Кристофер Дж. Шофилд
Кристофер Дж. Шофилд | |
---|---|
Рожденный | Кристофер Джозеф Шофилд 17 июня 1960 г. Великобритания |
Национальность | Британский |
Другие имена | Крис Шофилд, CJS |
Альма-матер | Манчестерский университет (бакалавр) Оксфордский университет (DPhil) |
Награды | Член Королевского общества |
Научная карьера | |
Поля | Гипоксическая реакция, эпигенетика, оксигеназы, устойчивость к антибиотикам |
Учреждения | Лаборатория химических исследований Оксфордского университета |
Веб-сайт | http://schofield.chem.ox.ac.uk/home http://research.chem.ox.ac.uk/christopher-schofield.aspx |
Кристофер Джозеф Шофилд (также известный как Крис Шофилд) — профессор химии Оксфордского университета. [ 1 ] и член Королевского общества . Крис Шофилд — профессор органической химии Оксфордского университета , факультет химии. [ 2 ] и член Хартфордского колледжа . [ 3 ] Шофилд изучал функциональное, структурное и механистическое понимание ферментов , которые используют кислород и 2-оксоглутарат в качестве ко-субстрата. [ 4 ] Его работа открыла новые возможности в исследованиях антибиотиков . [ 5 ] кислородное зондирование, [ 6 ] и регуляция генов . [ 7 ]
После работы над растительными и микробными оксигеназами , [ 4 ] он изучал неизведанные человеческие оксигеназы. [ 8 ] Его исследования выявили неожиданную роль оксигеназ. [ 9 ] в регуляции экспрессии генов , что особенно важно в клеточной гипоксической реакции, [ 10 ] и выявил новые посттрансляционные модификации белков сплайсинга хроматина и РНК . [ 11 ] Работа выявила новые возможности для медицинского вмешательства. [ 12 ]
Образование
[ редактировать ]Крис Шофилд учился в Колледжа Святого Ансельма католической гимназии в Мерсисайде, затем получил степень бакалавра наук по химии в Манчестерском университете и окончил его с отличием (1979–1982). В 1982 году он переехал в Оксфорд, чтобы учиться на доктора философии у профессора Джека Э. Болдуина . В 1985 году он стал кафедральным демонстратором в лаборатории Дайсона Перринса , Оксфордского университета после чего был назначен преподавателем химии. [ 2 ] и член Хартфордского колледжа [ 3 ] в 1990 году. В 1998 году он стал профессором химии , [ 1 ] а в 2011 году назначен заведующим отделением органической химии [ 13 ] на химическом факультете Оксфордского университета. В 2013 году он был избран членом Королевского общества ФРС. [ 14 ]
Исследовать
[ редактировать ]Работа в лаборатории Криса Шофилда сосредоточена на различных областях исследований, в том числе:
Молекулярные механизмы гипоксической реакции
[ редактировать ]Индуцируемый гипоксией фактор-1 (HIF-1) представляет собой гетеродимерный α,β-транскрипционный комплекс. [ 15 ] который опосредует клеточный ответ на доступность кислорода в многоклеточных организмах, [ 6 ] [ 16 ] начиная от простейших известных животных Trichoplax adhaerens и заканчивая людьми. [ 4 ] [ 6 ] [ 17 ] [ 18 ] [ 19 ] Исследование структуры и механизмов действия HIF-пролилгидроксилаз является актуальным направлением работ. [ 10 ] [ 20 ] Группа решила кристаллические структуры PHD2. [ 9 ] [ 21 ] человека - одна из пролилгидроксилаз - и обнаружил, что аспарагинилгидроксилаза HIF также катализирует гидроксилирование консервативных мотивов, [ 22 ] анкириновый повторяющийся домен.
Химические основы эпигенетики
[ редактировать ]В настоящее время в центре внимания группы находится модификация гистонов, в частности катализируемое оксигеназой N -деметилирование метилированных лизина гистонов. остатков [ 7 ] [ 23 ] – в сотрудничестве с Консорциумом структурной геномики . Гистоновые деметилазы [ 24 ] [ 25 ] представляют интерес как с точки зрения их связи с болезнями, включая рак [ 26 ] [ 27 ] и воспалительные заболевания , [ 28 ] а также роль метилирования в регуляции транскрипции . [ 29 ] Недавние области интереса включают жировую массу и белок ожирения. [ 30 ] [ 31 ] который, как было показано, представляет собой нуклеиновой кислоты деметилазу [ 32 ] и JMJD6 [ 33 ] [ 34 ] , модифицирующий лизилгидроксилазу который представляет собой белок сплайсинга РНК . [ 11 ]
Структурные и функциональные исследования 2OG-оксигеназ
[ редактировать ]2- оксоглутарат (2OG)-зависимые оксигеназы представляют собой суперсемейство негемовых железозависимых оксигеназ . [ 35 ] большинство из них используют промежуточный продукт цикла Кребса , 2OG , в качестве ко-субстрата . [ 36 ] Группа заинтересована в понимании этих ферментов. [ 37 ] за их способность катализировать синтетически сложные или «невозможные» реакции ( например, гидроксилирование стереоселективное неактивированных углерод -водородных связей), за их разнообразную физиологическую роль, [ 8 ] и за их связь с болезнями. [ 38 ] Исследование сосредоточено на членах семьи, которые связаны с заболеванием или могут быть направлены на лечение заболевания. [ 39 ] [ 40 ] Методы, используемые в этом междисциплинарном исследовании, включают протеомику , [ 41 ] рентгеновская кристаллография , [ 42 ] спектроскопия ядерного магнитного резонанса (ЯМР), [ 43 ] [ 44 ] [ 45 ] [ 46 ] [ 47 ] биологическая масс-спектрометрия , [ 48 ] молекулярная биология , [ 49 ] кинетика ферментов , [ 50 ] [ 51 ] динамическая комбинаторная химия, направленная на белки [ 52 ] [ 53 ] и органический синтез / медицинская химия . [ 54 ] [ 55 ]
