Нитрососферота
Нитрососферота | |
---|---|
![]() | |
Nitrosopumilus maritimus , частично с прикрепленными вирионами веретенообразного вируса Nitrosopumilus 1 ( Thaspiviridae ). | |
Научная классификация | |
Домен: | |
Супертип: | « Протеоархеота »
|
Тип: | Нитрососферота Брошье-Армане и др. 2021 год [ 1 ]
|
Сорт: | |
Заказ | |
Синонимы | |
|
Nitrososphaerota тип (син. Thaumarchaeota ) — это архей , предложенный в 2008 году после того, как геном Cenarchaeum symbiosum был секвенирован и обнаружено, что он значительно отличается от других членов гипертермофильного типа Thermoproteota (ранее Crenarchaeota). [ 3 ] [ 2 ] [ 4 ] Помимо C. symbiosum, тремя описанными видами являются Nitrosopumilus maritimus , Nitrososphaera viennensis и Nitrososphaera gargensis . [ 2 ] Этот тип был предложен в 2008 году на основе филогенетических данных, таких как последовательности генов рибосомальной РНК этих организмов , а также наличие формы топоизомеразы типа I , которая ранее считалась уникальной для эукариот . [ 2 ] [ 5 ] Это отнесение было подтверждено дальнейшим анализом, опубликованным в 2010 году, в котором изучались геномы окисляющих аммиак архей Nitrosopumilus maritimus и Nitrososphaera gargensis , и был сделан вывод, что эти виды образуют отдельную линию, включающую Cenarchaeum symbiosum . [ 6 ] Липидный кренархеол обнаружен только у Nitrososphaerota, что делает его потенциальным биомаркером этого типа. [ 7 ] [ 8 ] Большинство организмов этой линии, идентифицированных к настоящему времени, являются хемолитоавтотрофными окислителями аммиака и могут играть важную роль в биогеохимических циклах , таких как цикл азота и цикл углерода . Метагеномное секвенирование показывает, что они составляют ~ 1% метагенома поверхности моря во многих местах. [ 9 ]
Мембранные тетраэфирные липиды, полученные из нитрозосфаэроты (диалкилглицерин тетраэфиры; GDGT) из морских отложений, можно использовать для восстановления прошлых температур с помощью TEX 86 палеотемпературного прокси , поскольку эти липиды различаются по структуре в зависимости от температуры. [ 10 ] Поскольку большинство Nitrososphaerota кажутся автотрофами , которые фиксируют CO 2 , их GDGT могут служить рекордом прошлых соотношений углерода-13 в пуле растворенного неорганического углерода и, таким образом, потенциально могут быть использованы для реконструкции углеродного цикла в прошлом. [ 7 ]
Таксономия
[ редактировать ]Филогения нитрозосфаэроты [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ] |
Филогения нитрозосфаэроты [ 14 ] [ 15 ] [ 16 ] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). [ 17 ] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) [ 18 ]
- Класс Nitrososphaeria Stieglmeier et al. 2014 год [ 19 ] [Conexivisphaeria Kato et al. 2020 ]
- « Ценопорархей » исправ. Чжан и др. 2019 год
- « Candidatus Giganthauma » Muller et al. 2010 год [ 20 ]
- ?" Candidatus Nitrosodeserticola " Hwang et al. 2021 год
- Отряд « Geothermarchaeales » Адам и др. 2022 год
- Семейство Geothermarchaeaceae Adam et al. 2022 год
- « Геотермархеум » Адам и др. 2022 год
- ? Scotarchaeum « Адам и др. 2022 год
- Семейство Geothermarchaeaceae Adam et al. 2022 год
- Отряд Conexivspherales Kato et al. 2020 год
- Семейство Conexivisphaeraceae Kato et al. 2020 год
- Коннексивосфера Като и др. 2020 год
- Семейство Conexivisphaeraceae Kato et al. 2020 год
- Орден « Nitrosocaldales » de la Torre et al. 2008 год
- Семейство « Nitrosocaldaceae » Qin et al. 2016 год
- « Candidatus Nitrosothermus » Luo et al. 2021 год
- « Кандидат Нитрозокальдус » де ла Торре и др. 2008 год
- Семейство « Nitrosocaldaceae » Qin et al. 2016 год
- Отряд Nitrososphaerales Stieglmeier et al. 2014 год
- Семейство Mmethylarchaeaceae Hua et al. 2019 год
- ?» Кандидат Метилархеум « Хуа и др. 2019 год
- ?" Кандидат Метанотовутия " Ou et al. 2022 год
- Семейство Nitrososphaeraceae Stieglmeier et al. 2014 год
- « Candidatus Nitrosocosmicus » Лехтовирта-Морли и др. 2016 год
- Нитрососфера Штигльмайер и др. 2014 год [ 21 ]
- Семейство Mmethylarchaeaceae Hua et al. 2019 год
- Отряд Nitrosopumilales Qin et al. 2017 год [ 22 ]
- Семейство Nitrosopumilaceae Qin et al. 2017 год
- « Candidatus Nitrosospongia » Moeller et al. 2019 год
- « Candidatus Nitrosotalea » Лехтовирта 2011 г. [ 23 ]
- « Кандидат Нитрозотенуис » Ли и др. 2016 год [ 24 ] [ 25 ]
- « кандидат Нитрозопелагический » Санторо и др. 2015 год [ 26 ]
- « Кенархей » Делонг и Престон, 1996 г.
