Кобальт-хелатаза

Кобальт-хелатаза, субъединица CobT
Кобальт-хелатаза, субъединица CobT
Идентификаторы
Символ	КобТ
Пфам	PF06213
ИнтерПро	ИПР006538
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

показывать Поиск
PMC	articles
PubMed	articles
NCBI	proteins

хелатаза кобальта
хелатаза кобальта
	Предполагаемый мономер хелатазы кобальта из Desulvobrio vulgaris .
Идентификаторы
Номер ЕС.	6.6.1.2
Номер CAS.	81295-49-0
Базы данных
ИнтЭнк	вид IntEnz
БРЕНДА	БРЕНДА запись
ЭксПАСи	Просмотр NiceZyme
КЕГГ	КЕГГ запись
МетаЦик	метаболический путь
ПРЯМОЙ	профиль
PDB Структуры	RCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтология	АмиГО / QuickGO
PMC
показывать Поиск
PMC	articles
PubMed	articles
NCBI	proteins

Хелатаза кобальта ( EC 6.6.1.2 ) представляет собой фермент химическую , катализирующий реакцию .

АТФ + а,с-диамид гидробириновой кислоты + Co ²⁺ + Н ₂ О

\rightleftharpoons

АДФ + фосфат + cob(II)ириновая кислота a,c-диамид + H ⁺

Четырьмя субстратами этого фермента являются АТФ , a,c-диамид гидробириновой кислоты , Co. ²⁺и H ₂ O ; его четырьмя продуктами являются АДФ , фосфат , а,c-диамид коб(II)ириновой кислоты и H. ⁺.

Аэробная хелатаза кобальта (аэробный путь биосинтеза кобаламина) ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]} состоит из трех субъединиц: CobT, CobN ( InterPro : IPR003672 ) и CobS ( InterPro : IPR006537 ).

Макроцикл Pseudomonas витамина В12 может образовывать комплекс с металлом посредством АТФ-зависимых реакций аэробного пути (например, у denitrificans ) или посредством АТФ-независимых реакций сирогидрохлорина анаэробного пути (например, у Salmonella typhimurium ). ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]} Соответствующие хелатазы кобальта не гомологичны. Однако аэробные субъединицы кобальт-хелатазы CobN и CobS гомологичны субъединицам Mg-хелатазы BchH и BchI соответственно. ^{[ 5 ]} Также было обнаружено, что CobT отдаленно связан с третьей субъединицей Mg-хелатазы, BchD (участвующей в синтезе бактериохлорофилла, например, у Rhodobacter capsulatus). ^{[ 5 ]}

Этот фермент принадлежит к семейству лигаз , в частности тех, которые образуют связи азот-D-металл в координационных комплексах. Систематическое название этого класса ферментов — гидробириновая кислота-a,c-диамид:кобальт-кобальт-лигаза (АДФ-образующая) . Другие широко используемые названия включают a,c-диамид-кобалтохелатазу гидробириновой кислоты , CobNST и CobNCobST . Этот фермент является частью пути биосинтеза кобаламина (витамина B ₁₂ ) у аэробных бактерий .

См. также

Биосинтез кобаламина

Ссылки

^ Ромао, Селия В.; Ладакис, Димитриос; Лобо, Сусана А.Л.; Каррондо, Мария А.; Бриндли, Аманда А.; Дири, Эвелин; Матиас, Педро М.; Пикерсгилл, Ричард В.; Сарайва, Лигия М.; Уоррен, Мартин Дж. (4 января 2011 г.). «Эволюция семейства хелатаз облегчается введением асимметрии активного центра и олигомеризацией белков» . Труды Национальной академии наук . 108 (1): 97–102. дои : 10.1073/pnas.1014298108 . ПМК 3017170 . ПМИД 21173279 .
^ Крузе Дж., Кэмерон Б., Кошуа Л., Риго С., Бланш Ф., Гийо С., Леви-шиль С., Руйез М.С. (1991). «Генетический анализ и анализ последовательности фрагмента ДНК Pseudomonas denitrificans, содержащего два гена початка» . Дж. Бактериол . 173 (19): 6058–6065. дои : 10.1128/jb.173.19.6058-6065.1991 . ПМК 208352 . ПМИД 1917840 .
^ Крузе Дж., Кэмерон Б., Бланш Ф., Тибо Д., Дебюше Л., Кудер М. (1992). «Анализ, очистка и характеристика кобальтохелатазы, уникального сложного фермента, катализирующего вставку кобальта в a,c-диамид гидробириновой кислоты во время биосинтеза кофермента B12 у Pseudomonas denitrificans» . Дж. Бактериол . 174 (22): 7445–7451. дои : 10.1128/jb.174.22.7445-7451.1992 . ПМК 207441 . ПМИД 1429466 .
^ Рот-младший, Лоуренс Дж.Г., Бобик Т.А. (1996). «Кобаламин (коэнзим B12): синтез и биологическое значение» (PDF) . Анну. Преподобный Микробиол . 50 : 137–181. дои : 10.1146/аннурев.микро.50.1.137 . ПМИД 8905078 . S2CID 36290299 . Архивировано из оригинала (PDF) 7 марта 2019 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с Уиллоуз Р.Д., Аль-Карадаги С., Ханссон М., Фодже М.Н., Ханссон А., Олсен Дж.Г., Гоф С. (2001). «Взаимодействие между модулем ААА и доменом интегрина I может регулировать функцию хелатазы магния». Дж. Мол. Биол . 311 (1): 111–122. дои : 10.1006/jmbi.2001.4834 . ПМИД 11469861 .

