Бромо прилегающий гомологический домен, содержащий 1

BAHD1
Идентификаторы
Псевдонимы	BAHD1 , Бромо прилегающий гомологический домен, содержащий 1
Внешние идентификаторы	Омим : 613880 ; MGI : 2139371 ; Гомологен : 8976 ; Genecards : Bahd1 ; OMA : BAHD1 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 15 (human)
End	40,468,236 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	118,755,009 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	olfactory bulb; ; granulocyte; ; left adrenal cortex; ; right adrenal gland; ; skin of arm; ; right lobe of thyroid gland; ; right ovary; ; vena cava; ; left ovary; ; left lobe of thyroid gland;
	Top expressed in
	superior cervical ganglion; ; mesenteric lymph nodes; ; otic vesicle; ; decidua; ; hand; ; yolk sac; ; otolith organ; ; epithelium of small intestine; ; spinal ganglia; ; utricle;
	More reference expression data
	n/a
showДжин Онтология
Molecular function	chromatin binding; protein binding; transcription cis-regulatory region binding;
Cellular component	chromatin; chromatin silencing complex; nucleus; nucleoplasm; chromosome;
Biological process	negative regulation of transcription, DNA-templated; heterochromatin assembly; regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; chromatin organization;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	22893
	228536
	ENSG00000140320
	EMSMUSM00000040007
	Q8TBE0
	Q497V6
	NM_001301132 ; NM_014952
	NM_001045523
	NP_001288061 ; NP_055767
	n/a
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Бромо прилегающий гомологический домен, содержащий 1 (BAHD1), является белком , который у людей кодируется BAHD1 геном . BAHD1 участвует в образовании гетерохроматина и репрессии транскрипции. ^{[ 5 ]}

Открытие

BAHD1 был впервые клонирован из библиотеки кДНК человека, а кодирующая последовательность была названа KIAA0945. ^{[ 6 ]} Бирн и его коллеги также обнаружили функцию BAHD1 в регуляции структуры хроматина и экспрессии генов. ^{[ 7 ]}

Функция

BAHD1 действует как копрессор, взаимодействуя с набором белков, которые способствуют уплотнению хроматина и регулируют транскрипцию. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} Tandem-affinity purification of the BAHD1-associated protein complex in human HEK293 cells identified MIER proteins ( MIER1 , MIER2, MIER3), histone deacetylase HDAC1 and HDAC2 , histone H3K9 methyltransferase EHMT2 , heterochromatin protein 1 (HP1 alpha, HP1 beta, HP1 gamma) В MBD1 , TRIM28 и CDYL в качестве партнеров BAHD1. ^{[ 8 ]} Сверхэкспрессия BAHD1 в клетках HEK293 индуцирует крупномасштабную конденсацию хроматина ^{[ 7 ]} и метилирование ДНК на аутосомах. ^{[ 9 ]} С-концевой домен BAH BAHD1 действует как читатель для эпигенетической марки H3K27ME3 . ^{[ 10 ]} Эктопически экспрессируемый BAHD1 колокализуется с гетерохроматической неактивной X -хромосомой (XI). ^{[ 7 ]}^{[ 9 ]}

Исследования животных

Абляция гена BAHD1 в мыши изменяет развитие плаценты и приводит к гипохолестеринемии, гипогликемии и снижению жира в организме. ^{[ 8 ]} BAHD1 -HAPLODEFINICTE у мышей снижает эффективность инфекции бактериальными листериальными моноцитогенами бактериального патогена . ^{[ 11 ]}

