Parachlamydiaceae
Parachlamydiaceae | |
---|---|
Научная классификация ![]() | |
Домен: | Бактерии |
Филум: | Хламидиота |
Сорт: | Хламидия |
Заказ: | Chlamydiales |
Семья: | Parachlamydiaceae Everett et al. , 1999 [ 1 ] |
Род | |
|
Parachlamydiaceae - это семейство бактерий в порядке хламидиалов . Виды в этом семействе имеют хламидиоз цикл репликации, похожий на , а их гены рибосомной РНК на 80–90% идентичны рибосомальным генам в Chlamydiaceae . Parachlamydiaceae естественным образом заражает амебы и может выращивать в культивируемых клетках Vero . Parachlamydiaceae не признаются моноклональными антителами , которые обнаруживают липополисахарид Chlamydiaceae . [ Цитация необходима ]
Филогения
[ редактировать ]Принятая в настоящее время таксономия основана на списке прокариотических имен в номенклатуре (LPSN) [ 2 ] и Национальный центр информации о биотехнологии (NCBI) [ 3 ]
16S RRNA на основе LTP _08_2023 [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] | 120 маркерных белков на основе GTDB 08-RS214 [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
Незнашиваемый вид:
- « Ca. Mesochlamydia Elodes » Corsaro et al. 2012
- « Ca. Metachlamydia lacustris » Corsaro et al. 2010 год
Изолированные эндосимбионты включают:
- Кокк Холла
- P9
- УФ-7
- Эндосимбионт Acanthamoeba sp. Tume1
- Эндосимбионт Acanthamoeba sp. UWC22
- Эндосимбионт Acanthamoeba sp. UWE1
Некультурные линии включают: [ 3 ]
- Неохламдийская черепаха типа 1
- Экологическая неохламидия
- Corvena4
- CVC15
- CVC7
- CVE5
Parachlamydia acanthamoebae имеет различные характеристики окрашивания грамма и является мезофильным . Трофозоиты Acanthamoeba, принимающие эти штаммы, были выделены от бессимптомных женщин в Германии , а также в вспышке лихорадки увлажнителя («кокка Холла») в Вермонте, США. [ Цитация необходима ] Четыре пациента из Новой Шотландии, чья сыворотка признала кокк Холла, не демонстрировал серологическую перекрестную реакцию с антигенами от Chlamydiaceae. [ 10 ]
Смотрите также
[ редактировать ]Примечания
[ редактировать ]Metachlamydia lacustris и виды Protochlamydia были обнаружены в Национальном центре биотехнологической информации (NCBI), но не имеют никакого значения с бактериологическим кодексом (1990 и последующим пересмотром), как подробно описано по списку прокариотических имен с положением в номенклатуре (LPSN) в результате Следующие причины:
• Никакая чистая культура, изолированная или доступная для прокариот.
• Недостаточно опубликовано, потому что эффективная публикация только документирует депозит типового штамма в единой признанной коллекции культуры.
• Не одобрен и опубликовано Международным журналом систематической бактериологии или Международным журналом систематической и эволюционной микробиологии (IJSB/IJSEM).
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Карин де Эверетт, Робин М. Буш и Артур А. Андерсен (1999). "Изменено описание порядка Chlamydiales, предложение Parachlamydiaceae Fam. Nov. И Simkaniaceae Fam. Nov., Каждый из которых содержал один монотипический род, пересмотренную таксономию семейства Chlamydiaceae, включая новый род и пять новых видов и стандарты для идентификации организмов " . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 49 (2): 415–440. doi : 10.1099/00207713-49-2-415 . PMID 10319462 .
- ^ JP Euzéby. "Parachlamydiaceae" . Список прокариотических имен с стоянием в номенклатуре (LPSN) . Получено 2022-09-09 .
- ^ Jump up to: а беременный Sayers; и др. "Parachlamydiaceae" . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) База данных таксономии . Получено 2022-09-09 .
- ^ "LTP" . Получено 20 ноября 2023 года .
- ^ «Дерево LTP_ALL в формате Newick» . Получено 20 ноября 2023 года .
- ^ «LTP_08_2023 Notes» (PDF) . Получено 20 ноября 2023 года .
- ^ "GTDB Release 08-RS214" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
- ^ "BAC120_R214.sp_label" . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
- ^ «История таксонов» . База данных таксономии генома . Получено 10 мая 2023 года .
- ^ RJ Birtles; TJ Rowbotham; C. Стори; TJ Marrie; Д. Раульт (1997). « Хламидиоподобный облигатный паразит свободных амеб». Lancet . 349 (9056): 925–926. doi : 10.1016/s0140-6736 (05) 62701-8 . PMID 9093261 .