ХВОСТОВИК2

ХВОСТОВИК2
Идентификаторы
Псевдонимы	SHANK2 , AUTS17, CORTBP1, CTTNBP1, ProSAP1, SHANK, SPANK-3, SH3 и несколько доменов анкириновых повторов 2
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 603290 ; МГИ : 2671987 ; Гомологен : 105965 ; Генные карты : SHANK2 ; ОМА : SHANK2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	71,252,577 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	143,978,231 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	Brodmann area 23; ; bronchial epithelial cell; ; middle temporal gyrus; ; Region I of hippocampus proper; ; entorhinal cortex; ; corpus epididymis; ; Epithelium of choroid plexus; ; endothelial cell; ; retinal pigment epithelium; ; primary visual cortex;
	Top expressed in
	primary visual cortex; ; superior frontal gyrus; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; otolith organ; ; utricle; ; cerebellar cortex; ; lobe of cerebellum; ; zygote; ; substantia nigra; ; neural layer of retina;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	SH3 domain binding; protein binding; synaptic receptor adaptor activity; ionotropic glutamate receptor binding; signaling receptor complex adaptor activity;
Cellular component	cytoplasm; postsynaptic membrane; cell projection; membrane; postsynaptic density; neurofilament; photoreceptor inner segment; growth cone; plasma membrane; dendritic spine; photoreceptor outer segment; synapse; brush border membrane; cell junction; neuronal cell body; apical plasma membrane; ciliary membrane; neuron projection; ionotropic glutamate receptor complex; cytosol; cellular component; dendrite; neuron spine;
Biological process	learning; vocalization behavior; adult behavior; long-term depression; social behavior; synapse assembly; long-term potentiation; brain morphogenesis; synaptic assembly at neuromuscular junction; positive regulation of synaptic transmission, glutamatergic; dendritic spine morphogenesis; positive regulation of dendritic spine development; postsynaptic density assembly; regulation of AMPA receptor activity; positive regulation of excitatory postsynaptic potential;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	22941
	210274
	ENSG00000162105
	ENSMUSG00000037541
	Q9UPX8
	Q80Z38
	НМ_012309 ; НМ_133266 ; НМ_001379226
	НМ_001081370 ; НМ_001113373
	НП_036441 ; НП_573573 ; НП_001366155
	НП_001074839 ; НП_001106844
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 2, содержащий домены SH3 и множественных повторов анкирина, представляет собой белок , который у человека кодируется SHANK2 геном . ^[5]^[6] двух альтернативных вариантах сплайсинга, кодирующих различные изоформы Сообщается о . Существуют дополнительные варианты сплайсинга, но их полноразмерная природа не определена. ^[6]

Функция

Этот ген кодирует белок, который является членом семейства синаптических белков Шэнка, которые могут функционировать как молекулярные каркасы в постсинаптической плотности (PSD). Белки хвостовика содержат несколько доменов для белок-белкового взаимодействия, включая анкириновые повторы , домен SH3 , домен PSD-95 /Dlg/ZO-1, стерильный домен альфа-мотива и богатую пролином область. Этот конкретный член семейства содержит домен PDZ , консенсусную последовательность для пептидов, связывающих домен SH3 кортактина, и стерильный альфа-мотив. Альтернативный сплайсинг, продемонстрированный в генах Shank, был предложен как механизм регуляции молекулярной структуры Shank и спектра взаимодействующих с Shank белков в PSDs взрослого и развивающегося мозга. ^[6]

Считается, что SHANK2 может играть роль в синаптогенезе , присоединяя метаботропные рецепторы глутамата (mGluRs) к существующему пулу рецепторов NMDA (NMDA-R), связываясь с NMDA-R через PSD-95 и с mGluRs через HOMER1 . ^[7] Альтернативная гипотеза состоит в том, что сборка Homer/Shank/GKAP/PSD-95 опосредует физическую ассоциацию NMDAR с IP3R/RYR и внутриклеточными запасами Ca2+.

