Jump to content

Дроша

(Перенаправлено из Drosha Rybonuclease III )

Кристаллическая структура Drosha и DGCR8, которые образуют ядро ​​микропроцессорного комплекса.
Дроша
Доступные структуры
PDB Поиск ортолога: PDBE RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы Drosha , Etohi2, HSA242976, Ranse3L, RN3, RNASE3L, RNASEN, Drosha Rybonuclease III
Внешние идентификаторы Омим : 608828 ; MGI : 1261425 ; Гомологен : 8293 ; GeneCards : Drosha ; OMA : Drosha - ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Набор
Uniprot
Refseq (мРНК)

NM_001100412
NM_013235
NM_001382508

NM_001130149
NM_026799

Refseq (белок)

NP_001093882
NP_037367
NP_001369437

NP_001123621
NP_081075

Расположение (UCSC) CHR 5: 31,4 - 31,53 МБ CHR 15: 12,82 - 12,94 МБ
PubMed Search [ 3 ] [ 4 ]
Викидид
Посмотреть/редактировать человека Посмотреть/редактировать мышь

Drosha класса 2 рибонуклеаза III - это фермент [ 5 ] что у людей кодируется Drosha (ранее Rnasen ) геном . [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] Это первичная нуклеаза, которая выполняет этап инициации обработки miRNA в ядре. Это работает в тесном контакте с DGCR8 и в корреляции с Dicer . Он был найден значительным в клинических знаниях для прогноза рака. [ 9 ] и репликация ВИЧ-1. [ 10 ]

Дроша человека была клонирована в 2000 году, когда она была идентифицирована как ядерная рибонуклеаза дсРНК, участвующую в обработке предшественников рибосомной РНК . [ 11 ] Два других фермента человека, которые участвуют в обработке и активности miRNA, - это Dicer и Argonaute Proteins. Недавно белки, такие как Drosha, были обнаружены значительными в прогнозе рака [ 9 ] и репликация ВИЧ-1. [ 10 ]

Члены суперсемейства рибонуклеазы III двухцепочечной ( DS) РНК -специфической эндорибонуклеазы участвуют в различных путях созревания РНК и распада в эукариотических и прокариотических клетках. [ 12 ] РНКаза III Drosha является основной нуклеазой , которая выполняет стадию инициации обработки микроРНК (miRNA) в ядре . [ 8 ] [ 11 ]

Полученные таким образом микроРНК представляют собой короткие молекулы РНК , которые регулируют широкий спектр других генов, взаимодействуя с РНК-индуцированным комплексом молчания (RISC), чтобы вызвать расщепление комплементарной РНК-посланника (мРНК) как часть пути интерференции РНК . Молекулы микроРНК синтезируются как длинные первичные транскрипты РНК, известные как PRI-MIRNAS , которые расщепляются Drosha, чтобы получить характерную структуру стволовых петлей около 70 пар оснований , известных как пре-мирна. [ 11 ] ПредомирНК, когда связаны с Exp5, стабилизируются из-за удаления 5 'Cap и 3' поли (A) хвоста. [ 13 ] </ref> Drosha существует как часть белкового комплекса, называемого микропроцессорным комплексом , который также содержит двухцепочечный РНК-связывающий белок DGCR8 (называется паша в D. melanogaster и C. elegans ). [ 14 ] DGCR8 необходим для активности Drosha и способен связывать одноцепочечные фрагменты PRI-MIRNA, которые необходимы для правильной обработки. [ 15 ] Комплекс Drosha также содержит несколько вспомогательных факторов, таких как EWSR1 , FUS, HNRNPS , P68 и P72. [ 16 ]

Как Drosha, так и DGCR8 локализуются в клеточном ядре , где происходит обработка PRI-MIRNA в пре-мирну. Эти два белка гомеостатически контролируют биогенез miRNA с помощью петли автоматической обратной связи. [ 16 ] Дроша генерируется 2NT 3 ', генерируется Drosha в ядре, распознаваемом Dicer в цитоплазме, которая объединяет всплывающие и нижние события обработки. Затем пре-мирна дополнительно обрабатывается РНКазой Dicer в зрелые miRNAs в клеточной цитоплазме . [ 11 ] [ 16 ] Существует также изоформа Drosha, которая не содержит сигнала ядерной локализации, что приводит к генерации C-D-Drosha. [ 17 ] [ 18 ] Было показано, что этот вариант локализуется в клеточной цитоплазме , а не в ядро, но влияние на обработку PRI-MIRNA пока неясно.

