Ubqln1

Ubqln1
Доступные структуры
PDB	Поиск ортолога: PDBE RCSB
showСписок кодов идентификаторов PDB
	2JY5, 2JY6, 2KLC
Идентификаторы
Псевдонимы	UBQLN1 , DA41, DSK2, PLIC-1, UBQN, XDRP1, Ubiquilin 1
Внешние идентификаторы	Омим : 605046 ; MGI : 1860276 ; Гомологен : 137258 ; GeneCards : ubqln1 ; OMA : Ubqln1 - ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 9 (human)
End	83,707,958 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 13 (mouse)
End	58,363,467 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	mucosa of ileum; ; cardiac muscle tissue of right atrium; ; skin of arm; ; tibialis anterior muscle; ; myocardium of left ventricle; ; endothelial cell; ; pons; ; pancreatic epithelial cell; ; ganglionic eminence; ; stromal cell of endometrium;
	Top expressed in
	secondary oocyte; ; seminal vesicula; ; parotid gland; ; medial dorsal nucleus; ; pontine nuclei; ; ventral tegmental area; ; dorsal tegmental nucleus; ; deep cerebellar nuclei; ; primitive streak; ; medial geniculate nucleus;
	More reference expression data
	n/a
showДжин Онтология
Molecular function	polyubiquitin modification-dependent protein binding; kinase binding; protein binding; identical protein binding;
Cellular component	cytoplasm; membrane; plasma membrane; nucleoplasm; aggresome; autophagosome; endoplasmic reticulum; perinuclear region of cytoplasm; proteasome complex; cytoplasmic vesicle; nucleus; cytosol; protein-containing complex;
Biological process	aggrephagy; negative regulation of store-operated calcium channel activity; regulation of protein ubiquitination; regulation of oxidative stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway; response to endoplasmic reticulum stress; positive regulation of ER-associated ubiquitin-dependent protein catabolic process; autophagy; ubiquitin-dependent ERAD pathway; positive regulation of protein ubiquitination; negative regulation of toll-like receptor 3 signaling pathway; cellular response to hypoxia; autophagosome maturation; autophagosome assembly; macroautophagy; ubiquitin-dependent protein catabolic process; regulation of macroautophagy;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	29979
	56085
	ENSG00000135018
	Ensmusg00000005312
	Q9UMX0
	Q8R317
	NM_013438 ; NM_053067
	NM_026842 ; NM_152234
	NP_038466 ; NP_444295 ; NP_444295.1
	NP_081118 ; NP_689420
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Убиквилин-1 -это белок , который у людей кодируется UBQLN1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Убиквилины содержат два домена , N-концевой убиквитин-подобный домен и C-концевой домен, ассоциированный с убиквитином . Они физически ассоциируются как с протеасомами , так и с убиквитиновыми лигазами , и, следовательно, считаются функционально связывают механизм убиквитинирования с протеасомой, чтобы воздействовать на in vivo деградацию белка .

Функции

Убиквилин-1 связан с деградацией белка и агрегацией неправильно свернутых белков и может участвовать в нейродегенеративных заболеваниях . ^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} Сообщалось, что убиквилин-1 действует как молекулярный шаперон для белка-предшественника амилоида (APP), белка, связанного с болезнью Альцгеймера . ^{[ 10 ]}

Убиквилин-1 был впервые идентифицирован через его взаимодействие с пресенилинами . ^{[ 11 ]} Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы. ^{[ 7 ]}

Связанные белки

Человеческий UBQLN1 имеет высокую степень сходства с связанными убиквилинами, включая UBQLN2 и UBQLN4 . ^{[ 12 ]}

