Воспалительный фактор аллотрансплантата 1

AIF1
Доступные структуры PDB Поиск ортолога: PDBE RCSB showСписок кодов идентификаторов PDB 2D58, 2G2B
Идентификаторы
Псевдонимы	AIF1 , AIF-1, IBA1, IRT-1, IRT1, Аллотрансплантат Воспалительный фактор 1, IBA-1
Внешние идентификаторы	Омим : 601833 ; MGI : 1343098 ; Гомологен : 1226 ; GeneCards : AIF1 ; OMA : AIF1 - ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 6 (human) Band 6p21.33 Start 31,615,217 bp End 31,617,021 bp
showМестоположение гена ( мышь ) Chr. Chromosome 17 (mouse) Band 17 B1|17 18.59 cM Start 35,389,967 bp End 35,395,044 bp
showРНК -паттерн экспрессии Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in monocyte granulocyte bone marrow cells testicle right lung gallbladder C1 segment rectum spleen right coronary artery Top expressed in seminiferous tubule mesenteric lymph nodes spermatid spleen stroma of bone marrow thymus spermatocyte subcutaneous adipose tissue optic nerve aortic valve More reference expression data BioGPS More reference expression data
showДжин Онтология Molecular function calcium ion binding metal ion binding actin filament binding actin binding molecular function Cellular component cytoplasm cytosol perikaryon cell projection membrane ruffle plasma membrane ruffle membrane actin filament perinuclear region of cytoplasm phagocytic cup cytoskeleton nucleus lamellipodium Biological process cellular response to extracellular stimulus positive regulation of smooth muscle cell chemotaxis response to cytokine positive regulation of protein phosphorylation negative regulation of smooth muscle cell proliferation positive regulation of cell migration positive regulation of muscle hyperplasia positive regulation of nitric oxide biosynthetic process positive regulation of monocyte chemotaxis negative regulation of apoptotic process response to glucocorticoid response to electrical stimulus negative regulation of gene expression cellular response to hydroperoxide actin filament bundle assembly microglial cell activation positive regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle actin filament polymerization negative regulation of smooth muscle cell chemotaxis cellular response to hormone stimulus phagocytosis, engulfment response to axon injury positive regulation of T cell proliferation cellular response to interferon-gamma cellular response to morphine Rac protein signal transduction inflammatory response ruffle assembly positive regulation of T cell migration positive regulation of smooth muscle cell proliferation cerebellum development positive regulation of cell population proliferation regulation of gene expression parallel actin filament bundle assembly cellular response to oxidative stress positive regulation of chemotaxis actin crosslink formation positive regulation of mononuclear cell migration positive regulation of fibroblast growth factor production Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 199 11629 Набор showENSG00000206428 ENSG00000235985 ENSG00000235588 ENSG00000234836 ENSG00000237727 ENSG00000204472 Ensmusg00000024397 Uniprot P55008 Q4V347 O70200 Refseq (мРНК) NM_001623 NM_004847 NM_032955 NM_001318970 NM_019467 NM_001361501 NM_001361502 Refseq (белок) NP_001305899 NP_001614 NP_116573 NP_001614.3 NP_062340 NP_001348430 NP_001348431 Расположение (UCSC) Chr 6: 31,62 - 31,62 МБ Chr 17: 35,39 - 35,4 МБ PubMed Search
Викидид
Посмотреть/редактировать человека Посмотреть/редактировать мышь

Воспалительный фактор аллотрансплантата 1 ( AIF-1 ), также известный как ионизированная кальций-связывающая молекула адаптера 1 ( IBA1 ), представляет собой белок , который у людей кодируется AIF1 геном .

Ген

Ген AIF1 расположен в сегменте основной области гистосовместимости комплекса класса III. Было показано, что этот ген высоко экспрессируется в яичке, селезенке и мозге, но слабо экспрессируется в легких и почках. Среди клеток мозга ген IBA1 сильно и специфически экспрессируется в микроглии. Циркулирующие макрофаги также экспрессируют IBA1.

Функция

AIF1 - это белок, который существует в цитоплазме , и он высоко эволюционно сохраняется. Это также, возможно, идентично трем другим белкам: IBA-2, MRF-1 (коэффициент ответа микроглии) и дайтейн. Однако полные функциональные профили всех трех белков и то, как они перекрываются, неизвестны. IBA1 представляет собой 17- KDA EF- белок, который специально экспрессируется в макрофагах / микроглии и активируется во время активации этих клеток. Экспрессия IBA1 активируется в микроглии после повреждения нерва, ишемия центральной нервной системы и несколько других заболеваний мозга.