- Нитросархеум корриг. Юнг и др. 2018 год [ 27 ] [ 28 ]
- Нитрозопумилюс Цинь и др. 2017 год [ 29 ] [ 30 ] [ 31 ]
- Семейство Nitrosopumilaceae Qin et al. 2017 год
Метаболизм
[ редактировать ]Nitrososphaerota являются важными окислителями аммиака в водной и наземной среде и являются первыми архей, которые идентифицированы как участвующие в нитрификации . [ 32 ] Они способны окислять аммиак при гораздо более низких концентрациях субстрата, чем бактерии, окисляющие аммиак , и поэтому, вероятно, доминируют в олиготрофных условиях. [ 8 ] [ 33 ] Их путь окисления аммиака требует меньше кислорода, чем путь бактерий, окисляющих аммиак, поэтому они лучше себя чувствуют в средах с низкой концентрацией кислорода, таких как отложения и горячие источники. Окисляющие аммиак Nitrososphaerota можно идентифицировать метагеномно по наличию генов архейной аммиакмонооксигеназы ( amoA ), что указывает на то, что они в целом более доминируют, чем бактерии, окисляющие аммиак. [ 8 ] Было показано, что помимо аммиака по крайней мере один штамм Nitrososphaerota способен использовать мочевину в качестве субстрата для нитрификации. Это позволило бы конкурировать с фитопланктоном, который также растет на мочевине. [ 34 ] Одно исследование микробов на очистных сооружениях показало, что не все Nitrososphaerota, экспрессирующие гены amoA, являются активными окислителями аммиака. Эти Nitrososphaerota могут быть способны окислять метан вместо аммиака или быть гетеротрофными , что указывает на потенциал разнообразия метаболического образа жизни внутри этого типа. [ 35 ] Было также показано, что морские Nitrososphaerota производят закись азота , которая, будучи парниковым газом, имеет последствия для изменения климата . Изотопный анализ показывает, что большая часть потока закиси азота в атмосферу из океана, который обеспечивает около 30% естественного потока, может быть связана с метаболической деятельностью архей. [ 36 ]
Многие представители этого типа ассимилируют углерод, фиксируя HCO 3. − . [ 9 ] Это делается с использованием цикла гидроксипропионат/гидроксибутират, аналогичного термопротеоте, но который, по-видимому, развился независимо. Все Nitrososphaerota, идентифицированные к настоящему времени метагеномикой, кодируют этот путь. Nitrososphaerota Примечательно, что путь фиксации CO 2 более эффективен, чем любой известный аэробный автотрофный путь. Эта эффективность помогает объяснить их способность процветать в среде с низким содержанием питательных веществ. [ 33 ] Некоторые Nitrososphaerota, такие как Nitrosopumilus maritimus, способны включать как органический, так и неорганический углерод, что указывает на способность к миксотрофии . [ 9 ] По крайней мере два изолированных штамма были идентифицированы как облигатные миксотрофы, то есть для роста им требуется источник органического углерода. [ 34 ]
Исследование показало, что Nitrososphaerota, скорее всего, являются доминирующими производителями важнейшего витамина B12 . Это открытие имеет важные последствия для эукариотического фитопланктона , многие из которых являются ауксотрофами и должны получать витамин B 12 из окружающей среды; таким образом, Nitrososphaerota могут играть роль в цветении водорослей и, как следствие, в глобальном уровне углекислого газа в атмосфере . Из-за важности витамина B12 в биологических процессах, таких как цикл лимонной кислоты и синтез ДНК , производство его Nitrososphaerota может быть важным для большого количества водных организмов. [ 37 ]