Антибиотики: биосинтез и механизмы устойчивости
[ редактировать ]Большинство клинически используемых антибиотиков основаны на натуральных продуктах . [ 5 ] Наиболее важное семейство антибиотиков содержит β-лактамное кольцо и включает пенициллин , [ 56 ] цефалоспорин , клуб , [ 57 ] и карбапенем [ 58 ] антибиотики . Биосинтетическая работа группы сосредоточена на клавамах. [ 59 ] и карбапенемы , [ 58 ] особое внимание уделяется механизму и структуре ферментов, которые катализируют химически «интересные» стадии. [ 60 ] [ 61 ] Самой большой угрозой для дальнейшего использования β-лактамных антибиотиков является устойчивость бактерий. Шофилд в настоящее время работает над разработкой и синтезом ингибиторов ферментов. [ 62 ] [ 63 ] [ 64 ] [ 65 ] для металло -β-лактамаз [ 66 ] – отсутствуют клинически используемые ингибиторы [ 67 ] из этих ферментов, но они представляют значительную угрозу, поскольку катализируют гидролиз почти всех клинически используемых β-лактамных антибиотиков . [ 68 ] Особый интерес представляют металло- β-лактамазы человека , имеющие одну и ту же структуру. [ 69 ]
Награды и почести
[ редактировать ]2015–2020: Премия Wellcome Trust Advanced Investigator (совместно с сэром Питером Рэтклиффом)
2013: член Королевского общества (Лондон); [ 14 ] Член ЕМБО ; Член Королевского биологического общества Великобритании; Член Биохимического общества ; Член Общества экспериментальной биологии , Великобритания.
2012: Финалист - Научно-исследовательский совет по биотехнологиям и биологическим наукам «Новатор года». [ 70 ]
2011: Королевское химическое общество , Премия Джереми Ноулза, Великобритания; [ 71 ] Высоко цитируемые награды ( например , «Биохимический журнал» , «Биоорганическая и медицинская химия»).
2009–2014: PI ERC Advanced Investigator Grant SPA GA 2008 233240 (совместно с сэром Питером Рэтклиффом); Молекулярный механизм определения кислорода ферментами (MOOSE)
2000: член Королевского химического общества (Лондон).
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б «Кристофер Шофилд» . Оксфордский университет . Проверено 24 июля 2023 г.
- ^ Jump up to: а б «Дом – Группа Шофилд» . Оксфордский университет . Проверено 8 августа 2016 г.
- ^ Jump up to: а б «Профессор Крис Шофилд, FRS | Хартфордский колледж» . Оксфордский университет . Проверено 8 августа 2016 г.
- ^ Jump up to: а б с Чоудхури, Рашедуззаман; Секирник, Рок; Бриссетт, Найджел С.; Кройер, Тобиас; Хо, Цзя-хуа; Нг, Стэнли С.; Клифтон, Ян Дж.; Ге, Вэй; Кершоу, Надя Дж. (19 июня 2014 г.). «Рибосомальные оксигеназы структурно консервативны от прокариот до человека» . Природа . 510 (7505): 422–426. Бибкод : 2014Natur.510..422C . дои : 10.1038/nature13263 . ISSN 0028-0836 . ПМК 4066111 . ПМИД 24814345 .
- ^ Jump up to: а б Хамед, Рефаат Б.; Гомес-Кастелланос, Х. Рубен; Генри, Люк; Духо, Кристиан; Макдонаф, Майкл А.; Шофилд, Кристофер Дж. (10 декабря 2012 г.). «Ферменты биосинтеза β-лактамов». Отчеты о натуральных продуктах . 30 (1): 21–107. дои : 10.1039/C2NP20065A . ISSN 1460-4752 . ПМИД 23135477 .
- ^ Jump up to: а б с Шофилд, Кристофер Дж.; Рэтклифф, Питер Дж. (1 мая 2004 г.). «Ощущение кислорода с помощью HIF-гидроксилаз». Nature Reviews Молекулярно-клеточная биология . 5 (5): 343–354. дои : 10.1038/nrm1366 . ISSN 1471-0072 . ПМИД 15122348 . S2CID 6586977 .
- ^ Jump up to: а б Тиннес, Сирил С.; Англия, Кэтрин С.; Кавамура, Аканэ; Чоудхури, Рашедуззаман; Шофилд, Кристофер Дж.; Хопкинсон, Ричард Дж. (1 декабря 2014 г.). «Нацеливание на гистон-лизин-деметилазы – прогресс, проблемы и будущее» . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Механизмы регуляции генов . Метилирование: многогранная модификация – взгляд на транскрипцию и не только. 1839 (12): 1416–1432. дои : 10.1016/j.bbagrm.2014.05.009 . ПМК 4316176 . ПМИД 24859458 .
- ^ Jump up to: а б Хорита, Шойчиро; Скотти, Джон С.; Тиннес, Сирилл; Моттаги-Таромсари, Юсеф С.; Талхаммер, Армин; Ге, Вэй; Айк, ВэйШен; Лоэнарц, Кристоф; Шофилд, Кристофер Дж. (7 апреля 2015 г.). «Структура рибосомальной оксигеназы OGFOD1 дает представление о регио- и стереоселективности пролилгидроксилаз» . Структура . 23 (4): 639–652. дои : 10.1016/j.str.2015.01.014 . ПМЦ 4396695 . ПМИД 25728928 .