Взаимодействия

Было показано, что SHANK2 взаимодействует с:

Ассоциации с нервно-психическими заболеваниями

Мутации в SHANK2 связаны с расстройствами аутистического спектра (РАС) и шизофренией. ^[13] В частности, гетерозиготные мутации с потерей функции имеют почти полную пенетрантность при РАС. ^[14] Нейроны, полученные от людей с мутациями ASD и SHANK2, образуют более крупные дендритные деревья и больше синаптических связей, чем у здоровых людей. ^[15] Кроме того, распространенные мутации в SHANK2 связаны с биполярным расстройством . ^[16]

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000162105 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037541 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Лим С., Нейсбитт С., Юн Дж., Хван Джи, Су П.Г., Шэн М., Ким Э. (октябрь 1999 г.). «Характеристика семейства синаптических белков Шэнка. Множественные гены, альтернативный сплайсинг и дифференциальная экспрессия в мозге и развитии» . Журнал биологической химии . 274 (41): 29510–8. дои : 10.1074/jbc.274.41.29510 . ПМИД 10506216 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с «Ген Энтрез: SHANK2 SH3 и множественные домены анкириновых повторов 2» .
^ Бокерс Т.М., Бокманн Дж., Кройц М.Р., Гундельфингер Э.Д. (июнь 2002 г.). «Белки ProSAP/Shank - семейство организующих молекул постсинаптической плотности высшего порядка, играющих новую роль в неврологических заболеваниях человека» . Журнал нейрохимии . 81 (5): 903–10. дои : 10.1046/j.1471-4159.2002.00931.x . ПМИД 12065602 . S2CID 19894590 .
^ Пак Э, На М, Чхве Дж., Ким С., Ли Дж.Р., Юн Дж. и др. (май 2003 г.). «Семейство белков постсинаптической плотности Shank взаимодействует и способствует синаптическому накоплению фактора обмена гуаниновых нуклеотидов бета PIX для Rac1 и Cdc42» . Журнал биологической химии . 278 (21): 19220–9. дои : 10.1074/jbc.M301052200 . ПМИД 12626503 .
^ Ду Ю, Виид С.А., Сюн В.К., Маршалл Т.Д., Парсонс Дж.Т. (октябрь 1998 г.). «Идентификация нового белка, связывающего домен SH3 кортактина, и его локализация в конусах роста культивируемых нейронов» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (10): 5838–51. дои : 10.1128/mcb.18.10.5838 . ПМК 109170 . ПМИД 9742101 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Нэйсбитт С., Вальшанофф Дж., Эллисон Д.