Клиническое значение

Во время заражения эпителиальными клетками человека патогенными листериями моноцитогенов BAHD1 подавляет гены, стимулированные интерфероном . ^{[ 11 ]} На определенных этапах инфекции листерий нуклеомодулин LNTA действует как ингибитор BAHD1 и активирует стимулированные интерфероном гены. ^{[ 11 ]}^{[ 12 ]} Ген BAHD1 подавлен в тканях толстой кишки в мышиной модели язвенного колита . ^{[ 13 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000140320 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000040007 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ "Entrez Gene: BAHD1" . Получено 2016-10-22 .
^ Нагасе Т., Ишикава К., Суяма М., Кикуно Р., Хиросава М., Мияджима Н., Танака А., Котани Х, Номура Н., Охара О (1999). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XIII. Полные последовательности из 100 новых клонов кДНК из мозга, которые код для крупных белков in vitro» . ДНК Res . 26 (6): 63–70. doi : 10.1093/dnares/6.1.63 . PMID 10231032 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Bierne H, Tham TN, Batsche E, Dumay A, Leguillou M, Kernéis-Golsteyn S, Regnault B, Seeler JS, Mugardt C, Feunteun J, Cossart P (2009). «Человеческий BAHD1 способствует гетерохроматическому молчанию генов» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 106 (33): 13826–31. Bibcode : 2009pnas..10613826b . doi : 10.1073/pnas.0901259106 . PMC 2728979 . PMID 19666599 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Lakisic G, Lebrton A, Poure R, Resolution O, Libertini E, Radford EJ, Le Guillou M, Champy MF, Wattenhofer-Donzu M, Soubgoo G, Ait-Ali -smith AC, Cossart P, Berne H (2016). «Роль бахд1-хроматина-рисующего комплекса в развитии и регуляции плаценты или метаболиме строительства» . PLOS GENET . 12 (3): E1005898. doi : 10 1371/Journal.pgen.1005898 . PMC 477444 . PMID 26938916 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Libertini E, Lebreton A, Lakisic G, Dillies MA, Beck S, Coppée JY, Cossart P, Bierne H (2015). «Сверхэкспрессия фактора гетерохроматизации BAHD1 в клетках HEK293 по -разному изменяет метитом ДНК на аутосомах и х хромосоме» . Front Genet . 1 декабря, 6: 339 (Ecollection 2015): E1005898. doi : 10.3389/fgene.2015.00339 . PMC 4664705 . PMID 26648976 .
^ Zhao D, Zhang X, Guan H, Xiong X, Shi X, Deng H, Li H (2016). «Бах -домен BAHD1 - это читатель гистона H3K27ME3» . Белковая клетка . 7 (3): 222–6. doi : 10.1007/s13238-016-0243-z . PMC 4791424 . PMID 26850261 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Lebreton A, Lakisic G, Job V, Fritch L, Tham TN, Camejo A, Matteï PJ, Regnault B, Nahori MA, Cabanes D, Gautreau A, A-A-Si-Aali S, Dessen A, Cossart P, Bierne H (2011 ) «Бактериальный белок нацелен на комплекс хроматина BAHD1 на стимулированный ответ интерферона типа III» (PDF) . Наука . 331 (6022): 1319–21. Bibcode : 2011sci ... 331.1319L . Doi : 10.1126/science.1200120 . PMID 21252314 . S2CID 35405265 .
^ Lebreton, Job V, Ragoon M, Le Monnier A, Dessen, Cosssen, Bierne H (2014). «Структурная основа для ингибирования репрессора хроматина BAHD1 бактериальным нуклеодулином LNTA » Мбио 21 (5 (1): E00775-13): E0 Doi : 10.1128/ bio.00775-1 3903274PMC PMID 24449750
^ Zhu H, Wan X, Li J, Han L, Bo X, Chen W, Lu C, Shen Z, Xu C, Chen L, Yu C, Xu G (2015). «Вычислительный прогноз и валидация BAHD1 в качестве новой молекулы для язвенного колита» . SCI Rep . 17 июля (5: 12227): 12227. Bibcode : 2015natsr ... 512227Z . doi : 10.1038/srep12227 . PMC 4505333 . PMID 26183847 .

Дальнейшее чтение

Талмуд П.Дж., Дренос Ф., Шах С., Шах Т., Пальмен Дж, Верцилли С., Гонт Т.Р., Паллас Дж., Любинг Р., Ли К., Касас Дж.П., Софат Р., Кумари М., Родригес С., Джонсон Т., Ньюхаус С.Дж., Доминик А. , Самани Н.Дж., Колфилд М., Север П., Стэнтон А., Шилдс Д.К., Падманабхан С., Меландер O, Hastie C, Delles C, Ebrahim S, Marmot MG, Smith GD, Lawlor DA, Munroe PB, Day In, Kivimaki M, Whittaker J, Humphries SE, Hingorani AD (2009). «Ген-ориентированные сигналы ассоциации для липидов и аполипопротеинов, идентифицированных через Humancvd Beadchip» . Являюсь. J. Hum. Генет . 85 (5): 628–42. doi : 10.1016/j.ajhg.2009.10.014 . PMC 2775832 . PMID 19913121 .
Бейли С.Д., Се С, до Р., Монпетит А., Диас Р., Мохан В., Кивни Б., Юсуф С., Герштейн Х.К., Энгерт Дж.С., Ананд С. (2010). «Изменения в локусе NFATC2 увеличивают риск индуцированного тиазолидионье в оценке снижения диабета с помощью исследования рамиприла и розиглитазона (DREAM)» . Уход за диабетом . 33 (10): 2250–3. doi : 10.2337/dc10-0452 . PMC 2945168 . PMID 20628086 .