- ^ Jump up to: а б Чоудхури, Р; Макдонаф, Массачусетс; Мецинович, Дж; Лоэнарц, К; Флэшман, Э; Хьюитсон, Канзас; Домен, К ; Шофилд, CJ (июль 2009 г.). «Структурная основа связывания фактора, индуцируемого гипоксией, с кислородчувствительными пролилгидроксилазами» . Структура . 17 (7): 981–989. doi : 10.1016/j.str.2009.06.002 . ПМИД 19604478 .
- ^ Jump up to: а б Достопочтенный, Вай-Чинг; Уилсон, Майкл И.; Харлос, Карл; Кларидж, Тимоти Д.В.; Шофилд, Кристофер Дж.; Пью, Кристофер В.; Максвелл, Патрик Х.; Рэтклифф, Питер Дж.; Стюарт, Дэвид И. (27 июня 2002 г.). «Структурная основа распознавания гидроксипролина в HIF-1α pVHL». Природа . 417 (6892): 975–978. Бибкод : 2002Natur.417..975H . дои : 10.1038/nature00767 . ISSN 0028-0836 . ПМИД 12050673 . S2CID 4388644 .
- ^ Jump up to: а б Уэбби, Селия Дж.; Вольф, Александр; Громак, Наталья; Дрегер, Матиас; Крамер, Хольгер; Кесслер, Бенедикт; Нильсен, Майкл Л.; Шмитц, Коринна; Батлер, Даника С. (3 июля 2009 г.). «Jmjd6 катализирует лизил-гидроксилирование U2AF65, белка, связанного со сплайсингом РНК». Наука . 325 (5936): 90–93. Бибкод : 2009Sci...325...90W . дои : 10.1126/science.1175865 . hdl : 10033/78493 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 19574390 . S2CID 38938528 .
- ^ «ReOx Ltd - Оксфордское отделение для разработки новых лекарственных препаратов» . Проверено 8 августа 2016 г.
- ^ «SELECTBIO - Биография спикера эпигенетики» . СЕЛЕКТБИО . Проверено 8 августа 2016 г.
- ^ Jump up to: а б «Кристофер Шофилд» . royalsociety.org . Проверено 8 августа 2016 г.
- ^ Уилкинс, Сара Э.; Аббуд, Мартина И.; Хэнкок, Ребекка Л.; Шофилд, Кристофер Дж. (19 апреля 2016 г.). «Нацеливание на белок-белковые взаимодействия в системе HIF» . ХимМедХим . 11 (8): 773–786. дои : 10.1002/cmdc.201600012 . ISSN 1860-7187 . ПМЦ 4848768 . ПМИД 26997519 .
- ^ Яаккола, Пану; Моул, Дэвид Р.; Тиан, Я-Мин; Уилсон, Майкл И.; Гилберт, Джанин; Гаскелл, Саймон Дж.; Кригсхайм, Александр фон; Хебестрайт, Хольгер Ф.; Мухерджи, Мридул (20 апреля 2001 г.). «Нацеливание HIF-α на комплекс убиквитилирования фон Хиппеля-Линдау посредством O2-регулируемого гидроксилирования пролила» . Наука . 292 (5516): 468–472. Бибкод : 2001Sci...292..468J . дои : 10.1126/science.1059796 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 11292861 . S2CID 20914281 .
- ^ Эпштейн, Эндрю CR; Глидл, Джонатан М.; Макнил, Люк А.; Хьюитсон, Кирсти С.; О'Рурк, Джон; Моул, Дэвид Р.; Мухерджи, Мридул; Метцен, Эрик; Уилсон, Майкл И. (5 октября 2001 г.). «C. elegans EGL-9 и гомологи млекопитающих определяют семейство диоксигеназ, которые регулируют HIF путем гидроксилирования пролила» . Клетка . 107 (1): 43–54. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00507-4 . ПМИД 11595184 .
- ^ Ге, Вэй; Вольф, Александр; Фэн, Тяньшу; Хо, Цзя-хуа; Секирник, Рок; Зайер, Адам; Гранатино, Николас; Кокман, Мэтью Э.; Лоэнарц, Кристоф (1 декабря 2012 г.). «Катализируемое оксигеназой гидроксилирование рибосом происходит у прокариот и человека» . Химическая биология природы . 8 (12): 960–962. дои : 10.1038/nchembio.1093 . ISSN 1552-4450 . ПМЦ 4972389 . ПМИД 23103944 .
- ^ Тиан, Я-Мин; Да, Кар Кенг; Ли, Мён Гю; Эрикссон, Туула; Кесслер, Бенедикт М.; Крамер, Хольгер Б.; Эдельманн, Мариола Дж.; Уильям, Карстен; Пью, Кристофер В. (15 апреля 2011 г.). «Дифференциальная чувствительность сайтов гидроксилирования факторов, индуцируемых гипоксией, к ингибиторам гипоксии и гидроксилазы» . Журнал биологической химии . 286 (15): 13041–13051. дои : 10.1074/jbc.M110.211110 . ISSN 0021-9258 . ПМК 3075650 . ПМИД 21335549 .
- ^ Лоэнарц, Кристоф; Шофилд, Кристофер Дж. (1 марта 2008 г.). «Расширение химической биологии 2-оксоглутаратоксигеназ». Химическая биология природы . 4 (3): 152–156. дои : 10.1038/nchembio0308-152 . ISSN 1552-4450 . ПМИД 18277970 .
