перетасовка ДНК

Перетасовка ДНК , также известная как молекулярная селекция, представляет собой метод случайной рекомбинации in vitro , позволяющий генерировать мутантные гены для направленной эволюции и обеспечивать быстрое увеличение размера библиотеки ДНК . [ 1 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] Тремя процедурами для осуществления перетасовки ДНК являются молекулярное скрещивание, основанное на гомологичной рекомбинации или сходстве последовательностей ДНК, ферменты рестрикции , основанные на общих сайтах рестрикции , и негомологичная случайная рекомбинация, требующая использования шпилек . [ 1 ] Во всех этих методах родительские гены фрагментируются, а затем рекомбинируются. [ 1 ] [ 4 ]
Перетасовка ДНК использует случайную рекомбинацию в отличие от сайт-направленного мутагенеза для создания белков с уникальными свойствами или комбинациями желаемых характеристик, закодированных в родительских генах, таких как термостабильность и высокая активность. [ 1 ] [ 8 ] Потенциал перетасовки ДНК для производства новых белков иллюстрируется рисунком, показанным справа, который демонстрирует разницу между точечными мутациями, инсерциями и делециями, а также перетасовкой ДНК. [ 1 ] В частности, на этом рисунке показано использование перетасовки ДНК в двух родительских генах, что позволяет генерировать рекомбинантные белки, имеющие случайную комбинацию последовательностей каждого родительского гена. [ 1 ] Это отличается от точечных мутаций , при которых один нуклеотид был изменен, вставлен или удален, а также от инсерций или делеций, при которых последовательность нуклеотидов была добавлена или удалена соответственно. [ 1 ] [ 2 ] В результате случайной рекомбинации перетасовка ДНК способна производить белки с новыми качествами или множеством полезных свойств, полученных от родительских генов. [ 1 ] [ 4 ]
В 1994 году Виллем Стеммер опубликовал первую статью о перетасовке ДНК. [ 7 ] С момента появления этого метода перетасовка ДНК стала применяться к белковым и низкомолекулярным фармацевтическим препаратам, биоремедиации , вакцинам , генной терапии и эволюционировавшим вирусам. [ 3 ] [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] Другие методы, которые дают результаты, аналогичные перетасовке ДНК, включают случайный химерагенез на временных матрицах (RACHITT), случайную печать, рекомбинацию in vitro (RPR) и процесс поэтапного удлинения (StEP). [ 4 ] [ 7 ] [ 13 ]
История
[ редактировать ]О перетасовке ДНК путем молекулярной селекции впервые сообщил в 1994 году Виллем Стеммер. [ 1 ] [ 7 ] Он начал с фрагментации гена β-лактамазы , который был амплифицирован с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР) с использованием ДНКазы I , которая случайным образом расщепляет ДНК. [ 14 ] [ 15 ] Затем он завершил модифицированную реакцию ПЦР, в которой не использовались праймеры , что привело к отжигу гомологичных фрагментов или фрагментов со схожими последовательностями. [ 14 ] Наконец, эти фрагменты амплифицировали с помощью ПЦР. [ 14 ] Стеммер сообщил, что использование перетасовки ДНК в сочетании с обратным скрещиванием привело к устранению несущественных мутаций и увеличению производства антибиотика цефотаксима . [ 14 ] Он также подчеркнул потенциал молекулярной эволюции при перетасовке ДНК. [ 16 ] В частности, он указал, что эту технику можно использовать для модификации белков. [ 16 ]
С тех пор перетасовку ДНК стали применять для создания библиотек гибридных или химерных генов , что послужило вдохновением для перетасовки семей, которая определяется как использование родственных генов при перетасовке ДНК. [ 17 ] [ 18 ] [ 19 ] Кроме того, перетасовка ДНК применялась к белковым и низкомолекулярным фармацевтическим препаратам, биоремедиации, генной терапии, вакцинам и эволюционировавшим вирусам. [ 3 ] [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] [ 20 ]
Процедуры
[ редактировать ]Молекулярная селекция