В., Сала С., Ким Э., Крейг А.М. и др. (июнь 2000 г.). «Взаимодействие белкового комплекса постсинаптическая плотность-95/гуанилаткиназный домен с легкой цепью миозина-V и динеина» . Журнал неврологии . 20 (12): 4524–34. doi : 10.1523/JNEUROSCI.20-12-04524.2000 . ПМК 6772433 . ПМИД 10844022 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Boeckers TM, Winter C, Smalla KH, Kreutz MR, Bockmann J, Seidenbecher C и др. (октябрь 1999 г.). «Богатые пролином белки ProSAP1 и ProSAP2, связанные с синапсами, взаимодействуют с синаптическими белками семейства SAPAP/GKAP». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 264 (1): 247–52. дои : 10.1006/bbrc.1999.1489 . ПМИД 10527873 .
^ Окамото П.М., Гэмби С., Уэллс Д., Фэллон Дж., Валле Р.Б. (декабрь 2001 г.). «Специфическое взаимодействие изоформы динамина с каркасными белками хвостовика / ProSAP постсинаптической плотности и актинового цитоскелета» . Журнал биологической химии . 276 (51): 48458–65. дои : 10.1074/jbc.M104927200 . ПМК 2715172 . ПМИД 11583995 .
^ Хоманн, Огайо; К. Мисура; Э. Ламас; Р.В. Сандрок; П. Нельсон; Стефан Макдонаф; Линн Э. ДеЛиси (декабрь 2016 г.). «Полногеномное секвенирование в мультиплексных семьях с психозами выявляет мутации в генах SHANK2 и SMARCA1, разделяющиеся при заболевании» . Молекулярная психиатрия . 21 (12): 1690–95. дои : 10.1038/mp.2016.24 . ПМК 5033653 . ПМИД 27001614 .
^ Леблон К.С., Нава С., Польж А., Готье Дж., Юге Дж., Лумброзо С. и др. (сентябрь 2014 г.). «Метаанализ мутаций SHANK при расстройствах аутистического спектра: градиент тяжести когнитивных нарушений» . ПЛОС Генетика . 10 (9): e1004580. дои : 10.1371/journal.pgen.1004580 . ПМЦ 4154644 . ПМИД 25188300 .
^ Заславский К., Чжан В.Б., Маккриди Ф.П., Родригес Д.С., Дено Э., Лу С. и др. (апрель 2019 г.). «Мутации SHANK2, связанные с расстройствами аутистического спектра, вызывают гиперсвязность нейронов человека» . Природная неврология . 22 (4): 556–564. дои : 10.1038/s41593-019-0365-8 . ПМК 6475597 . ПМИД 30911184 .
^ Шталь Е.А., Брин Г., Форстнер А.Дж., Маккуиллин А., Рипке С., Трубецкой В. и др. (май 2019 г.). «Полногеномное исследование ассоциаций идентифицирует 30 локусов, связанных с биполярным расстройством» . Природная генетика . 51 (5): 793–803. дои : 10.1038/s41588-019-0397-8 . ПМЦ 6956732 . ПМИД 31043756 .

