ПОЛГ2

ПОЛГ2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2G4C, 3IKL, 3IKM, 4ZTU, 4ZTZ, 5C53, 5C51, 5C52
Идентификаторы
Псевдонимы	POLG2 , HP55, MTPOLB, PEOA4, POLB, POLG-BETA, POLGB, полимераза (ДНК) гамма 2, вспомогательная субъединица, ДНК-полимераза гамма 2, вспомогательная субъединица, MTDPS16, MTDPS16A, MTDPS16B
Внешние идентификаторы	Опустить : 604983 ; МГИ : 1354947 ; Гомологен : 5221 ; Генные карты : POLG2 ; OMA : POLG2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 17 (human)
End	64,497,054 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	106,670,363 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	secondary oocyte; ; left testis; ; right testis; ; left ovary; ; right ovary; ; right uterine tube; ; granulocyte; ; monocyte; ; lymph node; ; spleen;
	Top expressed in
	retinal pigment epithelium; ; epithelium of lens; ; granulocyte; ; Paneth cell; ; neural layer of retina; ; primitive streak; ; left lobe of liver; ; fossa; ; condyle; ; jejunum;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	transferase activity; DNA binding; nucleotidyltransferase activity; protein binding; glycine-tRNA ligase activity; identical protein binding; DNA-directed DNA polymerase activity;
Cellular component	mitochondrial chromosome; mitochondrial matrix; mitochondrion; mitochondrial nucleoid; cytoplasm;
Biological process	DNA-dependent DNA replication; mitochondrial DNA metabolic process; mitochondrion organization; in utero embryonic development; DNA replication; respiratory electron transport chain; mitochondrion morphogenesis; DNA repair; DNA biosynthetic process; mitochondrial glycyl-tRNA aminoacylation; mitochondrial DNA replication;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	11232
	50776
	ENSG00000256525
	ENSMUSG00000020718
	Q9UHN1
	Q9QZM2
	НМ_007215
	НМ_015810 ; НМ_001353435
	НП_009146
	НП_056625 ; НП_001340364
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Субъединица ДНК-полимеразы гамма-2 митохондрий представляет собой белок , который у человека кодируется POLG2 геном . Ген POLG2 кодирует белок вспомогательной субъединицы массой 55 кДа, который придает высокую процессивность и солеустойчивость каталитической субъединице ДНК-полимеразы гамма , кодируемой геном POLG . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Мутации в этом гене приводят к аутосомно-доминантной прогрессирующей наружной офтальмоплегии с делециями митохондриальной ДНК . ^{[ 7 ]}

Структура

POLG2 расположен на q-плече 17- й хромосомы в положении 23,3 и имеет 8 экзонов . ^{[ 7 ]} POLG2, белок , кодируемый этим геном, содержит модифицированный фосфосерин остаток в p. 38 и транзитный пептид . Его структура состоит из 25 бета-нитей , 21 альфа-спирали и 8 витков. ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

Функция

POLG2 кодирует субъединицу процессивности митохондриальной ДНК-полимеразы гамма . Кодируемый белок образует гетеротример, содержащий одну каталитическую субъединицу и две процессивные субъединицы. Этот белок усиливает связывание ДНК , стимулирует активность полимеразы и экзонуклеазы и способствует процессивному синтезу ДНК . ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

Каталитическая активность

Дезоксинуклеозидтрифосфат + ДНК(n) = дифосфат + ДНК(n+1) ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}

Клиническое значение

Мутации в POLG2 связаны с прогрессирующей внешней офтальмоплегией с делециями митохондриальной ДНК. Это заболевание приводит к прогрессирующей слабости глазных мышц и мышцы, поднимающей верхнее веко, и у пациентов с ним также могут проявляться скелетная миопатия , рваные красные волокна и атрофия, показанные при биопсии мышц, катаракта , потеря слуха , сенсорная аксональная нейропатия, атаксия , депрессия, гипогонадизм и паркинсонизм . Это мультисистемное заболевание связано с мутацией G451E, которая разрушает гамма-субъединицы ДНК-полимеразы. ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}

Считается, что у пациентов с хроническим гепатитом С лица, несущие минорный аллель DDX5 или гаплотипы DDX5-POLG2, подвергаются повышенному риску развития прогрессирующего фиброза . Однако важно отметить, что считается, что носители минорного аллеля CPT1A подвергаются меньшему риску. ^{[ 11 ]}