[ редактировать ]Во-первых, ДНКаза I используется для фрагментации набора родительских генов на сегменты двухцепочечной ДНК размером от 10-50 п.о. до более 1 т.п.н. [ 4 ] [ 16 ] Затем следует ПЦР без праймеров. [ 14 ] В ПЦР фрагменты ДНК с достаточно перекрывающимися последовательностями гибридизуются друг с другом, а затем удлиняются ДНК-полимеразой . [ 1 ] [ 4 ] [ 5 ] [ 7 ] [ 14 ] [ 16 ] [ 21 ] Расширение ПЦР не произойдет, если не будут обнаружены последовательности ДНК с высоким сходством. [ 1 ] Важными факторами, влияющими на последовательности, синтезируемые при перетасовке ДНК, являются ДНК-полимераза, концентрации солей и температура отжига. [ 10 ] Например, использование Taq-полимеразы для амплификации фрагмента размером 1 т.п.н. в ПЦР из 20 циклов приводит к тому, что от 33% до 98% продуктов содержат одну или несколько мутаций. [ 21 ]
Для амплификации фрагментов можно использовать несколько циклов расширения ПЦР. [ 1 ] [ 4 ] [ 5 ] [ 7 ] [ 14 ] [ 16 ] [ 21 ] Для дальнейшей амплификации последовательностей с помощью другой ПЦР добавляются праймеры, которые предназначены для комплементарности концам удлиненных фрагментов. [ 1 ] [ 14 ] [ 21 ] Праймеры могут быть выбраны так, чтобы к их 5'-концам были добавлены дополнительные последовательности, такие как последовательности для сайтов узнавания ферментов рестрикции , которые необходимы для лигирования в вектор клонирования . [ 1 ] [ 14 ]
Можно рекомбинировать части родительских генов для создания гибридов или химерных форм с уникальными свойствами, отсюда и термин «перетасовка ДНК». [ 22 ] Недостатком молекулярного скрещивания является требование сходства между последовательностями, что вдохновило на разработку других процедур перетасовки ДНК. [ 1 ]
Рестриктивные ферменты
[ редактировать ]Ферменты рестрикции используются для фрагментации родительских генов. [ 1 ] [ 21 ] Затем фрагменты соединяются вместе посредством лигирования, которое можно осуществить с помощью ДНК-лигазы . [ 1 ] Например, если два родительских гена имеют три сайта рестрикции, можно создать четырнадцать различных гибридов полноразмерных генов. [ 1 ] Количество уникальных полноразмерных гибридов определяется тем, что ген с тремя сайтами рестрикции может быть разбит на четыре фрагмента . [ 1 ] Таким образом, существует два варианта для каждой из четырех позиций за вычетом комбинаций, которые воссоздали бы два родительских гена, давая 2 4 - 2 = 14 различных полноразмерных гибридных генов . [ 1 ]
Основное различие между перетасовкой ДНК с помощью рестрикционных ферментов и молекулярным скрещиванием заключается в том, что молекулярное скрещивание основано на гомологии последовательностей для отжига цепей и ПЦР для удлинения, тогда как с помощью рестрикционных ферментов создаются концы фрагментов, которые можно лигировать. [ 1 ] Основные преимущества использования ферментов рестрикции включают контроль количества событий рекомбинации и отсутствие необходимости ПЦР-амплификации. [ 1 ] [ 23 ] Основным недостатком является необходимость наличия общих сайтов рестрикции. [ 1 ]
Негомологичная случайная рекомбинация
[ редактировать ]Для создания сегментов размером от 10-50 п.н. до более 1 т.п.н. используется ДНКаза I. [ 4 ] [ 16 ] [ 24 ] Концы фрагментов затупляются добавлением ДНК-полимеразы Т4. [ 1 ] [ 24 ] Затупление фрагментов важно для объединения фрагментов, поскольку несовместимые липкие концы или выступы предотвращают соединение концов. [ 1 ] [ 25 ] [ 26 ] Затем к смеси фрагментов добавляют шпильки со специфическим сайтом рестрикции. [ 1 ] [ 24 ] Затем ДНК-лигаза Т4 используется для лигирования фрагментов с образованием расширенных последовательностей. [ 1 ] [ 24 ] Лигирование шпилек с фрагментами ограничивает длину расширенных последовательностей, предотвращая добавление большего количества фрагментов. [ 1 ] Наконец, чтобы удалить шпильки, используется фермент рестрикции. [ 1 ] [ 24 ]
Негомологичная случайная рекомбинация отличается от молекулярного скрещивания, поскольку не требуется гомологии лигированных последовательностей, что является преимуществом. [ 1 ] Однако , поскольку этот процесс рекомбинирует фрагменты случайным образом, вполне вероятно, что большая часть рекомбинированных последовательностей ДНК не будет иметь желаемых характеристик, что является недостатком. [ 1 ] Негомологичная случайная рекомбинация также отличается от использования ферментов рестрикции для перетасовки ДНК, поскольку не требуются общие сайты ферментов рестрикции на родительских генах и необходимо использование шпилек, что демонстрирует преимущество и недостаток негомологичной случайной рекомбинации перед использованием ферментов рестрикции. соответственно. [ 1 ]