Дальнейшее чтение

Шэн М., Ким Э (июнь 2000 г.). «Семейство каркасных белков Шэнка». Журнал клеточной науки . 113. 113 (Часть 11) (11): 1851–6. дои : 10.1242/jcs.113.11.1851 . ПМИД 10806096 .
Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Дж.Ю., Лю В., Гиббс Р.А. (апрель 1996 г.). «Метод «двойного адаптера» для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Аналитическая биохимия . 236 (1): 107–13. дои : 10.1006/abio.1996.0138 . ПМИД 8619474 .
Ю В., Андерссон Б., Уорли К.С., Музный Д.М., Дин Ю., Лю В. и др. (апрель 1997 г.). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК» . Геномные исследования . 7 (4): 353–8. дои : 10.1101/гр.7.4.353 . ПМК 139146 . ПМИД 9110174 .
Ду Ю, Виид С.А., Сюн В.К., Маршалл Т.Д., Парсонс Дж.Т. (октябрь 1998 г.). «Идентификация нового белка, связывающего домен SH3 кортактина, и его локализация в конусах роста культивируемых нейронов» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (10): 5838–51. дои : 10.1128/MCB.18.10.5838 . ПМК 109170 . ПМИД 9742101 .
Зитцер Х., Рихтер Д., Крайенкамп Х.Дж. (июнь 1999 г.). «Агонист-зависимое взаимодействие подтипа 2 рецептора соматостатина крысы с кортактин-связывающим белком 1» . Журнал биологической химии . 274 (26): 18153–6. дои : 10.1074/jbc.274.26.18153 . ПМИД 10373412 .
Ту Дж.К., Сяо Б., Нейсбитт С., Юань Дж.П., Петралия Р.С., Брейкман П. и др. (июль 1999 г.). «Связывание комплексов mGluR/Homer и PSD-95 с семейством белков постсинаптической плотности Shank» . Нейрон . 23 (3): 583–92. дои : 10.1016/S0896-6273(00)80810-7 . ПМИД 10433269 . S2CID 16429070 .
Кикуно Р., Нагасе Т., Исикава К., Хиросава М., Миядзима Н., Танака А. и др. (июнь 1999 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XIV. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . Исследование ДНК . 6 (3): 197–205. дои : 10.1093/dnares/6.3.197 . ПМИД 10470851 .
Boeckers TM, Winter C, Smalla KH, Kreutz MR, Bockmann J, Seidenbecher C и др. (октябрь 1999 г.). «Богатые пролином белки ProSAP1 и ProSAP2, связанные с синапсами, взаимодействуют с синаптическими белками семейства SAPAP/GKAP». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 264 (1): 247–52. дои : 10.1006/bbrc.1999.1489 . ПМИД 10527873 .
Крайенкамп Х.Дж., Зитцер Х., Гундельфингер Э.Д., Рихтер Д., Бокерс Т.М. (октябрь 2000 г.). «Кальций-независимый рецептор альфа-латротоксина из мозга человека и грызунов взаимодействует с членами семейства мультидоменных белков ProSAP/SSTRIP/Shank» . Журнал биологической химии . 275 (42): 32387–90. дои : 10.1074/jbc.C000490200 . ПМИД 10964907 .
Крайенкамп Х.Дж., Зитцер Х., Рихтер Д. (2001). «Идентификация белков, взаимодействующих с рецептором соматостатина крысы подтипа 2». Журнал физиологии, Париж . 94 (3–4): 193–8. дои : 10.1016/S0928-4257(00)00204-7 . ПМИД 11087996 . S2CID 8791865 .
Окамото П.М., Гэмби С., Уэллс Д., Фэллон Дж., Валле Р.Б. (декабрь 2001 г.). «Специфическое взаимодействие изоформы динамина с каркасными белками хвостовика / ProSAP постсинаптической плотности и актинового цитоскелета» . Журнал биологической химии . 276 (51): 48458–65. дои : 10.1074/jbc.M104927200 . ПМК 2715172 . ПМИД 11583995 .
Зольтау М., Рихтер Д., Крайенкамп Х.Дж. (декабрь 2002 г.). «Субстрат инсулинового рецептора IRSp53 связывает постсинаптический хвостовик1 с небольшим G-белком cdc42». Молекулярная и клеточная нейронауки . 21 (4): 575–83. дои : 10.1006/mcne.2002.1201 . ПМИД 12504591 . S2CID 572407 .
Пак Э, На М, Чхве Дж., Ким С., Ли Дж.Р., Юн Дж. и др. (май 2003 г.). «Семейство белков постсинаптической плотности Shank взаимодействует и способствует синаптическому накоплению фактора обмена гуаниновых нуклеотидов бета PIX для Rac1 и Cdc42» . Журнал биологической химии . 278 (21): 19220–9. дои : 10.1074/jbc.M301052200 . ПМИД 12626503 .
Хан В., Ким К.Х., Джо М.Дж., Ли Дж.Х., Ян Дж., Доктор Р.Б. и др. (январь 2006 г.). «Шанк 2 связывается с обменником Na+/H+ 3 и регулирует его» . Журнал биологической химии . 281 (3): 1461–9. дои : 10.1074/jbc.M509786200 . ПМИД 16293618 .
Тейлор Т.Д., Ногучи Х., Тотоки Ю., Тойода А., Куроки Ю., Дьюар К. и др. (март 2006 г.). «Последовательность и анализ ДНК хромосомы 11 человека, включая идентификацию новых генов» . Природа . 440 (7083): 497–500. Бибкод : 2006Natur.440..497T . дои : 10.1038/nature04632 . ПМИД 16554811 .

