Галоацетат дегалогеназа
Галоацетат дегалогеназа | |||
---|---|---|---|
![]() Rodopseudomonas palustris галоацетат дегалогеназа | |||
Идентификаторы | |||
ЕС №. | 3.8.1.3 | ||
CAS №. | 37289-40-0 | ||
Базы данных | |||
Intenz | Intenz View | ||
Бренда | Бренда вход | ||
Расширение | Вид Nicezyme | ||
Кегг | Кегг вход | ||
Метатический | Метаболический путь | ||
Напрямую | профиль | ||
PDB Структуры | RCSB PDB PDBE PDBSUM | ||
Джин Онтология | Друг / Quickgo | ||
|
В фермерке галоацетат дегалогеназа ( EC 3.8.1.3 ) представляет собой фермент , который катализирует химическую реакцию
- галоацетат + h 2 o Гликолят + галогенид
Таким образом, два субстрата этого фермента являются галоацетат и H 2 O , тогда как два его продукта являются гликолитными и галогенными . Для примеров, в случае фторуацетата в Glycolate и фториде .
Этот фермент принадлежит к семейству гидролаз , одно из крупнейших известных ферментов, составляющих приблизительно 1% генов в геноме человека , существует как гомодимер и действует специально на галогенидных связях в углеродных соединениях. Систематическим названием этого класса ферментов является галоацетат галидогидролаза . Этот фермент также называется моногалоацетат -дегалогеназой и фторуацетат дегалогеназой . Этот фермент участвует в деградации гамма-гексахлорциклогексана и деградации 1,2-дихлорэтана .
Реакция
[ редактировать ]Галоацетат дегалогеназа уникальна, потому что она катализирует расщепление удивительно стабильной углерод -флуориновой связи фторированного алифатического соединения . В реакции L-2-галоцид дегалогеназы и фторуацетат дегалогеназы, карбоксилатная группа выполняет нуклеофильную атаку на альфа-углеродный атом, перемещая атом галогена. Это действие является общим для галоалкан дегалогеназы и 4-хлорбензоил-коа-дегалогеназы. DL-2-HALOACID-дегалогеназа уникальна тем, что молекула воды напрямую атакует субстрат, вытесняя атом галогена .
Значение
[ редактировать ]Поскольку флуоруацетат ядовит и присутствует в растениях, эндемичных для Австралии, Африки и Центральной Америки, скот часто убивают отравление фторуацетатом. Флуоруацетат является смертельным для овец и крупного рогатого скота в дозах от 0,25 до 0,5 мг/кг массы тела и является проблемой в животноводческой промышленности. фторуацетат дегалогеназы Ген в почвенной бактерии из штамма Moraxella переносили в бактерию рубца бактерии Butyrivibrio Фибризолвенс и экспрессировали in vitro на достаточно высоких уровнях для детоксикации фторуацетата в окружающей среде. Ученые и фермеры хотят определить способ попасть в B. fibrisolvens в животных или растений.
Структурные исследования
[ редактировать ]В конце 2007 года только одна структура для этого класса ферментов была решена PDB , а Кодекс вступления 1y37 .
Ссылки
[ редактировать ]- Goldman P (1965). «Ферментативное расщепление углеродной флюориновой связи в фторацетате» . Дж. Биол. Химический 240 (8): 3434–8. doi : 10.1016/s0021-9258 (18) 97236-4 . PMID 14321384 .
- Goldman P, Milne GW (1966). «Расщепление углеродиновой связи. II. Исследования по механизму дефуоринации фторуацетата» . Дж. Биол. Химический 241 (23): 5557–9. doi : 10.1016/s0021-9258 (18) 96379-9 . PMID 5928195 .
- Форум Japan Chemical Journal и Wiley Periodicals, Inc.2008
- Маккензи, Д. Проблемы на ветру из -за измененных соевых бобов. Новый ученый. Том 148 (2006), стр .12. 2 декабря 1995 г.
- 1995 Соевая статистика. Домашняя страница Американской ассоциации сои.
- Biotech Plant Biotech наживет на экране радарного сектора сельскохозяйственного сектора в 1996 году. Биобавин. 8 декабря 1995 г.
- Tatsuo Kurihara Journal of Biochemistry. Тол. 131, с. 671–677 (2002), обычная бумага; 2002