Хламидии (род)
| Хламидии | |
|---|---|
 | |
| Chlamydia trachomatis Тельца включения (коричневые) в культуре клеток Маккоя. | |
Научная классификация  | |
| Домен: | Бактерии |
| Тип: | Хламидиота |
| Сорт: | Хламидии |
| Заказ: | Хламидии |
| Семья: | Хламидиевые |
| Род: | Хламидии Джонс, Рейк и Стернс, 1945 г. |
| Типовой вид | |
| Хламидия трахоматис (Бусакка, 1935 г.) Рейк, 1957 г. | |
| Разновидность | |
| |
| Синонимы | |
| |
Хламидии — род патогенных , грамотрицательных бактерий являющихся облигатными внутриклеточными паразитами . Хламидиозные инфекции являются наиболее распространенными бактериальными заболеваниями, передающимися половым путем, у людей и основной причиной инфекционной слепоты во всем мире. [1]
Виды включают Chlamydia trachomatis (возбудитель человека), Ch. suis (воздействует только на свиней ) и Ch. muridarum (поражает только мышей и хомяков ). [2] Люди в основном заражаются Ch. трахоматис , гл. pneumoniae , Ch. абортус и Ch. пситачи . [3]
Классификация
[ редактировать ]Из-за хламидий уникального цикла развития они были таксономически выделены в отдельный порядок. [4] Хламидии относятся к порядку Chlamydiales семейства Chlamydiaceae. [ нужна ссылка ]
В начале 1990-х годов было известно шесть видов хламидий . В результате масштабного переописания порядка Chlamydiales в 1999 году с использованием новых на тот момент методов анализа ДНК три вида были выделены из рода Chlamydia и реклассифицированы в недавно созданный тогда род Chlamydophila , а также добавлены три новых вида к этому роду. . [5] В 2001 году многие бактериологи категорически возражали против реклассификации. [6] хотя в 2006 году некоторые ученые все еще поддерживали отличие хламидофилы . [7] В 2009 году достоверность Chlamydophila была поставлена под сомнение новыми методами анализа ДНК, что привело к предложению «воссоединить Chlamydiaceae в единый род Chlamydia ». [8] Судя по всему, это было принято сообществом. [9] [10] доведя число (действительных) видов хламидий до 9. Многие вероятные виды впоследствии были выделены, но никто не удосужился их назвать. В 2013 г. был добавлен 10-й вид Ch. ibidis , известный только по дикому священному ибису во Франции. [11] Еще два вида были добавлены в 2014 г. (но подтверждены в 2015 г.): Ch. avium, поражающий голубей и попугаев, и Ch. Gallinacea, поражающая кур, цесарок и индеек. [3] Ч. abortus был добавлен в 2015 году, а вид Chlamydophila был реклассифицирован. [6] Ряд новых видов первоначально был отнесен к аберрантным штаммам Ch. попугаи [3]
Геномы
[ редактировать ]Chlamydia Виды от 1,0 до 1,3 мегабаз . имеют геномы длиной [12] Большинство из них кодируют от ~900 до 1050 белков. [13] Некоторые виды содержат также ДНК- плазмиды или фаговые геномы (см. таблицу). Элементарное тельце содержит РНК-полимеразу, ответственную за транскрипцию ДНК-генома после проникновения в цитоплазму клетки-хозяина и начала цикла роста. рибосомы и рибосомальные субъединицы. В этих тельцах находятся [14]
| Ч. трахоматис MoPn | Ч. трахоматис Д | Ч. пневмония AR39 | Ч. пневмония CWL029 | |
|---|---|---|---|---|
| Размер (нт) | 1,069,412 | 1,042,519 | 1,229,853 | 1,230,230 |
| ORF | 924 | 894 | 1052 | 1052 |
| тРНК | 37 | 37 | 38 | 38 |
| плазмиды | 1 (7501 нт) | 1 (7493 нт) | 1 фаг оцДНК | никто |
Таблица 1. Особенности генома отдельных видов и штаммов хламидий . MoPn является патогеном мышей, а штамм «D» — патогеном человека. Около 80% генов Ch. trachomatis и Ch. pneumoniae являются ортологами. Адаптировано по материалам Read et al. 2000 г. [13]
Цикл развития
[ редактировать ]Хламидии могут встречаться в форме элементарного тельца и сетчатого тела. Элементарное тело — это нереплицирующаяся инфекционная частица, которая высвобождается при разрыве инфицированных клеток. Он отвечает за способность бактерий передаваться от человека к человеку и аналогичен споре . Элементарное тело может иметь диаметр от 0,25 до 0,30 мкм. Эта форма покрыта жесткой клеточной стенкой (отсюда и объединяющая форма хламид- в названии рода). Элементарное тело индуцирует собственный эндоцитоз при воздействии на клетки-мишени. Одна фаголизосома обычно производит около 100–1000 элементарных тел. [ нужна ссылка ]