- ^ Макдонаф, Майкл А.; Ли, Вивиан; Флэшман, Эмили; Чоудхури, Рашедуззаман; Мор, Кристофер; Льенар, Бенуа MR; Зондло, Джеймс; Олдхэм, Нил Дж.; Клифтон, Ян Дж. (27 июня 2006 г.). «Клеточное восприятие кислорода: кристаллическая структура индуцируемого гипоксией фактора пролилгидроксилазы (PHD2)» . Труды Национальной академии наук . 103 (26): 9814–9819. Бибкод : 2006PNAS..103.9814M . дои : 10.1073/pnas.0601283103 . ISSN 0027-8424 . ПМК 1502536 . ПМИД 16782814 .
- ^ Ян, Мин; Чоудхури, Рашедуззаман; Ге, Вэй; Хамед, Рефаат Б.; Макдонаф, Майкл А.; Кларидж, Тимоти Д.В.; Кесслер, Бенедикт М.; Кокман, Мэтью Э.; Рэтклифф, Питер Дж. (1 апреля 2011 г.). «Фактор, ингибирующий индуцируемый гипоксией фактор (FIH), катализирует посттрансляционное гидроксилирование гистидинильных остатков в повторяющихся доменах анкирина» . Журнал ФЭБС . 278 (7): 1086–1097. дои : 10.1111/j.1742-4658.2011.08022.x . ISSN 1742-4658 . ПМЦ 3569879 . ПМИД 21251231 .
- ^ Лэнгли, Гарет В.; Бринкё, Энн; Мюнцель, Мартин; Уолпорт, Луиза Дж.; Шофилд, Кристофер Дж.; Хопкинсон, Ричард Дж. (25 ноября 2015 г.). «Анализ деметилирования, катализируемого деметилазой JmjC, с использованием геометрически ограниченных аналогов лизина» . АКС Химическая биология . 11 (3): 755–762. doi : 10.1021/acschembio.5b00738 . ПМИД 26555343 . S2CID 19124771 .
- ^ Уолпорт, Луиза Дж.; Хопкинсон, Ричард Дж.; Чоудхури, Рашедуззаман; Шиллер, Рэйчел; Ге, Вэй; Кавамура, Аканэ; Шофилд, Кристофер Дж. (23 июня 2016 г.). «Деметилирование аргинина катализируется подмножеством гистон-лизиндеметилаз JmjC» . Природные коммуникации . 7 : 11974. Бибкод : 2016NatCo...711974W . дои : 10.1038/ncomms11974 . ПМК 4931022 . ПМИД 27337104 .
- ^ Нг, Стэнли С.; Кавана, Кэтрин Л.; Макдонаф, Майкл А.; Батлер, Даника; Пилка, Ева С.; Лиенард, Бенуа MR; Брей, Джеймс Э.; Савицкий, Павел; Гилеади, Офер (5 июля 2007 г.). «Кристаллические структуры деметилазы гистонов JMJD2A раскрывают основу субстратной специфичности». Природа . 448 (7149): 87–91. Бибкод : 2007Natur.448...87N . дои : 10.1038/nature05971 . ISSN 0028-0836 . ПМИД 17589501 . S2CID 4331492 .
- ^ Кавамура, Аканэ; Лоэнарц, Кристоф; Шофилд, Кристофер Дж. (1 сентября 2011 г.). «Мутации метаболических ферментов при раке предвещают необходимость объединения генетики и биохимии» . Клеточный цикл . 10 (17): 2819–2820. дои : 10.4161/cc.10.17.16745 . ISSN 1538-4101 . ПМИД 21857150 .
- ^ Ротили, Данте; Томасси, Стефано; Конте, Мариаросария; Бенедетти, Розария; Торторичи, Марчелло; Чоссани, Джузеппе; Валенте, Серджио; Маррокко, Бьягина; Лабелла, Донателла (19 декабря 2013 г.). «Ингибиторы пангистоновой деметилазы, одновременно воздействующие на Jumonji C и лизин-специфичные деметилазы, проявляют высокую противораковую активность». Журнал медицинской химии . 57 (1): 42–55. дои : 10.1021/jm4012802 . hdl : 11573/542432 . ПМИД 24325601 .
- ^ Круденье, Лоуренс; Чунг, Чун-ва; Ченг, Чжунцзюнь; Лиддл, Джон; Ты, КаХинг; Джоберти, Джерард; Банщефф, Маркус; Бунтра, Час; Бриджес, Анджела (16 августа 2012 г.). «Селективный ингибитор деметилазы jumonji H3K27 модулирует провоспалительную реакцию макрофагов» . Природа 488 (7411): 404–408. Бибкод : 2012Природа.488..404К . дои : 10.1038/nature11262 . ISSN 0028-0836 . ПМЦ 4691848 . ПМИД 22842901 .
- ^ Лершер, Лукас; Макдонаф, Майкл А.; Эль-Сахир, Афаф Х.; Талхаммер, Армин; Криаученис, Скирмантас; Браун, Том; Шофилд, Кристофер Дж. (23 января 2014 г.). «Структурное понимание того, как 5-гидроксиметилирование влияет на связывание факторов транскрипции» . Химические коммуникации . 50 (15): 1794–1796. дои : 10.1039/C3CC48151D . ISSN 1364-548X . ПМИД 24287551 . S2CID 6489226 .