Приложения
[ редактировать ]Белковые и низкомолекулярные фармацевтические препараты
[ редактировать ]Поскольку перетасовка ДНК обеспечивает рекомбинацию генов, можно повысить активность белков. [ 3 ] [ 20 ] Например, перетасовка ДНК использовалась для повышения эффективности рекомбинантных интерферонов, отображаемых фагом, на клетках мыши и человека. [ 3 ] Кроме того, улучшение зеленого флуоресцентного белка (GFP) было достигнуто за счет перетасовки ДНК путем молекулярного скрещивания, поскольку был получен сигнал в 45 раз больший, чем стандарт для флуоресценции цельных клеток. [ 20 ] Более того, синтез разнообразных генов может также привести к производству белков с новыми свойствами. [ 1 ] Поэтому перетасовка ДНК использовалась для разработки белков для детоксикации химических веществ. [ 3 ] [ 27 ] Например, метод гомологичной рекомбинации перетасовки ДНК путем молекулярного скрещивания использовался для усиления детоксикации атразина и арсената . [ 3 ] [ 27 ]
Биоремедиация
[ редактировать ]Перетасовка ДНК также использовалась для улучшения разложения биологических загрязнителей. [ 12 ] [ 28 ] В частности, был создан рекомбинантный штамм E. coli с использованием перетасовки ДНК путем молекулярного скрещивания для биоремедиации трихлорэтилена (ТХЭ), потенциального канцерогена , который менее восприимчив к токсичным эпоксидным промежуточным соединениям. [ 12 ] [ 21 ] [ 28 ]
Вакцина
[ редактировать ]Возможность отбора желаемых рекомбинантов с помощью перетасовки ДНК использовалась в сочетании со стратегиями скрининга для улучшения кандидатов на вакцины против инфекций с упором на улучшение иммуногенности , производства вакцин, стабильности и перекрестной реактивности к множеству штаммов патогенов. [ 3 ] [ 10 ] некоторые вакцины-кандидаты против Plasmodium falciparum , вируса денге , энцефалитических альфавирусов (включая VEEV , WEEV и EEEV ), вируса иммунодефицита человека-1 (ВИЧ-1) и вируса гепатита B (HBV). Были исследованы [ 10 ]
Генная терапия и эволюционировавшие вирусы
[ редактировать ]Требования к генной терапии человека включают высокую чистоту, высокий титр и стабильность. [ 11 ] Перетасовка ДНК позволяет создавать ретровирусные векторы с этими атрибутами. [ 11 ] Например, перетасовка ДНК с помощью молекулярного селекции была применена к шести штаммам экотропного вируса мышиного лейкоза (MLV), что привело к составлению обширной библиотеки рекомбинантных ретровирусов и идентификации множественных клонов с повышенной стабильностью. [ 11 ] Кроме того, применение перетасовки ДНК путем молекулярного скрещивания на множественных векторах родительского аденоассоциированного вируса (AAV) было использовано для создания библиотеки из десяти миллионов химер. [ 29 ] Полученные преимущества включают повышенную устойчивость к внутривенному иммуноглобулину человека (ВВИГ) и продукцию клеточного тропизма в новых вирусах. [ 29 ]
Сравнение с другими методами
[ редактировать ]Хотя перетасовка ДНК стала полезным методом случайной рекомбинации, для этой цели также были разработаны другие методы, включая RACHITT, RPR и StEP. [ 4 ] [ 13 ] Ниже приведены некоторые преимущества и недостатки этих других методов рекомбинации. [ 4 ] [ 7 ] [ 13 ]
РАЧИТТ
[ редактировать ]В RACHITT фрагменты одноцепочечных (ss) родительских генов отжигаются на ss-матрице, что приводит к уменьшению несоответствия, что является преимуществом. [ 13 ] Кроме того, RACHIIT позволяет рекомбинировать гены с низким сходством последовательностей. [ 7 ] Однако основным недостатком является подготовка ss-фрагментов родительских генов и ss-матрицы. [ 7 ] [ 13 ]
РПР