Хламидии могут также иметь форму сетчатого тела, которое на самом деле является внутрицитоплазматической формой, активно участвующей в процессе репликации и роста этих бактерий. Сетчатое тело немного крупнее элементарного тела и может достигать в диаметре до 0,6 мкм при минимальном диаметре 0,5 мкм. Он не имеет клеточной стенки. При окраске йодом сетчатые тельца выглядят как включения в клетке. Геном ДНК, белки и рибосомы сохраняются в сетчатом теле. Это происходит в результате цикла развития бактерий. Ретикулярное тельце — это, по сути, структура, в которой геном хламидий транскрибируется в РНК, синтезируются белки и реплицируется ДНК. Сетчатое тело делится путем бинарного деления с образованием частиц, которые после синтеза внешней клеточной стенки развиваются в новое потомство инфекционных элементарных тел. Слияние длится около трех часов, а инкубационный период может достигать 21 дня. После деления сетчатое тело снова принимает элементарную форму и высвобождается клеткой путем экзоцитоз . [4]
Исследования цикла роста Ch. trachomatis и Ch. psittaci в культурах клеток in vitro показывают, что инфекционное элементарное тельце (EB) развивается в неинфекционное сетчатое тельце (RB) внутри цитоплазматической вакуоли инфицированной клетки. После попадания элементарного тела в зараженную клетку наступает 20-часовая фаза затмения, в течение которой инфекционная частица развивается в сетчатое тело. Выход элементарных тел хламидий максимален через 36–50 часов после заражения. [14]
Гистоны, подобные белкам HctA и HctB, играют роль в контроле дифференциации между двумя типами клеток. Экспрессия HctA жестко регулируется и подавляется небольшой некодирующей РНК IhtA до поздней редифференцировки RB в EB. [15] РНК IhtA консервативна у всех видов Chlamydia . [16]
Патология
[ редактировать ]Большинство хламидийных инфекций не вызывают симптомов. [17] Симптоматические инфекции часто включают ощущение жжения при мочеиспускании, а также боль и дискомфорт в животе или гениталиях. [18] Всем людям, вступавшим в половую связь с потенциально инфицированными людьми, может быть предложен один из нескольких тестов для диагностики этого заболевания. [ нужна ссылка ] Тесты амплификации нуклеиновых кислот (МАНК), которые включают полимеразную цепную реакцию (ПЦР), транскрипционно-опосредованную амплификацию (ТМА), лигазную цепную реакцию (ЛЦР) и амплификацию смещения цепи (SDA), являются наиболее широко используемыми диагностическими тестами на хламидии . [19]
Эволюция
[ редактировать ]Недавние филогенетические исследования показали, что хламидии , вероятно, имеют общего предка с цианобактериями , группой, содержащей эндосимбионтного предка хлоропластов современных растений , следовательно, хламидии сохраняют необычные растительноподобные черты, как генетически , так и физиологически . В частности, фермент L,L-диаминопимелатаминотрансфераза , который связан с выработкой лизина в растениях, также связан со строительством хламидийного пептидогликана , необходимого для деления. [20] Генетическая кодировка ферментов удивительно схожа у растений, цианобактерий и хламидий , что свидетельствует о близком общем происхождении. [21]
Филогения
[ редактировать ]| на основе 16S рРНК ДП _08_2023 [22] [23] [24] | 120 маркерных белков на основе GTDB 08-RS214 [25] [26] [27] | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
|
|
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Дрю, В. Лоуренс (2004). «Хламидии». В Райане, Кеннете; Рэй, К. Джордж (ред.). Медицинская микробиология Шерриса (PDF) (4-е изд.). МакГроу Хилл. стр. 463–470. ISBN 978-0-8385-8529-0 .