Эта статья о гене о хромосоме человека 15 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000140320 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000040007 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[entrez-5] "Entrez Gene: BAHD1" . Получено 2016-10-22 .

[pmid10231032-6] Нагасе Т., Ишикава К., Суяма М., Кикуно Р., Хиросава М., Мияджима Н., Танака А., Котани Х, Номура Н., Охара О (1999). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XIII. Полные последовательности из 100 новых клонов кДНК из мозга, которые код для крупных белков in vitro» . ДНК Res . 26 (6): 63–70. doi : 10.1093/dnares/6.1.63 . PMID 10231032 .

[pmid19666599-7] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} Bierne H, Tham TN, Batsche E, Dumay A, Leguillou M, Kernéis-Golsteyn S, Regnault B, Seeler JS, Mugardt C, Feunteun J, Cossart P (2009). «Человеческий BAHD1 способствует гетерохроматическому молчанию генов» . Прокурор Нат. Академический Наука США . 106 (33): 13826–31. Bibcode : 2009pnas..10613826b . doi : 10.1073/pnas.0901259106 . PMC 2728979 . PMID 19666599 .

[pmid26938916-8] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Lakisic G, Lebrton A, Poure R, Resolution O, Libertini E, Radford EJ, Le Guillou M, Champy MF, Wattenhofer-Donzu M, Soubgoo G, Ait-Ali -smith AC, Cossart P, Berne H (2016). «Роль бахд1-хроматина-рисующего комплекса в развитии и регуляции плаценты или метаболиме строительства» . PLOS GENET . 12 (3): E1005898. doi : 10 1371/Journal.pgen.1005898 . PMC 477444 . PMID 26938916 .

[pmid26648976-9] Jump up to: ^а ^{беременный} Libertini E, Lebreton A, Lakisic G, Dillies MA, Beck S, Coppée JY, Cossart P, Bierne H (2015). «Сверхэкспрессия фактора гетерохроматизации BAHD1 в клетках HEK293 по -разному изменяет метитом ДНК на аутосомах и х хромосоме» . Front Genet . 1 декабря, 6: 339 (Ecollection 2015): E1005898. doi : 10.3389/fgene.2015.00339 . PMC 4664705 . PMID 26648976 .

[pmid26850261-10] Zhao D, Zhang X, Guan H, Xiong X, Shi X, Deng H, Li H (2016). «Бах -домен BAHD1 - это читатель гистона H3K27ME3» . Белковая клетка . 7 (3): 222–6. doi : 10.1007/s13238-016-0243-z . PMC 4791424 . PMID 26850261 .

[pmid21252314-11] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в Lebreton A, Lakisic G, Job V, Fritch L, Tham TN, Camejo A, Matteï PJ, Regnault B, Nahori MA, Cabanes D, Gautreau A, A-A-Si-Aali S, Dessen A, Cossart P, Bierne H (2011 ) «Бактериальный белок нацелен на комплекс хроматина BAHD1 на стимулированный ответ интерферона типа III» (PDF) . Наука . 331 (6022): 1319–21. Bibcode : 2011sci ... 331.1319L . Doi : 10.1126/science.1200120 . PMID 21252314 . S2CID 35405265 .

[pmid24449750-12] Lebreton, Job V, Ragoon M, Le Monnier A, Dessen, Cosssen, Bierne H (2014). «Структурная основа для ингибирования репрессора хроматина BAHD1 бактериальным нуклеодулином LNTA » Мбио 21 (5 (1): E00775-13): E0 Doi : 10.1128/ bio.00775-1 3903274PMC PMID 24449750

[pmid26183847-13] Zhu H, Wan X, Li J, Han L, Bo X, Chen W, Lu C, Shen Z, Xu C, Chen L, Yu C, Xu G (2015). «Вычислительный прогноз и валидация BAHD1 в качестве новой молекулы для язвенного колита» . SCI Rep . 17 июля (5: 12227): 12227. Bibcode : 2015natsr ... 512227Z . doi : 10.1038/srep12227 . PMC 4505333 . PMID 26183847 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]