Взаимодействия

Было показано, что POLG2 имеет 39 бинарных белок-белковых взаимодействий, включая 19 кокомплексных взаимодействий. POLG2, похоже, взаимодействует с POLG . ^{[ 12 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000256525 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020718 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Ван Ю, Фарр С.Л., Кагуни Л.С. (май 1997 г.). «Аксессуарная субъединица митохондриальной ДНК-полимеразы эмбрионов дрозофилы. Клонирование, молекулярный анализ и ассоциация с нативным ферментом» . Журнал биологической химии . 272 (21): 13640–6. дои : 10.1074/jbc.272.21.13640 . ПМИД 9153213 .
^ Лим С.Э., Лонгли М.Дж., Коупленд У.К. (декабрь 1999 г.). «Митохондриальная вспомогательная субъединица p55 человеческой ДНК-полимеразы гамма усиливает связывание ДНК, способствует процессивному синтезу ДНК и придает устойчивость к N-этилмалеимиду» . Журнал биологической химии . 274 (53): 38197–203. дои : 10.1074/jbc.274.53.38197 . ПМИД 10608893 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с «Ген Энтрез: полимераза POLG2 (направленная на ДНК), гамма 2, вспомогательная субъединица» . В данную статью включен текст из этого источника, находящегося в свободном доступе .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д «POLG2 - субъединица ДНК-полимеразы гамма-2, митохондриальный предшественник - Homo sapiens (человек) - ген и белок POLG2» . www.uniprot.org . Проверено 31 августа 2018 г. В эту статью включен текст, доступный по лицензии CC BY 4.0 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д «UniProt: универсальная база знаний о белках» . Исследования нуклеиновых кислот . 45 (Д1): Д158–Д169. Январь 2017 г. doi : 10.1093/nar/gkw1099 . ПМК 5210571 . ПМИД 27899622 .
^ Лонгли М.Дж., Кларк С., Ю Вай Ман С., Хадсон Дж., Дарем С.Э., Тейлор Р.В., Найтингейл С., Тернбулл Д.М., Коупленд У.К., Чиннери П.Ф. (июнь 2006 г.). «Мутант POLG2 разрушает гамма-субъединицы ДНК-полимеразы и вызывает прогрессирующую внешнюю офтальмоплегию» . Американский журнал генетики человека . 78 (6): 1026–34. дои : 10.1086/504303 . ПМЦ 1474082 . ПМИД 16685652 .
^ Хуан Х, Шиффман МЛ, Чунг Р.К., Лейден Т.Дж., Фридман С., Абар О.Т., Йи Л., Чоккалингам А.П., Шроди С.Дж., Чан Дж., Катанезе Дж.Дж., Леонг Д.У., Росс Д., Ху X, Монто А., Макаллистер Л.Б., Бродер С. , Уайт Т., Снински Дж.Дж., Райт Т.Л. (май 2006 г.). «Идентификация двух вариантов гена, связанных с риском развития фиброза у пациентов с хроническим гепатитом С» . Гастроэнтерология . 130 (6): 1679–87. дои : 10.1053/j.gastro.2006.02.032 . ПМИД 16697732 .
^ «По поисковому запросу POLG2 найдено 39 бинарных взаимодействий» . Нетронутый . ЭМБЛ-ЭБИ . Проверено 4 сентября 2019 г.

Дальнейшее чтение

Михилс С., Даной П., Дессен П., Бера А., Буле Т., Бушарди С., Латроп М., Сарасин А., Бенаму С. (август 2007 г.). «Обнаружение полиморфизма в 62 генах репарации ДНК и ассоциации гаплотипов с риском развития рака легких, головы и шеи» . Канцерогенез . 28 (8): 1731–9. дои : 10.1093/carcin/bgm111 . ПМИД 17494052 .
Хуан Х, Шиффман МЛ, Чунг Р.К., Лейден Т.Дж., Фридман С., Абар О.Т., Йи Л., Чоккалингам А.П., Шроди С.Дж., Чан Дж., Катанезе Дж.Дж., Леонг Д.У., Росс Д., Ху X, Монто А., Макаллистер Л.Б., Бродер С. , Уайт Т., Снински Дж.Дж., Райт Т.Л. (май 2006 г.). «Идентификация двух вариантов гена, связанных с риском развития фиброза у пациентов с хроническим гепатитом С» . Гастроэнтерология . 130 (6): 1679–87. дои : 10.1053/j.gastro.2006.02.032 . ПМИД 16697732 .
Лонгли М.Дж., Кларк С., Ю Вай Ман С., Хадсон Дж., Дарем С.Э., Тейлор Р.В., Найтингейл С., Тернбулл Д.М., Коупленд У.К., Чиннери П.Ф. (июнь 2006 г.). «Мутант POLG2 разрушает гамма-субъединицы ДНК-полимеразы и вызывает прогрессирующую внешнюю офтальмоплегию» . Американский журнал генетики человека . 78 (6): 1026–34. дои : 10.1086/504303 . ПМЦ 1474082 . ПМИД 16685652 .
Якубовская Е., Чен З., Карродегуас Х.А., Кискер С., Богенхаген Д.Ф. (январь 2006 г.). «Функциональная гамма-полимераза митохондриальной ДНК человека образует гетеротример» . Журнал биологической химии . 281 (1): 374–82. дои : 10.1074/jbc.M509730200 . ПМИД 16263719 .
Карродегуас Х.А., Пинц К.Г., Богенхаген Д.Ф. (декабрь 2002 г.). «ДНК-связывающие свойства человеческого pol gammaB» . Журнал биологической химии . 277 (51): 50008–14. дои : 10.1074/jbc.M207030200 . ПМИД 12379656 .
Джонсон А.А., Цай Ю., Грейвс С.В., Джонсон К.А. (февраль 2000 г.). «Голофермент митохондриальной ДНК-полимеразы человека: восстановление и характеристика». Биохимия . 39 (7): 1702–8. дои : 10.1021/bi992104w . ПМИД 10677218 .
Карродегуас Х.А., Богенхаген Д.Ф. (март 2000 г.). «Белковые последовательности, консервативные в прокариотических аминоацил-тРНК-синтетазах, важны для активности фактора процессивности митохондриальной ДНК-полимеразы человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 28 (5): 1237–44. дои : 10.1093/нар/28.5.1237 . ПМЦ 102604 . PMID 10666468 .
Лим С.Э., Лонгли М.Дж., Коупленд У.К. (декабрь 1999 г.). «Митохондриальная вспомогательная субъединица p55 человеческой ДНК-полимеразы гамма усиливает связывание ДНК, способствует процессивному синтезу ДНК и придает устойчивость к N-этилмалеимиду» . Журнал биологической химии . 274 (53): 38197–203. дои : 10.1074/jbc.274.53.38197 . ПМИД 10608893 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q9UHN1 (субъединица гамма-2 ДНК-полимеразы человека, митохондриальная) в PDBe-KB .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q9QZM2 (субъединица гамма-2 ДНК-полимеразы мыши, митохондриальная) в PDBe-KB .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000256525 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020718 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9153213-5] Ван Ю, Фарр С.Л., Кагуни Л.С. (май 1997 г.). «Аксессуарная субъединица митохондриальной ДНК-полимеразы эмбрионов дрозофилы. Клонирование, молекулярный анализ и ассоциация с нативным ферментом» . Журнал биологической химии . 272 (21): 13640–6. дои : 10.1074/jbc.272.21.13640 . ПМИД 9153213 .