- ^ Уорд М. «Таксономическая диаграмма» . Chlamydiae.com . Архивировано из оригинала 18 сентября 2010 г. Проверено 28 октября 2008 г.
- ^ Jump up to: а б с Джозеф, С.Дж.; и др. (2015), «Геномика Chlamydiaceae выявляет межвидовую примесь и недавнюю эволюцию Chlamydia abortus, заражающую низшие виды млекопитающих и человека», Genome Biol Evol , 7 (11): 3070–3084, doi : 10.1093/gbe/evv201 , PMC 4994753 , PMID 26507799 .
- ^ Jump up to: а б «Хламидия трахоматис» . Архивировано из оригинала 2 июля 2010 года . Проверено 18 июня 2010 г.
- ^ Эверетт К.Д., Буш Р.М., Андерсен А.А. (апрель 1999 г.). «Исправленное описание порядка Chlamydiales, предложение Parachlamydiaceae семейства nov. и Simkaniaceae семейства nov., каждый из которых содержит один монотипический род, пересмотренная таксономия семейства Chlamydiaceae, включающая новый род и пять новых видов, а также стандарты для идентификации организмы» . Межд. Дж. Сист. Бактериол . 49 (2): 415–40. дои : 10.1099/00207713-49-2-415 . ПМИД 10319462 .
- ^ Jump up to: а б Парте, АЦ «Хламидии» . ЛПСН .
- ^ Гриффитс Э., Вентреска М.С., Гупта Р.С. (2006). «BLAST-скрининг геномов хламидий для выявления сигнатурных белков, уникальных для групп видов Chlamydiales, Chlamydiaceae, Chlamydophila и Chlamydia» . БМК Геномика . 7:14 . дои : 10.1186/1471-2164-7-14 . ПМЦ 1403754 . ПМИД 16436211 .
- ^ Стивенс Р.С., Майерс Г., Эппингер М., Бавойл П.М. (март 2009 г.). «Расхождение без различия: решены филогенетика и таксономия хламидий» . ФЭМС Иммунол. Мед. Микробиол . 55 (2): 115–9. дои : 10.1111/j.1574-695X.2008.00516.x . ПМИД 19281563 .
- ^ Греуб, Гилберт (1 ноября 2010 г.). «Подкомитет Международного комитета по систематике прокариот по таксономии хламидий, протокол первого закрытого заседания, 21 марта 2009 г., Литл-Рок, Арканзас, США» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 60 (11): 2691–2693. дои : 10.1099/ijs.0.028225-0 . ПМИД 21048221 .
- ^ Бальзамо, Дж; и др. (2017), «Сборник мер по контролю инфекции Chlamydia psittaci среди людей (орнитоз) и домашних птиц (птичий хламидиоз), 2017» (PDF) , J Avian Med Surg , 31 (3): 262–282, doi : 10.1647/ 217-265 , ПМИД 28891690 , S2CID 26000244 .