Среда
[ редактировать ]Многие Nitrososphaerota, такие как Nitrosopumilus maritimus , являются морскими и обитают в открытом океане. [ 9 ] Большинство этих планктонных Nitrososphaerota, составляющих морскую группу I.1a, распространены в субфотической зоне, между 100 и 350 м. [ 7 ] Другие морские Nitrososphaerota обитают на мелководье. Одно исследование выявило два новых вида Nitrososphaerota, живущих в сульфидной среде тропических мангровых болот . Из этих двух видов, Candidatus Giganthauma insulaporcus и Candidatus Giganthauma karukerense , последний связан с гаммапротеобактериями , с которыми он может иметь симбиотические отношения , хотя природа этих отношений неизвестна. Эти два вида очень крупные и образуют нити большего размера, чем когда-либо ранее наблюдавшиеся у архей. Как и многие Nitrososphaerota, они мезофилы . [ 38 ] Генетический анализ и наблюдение, что большинство идентифицированных базальных геномов Nitrososphaerota происходят из жарких сред, позволяют предположить, что предок Nitrososphaerota был термофильным , а мезофилия развилась позже. [ 32 ]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Орен А., генеральный менеджер Гаррити (2021 г.). «Действительная публикация названий сорока двух типов прокариот» . Int J Syst Evol Microbiol . 71 (10): 5056. doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . ПМИД 34694987 .
- ^ Перейти обратно: а б с д Брошер-Армане К., Буссау Б., Грибальдо С., Фортер П. (март 2008 г.). «Мезофильная Crenarchaeota : Предложение о третьем типе архей, Thaumarchaeota ». Обзоры природы Микробиология . 6 (3): 245–52. дои : 10.1038/nrmicro1852 . ПМИД 18274537 . S2CID 8030169 .
- ^ Турна М, Штигльмайер М, Спанг А, Кеннеке М, Шинтлмейстер А, Урих Т, Энгель М, Шлотер М, Вагнер М, Рихтер А, Шлепер С (май 2011 г.). « Nitrososphaera viennensis , архея, окисляющая аммиак из почвы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (20): 8420–5. Бибкод : 2011PNAS..108.8420T . дои : 10.1073/pnas.1013488108 . ПМК 3100973 . ПМИД 21525411 .
- ^ Делонг Э.Ф. (15 июня 1992 г.). «Археи в прибрежных морских средах» . Труды Национальной академии наук . 89 (12): 5685–5689. Бибкод : 1992PNAS...89.5685D . дои : 10.1073/pnas.89.12.5685 . ISSN 0027-8424 . ПМК 49357 . ПМИД 1608980 .
- ^ Брошье-Армане К., Грибальдо С., Фортер П. (декабрь 2008 г.). «ДНК-топоизомераза IB у Thaumarchaeota свидетельствует о наличии этого фермента у последнего общего предка архей и эукариев» . Биология Директ . 3:54 . дои : 10.1186/1745-6150-3-54 . ПМК 2621148 . ПМИД 19105819 .
- ^ Спанг А., Хаценпихлер Р., Брошье-Армане С., Раттей Т., Тишлер П., Шпик Е., Штрайт В., Шталь Д.А., Вагнер М., Шлепер С. (август 2010 г.). «Различный набор генов в двух разных линиях архей, окисляющих аммиак, поддерживает тип Thaumarchaeota». Тенденции в микробиологии . 18 (8): 331–40. дои : 10.1016/j.tim.2010.06.003 . ПМИД 20598889 .
- ^ Перейти обратно: а б с Пирсон А., Херли С.Дж., Уолтер С.Р., Куш С., Лихтин С., Чжан Ю.Г. (2016). «Стабильные соотношения изотопов углерода в неповрежденных GDGT указывают на гетерогенные источники морских отложений». Geochimica et Cosmochimica Acta . 181 : 18–35. Бибкод : 2016GeCoA.181...18P . дои : 10.1016/j.gca.2016.02.034 .
- ^ Перейти обратно: а б с Пестер М., Шлепер С., Вагнер М. (июнь 2011 г.). «Таумархеоты: новый взгляд на их филогению и экофизиологию» . Современное мнение в микробиологии . 14 (3): 300–6. дои : 10.1016/j.mib.2011.04.007 . ПМК 3126993 . ПМИД 21546306 .