Взаимодействия

Было показано, что ubqln1 взаимодействует с

Herpud1 , ^{[ 13 ]}
MTOR , ^{[ 14 ]}
P4HB , ^{[ 15 ]}
PSEN1 ^{[ 16 ]}
Psen2 , ^{[ 16 ]} и
UBE3A . ^{[ 17 ]}
TMCO6 , ^{[ 18 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000135018 - Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000005312 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ Озаки Т., Хишики Т., Тояма Ю., Юаса С., Накагавара А., Сакияма С. (август 1997). «Идентификация нового клеточного белка, который может конкретно взаимодействовать с Дэном». ДНК и клеточная биология . 16 (8): 985–91. doi : 10.1089/dna.1997.16.985 . PMID 9303440 .
^ Hanaoka E, Ozaki T, Ohira M, Nakamura Y, Suzuki M, Takahashi E, et al. (Июль 2000). «Молекулярное клонирование и анализ экспрессии гена DA41 человека и его отображение с хромосомой 9q21.2-Q21.3» . Журнал человеческой генетики . 45 (3): 188–91. doi : 10.1007/s100380050209 . PMID 10807547 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} "Entrez Gene: Ubqln1 Ubiquilin 1" .
^ Хаапасало А., Вишванатан Дж., Бертрам Л., Сойнинен Х., Танзи Р.Е., Хилтунен М (февраль 2010 г.). «Новая роль убиквилина-1, связанного с болезнью Альцгеймера, в агрегации белка». Биохимическое общество транзакций . 38 (Pt 1): 150–5. doi : 10.1042/bst0380150 . HDL : 11858/00-001M-0000-0010-7C06-4 . PMID 20074050 .
^ Zhang C, Saunders AJ (июнь 2009 г.). «Новая роль убиквилина 1 в регуляции системы контроля качества белка и в патогенезе заболевания» . Discovery Medicine . 8 (40): 18–22. PMC 3158983 . PMID 19772837 .
^
Stieren ES, El Ayadi A, Xiao Y, Siller E, Landsverk ML, Oberhauser AF, et al. (Октябрь 2011). «Убиквилин-1 является молекулярным шапероном для белка-предшественника амилоида» . Журнал биологической химии . 286 (41): 35689–98. doi : 10.1074/jbc.m111.243147 . PMC 3195644 . PMID 21852239 .
- «В мозге Альцгеймера, обнаруженные более низкими уровнями ключевого белка» . ScienceDaily (пресс -релиз). 1 сентября 2011 г.
^ Махл, Перри Г., Смит М.А., Монтейро М.Дж. (ноябрь 2000 г.). «Идентификация убиквилина, нового пресенилинового взаимодействия, который увеличивает накопление пресенилинового белка» . Журнал клеточной биологии . 151 (4): 847–62. doi : 10.1083/jcb.151.4.847 . PMC 2169435 . PMID 11076969 .
^ Марин I (март 2014 г.). «Семейство генов убиквилина: эволюционные закономерности и функциональные идеи» . BMC Эволюционная биология . 14 (1): 63. Bibcode : 2014bmcee..14 ... 63M . doi : 10.1186/1471-2148-14-63 . PMC 4230246 . PMID 24674348 .
^ Ким Тай, Ким Э, Юн С.К., Юн Дж. Б. (май 2008 г.). «Herp усиливает эре, ассоциированную с ER, деградация белка за счет рекрута убиквилинов». Биохимическая и биофизическая исследовательская коммуникация . 369 (2): 741–6. doi : 10.1016/j.bbrc.2008.02.086 . PMID 18307982 .
^ Wu S, Mikhailov A, Kallo-Hosein H, Hara K, Yonezawa K, Avruch J (январь 2002 г.). «Характеристика убиквилина 1, белка-взаимодействующего с mTOR » Biochimica et Biophysica Acta (BB) - исследования молекулярных клеток 1542 (1–3): 41–5 Doi : 10.1016/s0167-4889 (01) 00164-1 11853878PMID
^ Ko HS, Uehara T, Nomura Y (сентябрь 2002 г.). «Роль убиквилина, связанного с белко-дисульфид изомеразой в эндоплазматической ретикулуме в вызванной стрессом апоптотической гибели клеток» . Журнал биологической химии . 277 (38): 35386–92. doi : 10.1074/jbc.m203412200 . PMID 12095988 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} Махл, Перри Г., Смит М.А., Монтейро М.Дж. (ноябрь 2000 г.). «Идентификация убиквилина, нового пресенилинового взаимодействия, который увеличивает накопление пресенилинового белка» . Журнал клеточной биологии . 151 (4): 847–62. doi : 10.1083/jcb.151.4.847 . PMC 2169435 . PMID 11076969 .
^ Kleijnen MF, Shih AH, Zhou P, Kumar S, Soccio Re, Kedersha NL, et al. (Август 2000). «Белки HPLIC могут обеспечить связь между машиной убиквитинирования и протеасомой» . Молекулярная клетка . 6 (2): 409–19. doi : 10.1016/s1097-2765 (00) 00040-x . PMID 10983987 .
^ Rolland T, Taşan M, Charloteaux B, Pevzner SJ, Zhong Q, Sahni N, et al. (Ноябрь 2014). «Карта протеома в сети взаимодействия человека» . Клетка . 159 (5): 1212–1226. doi : 10.1016/j.cell.2014.10.050 . PMC 4266588 . PMID 25416956 .

