2-C-метил-D-эритритол-4-фосфатцитидилилтрансфераза
| 2-C-метил-D-эритритол-4-фосфатцитидилилтрансфераза | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Номер ЕС. | 2.7.7.60 | ||
| Номер CAS. | 251990-59-7 | ||
| Базы данных | |||
| ИнтЭнк | вид IntEnz | ||
| БРЕНДА | БРЕНДА запись | ||
| Экспаси | Просмотр NiceZyme | ||
| КЕГГ | КЕГГ запись | ||
| МетаЦик | метаболический путь | ||
| ПРЯМОЙ | профиль | ||
| PDB Структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||
| Генная онтология | АмиГО / QuickGO | ||
| |||
| ИспД | |||
|---|---|---|---|
 2-C-метил-D-эритритол-4-фосфатцитидилилтрансфераза (IspD) из Arabidopsis thaliana | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | ИспД | ||
| Пфам | PF01128 | ||
| Пфам Клан | CL0110 | ||
| ИнтерПро | ИПР001228 | ||
| PROSITE | PDOC00997 | ||
| СКОП2 | 1inj / SCOPe / СУПФАМ | ||
| |||
В энзимологии 2 4-фосфатцитидилилтрансфераза ( EC 2.7.7.60 ) представляет собой фермент , катализирующий -C-метил-D-эритрит - химическую реакцию :
- 2-C-метил-D-эритрит-4-фосфат + CTP дифосфат + 4-(цитидин-5'-дифосфо)-2-C-метил-D-эритрит
Таким образом, двумя субстратами этого фермента являются CTP и 2-C-метил-D-эритрит-4-фосфат , тогда как двумя его продуктами являются дифосфат и 4-дифосфоцитидил-2-C-метилэритрит .
Этот фермент принадлежит к семейству трансфераз , в частности переносящих фосфорсодержащие нуклеотидные группы ( нуклеотидилтрансферазы ).
Этот фермент участвует в биосинтезе изопреноидов и стенвенозима. Он катализирует третий этап пути МВП ; образование CDP-ME (4-дифосфоцитидил-2C-метил-D-эритрита) из CTP и MEP (2C-метил-D-эритрит 4-фосфата). [1] Изопреноидный путь является хорошо известной мишенью для разработки противоинфекционных препаратов. [2] [3]
Номенклатура
[ редактировать ]Систематическое название этого класса ферментов — CTP:2-C-метил-D-эритрит-4-фосфатцитидилилтрансфераза . Этот фермент еще называют:
- МВП цитидилтрансфераза
- CDP-ME-синтетаза
Обычно это сокращение IspD. На него также ссылается открытая рамка считывания YgbP.
Структурные исследования
[ редактировать ]Кристаллическая структура E. coli 2-C-метил-D-эритрит-4-фосфатцитидилилтрансферазы 1I52 , 1INI и 1INJ , о которой сообщили Richard et al. (2001) были первыми, кто обнаружил фермент, участвующий в пути MEP.
По состоянию на февраль 2010 года еще 13 структур для этого класса ферментов было решено PDB с кодами доступа 1H3M , 1VGT , 1VGU , 1VGZ , 1VPA , 1VGW , 1W55 , 1W57 , 1W77 , 2PX7 , 2VSI , 3F1C и 2VSH .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Родих Ф., Вунгсинтавикуль Дж., Эйзенрайх В., Рихтер Г., Шур К.А., Хехт С., Зенк М.Х., Бахер А. (июнь 2000 г.). «Биосинтез терпеноидов: 4-дифосфоцитидил-2C-метил-D-эритритолсинтаза Arabidopsis thaliana» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 97 (12): 6451–6. Бибкод : 2000PNAS...97.6451R . дои : 10.1073/pnas.97.12.6451 . ЧВК 18623 . ПМИД 10841550 .
- ^ Илларионова В, Кайзер Дж, Остроженкова Е, Бахер А, Фишер М, Эйзенрайх В, Родих Ф (ноябрь 2006 г.). «Ферменты биосинтеза немевалонатных терпенов как мишени противоинфекционных препаратов: синтез субстрата и методы высокопроизводительного скрининга». Дж. Орг. Хим . 71 (23): 8824–34. дои : 10.1021/jo061466o . ПМИД 17081012 .
- ^ Эо Х, Браун А.С., Бьютоу Л., Хантер В.Н., Пэриш Т., Каур Д., Бреннан П.Дж., Крик, округ Колумбия (декабрь 2007 г.). «Характеристика 4-дифосфоцитидил-2-C-метил-D-эритритсинтазы микобактерии туберкулеза: потенциал для разработки лекарств» . Дж. Бактериол . 189 (24): 8922–7. дои : 10.1128/JB.00925-07 . ПМК 2168624 . ПМИД 17921290 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Ричард С.Б., Боуман М.Э., Квятковски В., Кан И., Чоу С., Лилло А.М., Кейн Д.Э., Ноэль Дж.П. (2001). «Структура 4-дифосфоцитидил-2-C-метилэритритсинтетазы, участвующей в независимом от мевалоната биосинтезе изопреноидов». Структурная и молекулярная биология природы . 8 (7): 641–8. дои : 10.1038/89691 . ПМИД 11427897 . S2CID 8494543 .
- Кузуяма Т; Такаги М; Канеда К; Дайри Т; Сето Х (2000). «Образование 4-(цитидин-5'-дифосфо)-2-C-метил-D-эритрита из 2-C-метил-D-эритрит 4-фосфата под действием 2-C-метил-D-эритрит 4-фосфат цитидилилтрансферазы, новый фермент немевалонатного пути». Тетраэдр Летт . 41 (50): 703–706. дои : 10.1016/S0040-4039(99)02143-7 .
- Родих Ф., Вунгсинтавикуль Дж., Феллермейер М. и др. (1999). «Цитидин-5'-трифосфат-зависимый биосинтез изопреноидов: белок YgbP Escherichia coli катализирует образование 4-дифосфоцитидил-2-C-метилэритрита» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 96 (21): 11758–63. дои : 10.1073/pnas.96.21.11758 . ЧВК 18359 . ПМИД 10518523 .