[6] Лим С.Э., Лонгли М.Дж., Коупленд У.К. (декабрь 1999 г.). «Митохондриальная вспомогательная субъединица p55 человеческой ДНК-полимеразы гамма усиливает связывание ДНК, способствует процессивному синтезу ДНК и придает устойчивость к N-этилмалеимиду» . Журнал биологической химии . 274 (53): 38197–203. дои : 10.1074/jbc.274.53.38197 . ПМИД 10608893 .

[entrez2-7] Jump up to: ^а ^б ^с «Ген Энтрез: полимераза POLG2 (направленная на ДНК), гамма 2, вспомогательная субъединица» . В данную статью включен текст из этого источника, находящегося в свободном доступе .

[:1-8] Jump up to: ^а ^б ^с ^д «POLG2 - субъединица ДНК-полимеразы гамма-2, митохондриальный предшественник - Homo sapiens (человек) - ген и белок POLG2» . www.uniprot.org . Проверено 31 августа 2018 г. В эту статью включен текст, доступный по лицензии CC BY 4.0 .

[:0-9] Jump up to: ^а ^б ^с ^д «UniProt: универсальная база знаний о белках» . Исследования нуклеиновых кислот . 45 (Д1): Д158–Д169. Январь 2017 г. doi : 10.1093/nar/gkw1099 . ПМК 5210571 . ПМИД 27899622 .

[10] Лонгли М.Дж., Кларк С., Ю Вай Ман С., Хадсон Дж., Дарем С.Э., Тейлор Р.В., Найтингейл С., Тернбулл Д.М., Коупленд У.К., Чиннери П.Ф. (июнь 2006 г.). «Мутант POLG2 разрушает гамма-субъединицы ДНК-полимеразы и вызывает прогрессирующую внешнюю офтальмоплегию» . Американский журнал генетики человека . 78 (6): 1026–34. дои : 10.1086/504303 . ПМЦ 1474082 . ПМИД 16685652 .

[11] Хуан Х, Шиффман МЛ, Чунг Р.К., Лейден Т.Дж., Фридман С., Абар О.Т., Йи Л., Чоккалингам А.П., Шроди С.Дж., Чан Дж., Катанезе Дж.Дж., Леонг Д.У., Росс Д., Ху X, Монто А., Макаллистер Л.Б., Бродер С. , Уайт Т., Снински Дж.Дж., Райт Т.Л. (май 2006 г.). «Идентификация двух вариантов гена, связанных с риском развития фиброза у пациентов с хроническим гепатитом С» . Гастроэнтерология . 130 (6): 1679–87. дои : 10.1053/j.gastro.2006.02.032 . ПМИД 16697732 .

[12] «По поисковому запросу POLG2 найдено 39 бинарных взаимодействий» . Нетронутый . ЭМБЛ-ЭБИ . Проверено 4 сентября 2019 г.

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]