- ^ Черч, Крис; Ли, Шина; Бэгг, Элеонора А.Л.; МакТаггарт, Джеймс С.; Дьякон, Роберт; Геркен, Томас; Ли, Анджела; Мойр, Ли; Мечинович, Жасмин (14 августа 2009 г.). «Мышиная модель метаболического воздействия жировой массы человека и гена FTO, связанного с ожирением» . ПЛОС Генет . 5 (8): e1000599. дои : 10.1371/journal.pgen.1000599 . ISSN 1553-7404 . ПМЦ 2719869 . ПМИД 19680540 .
- ^ Айк, ВэйШен; Деметриадес, Марина; Хамдан, Мухаммад К.К.; Бэгг, Элеонора. АЛ; Да, Кар Кенг; Лежен, Кларисса; Чжан, Чжихун; Макдонаф, Майкл А.; Шофилд, Кристофер Дж. (23 апреля 2013 г.). «Структурная основа ингибирования жировой массы и белка, связанного с ожирением (FTO)». Журнал медицинской химии . 56 (9): 3680–3688. дои : 10.1021/jm400193d . ПМИД 23547775 .
- ^ Геркен, Томас; Жирар, Кристоф А.; Тунг, И-Чун Лорейн; Уэбби, Селия Дж.; Саудек, Владимир; Хьюитсон, Кирсти С.; Йо, Джайлз Ш.; Макдонаф, Майкл А.; Канлифф, Шэрон (30 ноября 2007 г.). «Ген FTO, связанный с ожирением, кодирует 2-оксоглутарат-зависимую деметилазу нуклеиновых кислот» . Наука . 318 (5855): 1469–1472. Бибкод : 2007Sci...318.1469G . дои : 10.1126/science.1151710 . ISSN 0036-8075 . ПМЦ 2668859 . ПМИД 17991826 .
- ^ Черч, Крис; Ли, Шина; Бэгг, Элеонора А.Л.; МакТаггарт, Джеймс С.; Дьякон, Роберт; Геркен, Томас; Ли, Анджела; Мойр, Ли; Мечинович, Жасмин (14 августа 2009 г.). «Мышиная модель метаболического воздействия жировой массы человека и гена FTO, связанного с ожирением» . ПЛОС Генет . 5 (8): e1000599. дои : 10.1371/journal.pgen.1000599 . ISSN 1553-7404 . ПМЦ 2719869 . ПМИД 19680540 .
- ^ Мантри, Моника; Кройер, Тобиас; Бэгг, Элеонора А.; Уэбби, Селия Дж.; Батлер, Даника С.; Кочан, Гражина; Кавана, Кэтрин Л.; Опперманн, Удо; Макдонаф, Майкл А. (13 августа 2010 г.). «Кристаллическая структура 2-оксоглутарат- и Fe(II)-зависимой лизилгидроксилазы JMJD6». Журнал молекулярной биологии . 401 (2): 211–222. дои : 10.1016/j.jmb.2010.05.054 . ПМИД 20685276 .
- ^ Клифтон, Ян Дж.; Макдонаф, Майкл А.; Эрисманн, Доминик; Кершоу, Надя Дж.; Гранатино, Николас; Шофилд, Кристофер Дж. (1 апреля 2006 г.). «Структурные исследования 2-оксоглутаратоксигеназ и родственных им двунитевых белков сгиба β-спирали». Журнал неорганической биохимии . Промежуточные соединения высоковалентного железа в биологии. Промежуточные соединения высоковалентного железа в биологии. 100 (4): 644–669. дои : 10.1016/j.jinorgbio.2006.01.024 . ПМИД 16513174 .
- ^ Велфорд, Ричард В.Д.; Киркпатрик, Джоанна М.; Макнил, Люк А.; Пури, Муниш; Олдхэм, Нил Дж.; Шофилд, Кристофер Дж. (5 декабря 2005 г.). «Исправление к «Включение кислорода в сукцинатный побочный продукт железо(II) и 2-оксоглутарат-зависимых оксигеназ бактерий, растений и человека (FEBS 29930)» [FEBS Lett. 579 (2005) 5170–5174]» . Письма ФЭБС . 579 (29): 6688. doi : 10.1016/j.febslet.2005.11.001 . hdl : 10536/DRO/DU:30095401 . ISSN 1873-3468 .
- ^ Лоэнарц, Кристоф; Мецинович, Жасмин; Чоудхури, Рашедуззаман; Макнил, Люк А.; Флэшман, Эмили; Шофилд, Кристофер Дж. (23 февраля 2009 г.). «Доказательства стереоэлектронного эффекта при измерении кислорода у человека». Angewandte Chemie, международное издание . 48 (10): 1784–1787. дои : 10.1002/anie.200805427 . ISSN 1521-3773 . ПМИД 19180614 .
- ^ Астути, Деви; Рикеттс, Кристофер Дж.; Чоудхури, Рашедуззаман; Макдонаф, Майкл А.; Нежно, Дин; Кирби, Гейл; Шлизио, Сюзанна; Кенчаппа, Раджаппа С.; Картер, Брюс Д. (1 февраля 2011 г.). «Анализ мутаций пролилгидроксилаз HIF (PHD/EGLN) у людей с признаками феохромоцитомы и предрасположенностью к почечно-клеточному раку» . Эндокринный рак . 18 (1): 73–83. дои : 10.1677/ERC-10-0113 . ISSN 1351-0088 . ПМК 3006001 . ПМИД 20959442 .
- ^ Роуз, Натан Р.; Макдонаф, Майкл А.; Кинг, Оливер Н.Ф.; Кавамура, Аканэ; Шофилд, Кристофер Дж. (14 июля 2011 г.). «Ингибирование 2-оксоглутаратзависимых оксигеназ». Обзоры химического общества . 40 (8): 4364–97. дои : 10.1039/C0CS00203H . ISSN 1460-4744 . ПМИД 21390379 .
