Чтение

Spink5
Доступные структуры PDB Поиск ортолога: PDBE RCSB showСписок кодов идентификаторов PDB 1H0Z, 1HDL, 1UUC, 1UVF, 1UVG
Идентификаторы
Псевдонимы	SPINK5 , LEKTI, LETKI, NETS, NS, VAKTI, serine peptidase inhibitor, Kazal type 5, serine peptidase inhibitor Kazal type 5
Внешние идентификаторы	Омим : 605010 ; MGI : 1919682 ; Гомологен : 4987 ; GeneCards : Spink5 ; OMA : Spink5 - ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 5 (human) Band 5q32 Start 148,025,683 bp End 148,137,382 bp
showGene location (Mouse) Chr. Chromosome 18 (mouse) Band 18 B3|18 23.74 cM Start 44,096,302 bp End 44,155,568 bp
showRNA expression pattern Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in vulva gums skin of thigh gingival epithelium oral cavity mucosa of pharynx human penis skin of hip skin of arm body of tongue Top expressed in skin of abdomen esophagus skin of external ear lip skin of back prostate lobe of prostate belly cord left lung lobe stomach More reference expression data BioGPS More reference expression data
showGene ontology Molecular function peptidase inhibitor activity serine-type endopeptidase inhibitor activity Cellular component cytoplasm cytosol endoplasmic reticulum membrane cell cortex endoplasmic reticulum perinuclear region of cytoplasm epidermal lamellar body extracellular region intracellular membrane-bounded organelle Biological process epidermal cell differentiation negative regulation of proteolysis negative regulation of serine-type peptidase activity negative regulation of peptidase activity epithelial cell differentiation hair cell differentiation extracellular matrix organization negative regulation of antibacterial peptide production negative regulation of immune response regulation of cell adhesion negative regulation of angiogenesis negative regulation of serine-type endopeptidase activity regulation of T cell differentiation cornification regulation of timing of anagen Sources:Amigo / QuickGO
hideOrthologs Species Human Mouse Entrez 11005 72432 Ensembl ENSG00000133710 ENSMUSG00000055561 UniProt Q9NQ38 Q148R4 RefSeq (mRNA) NM_001127698 NM_001127699 NM_006846 NM_001081180 RefSeq (protein) NP_001121170 NP_001121171 NP_006837 NP_001074649 Location (UCSC) Chr 5: 148.03 – 148.14 Mb Chr 18: 44.1 – 44.16 Mb PubMed search
Wikidata
View/Edit Human View/Edit Mouse

Лимфоэпителиальный ингибитор, связанный с лимфоэпителиальным казалом (LEKTI), также известный как ингибитор сериновой протеазы казаль-тип 5 (Spink5), является белком , который у людей кодируется Spink5 геном .

Структура и функция

Lekti представляет собой большой многодомен сериновой протеазы, -ингибитор экспрессируемый в стратифицированной эпителиальной ткани. Он состоит из 15 доменов, которые расщепляются на более мелкие функциональные фрагменты протеазой фурином . Только два из этих доменов (2 и 15) содержат 6 равномерно расположенных цистеинов, ответственных за 3 внутримолекулярных дисульфидных связей, характерных для ингибиторов, связанных с казальским типом . Остальные домены содержат 4 цистеина. Эти дисульфидные связи заставляют молекулу в жесткую конформацию, которая позволяет белке взаимодействовать с целевой протеазой через расширенную бета-лист . Все домены (за исключением 1, 2 и 15) содержат аргинин в P1, что указывает на трипсин, подобные протеазам, являются вероятными мишенями.

In the epidermis, LEKTI is implicated in the regulation of desquamation via its ability to selectively inhibit KLK5, KLK7 and KLK14. Recombinant full length LEKTI inhibits the exogenous serine proteases trypsin, plasmin, subtilisin A, cathepsin G and human neutrophil elastase.

LEKTI may play a role in skin and hair morphogenesis and anti-inflammatory and/or antimicrobial protection of mucous epithelia.

Gene

SPINK5 is a member of a gene family cluster located on chromosome 5q32, which encode inhibitors of serine proteases. This includes other epidermal proteins SPINK6 and LEKTI-2 (SPINK9). The SPINK5 gene is 61 kb in length and contains 33 exons. Alternative processing of SPINK5 results in the formation of three different gene products, which have been identified in differentiated keratinocytes.

Clinical significance

Mutations in the SPINK5 gene result in Netherton syndrome, a disorder characterized by ichthyosis and specific immune system defects.