[ редактировать ]RPR использует случайные праймеры. [ 30 ] Эти случайные праймеры отжигаются с ДНК-матрицей, а затем удлиняются фрагментом Кленова . [ 30 ] Затем матрицы удаляются, а фрагменты собираются по гомологии в процессе, аналогичном ПЦР. [ 30 ] Некоторые основные преимущества включают меньшую потребность в родительских генах из-за использования ss-матриц и увеличение разнообразия последовательностей из-за неправильного прайминга и неправильного включения. [ 7 ] [ 30 ] Одним из недостатков RPR является подготовка шаблона. [ 30 ]
Шаг
[ редактировать ]В StEP для создания полноразмерных последовательностей используются короткие циклы отжига праймера с матрицей и удлинения с помощью полимеразы. [ 31 ] [ 32 ] Основными преимуществами СтЭП являются простота метода и отсутствие очистки фрагментов. [ 7 ] [ 13 ] К недостаткам StEP можно отнести то, что он требует много времени и требует гомологии последовательностей. [ 7 ] [ 13 ]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с д и ж г час я дж к л м н тот п д р с т в v В х и С аа аб и объявление но из в ах есть Глик БР (2017). Молекулярная биотехнология: принципы и применение рекомбинантной ДНК . Шерил Л. Паттен (Пятое изд.). Вашингтон, округ Колумбия. ISBN 978-1-55581-936-1 . OCLC 975991667 .
{{cite book}}
: CS1 maint: отсутствует местоположение издателя ( ссылка ) - ^ Перейти обратно: а б Леви Т., Слуцкин А., Калифа Р., Ювен-Гершон Т., Герлиц О. (14 июля 2020 г.). «Эффективное введение точечных мутаций in vivo с использованием ssODN и подхода Co-CRISPR» . Биологические процедуры онлайн . 22 (1): 14. дои : 10.1186/s12575-020-00123-7 . ПМЦ 7362497 . ПМИД 32684853 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж г час я Паттен П.А., Ховард Р.Дж., Стеммер В.П. (декабрь 1997 г.). «Применение перетасовки ДНК в фармацевтических препаратах и вакцинах». Современное мнение в области биотехнологии . 8 (6): 724–733. дои : 10.1016/S0958-1669(97)80127-9 . ПМИД 9425664 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж г час я дж Чирино ПК, Цянь С. (01 января 2013 г.), Чжао Х (редактор), «Глава 2 - Белковая инженерия как дополнительный инструмент для синтетической биологии», Синтетическая биология , Бостон: Academic Press, стр. 23–42, doi : 10.1016/b978-0-12-394430-6.00002-9 , ISBN 978-0-12-394430-6
- ^ Перейти обратно: а б с Кларк Д.П., Паздерник, Нью-Джерси (2016), «Белковая инженерия», Биотехнология , Elsevier, стр. 365–392, doi : 10.1016/b978-0-12-385015-7.00011-9 , ISBN 978-0-12-385015-7
- ^ Камада Х (01 января 2013 г.), Парк К., Цунода С.И. (ред.), «5 - Генерация функциональных мутантных белков для создания высокобиоактивных противораковых биофармацевтических препаратов», Биоматериалы для терапии рака , Woodhead Publishing, стр. 95–112, doi : 10.1533/9780857096760.2.95 , ISBN 978-0-85709-664-7
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж г час я дж к л Биопереработка продуктов с добавленной стоимостью из возобновляемых ресурсов: новые технологии и приложения . Шан-Тянь Ян (1-е изд.). Амстердам: Эльзевир. 2007. ISBN 978-0-444-52114-9 . OCLC 162587118 .
{{cite book}}
: CS1 maint: другие ( ссылка ) - ^ Перейти обратно: а б Аркин М. (01.01.2001), «Мутагенез in vitro», в книге Бреннер С., Миллер Дж.Х. (ред.), Энциклопедия генетики , Нью-Йорк: Academic Press, стр. 1010–1014, номер документа : 10.1006/rwgn.2001.0714. , ISBN 978-0-12-227080-2
- ^ Маршалл С.Х. (ноябрь 2002 г.). «Перетасовка ДНК: индуцированная молекулярная селекция для производства вакцин нового поколения длительного действия». Достижения биотехнологии . 20 (3–4): 229–238. дои : 10.1016/s0734-9750(02)00015-0 . ПМИД 14550030 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и Лохер К.П., Пайдхунгат М., Уэлен Р.Г., Пуннонен Дж. (апрель 2005 г.). «Стратегии перетасовки ДНК и скрининга для повышения эффективности вакцин». ДНК и клеточная биология . 24 (4): 256–263. дои : 10.1089/dna.2005.24.256 . ПМИД 15812242 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и Пауэлл С.К., Калосс М.А., Пинкстафф А., Макки Р., Буримски И., Пенсьеро М. и др. (декабрь 2000 г.). «Селекция ретровирусов путем перетасовки ДНК для повышения стабильности и урожайности обработки». Природная биотехнология . 18 (12): 1279–1282. дои : 10.1038/82391 . ПМИД 11101807 . S2CID 1865270 .
- ^ Перейти обратно: а б с д Руи Л., Квон Ю.М., Рирдон К.Ф., Вуд Т.К. (май 2004 г.). «Инженерия метаболических путей для усиления аэробной деградации хлорированных этинов и снижения их токсичности путем клонирования новой глутатион-S-трансферазы, развитой толуол-о-монооксигеназы и гамма-глутамилцистеинсинтетазы». Экологическая микробиология . 6 (5): 491–500. дои : 10.1111/j.1462-2920.2004.00586.x . ПМИД 15049922 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж г Курцман А.Л., Говиндараджан С., Вале К., Джонс Дж.Т., Генрихс В., Паттен П.А. (август 2001 г.). «Достижения в направленной эволюции белков путем рекурсивной генетической рекомбинации: применение к терапевтическим белкам». Современное мнение в области биотехнологии . 12 (4): 361–370. дои : 10.1016/S0958-1669(00)00228-7 . ПМИД 11551464 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж г час я Стеммер В.П. (август 1994 г.). «Быстрая эволюция белка in vitro путем перетасовки ДНК». Природа . 370 (6488): 389–391. Бибкод : 1994Natur.370..389S . дои : 10.1038/370389a0 . ПМИД 8047147 . S2CID 4363498 .
- ^ «ДНКаза I (без РНКазы) | NEB» . www.neb.com . Проверено 30 октября 2021 г.
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж Стеммер В.П. (октябрь 1994 г.). «Перетасовка ДНК путем случайной фрагментации и повторной сборки: рекомбинация in vitro для молекулярной эволюции» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 91 (22): 10747–10751. Бибкод : 1994PNAS...9110747S . дои : 10.1073/pnas.91.22.10747 . ПМК 45099 . ПМИД 7938023 .
- ^ Кикучи М., Ониши К., Хараяма С. (8 февраля 2000 г.). «Эффективный метод семейной перетасовки с использованием одноцепочечной ДНК». Джин . 243 (1): 133–137. дои : 10.1016/S0378-1119(99)00547-8 . ISSN 0378-1119 . ПМИД 10675621 .
- ^ Крамери А., Райлард С.А., Бермудес Э., Стеммер В.П. (январь 1998 г.). «Перетасовка ДНК семейства генов разных видов ускоряет направленную эволюцию». Природа . 391 (6664): 288–291. Бибкод : 1998Natur.391..288C . дои : 10.1038/34663 . ПМИД 9440693 . S2CID 4352696 .
- ^ Коко В.М., Левинсон В.Е., Крист М.Дж., Гектор Х.Дж., Дарзинс А., Пиенкос П.Т. и др. (апрель 2001 г.). «Метод перетасовки ДНК для создания сильно рекомбинантных генов и эволюционировавших ферментов». Природная биотехнология . 19 (4): 354–359. дои : 10.1038/86744 . ПМИД 11283594 . S2CID 35360374 .
- ^ Перейти обратно: а б с Крамери А., Уайтхорн Э.А., Тейт Э., Стеммер В.П. (март 1996 г.). «Улучшенный зеленый флуоресцентный белок путем молекулярной эволюции с использованием перетасовки ДНК». Природная биотехнология . 14 (3): 315–319. дои : 10.1038/nbt0396-315 . ПМИД 9630892 . S2CID 22803570 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж Чжао Х., Арнольд Ф.Х. (март 1997 г.). «Оптимизация перетасовки ДНК для высокоточной рекомбинации» . Исследования нуклеиновых кислот . 25 (6): 1307–1308. дои : 10.1093/нар/25.6.1307 . ПМК 146579 . ПМИД 9092645 .
- ^ Бахер Дж. М., Рейсс Б. Д., Эллингтон А. Д. (июль 2002 г.). «Упреждающая эволюция и перетасовка ДНК» . Геномная биология . 3 (8): ОБЗОРЫ1021. doi : 10.1186/gb-2002-3-8-reviews1021 . ПМК 139397 . ПМИД 12186650 .
- ^ Энглер С., Грюцнер Р., Кандзия Р., Марилоннет С. (14 мая 2009 г.). «Перетасовка Золотых ворот: метод перетасовки ДНК в одном горшке, основанный на ферментах рестрикции типа IIs» . ПЛОС ОДИН . 4 (5): е5553. Бибкод : 2009PLoSO...4.5553E . дои : 10.1371/journal.pone.0005553 . ПМЦ 2677662 . ПМИД 19436741 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и Битткер Дж. А., Ле Б. В., Лю Дж. М., Лю Д. Р. (май 2004 г.). «Направленная эволюция белковых ферментов с помощью негомологичной случайной рекомбинации» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 101 (18): 7011–7016. Бибкод : 2004PNAS..101.7011B . дои : 10.1073/pnas.0402202101 . ПМК 406457 . ПМИД 15118093 .
- ^ Чжу С, Пэн А (июнь 2016 г.). «Восстановление негомологичного концевого соединения в экстракте яиц Xenopus» . Научные отчеты . 6 (1): 27797. Бибкод : 2016NatSR...627797Z . дои : 10.1038/srep27797 . ПМЦ 4914968 . ПМИД 27324260 .
- ^ Огивара Х, Коно Т (14 декабря 2011 г.). «Основные факторы соединения несовместимых концов ДНК при разрывах двойной цепи хромосомной ДНК in vivo» . ПЛОС ОДИН . 6 (12): e28756. Бибкод : 2011PLoSO...628756O . дои : 10.1371/journal.pone.0028756 . ПМЦ 3237495 . ПМИД 22194904 .
- ^ Перейти обратно: а б Крамери А., Дауэс Г., Родригес Э., Сильвер С., Стеммер В.П. (май 1997 г.). «Молекулярная эволюция пути детоксикации арсената путем перетасовки ДНК». Природная биотехнология . 15 (5): 436–438. дои : 10.1038/nbt0597-436 . ПМИД 9131621 . S2CID 25669058 .
- ^ Перейти обратно: а б Канада К.А., Ивашита С., Шим Х., Вуд Т.К. (январь 2002 г.). «Направленная эволюция толуолортомонооксигеназы для усиления синтеза 1-нафтола и разложения хлорированного этена» . Журнал бактериологии . 184 (2): 344–349. дои : 10.1128/JB.184.2.344-349.2002 . ПМК 139589 . ПМИД 11751810 .
- ^ Перейти обратно: а б Кербер Дж.Т., Джанг Дж.Х., Шаффер Д.В. (октябрь 2008 г.). «Перетасовка ДНК аденоассоциированного вируса дает функционально разнообразное вирусное потомство» . Молекулярная терапия . 16 (10): 1703–1709. дои : 10.1038/mt.2008.167 . ПМЦ 2683895 . ПМИД 18728640 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и Эстебан О, Вудиер РД, Чжао Х (2003). «Рекомбинация ДНК in vitro путем случайного прайминга». В Арнольде Ф.Х., Георгиу Дж. (ред.). Создание библиотеки направленной эволюции . Методы молекулярной биологии. Том. 231. Тотова, Нью-Джерси: Humana Press. стр. 99–104. дои : 10.1385/1-59259-395-x:99 . ISBN 978-1-59259-395-8 . ПМИД 12824607 .
- ^ Чжао Х., Гивер Л., Шао З., Аффхолтер Дж.А., Арнольд Ф.Х. (март 1998 г.). «Молекулярная эволюция путем поэтапного процесса расширения (StEP) рекомбинации in vitro». Природная биотехнология . 16 (3): 258–261. дои : 10.1038/nbt0398-258 . ПМИД 9528005 . S2CID 20490024 .
- ^ Агинальдо AM, Арнольд Ф.Х. (2003). «Процесс поэтапного расширения (StEP) рекомбинации in vitro». В Арнольде Ф.Х., Георгиу Дж. (ред.). Создание библиотеки направленной эволюции . Методы молекулярной биологии. Том. 231. Тотова, Нью-Джерси: Humana Press. стр. 105–110. дои : 10.1385/1-59259-395-X:105 . ISBN 978-1-59259-395-8 . ПМИД 12824608 .