И Дроша, и Дисер также участвуют в ответе на повреждение ДНК . [ 19 ]

Было обнаружено, что определенные miRNAs отклоняются от обычных путей биогенеза и не обязательно требуют Drosha или Dicer , что связано с тем, что они не требуют обработки PRI-MIRNA для пре-мирны. [ 16 ] Drosha-независимые miRNAs происходят из miRtrons , которые представляют собой гены, которые кодируют для miRNAs в их интронах и используют сплайсинг, чтобы обходить расщепление Drosha. Simtrons являются mirtron-подобными, независимыми от сплайсинга и требуют опосредованного Drosha, хотя они не требуют большинства белков в каноническом пути, таких как DGCR8 или Dicer . [ 10 ]

Клиническое значение

[ редактировать ]

Drosha и другие ферменты обработки miRNA могут быть важны для прогноза рака. [ 9 ] Как Drosha, так и Dicer могут функционировать как основные регуляторы обработки miRNA и, как было обнаружено, подавляются в некоторых типах рака молочной железы . [ 20 ] Альтернативные паттерны сплайсинга дрожи в атласе генома рака также указывали на то, что C-D-Drosha, по-видимому, обогащен различными типами рака молочной железы, рака толстой кишки и рака пищевода . [ 18 ] Однако точный характер связи между обработкой микроРНК и онкогенезом неясен, [ 21 ] Но его функция может быть эффективно изучена с помощью нокдауна siRNA на основе независимой валидации. [ 22 ]

Дроша и другие ферменты обработки miRNA также могут быть важны при репликации ВИЧ-1. miRNAs способствуют врожденной антивирусной защите. Это может быть показано с помощью нокдауна двух важных белков, обрабатывающей miRNA, Drosha и Dicer, что приводит к значительному усилению репликации вируса у PBMC у пациентов с ВИЧ-1. Таким образом, Drosha в сочетании с Dicer, похоже, играет роль в контроле репликации ВИЧ-1. [ 10 ]