Дальнейшее чтение

Озаки Т., Кондо К., Накамура Ю., Ичимия С., Накагавара А., Сакияма С. (август 1997). «Взаимодействие DA41, DAN-связывающего белка с эпидермальным фактором роста белка, S (1-5)». Биохимическая и биофизическая исследовательская коммуникация . 237 (2): 245–50. doi : 10.1006/bbrc.1997.7122 . PMID 9268694 .
Озаки Т., Ханаока Е., Нака М., Накагавара А., Сакияма С (июнь 1999 г.). «Клонирование и характеристика кДНК крысы BAT3». ДНК и клеточная биология . 18 (6): 503–12. doi : 10.1089/104454999315222 . PMID 10390159 .
Wu AL, Wang J, Zheleznyak A, Brown EJ (октябрь 1999). «Связанные с убиквитином белки регулируют взаимодействие промежуточных филаментов виментина с плазматической мембраной» . Молекулярная клетка . 4 (4): 619–25. doi : 10.1016/s1097-2765 (00) 80212-9 . PMID 10549293 .
Kleijnen MF, Shih AH, Zhou P, Kumar S, Soccio Re, Kedersha NL, et al. (Август 2000). «Белки HPLIC могут обеспечить связь между машиной убиквитинирования и протеасомой» . Молекулярная клетка . 6 (2): 409–19. doi : 10.1016/s1097-2765 (00) 00040-x . PMID 10983987 .
Махл, Перри Г., Смит М.А., Монтейро М.Дж. (ноябрь 2000 г.). «Идентификация убиквилина, нового пресенилинового взаимодействия, который увеличивает накопление пресенилинового белка» . Журнал клеточной биологии . 151 (4): 847–62. doi : 10.1083/jcb.151.4.847 . PMC 2169435 . PMID 11076969 .
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, et al. (Март 2001 г.). «На пути к каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Исследование генома . 11 (3): 422–35. doi : 10.1101/gr.gr1547r . PMC 311072 . PMID 11230166 .
Симпсон JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (сентябрь 2000 г.). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных крупномасштабным секвенированием кДНК» . Embo сообщает . 1 (3): 287–92. doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . PMC 1083732 . PMID 11256614 .
Бедфорд Ф.К., Киттлер Дж.Т., Мюллер Э., Томас П., Урен Дж. М., Мерло Д. и др. (Сентябрь 2001 г.). «ГАМК (а) номер клеточной поверхности рецепторных клеток и стабильность субъединиц регулируются убиквитиноподобным белком PLIC-1». Nature Neuroscience . 4 (9): 908–16. doi : 10.1038/nn0901-908 . PMID 11528422 . S2CID 13078743 .