Внешние ссылки

Фонд SHANK2 — некоммерческая организация, поддерживающая семьи и исследования расстройств SHANK2.

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 11 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000162105 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000037541 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10506216-5] Лим С., Нейсбитт С., Юн Дж., Хван Джи, Су П.Г., Шэн М., Ким Э. (октябрь 1999 г.). «Характеристика семейства синаптических белков Шэнка. Множественные гены, альтернативный сплайсинг и дифференциальная экспрессия в мозге и развитии» . Журнал биологической химии . 274 (41): 29510–8. дои : 10.1074/jbc.274.41.29510 . ПМИД 10506216 .

[entrez-6] Перейти обратно: ^а ^б ^с «Ген Энтрез: SHANK2 SH3 и множественные домены анкириновых повторов 2» .

[pmid12065602-7] Бокерс Т.М., Бокманн Дж., Кройц М.Р., Гундельфингер Э.Д. (июнь 2002 г.). «Белки ProSAP/Shank - семейство организующих молекул постсинаптической плотности высшего порядка, играющих новую роль в неврологических заболеваниях человека» . Журнал нейрохимии . 81 (5): 903–10. дои : 10.1046/j.1471-4159.2002.00931.x . ПМИД 12065602 . S2CID 19894590 .

[pmid12626503-8] Пак Э, На М, Чхве Дж., Ким С., Ли Дж.Р., Юн Дж. и др. (май 2003 г.). «Семейство белков постсинаптической плотности Shank взаимодействует и способствует синаптическому накоплению фактора обмена гуаниновых нуклеотидов бета PIX для Rac1 и Cdc42» . Журнал биологической химии . 278 (21): 19220–9. дои : 10.1074/jbc.M301052200 . ПМИД 12626503 .

[pmid9742101-9] Ду Ю, Виид С.А., Сюн В.К., Маршалл Т.Д., Парсонс Дж.Т. (октябрь 1998 г.). «Идентификация нового белка, связывающего домен SH3 кортактина, и его локализация в конусах роста культивируемых нейронов» . Молекулярная и клеточная биология . 18 (10): 5838–51. дои : 10.1128/mcb.18.10.5838 . ПМК 109170 . ПМИД 9742101 .

[pmid10844022-10] Перейти обратно: ^а ^б Нэйсбитт С., Вальшанофф Дж., Эллисон Д.В., Сала С., Ким Э., Крейг А.М. и др. (июнь 2000 г.). «Взаимодействие белкового комплекса постсинаптическая плотность-95/гуанилаткиназный домен с легкой цепью миозина-V и динеина» . Журнал неврологии . 20 (12): 4524–34. doi : 10.1523/JNEUROSCI.20-12-04524.2000 . ПМК 6772433 . ПМИД 10844022 .

[pmid10527873-11] Перейти обратно: ^а ^б Boeckers TM, Winter C, Smalla KH, Kreutz MR, Bockmann J, Seidenbecher C и др. (октябрь 1999 г.). «Богатые пролином белки ProSAP1 и ProSAP2, связанные с синапсами, взаимодействуют с синаптическими белками семейства SAPAP/GKAP». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 264 (1): 247–52. дои : 10.1006/bbrc.1999.1489 . ПМИД 10527873 .

[pmid11583995-12] Окамото П.М., Гэмби С., Уэллс Д., Фэллон Дж., Валле Р.Б. (декабрь 2001 г.). «Специфическое взаимодействие изоформы динамина с каркасными белками хвостовика / ProSAP постсинаптической плотности и актинового цитоскелета» . Журнал биологической химии . 276 (51): 48458–65. дои : 10.1074/jbc.M104927200 . ПМК 2715172 . ПМИД 11583995 .

[13] Хоманн, Огайо; К. Мисура; Э. Ламас; Р.В. Сандрок; П. Нельсон; Стефан Макдонаф; Линн Э. ДеЛиси (декабрь 2016 г.). «Полногеномное секвенирование в мультиплексных семьях с психозами выявляет мутации в генах SHANK2 и SMARCA1, разделяющиеся при заболевании» . Молекулярная психиатрия . 21 (12): 1690–95. дои : 10.1038/mp.2016.24 . ПМК 5033653 . ПМИД 27001614 .

[14] Леблон К.С., Нава С., Польж А., Готье Дж., Юге Дж., Лумброзо С. и др. (сентябрь 2014 г.). «Метаанализ мутаций SHANK при расстройствах аутистического спектра: градиент тяжести когнитивных нарушений» . ПЛОС Генетика . 10 (9): e1004580. дои : 10.1371/journal.pgen.1004580 . ПМЦ 4154644 . ПМИД 25188300 .

[15] Заславский К., Чжан В.Б., Маккриди Ф.П., Родригес Д.С., Дено Э., Лу С. и др. (апрель 2019 г.). «Мутации SHANK2, связанные с расстройствами аутистического спектра, вызывают гиперсвязность нейронов человека» . Природная неврология . 22 (4): 556–564. дои : 10.1038/s41593-019-0365-8 . ПМК 6475597 . ПМИД 30911184 .

[16] Шталь Е.А., Брин Г., Форстнер А.Дж., Маккуиллин А., Рипке С., Трубецкой В. и др. (май 2019 г.). «Полногеномное исследование ассоциаций идентифицирует 30 локусов, связанных с биполярным расстройством» . Природная генетика . 51 (5): 793–803. дои : 10.1038/s41588-019-0397-8 . ПМЦ 6956732 . ПМИД 31043756 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]