- ^ Айк, ВэйШен; Скотти, Джон С.; Чхве, Хванхо; Гонг, Линчжи; Деметриадес, Марина; Шофилд, Кристофер Дж.; Макдонаф, Майкл А. (1 апреля 2014 г.). «Структура человеческой РНК N6-метиладениндеметилазы ALKBH5 дает представление о ее механизмах распознавания и деметилирования нуклеиновых кислот» . Исследования нуклеиновых кислот . 42 (7): 4741–4754. дои : 10.1093/nar/gku085 . ISSN 0305-1048 . ПМЦ 3985658 . ПМИД 24489119 .
- ^ Маккин, Мукрам М.; Крамер, Хольгер Б.; Чанг, Кай-Сюань; Коулман, Мэтью Л.; Хопкинсон, Ричард Дж.; Шофилд, Кристофер Дж.; Кесслер, Бенедикт М. (21 июля 2010 г.). «Ингибирование деметилирования гистонов в клетках на основе малых молекул, оцененное с помощью количественной масс-спектрометрии» . Журнал исследований протеома . 9 (8): 4082–4092. дои : 10.1021/pr100269b . ПМК 4681095 . ПМИД 20583823 .
- ^ Клифтон, Ян Дж.; Сюэ, Ли-Цзин; Болдуин, Джек Э.; Харлос, Карл; Шофилд, Кристофер Дж. (15 декабря 2001 г.). «Строение пролин-3-гидроксилазы» . Европейский журнал биохимии . 268 (24): 6625–6636. дои : 10.1046/j.0014-2956.2001.02617.x . ISSN 1432-1033 . ПМИД 11737217 .
- ^ Мбенза Н.М., Вадаккедат П.Г., Макгилливрей DJ, Люнг И.К. (декабрь 2017 г.). «ЯМР-исследования негемовых Fe (II) и 2-оксоглутарат-зависимых оксигеназ». Дж. Неорг. Биохим . 177 : 384–394. дои : 10.1016/j.jinorgbio.2017.08.032 . ПМИД 28893416 .
- ^ Хан А., Лесняк Р.К., Брем Дж., Рыдзик А.М., Чой Х., Люнг И.К., Макдонаф М.А., Шофилд С.Дж., Кларидж Т.Д. (февраль 2016 г.). «Разработка и применение методов ЯМР-скрининга на основе лигандов для γ-бутиробетаингидроксилазы» . Мед. хим. Коммун . 7 (5): 873–880. дои : 10.1039/C6MD00004E . hdl : 2292/30083 .
- ^ Люнг И.К., Деметриадес М., Харди А.П., Лежен С., Смарт Т.Дж., Сёллёсси А., Кавамура А., Шофилд С.Дж., Кларидж Т.Д. (январь 2013 г.). «Метод ЯМР-скрининга репортерных лигандов на наличие ингибиторов 2-оксоглутаратоксигеназы» . Дж. Мед. Хим . 56 (2): 547–555. дои : 10.1021/jm301583m . ПМЦ 4673903 . ПМИД 23234607 .
- ^ Люнг И.К., Флэшман Э., Йео К.К., Шофилд С.Дж., Кларидж Т.Д. (январь 2010 г.). «Использование релаксации воды в растворителе ЯМР для исследования взаимодействий связывания металлофермента и лиганда». Дж. Мед. Хим . 53 (2): 867–875. дои : 10.1021/jm901537q . ПМИД 20025281 .
- ^ Рыдзик А.М., Люнг И.К., Талхаммер А., Кочан Г.Т., Кларидж Т.Д., Шофилд С.Дж. (февраль 2014 г.). «Фторметилированные производные промежуточных продуктов биосинтеза карнитина - синтез и применение» . хим. Коммун . 50 (10): 1175–1177. дои : 10.1039/c3cc47581f . ПМИД 24317009 .
- ^ Мецинович, Жасмин; Чоудхури, Рашедуззаман; Флэшман, Эмили; Шофилд, Кристофер Дж. (15 октября 2009 г.). «Использование масс-спектрометрии для исследования нуклеофильности цистеинильных остатков домена 2 пролилгидроксилазы». Аналитическая биохимия . 393 (2): 215–221. дои : 10.1016/j.ab.2009.06.029 . ПМИД 19563769 .
- ^ Тан, Суат Ченг; Карр, Кэролайн А.; Да, КарХенг; Шофилд, Кристофер Дж.; Дэвис, Кей Э.; Кларк, Киран (1 апреля 2012 г.). «Идентификация действительных генов домашнего хозяйства для количественного RT-PCR анализа клеток кардиосферного происхождения, предварительно кондиционированных в условиях гипоксии или ингибиторов пролил-4-гидроксилазы» . Отчеты по молекулярной биологии . 39 (4): 4857–4867. дои : 10.1007/s11033-011-1281-5 . ISSN 0301-4851 . ПМК 3294216 . ПМИД 22065248 .
- ^ Рыдзик А.М., Люнг И.К., Кочан Г.Т., Талхаммер А., Опперманн Ю., Кларидж Т.Д., Шофилд С.Дж. (июль 2012 г.). «Разработка и применение флуоресцентного анализа γ-бутиробетаингидроксилазы на основе обнаружения фторида». ХимБиоХим . 13 (11): 1559–1563. дои : 10.1002/cbic.201200256 . ПМИД 22730246 . S2CID 13956474 .
