюционной истории C6ORF201 . Там нет паралогов или событий дублирования генов для C6ORF201.

Ортологи

Гомологичные области

C6ORF201 относится к DUF4523 (PFAM15023), функционально нехарактерному семейству белков , которое встречается у млекопитающих . ^{[ 14 ]}

Белок

Имена

C6ORF201 Менее распространенные названия белка являются: белок MGC87625, гипотетический белок LOC404220, Otthump00000213693 и Otthump00000213725. ^{[ 10 ]}

Общие свойства/функции

У людей самый длинный белка вариант составляет 140 аминокислот длиной, ^{[ 15 ]} имеет молекулярную массу 16,2 кДа , ^{[ 16 ]} и изоэлектрическая точка 10,88. ^{[ 16 ]} Предполагается, что C6ORF201 является ядерным белком . ^{[ 7 ]}

Модификация и структура

C6ORF201 имеет множественные предсказанные PKC и CKII фосфорилирования сайты у людей . ^{[ 17 ]} Белок . имеет сигнал ядерной локализации также ^{[ 7 ]} C6ORF201 имеет консервативную альфа -спираль и консервативную бета -цепь в белке . ^{[ 16 ]}

Белковые взаимодействия

C6ORF201 взаимодействует с SRPK1 , ^{[ 18 ]} Tmem106b , ^{[ 19 ]} и приложение ^{[ 20 ]}

Выражение

C6ORF201 в основном экспрессируется в яичке людей , а также экспрессируется в яичках взрослых мышей и крыс . ^{[ 6 ]} Данные GEO микрочипов также подтверждают экспрессию C6ORF201 в яичках людей и мыши . ^{[ 21 ]}^{[ 22 ]}

Клиническая значимость

Результаты исследований

Токсикологическое исследование показало , что C6ORF201 был одним из 20 ведущих дерегулированных генов у обезьян , которые подвергались воздействию сварочных паров в течение длительного периода времени. ^{[ 23 ]} В другом исследовании исследовали экспрессию генов после использования ингибитора метилирования , C6ORF201 является одним из многих исследованных генов . ^{[ 24 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000185689 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000021415 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK, Edwards CA, Ashurst JL, Wilming L, et al. (Октябрь 2003 г.). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы человека 6» . Природа . 425 (6960): 805–11. Bibcode : 2003natur.425..805m . doi : 10.1038/nature02055 . PMID 14574404 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} "EST Profile" . Национальный центр информации о биотехнологии . Получено 9 мая 2015 года .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Накай, Кента. «Псиарт II прогноз» . Genscript . Архивировано из оригинала 6 сентября 2021 года . Получено 9 мая 2015 года .
^ «GeneCards: сборник генов человека» . Получено 8 февраля 2015 года .
^ «Homo Sapiens Chromosome 6 открытая рамка чтения 201 (C6ORF201) мРНК» . Национальный центр информации о биотехнологии . Получено 9 мая 2015 года .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} «Homo Sapiens Gene C6ORF201, кодирование хромосомы 6 открытого кадры чтения 201» . NCBI: AceView . Получено 9 мая 2015 года .
^ "Genomatix" . Архивировано из оригинала 2 декабря 2021 года . Получено 9 мая 2015 года .
^ «Ген NCBI: ген C6ORF201» . Получено 8 февраля 2015 года .
^ «Основной локальный инструмент поиска выравнивания» . NCBI Blast .
^ «Семья: DUF4523 (PF15023)» . Европейский институт биоинформатики . Получено 26 апреля 2015 года .
^ «Нехарактерный белок C6ORF201 [Homo Sapiens]» . Национальный центр информации о биотехнологии . Получено 9 мая 2015 года .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в «Биология Workbench» . Сан -Диего Супер компьютер . Получено 9 мая 2015 года .
^ "Сканирование мотива" . Расширение: портал ресурсов SIB Bioinformatics . Получено 9 мая 2015 года .
^ Varjosalo M, Keskitalo S, Van Drogen A, Nurkkala H, Vichalkovski A, Aebersold R, Gstaiger M (апрель 2013 г.). «Ландшафт взаимодействия белка человеческой группы CMGC -киназы» . Сотовые отчеты . 3 (4): 1306-20. Doi : 10.1016/j.celrp 2013.03.027 . HDL : 20.500.11850/70524 . PMID 23602568 .
^ Rolland T, Taşan M, Charloteaux B, Pevzner SJ, Zhong Q, Sahni N, et al. (Ноябрь 2014). «Карта протеома в сети взаимодействия человека» . Клетка . 159 (5): 1212–1226. doi : 10.1016/j.cell.2014.10.050 . PMC 4266588 . PMID 25416956 .
^ Oláh J, Vincze O, Virók D, Simon D, Bozsó Z, Tõkési N, Horváth I, Hlavanda E, Kovács J, Magyar A, Szũcs M, Russian F, Penke B, Ovádi J (сентябрь 2011). «Взаимодействие патологического белка для признаков: полимеризация тубулина, способствующая белке/р25, бета-амилоиду и альфа-синуклеину» . Журнал биологической химии . 286 (39): 34088-100. Doi : 10.1074/jbc.m111.243907 . PMC 3190826 . PMID 21832049 .
^ «C6ORF201 Рак легких - Homo Sapiens» . Национальный центр биотехнологий информации о поиске поиска . Получено 9 мая 2015 года .
^ «C6ORF201 Различные ткани - Mus Musculus» . Национальный центр информации о биотехнологии . Получено 9 мая 2015 года .
^ HEO JD, OH JH, Lee K, Kim Cy, Song CW, Yoon S, Han JS, Yu IJ (март 2010 г.). «Профилирование экспрессии генов в ткани легких обезьян Cynomolgus в ответ на повторное воздействие сварочных паров» . Архив токсикологии . 84 (3): 191–203. doi : 10.1007/s00204-009-0486-z . PMC 2820669 . PMID 19936710 .
^ Park GT, Han J, Park SG, Kim S, Kim Ty (апрель 2014 г.). «Анализ метилирования ДНК CD4+ T -клеток у пациентов с псориазом». Архивы дерматологических исследований . 306 (3): 259–68. doi : 10.1007/s00403-013-1432-8 . PMID 24323136 . S2CID 25754439 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000185689 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000021415 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[DNA_sequence_and_analysis_of_human_chromosome_6-5] Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK, Edwards CA, Ashurst JL, Wilming L, et al. (Октябрь 2003 г.). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы человека 6» . Природа . 425 (6960): 805–11. Bibcode : 2003natur.425..805m . doi : 10.1038/nature02055 . PMID 14574404 .