Wu S, Mikhailov A, Kallo-Hosein H, Hara K, Yonezawa K, Avruch J (январь 2002 г.). «Характеристика убиквилина 1, белка-взаимодействующего с mTOR » Biochimica et Biophysica Acta (BB) - исследования молекулярных клеток 1542 (1–3): 41–5 Doi : 10.1016/s0167-4889 (01) 00164-1 11853878PMID
Ko HS, Uehara T, Nomura Y (сентябрь 2002 г.). «Роль убиквилина, связанного с белко-дисульфид изомеразой в эндоплазматической ретикулуме в вызванной стрессом апоптотической гибели клеток» . Журнал биологической химии . 277 (38): 35386–92. doi : 10.1074/jbc.m203412200 . PMID 12095988 .
Gao L, Tu H, Shi St, Lee KJ, Asanaka M, Hwang SB, Lai MM (апрель 2003 г.). «Взаимодействие с убиквитиноподобным белком усиливает убиквитинирование и деградацию РНК-зависимой РНК-полимеразы вируса гепатита С» . Журнал вирусологии . 77 (7): 4149–59. doi : 10.1128/JVI.77.7.4149-4159.2003 . PMC 150629 . PMID 12634373 .
Massey LK, Mah Al, Ford DL, Miller J, Liang J, Doong H, Monteiro MJ (февраль 2004 г.). «Сверхэкспрессия убиквилина уменьшает убиквитинирование и деградацию белков пресенилина». Журнал болезни Альцгеймера . 6 (1): 79–92. doi : 10.3233/JAD-2004-6109 . PMID 15004330 .
Colland F, Jacq X, Truplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, et al. (Июль 2004 г.). «Функциональная протеомика картирование сигнального пути человека» . Исследование генома . 14 (7): 1324–32. doi : 10.1101/gr.2334104 . PMC 442148 . PMID 15231748 .
Persson P, Stockhausen MT, Påhlman S, Axelson H (ноябрь 2004 г.). «Убиквилин-1-это новый хэш-1-компонентный белок, который регулирует уровни нейрональных факторов транскрипции BHLH в клетках нейробластомы человека». Международный журнал онкологии . 25 (5): 1213–21. doi : 10.3892/ijo.25.5.1213 . PMID 15492808 .
Bertram L, Hiltunen M, Parkinson M, Ingelsson M, Lange C, Ramasamy K, et al. (Март 2005 г.). «Семейная связь между болезнью Альцгеймера и вариантами в UBQLN1» . Новая Англия Журнал медицины . 352 (9): 884–94. doi : 10.1056/nejmoa042765 . PMID 15745979 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000135018 - Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg00000005312 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[pmid9303440-5] Озаки Т., Хишики Т., Тояма Ю., Юаса С., Накагавара А., Сакияма С. (август 1997). «Идентификация нового клеточного белка, который может конкретно взаимодействовать с Дэном». ДНК и клеточная биология . 16 (8): 985–91. doi : 10.1089/dna.1997.16.985 . PMID 9303440 .