- ^ Перейти обратно: а б с д Уокер С.Б., де ла Торре Дж.Р., Клотц М.Г., Уракава Х., Пинель Н., Арп DJ, Брошье-Арманет С., Чейн П.С., Чан П.П., Голлабгир А., Хемп Дж., Хюглер М., Карр Э.А., Коннеке М., Шин М., Лоутон Т.Дж., Лоу Т., Мартенс-Хаббена В., Саяведра-Сото Л.А., Ланг Д., Зиверт С.М., Розенцвейг А.С., Мэннинг Г., Шталь Д.А. (май 2010 г.). « Геном Nitrosopumilus maritimus раскрывает уникальные механизмы нитрификации и автотрофии у глобально распространенных морских кренархей» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (19): 8818–23. Бибкод : 2010PNAS..107.8818W . дои : 10.1073/pnas.0913533107 . ПМЦ 2889351 . ПМИД 20421470 .
- ^ Схоутен С., Хопманс Э.К., Шефусс Э., Дамсте Дж.С. (2002). «Вариации распределения липидов морских кренархеотальных мембран: новый инструмент для реконструкции температуры древней морской воды?». Письма о Земле и планетологии . 204 (1–2): 265–274. Бибкод : 2002E&PSL.204..265S . дои : 10.1016/S0012-821X(02)00979-2 . S2CID 54198843 .
- ^ «ЛТП» . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «Примечания к выпуску LTP_06_2022» (PDF) . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных таксономии геномов . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ "ar53_r214.sp_label" . База данных таксономии геномов . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «История таксонов» . База данных таксономии геномов . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ Ж. П. Эзеби. «Таумархеота» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 20 марта 2021 г.
- ^ Сэйерс и др. «Таумархеота» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 20 марта 2021 г.
- ^ Штигльмайер М., Клингл А., Алвес Р.Дж., Риттманн С.К., Мельчер М., Лейш Н. и др. (август 2014 г.). «Nitrososphaera viennensis gen. nov., sp. nov., аэробная и мезофильная архея, окисляющая аммиак из почвы, и представитель архейного типа Thaumarchaeota» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 64 (Часть 8): 2738–52. дои : 10.1099/ijs.0.063172-0 . ПМК 4129164 . ПМИД 24907263 .
- ^ Мюллер Ф., Бриссак Т., Ле Брис Н., Фелбек Х., Грос О. (август 2010 г.). «Первое описание гигантских архей (Thaumarchaeota), связанных с предполагаемыми бактериальными эктосимбионтами в сульфидной морской среде обитания» . Экологическая микробиология . 12 (8): 2371–83. Бибкод : 2010EnvMi..12.2371M . дои : 10.1111/j.1462-2920.2010.02309.x . ПМИД 21966926 .
- ^ Жалнина К.В., Диас Р., Леонард М.Т., Дорр де Куадрос П., Камарго Ф.А., Дрю Дж.К. и др. (7 июля 2014 г.). «Последовательность генома Candidatus Nitrososphaera evergladensis из группы I.1b, полученная из почвы Эверглейдс, раскрывает новые геномные особенности архей, окисляющих аммиак» . ПЛОС ОДИН . 9 (7): e101648. Бибкод : 2014PLoSO...9j1648Z . дои : 10.1371/journal.pone.0101648 . ПМК 4084955 . ПМИД 24999826 .
- ^ Кеннеке М., Бернхард А.Е., де ла Торре-младший, Уокер С.Б., Уотербери Дж.Б., Шталь Д.А. (сентябрь 2005 г.). «Выделение автотрофного морского архея, окисляющего аммиак». Природа . 437 (7058): 543–6. Бибкод : 2005Natur.437..543K . дои : 10.1038/nature03911 . ПМИД 16177789 . S2CID 4340386 .
- ^ Лехтовирта-Морли Л.Е., Стокер К., Вильчинскас А., Проссер Дж.И., Никол Г.В. (сентябрь 2011 г.). «Культивирование облигатного ацидофильного окислителя аммиака из нитрифицирующей кислой почвы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (38): 15892–7. Бибкод : 2011PNAS..10815892L . дои : 10.1073/pnas.1107196108 . ПМК 3179093 . ПМИД 21896746 .