AIF1 был первоначально обнаружен в атеросклеротических поражениях на крысиной модели хронического отторжения сердечного аллотрансплантата . Было обнаружено, что он активируется у макрофагов и нейтрофилов в ответ на цитокин IFN-γ . Было замечено, что экспрессия AIF1 увеличивается в сосудистой ткани в ответ на артериальное повреждение, в частности, она обнаруживается в активированных клетках гладких мышц сосудов в ответ на IFN-γ, IL-1β и кондиционированные среды T-клеток. В клетках гладких мышц сосудов активация ответственна за утолщение артерий в аллотрансплантатах посредством пролиферации. Было обнаружено, что AIF1 усиливает рост и способствует пролиферации в клетках гладких мышц сосудов посредством дерегуляции клеточного цикла. Это происходит путем сокращения клеточного цикла и изменения экспрессии циклинов. Несмотря на то, что AIF1 также отличается, AIF1 способствует пролиферации и активации эндотелиальных клеток (EC). Активация ЕС, приводит к пролиферации и миграции клеток, которая участвует в множественных нормальных сосудистых процессах, таких как атеросклероз, ангиогенез и заживление ран. В настоящее время теоретизируется, что AIF1 работает над контролем пролиферации и миграции эндотелиальных клеток посредством действия в пути передачи сигнала . Он имеет особенности цитоплазматического сигнального белка, в том числе несколько доменов, которые позволяют связывать с мультипротеиновыми комплексами, называемыми доменами PDZ . В эндотелиальных клетках было специально показано, что AIF1 регулирует васкулогенез , включая образование прорастания аорты и трубчатые формации. Было показано, что AIF1 взаимодействует с киназой P44/42 и PAK1 , двумя ранее известными молекулами передачи сигнала, в регуляции этих процессов. AIF1 также показывает четкие различия в путях, по которым он регулирует эндотелиальные клетки, макрофаги и клетки гладких мышц сосудов. Повышенная регуляция AIF-1 связана с повышенной миграцией мононуклеарной периферической клетки крови. В CD14- положительных клетках AIF-1 поддерживают секрецию IL-6 и различных хемокинов . AIF-1 также может играть роль в ответе Т-клеток. Было показано, что AIF-1 увеличивает экспрессию IL-2 и IFN-γ в Т-клетках, в то время как экспрессия IL-4 и TGF-β снижается. Присутствие AIF-1 также ингибирует поляризацию в регуляторные Т- клетки.

Клиническое значение

Воспалительный фактор аллотрансплантата 1 обнаружен в активированных макрофагах. Активированные макрофаги обнаруживаются в тканях с воспалением. Было обнаружено, что уровни AIF1 у здоровых людей положительно коррелируют с метаболическими показателями, такими как индекс массы тела, триглицериды и уровни глюкозы в плазме натощак. Обнаружено, что избыток жировой ткани, обнаруженного у пациентов с ожирением, вызывает хроническое воспаление с увеличением числа активированных макрофагов. Впоследствии AIF1 может быть точным индикатором активации макрофагов в организме. Существуют также доказательства того, что AIF1 может быть маркером для диабетической нефропатии при обнаружении в сыворотке. Поскольку диабетическая нефропатия является следствием долгосрочного диабета типа 1 и типа 2, это согласуется с доказательствами того, что AIF1 может быть связан с другими аспектами диабета. Он обнаруживается в активированных макрофагах в островках поджелудочной железы и, как было показано, уменьшает секрецию инсулина, одновременно нарушая устранение глюкозы.

Роль в прогрессировании рака

В последние годы также была рассмотрена возможность роли AIF-1 в развитии рака. Значительно более высокие уровни экспрессии AIF-1 были обнаружены в гепатокарциномы клеточных линиях и в тканях по сравнению со здоровыми образцами. Одним из вариантов, в котором AIF-1 может способствовать развитию патологии, является участие в пролиферации и миграции опухолевых клеток. Также было показано, что AIF-1 способствует пролиферации клеток в линии раковых клеток Бреста. Этот эффект зависел от времени и уровня белка AIF-1. Повышенная регуляция AIF-1 повышенная активность NF-κB и повышенная экспрессия циклина D1 . Cyclin D1 способствует пролиферации, а клеточная пролиферация и мутация в этом гене связана с разнообразием опухолей. Также было показано, что экспрессия AIF-1 может способствовать прогрессированию рака путем ингибирования апоптоза в клетках.

Роль при ревматоидном артрите

Роль активации экспрессии AIF-1 была продемонстрирована при ревматоидном артрите . Наличие AIF-1 было подтверждено в синовиальной ткани пациента с этой патологией. AIF-1 был сильно экспрессирован в нескольких типах синовиальной ткани , таких как фибробласты и синовиальные клетки, а также в инфильтрированных иммунных клетках. Также было показано, что активация AIF-1 способствует индукции повышения производства IL-6. Другим фактором, с помощью которого экспрессия AIF-1 влияет на курс заболевания, является повышение пролиферации синовиальных клеток.