Дальнейшее чтение

Дебюше Л., Кудер М., Тибо Д., Кэмерон Б., Крузе Дж., Бланш Ф. (1992). «Анализ, очистка и характеристика кобальтохелатазы, уникального сложного фермента, катализирующего вставку кобальта в a,c-диамид гидробириновой кислоты во время биосинтеза кофермента B12 у Pseudomonas denitrificans» . Дж. Бактериол . 174 (22): 7445–51. дои : 10.1128/JB.174.22.7445-7451.1992 . ПМК 207441 . ПМИД 1429466 .
Уоррен М.Дж., Ро Э., Шуберт Х.Л., Эскаланте-Семерена Дж.К. (2002). «Биосинтез аденозилкобаламина (витамина В12)». Нат. Прод. Представитель . 19 (4): 390–412. дои : 10.1039/b108967f . ПМИД 12195810 .

В эту статью включен текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR006538.

Эта о лигазе статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] Ромао, Селия В.; Ладакис, Димитриос; Лобо, Сусана А.Л.; Каррондо, Мария А.; Бриндли, Аманда А.; Дири, Эвелин; Матиас, Педро М.; Пикерсгилл, Ричард В.; Сарайва, Лигия М.; Уоррен, Мартин Дж. (4 января 2011 г.). «Эволюция семейства хелатаз облегчается введением асимметрии активного центра и олигомеризацией белков» . Труды Национальной академии наук . 108 (1): 97–102. дои : 10.1073/pnas.1014298108 . ПМК 3017170 . ПМИД 21173279 .

[PUB00011188-2] Крузе Дж., Кэмерон Б., Кошуа Л., Риго С., Бланш Ф., Гийо С., Леви-шиль С., Руйез М.С. (1991). «Генетический анализ и анализ последовательности фрагмента ДНК Pseudomonas denitrificans, содержащего два гена початка» . Дж. Бактериол . 173 (19): 6058–6065. дои : 10.1128/jb.173.19.6058-6065.1991 . ПМК 208352 . ПМИД 1917840 .

[PUB00009664-3] Крузе Дж., Кэмерон Б., Бланш Ф., Тибо Д., Дебюше Л., Кудер М. (1992). «Анализ, очистка и характеристика кобальтохелатазы, уникального сложного фермента, катализирующего вставку кобальта в a,c-диамид гидробириновой кислоты во время биосинтеза кофермента B12 у Pseudomonas denitrificans» . Дж. Бактериол . 174 (22): 7445–7451. дои : 10.1128/jb.174.22.7445-7451.1992 . ПМК 207441 . ПМИД 1429466 .

[PUB00006361-4] Рот-младший, Лоуренс Дж.Г., Бобик Т.А. (1996). «Кобаламин (коэнзим B12): синтез и биологическое значение» (PDF) . Анну. Преподобный Микробиол . 50 : 137–181. дои : 10.1146/аннурев.микро.50.1.137 . ПМИД 8905078 . S2CID 36290299 . Архивировано из оригинала (PDF) 7 марта 2019 г.

[PUB00011189-5] Jump up to: ^а ^б ^с Уиллоуз Р.Д., Аль-Карадаги С., Ханссон М., Фодже М.Н., Ханссон А., Олсен Дж.Г., Гоф С. (2001). «Взаимодействие между модулем ААА и доменом интегрина I может регулировать функцию хелатазы магния». Дж. Мол. Биол . 311 (1): 111–122. дои : 10.1006/jmbi.2001.4834 . ПМИД 11469861 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

v т и Ферменты : фосфорный эфир и азотно-металлические лигазы ( EC 6,5-6,6).
6.5: Phosphoric Ester	DNA ligase
6.6: Nitrogen-Metal	Magnesium chelatase Cobalt chelatase

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)