- ^ Лебедева Е.В., Хаценпихлер Р., Пеллетье Е., Шустер Н., Хаузмайер С., Булаев А., Григорьева Н.В., Галушко А., Шмид М., Палатински М., Ле Паслье Д., Даймс Х., Вагнер М. (2013). «Обогащение и последовательность генома группы I.1a аммиакокисляющих археев «Ca. Nitrosotenuis uzonensis «представляет собой кладу, широко распространенную в термальных средах обитания» . ПЛОС ОДИН . 8 (11): е80835. Бибкод : 2013PLoSO...880835L . дои : 10.1371/journal.pone.0080835 . ПМЦ 3835317 . ПМИД 24278328 .
- ^ Ли Ю, Дин К, Вэнь Х, Чжан Б, Шэнь Б, Ян Ю (март 2016 г.). «Новый архей, окисляющий аммиак, из очистных сооружений: его обогащение, физиологические и геномные характеристики» . Научные отчеты . 6 : 23747. Бибкод : 2016NatSR...623747L . дои : 10.1038/srep23747 . ПМЦ 4814877 . ПМИД 27030530 .
- ^ Санторо А.Э., Дюпон К.Л., Рихтер Р.А., Крейг М.Т., Карини П., Макилвин М.Р. и др. (январь 2015 г.). «Геномная и протеомная характеристика Candidatus Nitrosopelagicus brevis»: архея, окисляющего аммиак, из открытого океана» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 112 (4): 1173–8. Бибкод : 2015PNAS..112.1173S . дои : 10.1073/pnas.1416223112 . ПМЦ 4313803 . ПМИД 25587132 .
- ^ Блейни ПК, Мозье А.С., Потанина А., Фрэнсис К.А., Quake SR (февраль 2011 г.). «Геном низкосоленой археи, окисляющей аммиак, определенный с помощью одноклеточного и метагеномного анализа» . ПЛОС ОДИН . 6 (2): e16626. Бибкод : 2011PLoSO...616626B . дои : 10.1371/journal.pone.0016626 . ПМК 3043068 . ПМИД 21364937 .
- ^ Ким БК, Юнг М.Ю., Ю Д.С., Пак С.Дж., О ТК, Ри С.К., Ким Дж.Ф. (октябрь 2011 г.). «Последовательность генома почвенного архея, окисляющего аммиак, Candidatus Nitrosoarchaeum koreensis» MY1» . Журнал бактериологии . 193 (19): 5539–40. дои : 10.1128/JB.05717-11 . ПМК 3187385 . ПМИД 21914867 .
- ^ Пак С.Дж., Ким Дж.Г., Юнг М.И., Ким С.Дж., Ча И.Т., Квон К., Ли Дж.Х., Ри С.К. (декабрь 2012 г.). «Проект последовательности генома археи, окисляющей аммиак, Candidatus Nitrosopumilus koreensis» AR1, из морских отложений» . Журнал бактериологии . 194 (24): 6940–1. дои : 10.1128/JB.01857-12 . ПМЦ 3510587 . ПМИД 23209206 .
- ^ Мозье А.С., Аллен Э.Э., Ким М., Феррьера С., Фрэнсис К.А. (апрель 2012 г.). «Последовательность генома Candidatus Nitrosopumilus salaria BD31, археи, окисляющей аммиак, из устья залива Сан-Франциско» . Журнал бактериологии . 194 (8): 2121–2. дои : 10.1128/JB.00013-12 . ПМК 3318490 . ПМИД 22461555 .
- ^ Байер Б., Войвода Дж., Оффре П., Алвес Р.Дж., Элизабет Н.Х., Гарсия Дж.А., Волланд Дж.М., Шривастава А., Шлепер С., Херндл Г.Дж. (май 2016 г.). «Физиологическая и геномная характеристика двух новых штаммов морских таумархей указывает на дифференциацию ниш» . Журнал ISME . 10 (5): 1051–63. Бибкод : 2016ISMEJ..10.1051B . дои : 10.1038/ismej.2015.200 . ПМЦ 4839502 . ПМИД 26528837 .
- ^ Перейти обратно: а б Брошье-Армане К., Грибальдо С., Фортер П. (февраль 2012 г.). «В центре внимания Таумархеоты» . Журнал ISME . 6 (2): 227–30. Бибкод : 2012ISMEJ...6..227B . дои : 10.1038/ismej.2011.145 . ПМК 3260508 . ПМИД 22071344 .