  1. ^ Jump up to: а беременный в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000113360 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Jump up to: а беременный в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000022191 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
  4. ^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
  5. ^ Филиппов V, Соловайв V , Филиппова М., Гилл СС (март 2000 г.). «Новый тип белков семейства РНКазы III у эукариот». Ген . 245 (1): 213–221. doi : 10.1016/s0378-1119 (99) 00571-5 . PMID   10713462 .
  6. ^ Филиппов V, Соловайв V, Филиппова М., Гилл СС (март 2000 г.). «Новый тип белков семейства РНКазы III у эукариот». Ген . 245 (1): 213–221. doi : 10.1016/s0378-1119 (99) 00571-5 . PMID   10713462 .
  7. ^ Wu H, Xu H, Miraglia LJ, Crooke St (ноябрь 2000 г.). «Человеческая РНКаза III представляет собой белок 160 кДа, участвующий в прерибосомной процедуре РНК» . Журнал биологической химии . 275 (47): 36957–36965. doi : 10.1074/jbc.m005494200 . PMID   10948199 .
  8. ^ Jump up to: а беременный «Ген Entrez: RNASEN RIBONUCLEASE III, ядерная» .
  9. ^ Jump up to: а беременный в Slack FJ, Weidhaas JB (декабрь 2008 г.). «МикроРНК в прогнозе рака» . Новая Англия Журнал медицины . 359 (25): 2720–2722. doi : 10.1056/nejme0808667 . PMC   10035200 . PMID   19092157 .
  10. ^ Jump up to: а беременный в дюймовый Swaminathan G, Navas-Martín S, Martín-García J (март 2014 г.). «МикроРНК и ВИЧ-1 инфекция: антивирусная активность и за его пределами» . Журнал молекулярной биологии . 426 (6): 1178–97. doi : 10.1016/j.jmb.2013.12.017 . PMID   24370931 .
  11. ^ Jump up to: а беременный в дюймовый Lee Y, Ahn C, Han J, Choi H, Kim J, Yim J, et al. (Сентябрь 2003 г.). «Ядерная РНКаза III Drosha инициирует обработку микроРНК». Природа . 425 (6956): 415–419. Bibcode : 2003natur.425..415L . doi : 10.1038/nature01957 . PMID   14508493 . S2CID   4421030 .
  12. ^ Fortin KR, Nicholson RH, Nicholson AW (август 2002 г.). «Мышиная рибонуклеаза III. Структура кДНК, анализ экспрессии и расположение хромосом» . BMC Genomics . 3 (1): 26. doi : 10.1186/1471-2164-3-26 . PMC   122089 . PMID   12191433 .
  13. ^ Слоан К.Е., Gleies PE, Bohnsack MT (май 2016 г.). «Нуклеоцитоплазматический транспорт РНК и РНК-белковых комплексов». Журнал молекулярной биологии . 428 (10 пт а): 2040–59. doi : 10.1016/j.jmb.2015.09.023 . PMID   26434509 .
  14. ^ Denli Am, Tops BB, Plasterk RH, Ketting RF, Hannon GJ (ноябрь 2004 г.). «Обработка первичных микроРНК с помощью микропроцессорного комплекса». Природа . 432 (7014): 231–235. Bibcode : 2004natur.432..231d . doi : 10.1038/nature03049 . PMID   15531879 . S2CID   4425505 .
  15. ^ Хан Дж., Ли Y, Йом К.Х., Нам Дж.В., Хео I, Ри Дж.К. и др. (Июнь 2006 г.). «Молекулярная основа для распознавания первичных микроРНК комплексом Drosha-DGCR8» . Клетка . 125 (5): 887–901. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.043 . PMID   16751099 . S2CID   453021 .
  16. ^ Jump up to: а беременный в дюймовый Suzuki Hi, Miyazono K (январь 2011 г.). «Новая сложность каскадов генерации микроРНК». Журнал биохимии . 149 (1): 15–25. doi : 10.1093/jb/mvq113 . PMID   20876186 .
  17. ^ Jump up to: а беременный Dai L, Chen K, Youngren B, Kulina J, Yang A, Guo Z, et al. (Декабрь 2016 г.). «Цитоплазматическая активность дрожи, полученная в результате альтернативного сплайсинга» . Исследование нуклеиновых кислот . 44 (21): 10454–10466. doi : 10.1093/nar/gkw668 . PMC   5137420 . PMID   27471035 .
  18. ^ Francia S, Michelini F, Saxena A, Tang D, De Hoon M, Anelli V, et al. (Август 2012 г.). «Специфичные для сайта продукты Dicer и Drosha RNA контролируют отклик ДНК-нанесения» . Природа . 488 (7410): 231–235. Bibcode : 2012natur.488..231f . doi : 10.1038/nature11179 . PMC   3442236 . PMID   22722852 .
  19. ^ Томсон Дж. М., Ньюман М., Паркер Дж.С., Морин-Кенсицци Э.М., Райт Т., Хаммонд С.М. (август 2006 г.). «Обширная посттранскрипционная регуляция микроРНК и его последствия для рака» . Гены и развитие . 20 (16): 2202–2207. doi : 10.1101/gad.1444406 . PMC   1553203 . PMID   16882971 .
  20. ^ Iorio MV, Croce CM (июнь 2012 г.). «Участие микроРНК в раке человека» . Канцерогенез . 33 (6): 1126–1133. doi : 10.1093/carcin/bgs140 . PMC   3514864 . PMID   22491715 .
  21. ^ Munkácsy G, Sztupinszki Z, Herman P, Bán B, Monetary Z, Szarvas N, et al. (Сентябрь 2016 г.). «Валидация эффективности молчания РНКи с использованием данных генов показывает 18,5% частоту отказов в 429 независимых экспериментах» . Молекулярная терапия. Нуклеиновые кислоты . 5 (9): E366. Doi : 10.1038/mtna.2016.66 . PMC   5056990 . PMID   27673562 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
[ редактировать ]
  • Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для Uniprot : Q9NRR4 (рибонуклеаза 3) в PDBE-KB .
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 325fa2e328ecdf9c5aee436a5fb36d3e__1726447440
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/32/3e/325fa2e328ecdf9c5aee436a5fb36d3e.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Drosha - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)