- ^ Флэшман, Эмили; Бэгг, Элеонора А.Л.; Чоудхури, Рашедуззаман; Мецинович, Жасмин; Лоэнарц, Кристоф; Макдонаф, Майкл А.; Хьюитсон, Кирсти С.; Шофилд, Кристофер Дж. (15 февраля 2008 г.). «Кинетическое обоснование селективности по отношению к N- и C-концевым кислородзависимым субстратам домена деградации, опосредованной петлевой областью индуцируемого гипоксией фактора пролилгидроксилазы» . Журнал биологической химии . 283 (7): 3808–3815. дои : 10.1074/jbc.M707411200 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 18063574 .
- ^ Деметриадес М., Люнг И.К., Чоудхури Р., Чан М.К., Макдоно М.А., Йео К.К., Тиан Ю.М., Кларидж Т.Д., Рэтклифф П.Дж., Вун Э.К., Шофилд С.Дж. (июль 2012 г.). «Динамическая комбинаторная химия с использованием бороновых кислот / боронатных эфиров приводит к созданию мощных ингибиторов оксигеназы». Энджью. хим. Межд. Эд . 51 (27): 6672–6675. дои : 10.1002/anie.201202000 . ПМИД 22639232 .
- ^ Люнг И.К., Браун Т.младший, Шофилд С.Дж., Кларидж Т.Д. (март 2011 г.). «Подход к ингибированию ферментов с использованием обратимого образования боронатного эфира». Мед. хим. Коммун . 2 (5): 390–395. дои : 10.1039/C1MD00011J .
- ^ Чан, Мун Чан; Атасойлу, Онур; Ходсон, Эмма; Тамбер, Энтони; Люнг, Айвенго К.Х.; Чоудхури, Рашедуззаман; Гомес-Перес, Вероника; Деметриадес, Марина; Рыдзик, Анна М. (6 июля 2015 г.). «Мощные и селективные ингибиторы на основе триазола фактора пролилгидроксилазы, индуцируемого гипоксией, с активностью в мозге мышей» . ПЛОС ОДИН . 10 (7): e0132004. Бибкод : 2015PLoSO..1032004C . дои : 10.1371/journal.pone.0132004 . ISSN 1932-6203 . ПМЦ 4492579 . ПМИД 26147748 .
- ^ Тиннес, CC; Тамбер, А.; Япп, К.; Скоццафава, Г.; Ага, Т.; Чан, MC; Тран, Т.А.; Сюй, К.; Тархонская, Х. (8 октября 2015 г.). «Реакция Бетти позволяет эффективно синтезировать 8-гидроксихинолиновые ингибиторы 2-оксоглутаратоксигеназы». Химические коммуникации . 51 (84): 15458–15461. дои : 10.1039/C5CC06095H . ISSN 1364-548X . ПМИД 26345662 .
- ^ ван Беркель, Сандер С.; Неттлшип, Джоан Э.; Люнг, Айвенго К.Х.; Брем, Юрген; Чхве, Хванхо; Стюарт, Дэвид И.; Кларидж, Тимоти Д.В.; Макдонаф, Майкл А.; Оуэнс, Рэймонд Дж. (15 августа 2013 г.). «Связывание (5 S )-пенициллиновой кислоты с пенициллинсвязывающим белком 3». АКС Химическая биология . 8 (10): 2112–2116. дои : 10.1021/cb400200h . ПМИД 23899657 .
- ^ Маккензи, Аласдер К.; Кершоу, Надя Дж.; Эрнандес, Хелена; Робинсон, Кэрол В.; Шофилд, Кристофер Дж.; Андерссон, Ингер (19 января 2007 г.). «Дегидрогеназа клавулановой кислоты: структурный и биохимический анализ заключительного этапа биосинтеза ингибитора β-лактамазы клавулановой кислоты †, ‡». Биохимия . 46 (6): 1523–1533. дои : 10.1021/bi061978x . ПМИД 17279617 .
- ^ Jump up to: а б Боровский, Томаш; Броцлавик, Ева; Шофилд, Кристофер Дж.; Зигбан, Per EM (30 апреля 2006 г.). «Эпимеризация и десатурация карбапенемсинтазой (CarC). Гибридное исследование DFT» . Журнал вычислительной химии . 27 (6): 740–748. дои : 10.1002/jcc.20384 . ISSN 1096-987X . ПМИД 16521121 . S2CID 21775977 .
- ^ Маккензи, Аласдер К.; Валегард, Карин; Икбал, Аман; Кейнс, Мэтью ЕС; Кершоу, Надя Дж.; Дженсен, Сьюзен Э.; Шофилд, Кристофер Дж.; Андерссон, Ингер (19 февраля 2010 г.). «Кристаллические структуры олигопептидсвязывающего белка биосинтетического пути ингибитора β-лактамаз клавулановой кислоты». Журнал молекулярной биологии . 396 (2): 332–344. дои : 10.1016/j.jmb.2009.11.045 . ПМИД 19941870 .
- ^ Лонг, Александра Дж.; Клифтон, Ян Дж.; Роуч, Питер Л.; Болдуин, Джек Э.; Шофилд, Кристофер Дж.; Ратледж, Питер Дж. (15 июня 2003 г.). «Структурные исследования реакции изопенициллин-N-синтазы с аналогом субстрата дельта-(l-альфа-аминоадипоил)-l-цистеинил-d-альфа-аминобутират» . Биохимический журнал . 372 (3): 687–693. дои : 10.1042/bj20021627 . ISSN 0264-6021 . ПМЦ 1223433 . ПМИД 12622704 .