- ^ Перейти обратно: а б Кённеке М., Шуберт Д.М., Браун П.С., Хюглер М., Штандфест С., Швандер Т., Шада фон Боржисковски Л., Эрб Т.Дж., Шталь Д.А., Берг И.А. (июнь 2014 г.). «Археи, окисляющие аммиак, используют наиболее энергоэффективный аэробный путь фиксации CO2» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (22): 8239–44. Бибкод : 2014PNAS..111.8239K . дои : 10.1073/pnas.1402028111 . ПМК 4050595 . ПМИД 24843170 .
- ^ Перейти обратно: а б Цинь В., Амин С.А., Мартенс-Хаббена В., Уокер С.Б., Уракава Х., Девол А.Х., Ингаллс А.Е., Моффетт Дж.В., Армбруст Е.В. (2014). «Морские изоляты архей, окисляющие аммиак, демонстрируют облигатную миксотрофию и широкую экотипическую изменчивость» . Труды Национальной академии наук . 111 (34): 12504–12509. Бибкод : 2014PNAS..11112504Q . дои : 10.1073/PNAS.1324115111 . ISSN 0027-8424 . ПМК 4151751 . ПМИД 25114236 .
- ^ Муссманн М., Брито И., Питчер А., Синнингхе Дамсте Дж.С., Хаценпихлер Р., Рихтер А., Нильсен Дж.Л., Нильсен П.Х., Мюллер А., Даймс Х., Вагнер М., руководитель IM (октябрь 2011 г.). «Таумаркеоты, обитающие в нитрифицирующих осадках нефтеперерабатывающих заводов, экспрессируют амоА, но не являются обязательными автотрофными окислителями аммиака» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (40): 16771–6. Бибкод : 2011PNAS..10816771M . дои : 10.1073/pnas.1106427108 . ПМК 3189051 . ПМИД 21930919 .
- ^ Санторо А.Э., Бухвальд С., Макилвин М.Р., Кашотти К.Л. (2 сентября 2011 г.). «Изотопная подпись N2O, производимого морскими архей, окисляющими аммиак». Наука . 333 (6047): 1282–1285. Бибкод : 2011Sci...333.1282S . дои : 10.1126/science.1208239 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 21798895 . S2CID 36668258 .
- ^ Докси А.С., Курц Д.А., Линч М.Д., Саудер Л.А., Нойфельд Дж.Д. (февраль 2015 г.). «Водные метагеномы указывают на участие Thaumarchaeota в глобальном производстве кобаламина» . Журнал ISME . 9 (2): 461–71. Бибкод : 2015ISMEJ...9..461D . дои : 10.1038/ismej.2014.142 . ПМК 4303638 . ПМИД 25126756 .
- ^ Мюллер Ф., Бриссак Т., Ле Брис Н., Фелбек Х., Грос О. (август 2010 г.). «Первое описание гигантских архей (Thaumarchaeota), связанных с предполагаемыми бактериальными эктосимбионтами в сульфидной морской среде обитания» . Экологическая микробиология . 12 (8): 2371–83. Бибкод : 2010EnvMi..12.2371M . дои : 10.1111/j.1462-2920.2010.02309.x . ПМИД 21966926 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Брейкер А., Шипперс А., Нисидзава М., Такаки Ю., Сунамура М., Урабе Т., Нунура Т., Такаи К. (октябрь 2014 г.). «Стратификация микробного сообщества, контролируемая потоком жидкости под морским дном и геотермальным градиентом на гидротермальном поле Ихэя-Норт в Средне-Окинавском желобе (Экспедиция 331 по комплексной программе океанского бурения)» . Прикладная и экологическая микробиология . 80 (19): 6126–35. Бибкод : 2014ApEnM..80.6126Y . дои : 10.1128/АЕМ.01741-14 . ПМК 4178666 . ПМИД 25063666 .
- Ву Ю, Конрад Р. (июль 2014 г.). «Зависимый от окисления аммиака рост группы I.1b Thaumarchaeota в кислых микрокосмах красной почвы» . ФЭМС Микробиология Экология . 89 (1): 127–34. Бибкод : 2014FEMME..89..127W . дои : 10.1111/1574-6941.12340 . ПМИД 24724989 .
- Дешам П., Живанович Ю., Морейра Д., Родригес-Валера Ф., Лопес-Гарсия П. (июнь 2014 г.). «Пангеномные доказательства обширного междоменного горизонтального переноса, влияющего на гены ядра и оболочки линии у некультивируемых планктонных таумархеот и эвриархеот» . Геномная биология и эволюция . 6 (7): 1549–63. дои : 10.1093/gbe/evu127 . ПМК 4122925 . ПМИД 24923324 .