[pmid10807547-6] Hanaoka E, Ozaki T, Ohira M, Nakamura Y, Suzuki M, Takahashi E, et al. (Июль 2000). «Молекулярное клонирование и анализ экспрессии гена DA41 человека и его отображение с хромосомой 9q21.2-Q21.3» . Журнал человеческой генетики . 45 (3): 188–91. doi : 10.1007/s100380050209 . PMID 10807547 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^{беременный} "Entrez Gene: Ubqln1 Ubiquilin 1" .

[haapasalo_2010-8] Хаапасало А., Вишванатан Дж., Бертрам Л., Сойнинен Х., Танзи Р.Е., Хилтунен М (февраль 2010 г.). «Новая роль убиквилина-1, связанного с болезнью Альцгеймера, в агрегации белка». Биохимическое общество транзакций . 38 (Pt 1): 150–5. doi : 10.1042/bst0380150 . HDL : 11858/00-001M-0000-0010-7C06-4 . PMID 20074050 .

[zhang_2009-9] Zhang C, Saunders AJ (июнь 2009 г.). «Новая роль убиквилина 1 в регуляции системы контроля качества белка и в патогенезе заболевания» . Discovery Medicine . 8 (40): 18–22. PMC 3158983 . PMID 19772837 .

[pmid21852239-10] Stieren ES, El Ayadi A, Xiao Y, Siller E, Landsverk ML, Oberhauser AF, et al. (Октябрь 2011). «Убиквилин-1 является молекулярным шапероном для белка-предшественника амилоида» . Журнал биологической химии . 286 (41): 35689–98. doi : 10.1074/jbc.m111.243147 . PMC 3195644 . PMID 21852239 .
«В мозге Альцгеймера, обнаруженные более низкими уровнями ключевого белка» . ScienceDaily (пресс -релиз). 1 сентября 2011 г.

[11] «В мозге Альцгеймера, обнаруженные более низкими уровнями ключевого белка» . ScienceDaily (пресс -релиз). 1 сентября 2011 г.

[mah_2000-11] Махл, Перри Г., Смит М.А., Монтейро М.Дж. (ноябрь 2000 г.). «Идентификация убиквилина, нового пресенилинового взаимодействия, который увеличивает накопление пресенилинового белка» . Журнал клеточной биологии . 151 (4): 847–62. doi : 10.1083/jcb.151.4.847 . PMC 2169435 . PMID 11076969 .

[pmid24674348-12] Марин I (март 2014 г.). «Семейство генов убиквилина: эволюционные закономерности и функциональные идеи» . BMC Эволюционная биология . 14 (1): 63. Bibcode : 2014bmcee..14 ... 63M . doi : 10.1186/1471-2148-14-63 . PMC 4230246 . PMID 24674348 .

[pmid18307982-13] Ким Тай, Ким Э, Юн С.К., Юн Дж. Б. (май 2008 г.). «Herp усиливает эре, ассоциированную с ER, деградация белка за счет рекрута убиквилинов». Биохимическая и биофизическая исследовательская коммуникация . 369 (2): 741–6. doi : 10.1016/j.bbrc.2008.02.086 . PMID 18307982 .

[pmid11853878-14] Wu S, Mikhailov A, Kallo-Hosein H, Hara K, Yonezawa K, Avruch J (январь 2002 г.). «Характеристика убиквилина 1, белка-взаимодействующего с mTOR » Biochimica et Biophysica Acta (BB) - исследования молекулярных клеток 1542 (1–3): 41–5 Doi : 10.1016/s0167-4889 (01) 00164-1 11853878PMID

[pmid12095988-15] Ko HS, Uehara T, Nomura Y (сентябрь 2002 г.). «Роль убиквилина, связанного с белко-дисульфид изомеразой в эндоплазматической ретикулуме в вызванной стрессом апоптотической гибели клеток» . Журнал биологической химии . 277 (38): 35386–92. doi : 10.1074/jbc.m203412200 . PMID 12095988 .

[pmid11076969-16] Jump up to: ^а ^{беременный} Махл, Перри Г., Смит М.А., Монтейро М.Дж. (ноябрь 2000 г.). «Идентификация убиквилина, нового пресенилинового взаимодействия, который увеличивает накопление пресенилинового белка» . Журнал клеточной биологии . 151 (4): 847–62. doi : 10.1083/jcb.151.4.847 . PMC 2169435 . PMID 11076969 .

[pmid10983987-17] Kleijnen MF, Shih AH, Zhou P, Kumar S, Soccio Re, Kedersha NL, et al. (Август 2000). «Белки HPLIC могут обеспечить связь между машиной убиквитинирования и протеасомой» . Молекулярная клетка . 6 (2): 409–19. doi : 10.1016/s1097-2765 (00) 00040-x . PMID 10983987 .

[18] Rolland T, Taşan M, Charloteaux B, Pevzner SJ, Zhong Q, Sahni N, et al. (Ноябрь 2014). «Карта протеома в сети взаимодействия человека» . Клетка . 159 (5): 1212–1226. doi : 10.1016/j.cell.2014.10.050 . PMC 4266588 . PMID 25416956 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]