- ^ Слиман, Марк С; Маккиннон, Колин Х; Хьюитсон, Кирсти С; Шофилд, Кристофер Дж (25 февраля 2002 г.). «Ферментативный синтез моноциклических β-лактамов». Письма по биоорганической и медицинской химии . 12 (4): 597–599. дои : 10.1016/S0960-894X(01)00806-X . ПМИД 11844680 .
- ^ Льенар, Бенуа MR; Хютинг, Ребекка; Лассо, Патрисия; Галлени, Морено; Брат Жан-Мари; Шофилд, Кристофер Дж. (19 января 2008 г.). «Динамическая комбинаторная масс-спектрометрия приводит к ингибиторам металло-β-лактамаз». Журнал медицинской химии . 51 (3): 684–688. дои : 10.1021/jm070866g . ПМИД 18205296 .
- ^ Брем, Юрген; Беркель, Сандер С. ван; Золлман, Дэвид; Ли, Сук Ю.; Галаади, Офер; Макхью, Питер Дж.; Уолш, Тимоти Р.; Макдонаф, Майкл А.; Шофилд, Кристофер Дж. (1 января 2016 г.). «Структурные основы ингибирования металло-β-лактамаз стереоизомерами каптоприла» . Антимикробные средства и химиотерапия . 60 (1): 142–150. дои : 10.1128/AAC.01335-15 . ISSN 0066-4804 . ПМК 4704194 . ПМИД 26482303 .
- ^ Льенар, Бенуа MR; Хорсфолл, Луиза Э.; Галлени, Морено; Брат Жан-Мари; Шофилд, Кристофер Дж. (15 февраля 2007 г.). «Ингибиторы металло-β-лактамазы СЭЗ-1». Письма по биоорганической и медицинской химии . 17 (4): 964–968. дои : 10.1016/j.bmcl.2006.11.053 . ПМИД 17157014 .
- ^ Брем, Юрген; Каин, Рики; Кэхилл, Сэмюэл; Макдонаф, Майкл А.; Клифтон, Ян Дж.; Хименес-Кастелланос, Хуан-Карлос; Ависон, Мэтью Б.; Спенсер, Джеймс; Фишвик, Колин В.Г. (8 августа 2016 г.). «Структурные основы ингибирования металло-β-лактамаз, серин-β-лактамаз и пенициллинсвязывающего белка циклическими боронатами» . Природные коммуникации . 7 : 12406. Бибкод : 2016NatCo...712406B . дои : 10.1038/ncomms12406 . ПМК 4979060 . ПМИД 27499424 .
- ^ Макена, Энн; Дюзгюн, Азер О; Брем, Юрген; Макдонаф, Майкл А.; Рыдзик, Анна М.; Аббуд, Мартина И.; Сарал, Айшегюль; Чичек, Айшегюль Ч; Сандалли, Джемаль (1 марта 2016 г.). «Сравнение вариантов металло-β-лактамаз (VIM), переносимых интеграном Вероны, выявляет различия в профилях стабильности и ингибирования» . Антимикробные средства и химиотерапия . 60 (3): 1377–1384. дои : 10.1128/AAC.01768-15 . ISSN 0066-4804 . ПМЦ 4775916 . ПМИД 26666919 .
- ^ Аббуд, Мартина И.; Дамблон, Кристиан; Брем, Юрген; Смаргьяссо, Николя; Меркури, Паола; Гилберт, Бернард; Рыдзик, Анна М.; Кларидж, Тимоти Д.В.; Шофилд, Кристофер Дж. (11 июля 2016 г.). «Взаимодействие авибактама с металло-β-лактамазами класса B» . Антимикробные средства и химиотерапия . 60 (10): AAC.00897–16. дои : 10.1128/AAC.00897-16 . ISSN 0066-4804 . ПМК 5038302 . ПМИД 27401561 .
- ^ Макена, Энн; Брем, Юрген; Пфеффер, Инга; Геффен, Ребекка Э.Дж.; Уилкинс, Сара Э.; Тархонская, Ханна; Флэшман, Эмили; Фи, Линетт М.; Уэрхэм, Дэвид В. (1 февраля 2015 г.). «Биохимическая характеристика вариантов металло-β-лактамаз Нью-Дели выявляет различия в стабильности белков» . Журнал антимикробной химиотерапии . 70 (2): 463–469. дои : 10.1093/jac/dku403 . ISSN 0305-7453 . ПМЦ 4291237 . ПМИД 25324420 .
- ^ Петтинати, Илария; Брем, Юрген; Макдонаф, Майкл А.; Шофилд, Кристофер Дж. (1 мая 2015 г.). «Кристаллическая структура персульфиддиоксигеназы человека: структурная основа этилмалоновой энцефалопатии» . Молекулярная генетика человека . 24 (9): 2458–2469. дои : 10.1093/hmg/ddv007 . ISSN 0964-6906 . ПМЦ 4383860 . ПМИД 25596185 .
- ^ Совет по исследованиям в области биотехнологий и биологических наук. «Исследовательская консультативная группа – BBSRC» . bbsrc.ac.uk . Проверено 25 февраля 2017 г. .
- ^ «Победитель премии Джереми Ноулза 2011 года» . rsc.org . Проверено 25 февраля 2017 г. .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- 1960 рождений
- Выпускники колледжа Святого Иоанна в Оксфорде
- Выпускники Института науки и технологий Манчестерского университета
- Британские химики
- Стипендиаты Хартфордского колледжа, Оксфорд
- Члены Королевского общества
- Члены Королевского химического общества
- Люди, получившие образование в колледже Святого Ансельма
- Живые люди