- ^ Воримор, Фабьен; Ся, Жу-цзин; Хуот-Кризи, Хизер; Бастиан, Сюзанна; Деруйтер, Люси; Пассет, Энн; Саксе, Конрад; Бавоил, Патрик; Майерс, Гарри; Ларукау, Карин (20 сентября 2013 г.). «Выделение нового вида хламидий от дикого священного ибиса ( Threskiornis aethiopicus ) — Chlamydia ibidis » . ПЛОС ОДИН . 8 (9). е74823. Бибкод : 2013PLoSO...874823V . дои : 10.1371/journal.pone.0074823 . ПМЦ 3779242 . ПМИД 24073223 .
- ^ «Бактериальные геномы EMBL» . Проверено 19 января 2012 г.
- ^ Jump up to: а б Читай, ТД; Брунэм, Колорадо; Шен, К.; Гилл, СР; Гейдельберг, Дж. Ф.; Уайт, О.; Хикки, ЕК; Петерсон, Дж.; Аттербек, Т. (15 марта 2000 г.). «Последовательности генома Chlamydia trachomatis MoPn и Chlamydia pneumoniae AR39» . Исследования нуклеиновых кислот . 28 (6): 1397–1406. дои : 10.1093/нар/28.6.1397 . ISSN 1362-4962 . ПМК 111046 . ПМИД 10684935 .
- ^ Jump up to: а б Беккер, Йехиэль (1996). «Хламидии» . В Бароне С. (ред.). Медицинская микробиология (4-е изд.). Медицинский филиал Техасского университета в Галвестоне. ISBN 0-9631172-1-1 . ПМИД 21413294 .
- ^ Гришабер, Н.А.; Гришабер, СС; Фишер, скорая помощь; Хакштадт, Т (2006). «Маленькая РНК ингибирует трансляцию гистоноподобного белка Hc1 в Chlamydia trachomatis». Мол. Микробиол . 59 (2): 541–50. дои : 10.1111/j.1365-2958.2005.04949.x . ПМИД 16390448 . S2CID 11872982 .
- ^ Таттерсолл, Дж; Рао, Г.В.; Рунак, Дж; Хакштадт, Т; Гришабер, СС; Гришабер, Н.А. (2012). «Ингибирование трансляции белка цикла развития HctA малой РНК IhtA сохраняется у хламидий» . ПЛОС ОДИН . 7 (10): е47439. Бибкод : 2012PLoSO...747439T . дои : 10.1371/journal.pone.0047439 . ПМЦ 3469542 . ПМИД 23071807 .
- ^ «Защита от хламидиоза» . Проверено 1 августа 2010 г.
- ^ «Хламидии» . Всемирная организация здравоохранения . 17 июля 2023 г. Проверено 25 декабря 2023 г.
- ^ «Факты о хламидиях» . Европейский центр профилактики и контроля заболеваний . Проверено 25 декабря 2023 г.
- ^ Лихти, ГВ; Куру, Э.; Холл, Э.; Калинда, А.; Брун, Ю.В.; ВанНьевенце, М.; Маурелли, AT (февраль 2014 г.). «Новый метод метаболической маркировки клеточной стенки обнаруживает пептидогликан в Chlamydia trachomatis» . Природа . 506 (7489): 507–510. дои : 10.1038/nature12892 . ISSN 1476-4687 . ПМЦ 3997218 . ПМИД 24336210 .
- ^ Маккой А.Дж., Адамс Н.Е., Хадсон А.О., Гилварг С., Леустек Т., Маурелли А.Т. (2006). «L,L-диаминопимелатаминотрансфераза, трансферментный фермент, общий для хламидий и растений для синтеза диаминопимелата/лизина» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 103 (47): 17909–14. Бибкод : 2006PNAS..10317909M . дои : 10.1073/pnas.0608643103 . ПМЦ 1693846 . ПМИД 17093042 .
- ^ «ЛТП» . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Примечания к выпуску LTP_08_2023» (PDF) . Проверено 20 ноября 2023 г.
- ^ «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ "bac120_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
- ^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]
Данные, связанные с хламидиями , в Wikispecies - Chlamydiae.com
| Базы данных органов управления : Национальные |
|---|