See also

• Kazal-type serine protease inhibitor domain

Further reading

• Norgett EE, Kelsell DP (2002). "SPINK5: both rare and common skin disease". Trends in Molecular Medicine. 8 (1): 7. doi:10.1016/S1471-4914(01)02228-6. PMID 11796258.
• Mägert HJ, Kreutzmann P, Ständker L, et al. (2002). "LEKTI: a multidomain serine proteinase inhibitor with pathophysiological relevance". Int. J. Biochem. Cell Biol. 34 (6): 573–6. doi:10.1016/S1357-2725(01)00179-0. PMID 11943586.
• Walden M, Kreutzmann P, Drögemüller K, et al. (2003). "Biochemical features, molecular biology and clinical relevance of the human 15-domain serine proteinase inhibitor LEKTI". Biol. Chem. 383 (7–8): 1139–41. doi:10.1515/BC.2002.124. PMID 12437098. S2CID 26084613.
• Chavanas S, Garner C, Bodemer C, et al. (2000). "Localization of the Netherton syndrome gene to chromosome 5q32, by linkage analysis and homozygosity mapping". Am. J. Hum. Genet. 66 (3): 914–21. doi:10.1086/302824. PMC 1288172. PMID 10712206.
• Chavanas S, Bodemer C, Rochat A, et al. (2000). "Mutations in SPINK5, encoding a serine protease inhibitor, cause Netherton syndrome". Nat. Genet. 25 (2): 141–2. doi:10.1038/75977. PMID 10835624. S2CID 40421711.
• Sprecher E, Chavanas S, DiGiovanna JJ, et al. (2001). "The spectrum of pathogenic mutations in SPINK5 in 19 families with Netherton syndrome: implications for mutation detection and first case of prenatal diagnosis". J. Invest. Dermatol. 117 (2): 179–87. doi:10.1046/j.1523-1747.2001.01389.x. PMID 11511292.
• Walley AJ, Chavanas S, Moffatt MF, et al. (2001). "Gene polymorphism in Netherton and common atopic disease". Nat. Genet. 29 (2): 175–8. doi:10.1038/ng728. PMID 11544479. S2CID 20292050.
• Ahmed A, Kandola P, Ziada G, Parenteau N (2002). "Purification and partial amino acid sequence of proteins from human epidermal keratinocyte conditioned medium". J. Protein Chem. 20 (4): 273–8. doi:10.1023/A:1010902815953. PMID 11594460. S2CID 11877191.
• Bitoun E, Chavanas S, Irvine AD, et al. (2002). "Netherton syndrome: disease expression and spectrum of SPINK5 mutations in 21 families". J. Invest. Dermatol. 118 (2): 352–61. doi:10.1046/j.1523-1747.2002.01603.x. PMID 11841556.
• Komatsu N, Takata M, Otsuki N, et al. (2002). "Elevated stratum corneum hydrolytic activity in Netherton syndrome suggests an inhibitory regulation of desquamation by SPINK5-derived peptides". J. Invest. Dermatol. 118 (3): 436–43. doi:10.1046/j.0022-202x.2001.01663.x. hdl:2297/15796. PMID 11874482.
• Bitoun E, Micheloni A, Lamant L, et al. (2004). "LEKTI proteolytic processing in human primary keratinocytes, tissue distribution and defective expression in Netherton syndrome". Hum. Mol. Genet. 12 (19): 2417–30. doi:10.1093/hmg/ddg247. PMID 12915442.
• Nishio Y, Noguchi E, Shibasaki M, et al. (2004). "Association between polymorphisms in the SPINK5 gene and atopic dermatitis in the Japanese". Genes Immun. 4 (7): 515–7. doi:10.1038/sj.gene.6363889. PMID 14551605.
• Raghunath M, Tontsidou L, Oji V, et al. (2004). "SPINK5 and Netherton syndrome: novel mutations, demonstration of missing LEKTI, and differential expression of transglutaminases". J. Invest. Dermatol. 123 (3): 474–83. doi:10.1111/j.0022-202X.2004.23220.x. PMID 15304086.
• Tidow H, Lauber T, Vitzithum K, et al. (2004). "The solution structure of a chimeric LEKTI domain reveals a chameleon sequence" (PDF). Biochemistry. 43 (35): 11238–47. doi:10.1021/bi0492399. PMID 15366933.
• Ян Т., Лян Д., Кох П.Дж. и др. (2004). «Эпидермальная отряд, десмосомная диссоциация и дестабилизация корнеодесмозина у мышей Spink5-/- . Гены Дев . 18 (19): 2354–8. doi : 10.1101/gad.1232104 . PMC   522985 . PMID   15466487 .
• Ишида-Ямамото А., Дерайсон С., Боннарт С. и др. (2005). «Lekti локализован в пластинчатых гранулах, отделен от KLK5 и KLK7 и секретируется во внеклеточных пространствах поверхностного гранулозума» . J. Invest. Дерматол . 124 (2): 360–6. doi : 10.1111/j.0022-202x.2004.23583.x . PMID   15675955 .

Внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для Uniprot : Q9NQ38 (ингибитор сериновой протеазы Казал 5) в PDBE-KB .