Desulfobulbaceae
| Desulfobulbaceae | |
|---|---|
Научная классификация 
| |
| Домен: | Бактерии |
| Филум: | Thermodesulfobacteriota |
| Сорт: | Desulfobulbia |
| Заказ: | Desulfobulbales |
| Семья: | Desulfobulbaceae Kuever et al. 2006 |
| Роды | |
| |
Desulfobulbaceae - это семейство термодесульфобактериоты . Они уменьшают сульфаты до сульфидов для получения энергии и являются анаэробными .
Обнаружение нитевидных Desulfobulbaceae в 2012 году выясняет причину малых электрических токов, измеренных в верхнем слое морских отложений . [ 1 ] Токи были впервые измерены в 2010 году. [ 2 ] Эти организмы, называемые « кабельными бактериями », состоят в тысячах клеток, расположенных в филапах длиной до трех сантиметров. Они переносят электроны от осадка, богатого серо водорода до богатого кислородом осадка, который находится в контакте с водой. [ 1 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] Более поздние исследования выявили их способность использовать нитрат или нитрит в качестве окончательного акцептора электронов в отсутствие кислорода [ 7 ] [ 8 ] С момента открытия кабельные бактерии сообщалось из широкого спектра отложений по всему миру. [ 9 ] Основываясь на филогенетическом анализе генов 16S рРНК и dsRab, было предложено выделить кабельные бактерии в рамках двух новых кандидатов, то есть ок. Электротри и ок. Электронема. [ 10 ]
Филогения
[ редактировать ]Принятая в настоящее время таксономия основана на списке прокариотических имен в номенклатуре (LPSN) [ 11 ] и Национальный центр информации о биотехнологии (NCBI) [ 12 ]
| 16S RRNA на основе LTP _08_2023 [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ] | 120 маркерных белков на основе GTDB 08-RS214 [ 16 ] [ 17 ] [ 18 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
Смотрите также
[ редактировать ]Примечания
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а беременный Pfeffer C, Larsen S, Song J, Dong M, Besenbacher F, Meyer RL, Kjeldsen Ku, Schreiber L, Gorby YA, El-Ignround MY, Leung KM, Schramm A, Risgaard-Terd-Sterers Niel LP (ноябрь 2012). «Фламентовые бактерий транспортируют электроны на сантиметрах расстояния» Природа 491 (7423): 218–2 Doi : 10.1038/ nature1 PMID 23103872
- ^ Нильсен, Ларс Питер; Рисгаард-Петерсен, Нильс; Высыпание, Хенрик; Кристенсен, Петр Бондо; Саяма, Микио (февраль 2010 г.). «Электрические токи пара пространственно отделенных биогеохимических процессов в морских отложениях». Природа . 463 (7284): 1071–1074. doi : 10.1038/nature08790 . ISSN 0028-0836 . PMID 20182510 .
- ^ Регуара G (ноябрь 2012 г.). «Микробиология: шнуры бактериальной питания». Природа . 491 (7423): 201–2. doi : 10.1038/nature11638 . PMID 23103866 .
- ^ Кейм Б (24 октября 2012 г.). «Электрические ошибки: новые живые формы микробов, глубоководные силовые кабели» . Проводная наука . Получено 26 октября 2012 года .
- ^ Смит Б (6 декабря 2014 г.). «Шок, как ученые, находят« электрические »бактерии в Ярре» . Возраст . п. 15
- ^ Larsen S, Nielsen LP, Schramm A (апрель 2015 г.). «Кабельные бактерии, связанные с дальним транспортом электронов в отложениях солонного болота Новой Англии». Отчеты о микробиологии окружающей среды . 7 (2): 175–9. doi : 10.1111/1758-2229.12216 . PMID 25224178 .
- ^ Marzocchi U, Trojan D, Larsen S, Meyer RL, Revsbech NP, Schramm A, Nielsen LP, Risgaard-Petersen N (август 2014 г.). «Электрическая связь между отдаленным восстановлением нитратов и окислением сульфида в морских отложениях» . Журнал ISME . 8 (8): 1682–90. doi : 10.1038/ismej.2014.19 . PMC 4817607 . PMID 24577351 .
- ^ Risgaard-Petersen N, Damgaard LR, Revil A, Nielsen LP (2014-08-01). «Картирование электронных источников и тонет в морской биогеобаттерей». Журнал геофизических исследований: Biogeosciences . 119 (8): 1475–1486. doi : 10.1002/2014jg002673 .
- ^ Burdorf LD, Tramper A, Seitaj D, Meire L, Hidalgo-Martinez S, Zetsche EM, Boschker HT, Meysman FJ (2017-02-10). «Расстояние электронов происходит во всем мире в морских отложениях» . Биогеонов . 14 (3): 683–701. doi : 10.5194/bg-14-683-2017 .
- ^ Trojan D, Schreiber L, Bjerg JT, Bøggild A, Yang T, Kjeldsen Ku, Schramm A (июль 2016 г.). «Таксономическая структура для кабельных бактерий и предложение кандидатов в родинг Electrothrix и Electronema» . Систематическая и прикладная микробиология . 39 (5): 297–306. doi : 10.1016/j.syapm.2016.05.006 . PMC 4958695 . PMID 27324572 .
- ^ AC Parte; и др. "Desulfobulbaceae" . Список прокариотических имен с стоянием в номенклатуре (LPSN) . Получено 2022-09-09 .
- ^ Sayers; и др. "Desulfobulbaceae" . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) База данных таксономии . Получено 2022-09-09 .
- ^ "LTP" . Получено 20 ноября 2023 года .
- ^ «Дерево LTP_ALL в формате Newick» . Получено 20 ноября 2023 года .
- ^ «LTP_08_2023 Notes» (PDF) . Получено 20 ноября 2023 года .
- ^ "GTDB Release 08-RS214" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
- ^ "BAC120_R214.sp_label" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
- ^ «История таксонов» . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
Ссылки
[ редактировать ]- Kueveen J, Raineey и т. Д., Widerg F (2005). «Приказ III. Desulfobacteres Ord. Nov.; Family II. Desulfoobulbaceae ord. Nov. Fam. Nov. Nov. Полем В Garrity G, Brenner D, Krieg N, et al. (Ред.). Берджи Руководство по систематической бактериологии Тол. 2. Springer. Стр. 988–9 ISBN 978-0-387-24145-6 .
- "Desulfobulbaceae" . NCBI таксономия браузер . 213121.
 | Эта статья, связанная с термодисульфобактеритой, является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |