Простекобактерия

Простекобактерия
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Веррукомикробиота
Сорт:	Веррукомикробии
Заказ:	Веррукомикробиалы
Семья:	Веррукомикробные
Род:	Простекобактерия ; Стейли и др. 1976 г., ранее Стейли и др. 1980 год
Типовой вид
	Простекобактерия фузиформис ; Стейли и др. 1976 г., ранее Стейли и др. 1980 год
Разновидность
	П. водоросли ; П. дебонти ; П. дежонгей ; П. флувиатилис ; П. fusiformis ; П. ваннеервении ;
Синонимы
	Бревифолис Оцука и др. 2013 год ;

Prosthecobacter — род бактерий из типа Verrucomicrobiota с отличительной характеристикой; наличие тубулиноподобных генов. Тубулины, являющиеся компонентами микротрубочек , никогда ранее не наблюдались у Gracilicutes .

Долгое время считалось, что тубулин свойственен эукариотам . Однако совсем недавно было показано, что несколько прокариотических белков связаны с тубулином. ^[2]^[3]^[4]^[5]

Большинство бактерий имеют гомологичную структуру FtsZ . Prosthecobacter Исключением являются , содержащие гены, которые имеют более высокую гомологию последовательности с эукариотическим тубулином, чем FtsZ.

Эти гены называются бактериальным тубулином а (BtubA) и бактериальным тубулином b (BtubB). Свойства не совсем одинаковы. Однако поверхностные петли и микротрубочки чрезвычайно похожи.

Филогения

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). ^[1] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) ^[6]

на основе 16S рРНК ДП _08_2023 ^[7]^[8]^[9]

120 маркерных белков на основе GTDB 08-RS214 ^[10]^[11]^[12]

Простекобактерия

	P. fluviatilis Takeda et al. 2008 год

	P. vanneervenii Hedlund et al. 1998 год

Brevifollis gellanilyticus Otsuka et al. 2013 год

P. debontii Hedlund et al. 1998 год

P. dejongeii Hedlund et al. 1998 год

	П. водоросли Lee et al. 2014 год

	P. fusiformis Staley et al. 1976 г., ранее Стейли и др. 1980 год

Простекобактерия

П. ваннеервении

Бревифоллис гелланилитический

П. дебонти

	П. дежонгей

	П. fusiformis

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б Ж. П. Эзеби. «Простекобактерий» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 9 сентября 2022 г.
^ Ногалес Э., Даунинг К.Х., Амос Л.А., Лёве Дж. (июнь 1998 г.). «Тубулин и FtsZ образуют отдельное семейство GTPases». Структурная биология природы . 5 (6): 451–8. дои : 10.1038/nsb0698-451 . ПМИД 9628483 . S2CID 5945125 .
^ Дженкинс С., Самудрала Р., Андерсон И., Хедлунд Б.П., Петрони Дж., Михайлова Н., Пинель Н., Овербик Р., Розати Г., Стейли Дж.Т. (декабрь 2002 г.). «Гены цитоскелетного белка тубулина у бактерий рода Prosthecobacter» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (26): 17049–54. Бибкод : 2002PNAS...9917049J . дои : 10.1073/pnas.012516899 . ПМК 139267 . ПМИД 12486237 .
^ Ютин Н., Кунин Е.В. (март 2012 г.). «Археальное происхождение тубулина» . Биология Директ . 7:10 . дои : 10.1186/1745-6150-7-10 . ПМЦ 3349469 . ПМИД 22458654 .
^ Ларсен Р.А., Кусумано С., Фудзиока А., Лим-Фонг Дж., Паттерсон П., Польяно Дж. (июнь 2007 г.). «Беговая дорожка прокариотического тубулиноподобного белка TubZ, необходимого для стабильности плазмиды в Bacillus thuringiensis» . Гены и развитие . 21 (11): 1340–52. дои : 10.1101/gad.1546107 . ПМЦ 1877747 . ПМИД 17510284 .
^ Сэйерс; и др. «Простекобактерий» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 9 сентября 2022 г.
^ «ЛТП» . Проверено 20 ноября 2023 г.
^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 20 ноября 2023 г.
^ «Примечания к выпуску LTP_08_2023» (PDF) . Проверено 20 ноября 2023 г.
^ «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
^ "bac120_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[LPSN-1] Jump up to: ^а ^б Ж. П. Эзеби. «Простекобактерий» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 9 сентября 2022 г.

[pmid9628483-2] Ногалес Э., Даунинг К.Х., Амос Л.А., Лёве Дж. (июнь 1998 г.). «Тубулин и FtsZ образуют отдельное семейство GTPases». Структурная биология природы . 5 (6): 451–8. дои : 10.1038/nsb0698-451 . ПМИД 9628483 . S2CID 5945125 .

[Jenkins_2002-3] Дженкинс С., Самудрала Р., Андерсон И., Хедлунд Б.П., Петрони Дж., Михайлова Н., Пинель Н., Овербик Р., Розати Г., Стейли Дж.Т. (декабрь 2002 г.). «Гены цитоскелетного белка тубулина у бактерий рода Prosthecobacter» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (26): 17049–54. Бибкод : 2002PNAS...9917049J . дои : 10.1073/pnas.012516899 . ПМК 139267 . ПМИД 12486237 .

[Yutin_2012-4] Ютин Н., Кунин Е.В. (март 2012 г.). «Археальное происхождение тубулина» . Биология Директ . 7:10 . дои : 10.1186/1745-6150-7-10 . ПМЦ 3349469 . ПМИД 22458654 .

[Larsen_2007-5] Ларсен Р.А., Кусумано С., Фудзиока А., Лим-Фонг Дж., Паттерсон П., Польяно Дж. (июнь 2007 г.). «Беговая дорожка прокариотического тубулиноподобного белка TubZ, необходимого для стабильности плазмиды в Bacillus thuringiensis» . Гены и развитие . 21 (11): 1340–52. дои : 10.1101/gad.1546107 . ПМЦ 1877747 . ПМИД 17510284 .

[NCBI-6] Сэйерс; и др. «Простекобактерий» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 9 сентября 2022 г.

[LTP-7] «ЛТП» . Проверено 20 ноября 2023 г.

[8] «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 20 ноября 2023 г.

[9] «Примечания к выпуску LTP_08_2023» (PDF) . Проверено 20 ноября 2023 г.

[about-10] «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[tree-11] "bac120_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[taxon_history-12] «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]