[EST_Profile-6] Jump up to: ^а ^{беременный} "EST Profile" . Национальный центр информации о биотехнологии . Получено 9 мая 2015 года .

[PSORT_II-7] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Накай, Кента. «Псиарт II прогноз» . Genscript . Архивировано из оригинала 6 сентября 2021 года . Получено 9 мая 2015 года .

[GeneCards-8] «GeneCards: сборник генов человека» . Получено 8 февраля 2015 года .

[NCBI_Nucleotide-9] «Homo Sapiens Chromosome 6 открытая рамка чтения 201 (C6ORF201) мРНК» . Национальный центр информации о биотехнологии . Получено 9 мая 2015 года .

[AveView-10] Jump up to: ^а ^{беременный} «Homo Sapiens Gene C6ORF201, кодирование хромосомы 6 открытого кадры чтения 201» . NCBI: AceView . Получено 9 мая 2015 года .

[11] "Genomatix" . Архивировано из оригинала 2 декабря 2021 года . Получено 9 мая 2015 года .

[NCBI_gene-12] «Ген NCBI: ген C6ORF201» . Получено 8 февраля 2015 года .

[13] «Основной локальный инструмент поиска выравнивания» . NCBI Blast .

[14] «Семья: DUF4523 (PF15023)» . Европейский институт биоинформатики . Получено 26 апреля 2015 года .

[NCBI:_Protein_NP_001078870.1-15] «Нехарактерный белок C6ORF201 [Homo Sapiens]» . Национальный центр информации о биотехнологии . Получено 9 мая 2015 года .

[Bio_WorkBench-16] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в «Биология Workbench» . Сан -Диего Супер компьютер . Получено 9 мая 2015 года .

[Motif_Scan-17] "Сканирование мотива" . Расширение: портал ресурсов SIB Bioinformatics . Получено 9 мая 2015 года .

[Varjosalo_2013-18] Varjosalo M, Keskitalo S, Van Drogen A, Nurkkala H, Vichalkovski A, Aebersold R, Gstaiger M (апрель 2013 г.). «Ландшафт взаимодействия белка человеческой группы CMGC -киназы» . Сотовые отчеты . 3 (4): 1306-20. Doi : 10.1016/j.celrp 2013.03.027 . HDL : 20.500.11850/70524 . PMID 23602568 .

[Rolland_2014-19] Rolland T, Taşan M, Charloteaux B, Pevzner SJ, Zhong Q, Sahni N, et al. (Ноябрь 2014). «Карта протеома в сети взаимодействия человека» . Клетка . 159 (5): 1212–1226. doi : 10.1016/j.cell.2014.10.050 . PMC 4266588 . PMID 25416956 .

[20] Oláh J, Vincze O, Virók D, Simon D, Bozsó Z, Tõkési N, Horváth I, Hlavanda E, Kovács J, Magyar A, Szũcs M, Russian F, Penke B, Ovádi J (сентябрь 2011). «Взаимодействие патологического белка для признаков: полимеризация тубулина, способствующая белке/р25, бета-амилоиду и альфа-синуклеину» . Журнал биологической химии . 286 (39): 34088-100. Doi : 10.1074/jbc.m111.243907 . PMC 3190826 . PMID 21832049 .

[GEO_Profile-21] «C6ORF201 Рак легких - Homo Sapiens» . Национальный центр биотехнологий информации о поиске поиска . Получено 9 мая 2015 года .

[GEO_Profile_2-22] «C6ORF201 Различные ткани - Mus Musculus» . Национальный центр информации о биотехнологии . Получено 9 мая 2015 года .

[23] HEO JD, OH JH, Lee K, Kim Cy, Song CW, Yoon S, Han JS, Yu IJ (март 2010 г.). «Профилирование экспрессии генов в ткани легких обезьян Cynomolgus в ответ на повторное воздействие сварочных паров» . Архив токсикологии . 84 (3): 191–203. doi : 10.1007/s00204-009-0486-z . PMC 2820669 . PMID 19936710 .

[24] Park GT, Han J, Park SG, Kim S, Kim Ty (апрель 2014 г.). «Анализ метилирования ДНК CD4+ T -клеток у пациентов с псориазом». Архивы дерматологических исследований . 306 (3): 259–68. doi : 10.1007/s00403-013-1432-8 . PMID 24323136 . S2CID 25754439 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]