2-C-метил-D-эритрит-2,4-циклодифосфатсинтаза
| 2- C -метил- D -эритритол-2,4-циклодифосфатсинтаза | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Номер ЕС. | 4.6.1.12 | ||
| Базы данных | |||
| ИнтЭнк | вид IntEnz | ||
| БРЕНДА | БРЕНДА запись | ||
| Экспаси | Просмотр NiceZyme | ||
| КЕГГ | КЕГГ запись | ||
| МетаЦик | метаболический путь | ||
| ПРЯМОЙ | профиль | ||
| PDB Структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||
| Генная онтология | АмиГО / QuickGO | ||
| |||
2- C -Метил- D -эритритол-2,4-циклодифосфатсинтаза ( MEcPP-синтаза , IspF , EC 4.6.1.12) — цинк -зависимый фермент и член N-концевого белкового домена YgbB , который участвует в пути MEP ( немевалонатный путь) биосинтеза предшественников изопреноидов . Он катализирует следующую реакцию: [1]
- 4-дифосфоцитидил-2- С -метил- D )эритрит-2-фосфат 2- C -метил- D -эритрит-2,4-циклодифосфат + CMP
Фермент считается фосфорно-кислородной лиазой. Систематическое название этого класса ферментов — 2-фосфо-4-(цитидин-5'-дифосфо)-2- С -метил-D- D -эритритол-CMP-лиаза (циклизующая; 2- С -метил- D -эритрит 2, 4-циклодифосфатобразующий) . Другие широко используемые названия включают IspF , YgbB и MEcPP-синтазу .
Структурные исследования
[ редактировать ]По состоянию на конец 2007 года 20 структур для этого класса ферментов было решено PDB с кодами доступа 1GX1 , 1H47 , 1H48 , 1IV1 , 1IV2 , 1IV3 , 1IV4 , 1T0A , 1U3L , 1U3P , 1U40 , 1U43 , 1VH8 , 1VHA , 1W55 . 1W57 , 1YQN , 2АМТ , 2ГЗЛ и 2ПМП .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Герц С., Вунгсинтавикуль Дж., Шур К.А., Хехт С., Люттген Х., Сагнер С., Феллермейер М., Айзенрайх В., Зенк М.Х., Бахер А., Родих Ф. (2000). «Биосинтез терпеноидов: белок YgbB превращает 4-дифосфоцитидил-2C-метил-d-эритрит 2-фосфат в 2C-метил-d-эритрит 2,4-циклодифосфат» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 97 (6): 2486–90. Бибкод : 2000PNAS...97.2486H . дои : 10.1073/pnas.040554697 . ПМК 15955 . ПМИД 10694574 .