Роль в заболеваниях почек

AIF-1 также рассматривался как игрок при заболеваниях, связанных с фиброзом . Например, при заболеваниях почек сверхэкспрессия AIF-1 в макрофагах способствует передаче сигналов через AKT и MTOR . Другим способом, которым AIF-1 вносит свой вклад в патологию почки,-это активация фермента NADPH-оксидазы 2 . Эта активация приводит к окислительному стрессу в клетках и прогрессированию повреждения почек. Экспрессия AIF-1 считается связанной с кальцификацией у пациентов с гемодилизом. Более высокое присутствие AIF-1/NF -κ B/MCP-1/CCR-2 было обнаружено в клетках гладких мышц сосудов с кальцифицированными. AIF-1 также был обнаружен как потенциальный фактор, который способствует апоптозу и воспалению.

Роль при заболеваниях сетчатки

Поскольку иммунный ответ в сетчатке жестко регулируется в физиологических условиях, микроглия может играть роль в заболеваниях сетчатки. Ретинит Пигментов - это наследственное заболевание, при котором фоторецепторы постепенно дегенерируются. Это состояние постепенно приводит к уменьшению темного зрения и в конечном итоге полной слепоты. В экспериментальной модели RCS (Королевский колледж хирургов) крыс с потерей фоторецепторов прогрессирования, уровень AIF-1 был повышен в сетчатке в отличие от дикого типа

Дальнейшее чтение

• Deininger MH, Meyermann R, Schlueshener HJ (март 2002 г.). «Семейство воспалительного фактора-1 аллотрансплантата 1» . Письма Febs . 514 (2–3): 115–21. doi : 10.1016/s0014-5793 (02) 02430-4 . PMID   11943136 . S2CID   34086133 .
• Утанс У, Аркчи Р.Дж., Ямашита Ю., Рассел М.Е. (июнь 1995 г.). «Клонирование и характеристика воспалительного фактора-1 аллотрансплантата-1: новый фактор макрофагов, идентифицированный в аллотрансплантатах сердца крысы с хроническим отторжением» . Журнал клинических исследований . 95 (6): 2954–62. doi : 10.1172/jci118003 . PMC   295984 . PMID   7769138 .
• Iris FJ, Bougueleret L, Prieur S, Caterina D, Primas G, Perrot V, et al. (Февраль 1993 г.). «Плотная кластеризация Alu и потенциальный новый член семьи NF Kappa B в сегменте HLA III класса 90 килобазы». Природа генетика . 3 (2): 137–45. doi : 10.1038/ng0293-137 . PMID   8499947 . S2CID   33041319 .
• Утанс У., Квист В.К., Макманус Б.М., Уилсон Дж.Е., Аркчи Р.Дж., Уоллес А.Ф., Рассел М.Е. (май 1996 г.). «Воспалительная фабрика-аллотрансплантат-1. Молекула макрофагов, чувствительная к цитокинам, экспрессируемая в трансплантированных человеческих сердцах» . Трансплантация . 61 (9): 1387–92. doi : 10.1097/00007890-199605150-00018 . PMID   8629302 .
• Atieri MV, Agrawal N (июнь 1998 г.). «IRT-1, новый интерферон-гамма-реагирующий транскрипт, кодирующий базовый белок лейциновой молнии на молнии» . Журнал биологической химии . 273 (24): 14731–7. doi : 10.1074/jbc.273.24.14731 . PMID   9614071 .
• Невилл MJ, Campbell Rd (апрель 1999 г.). «Новый член суперсемейства IG и субъединицы V-ATPase G входят в число предсказанных продуктов новых генов, близких к локусу TNF в человеческом MHC» . Журнал иммунологии . 162 (8): 4745–54. doi : 10.4049/jimmunol.162.8.4745 . PMID   10202016 .
• Сасаки Ю., Осава К., Каназава Х., Кохсака С., Имай Ю (август 2001 г.). «IBA1-это белок, связывающий актин, в макрофагах/микромлии» Биохимическая и биофизическая исследовательская коммуникация 286 (2): 292–7 Doi : 10.1006/ bbrc.2001.5 PMID   11500035
• Atieri MV, Kelemen SE, Wendt KW (май 2003 г.). «AIF-1-это актин-полимеризационный и активирующий RAC1 белок, который способствует миграции клеток гладких мышц сосудов» . Исследование циркуляции . 92 (10): 1107–14. doi : 10.1161/01.res.0000074000.03562.cc . PMID   12714565 .
• Deininger MH, Weinschenk T, Meyermann R, Schlueshener HJ (август 2003 г.). «Воспалительный фактор-1 аллотрансплантата в мозге болезни Крейтцфельдта-Якоба» . Невропатология и прикладная нейробиология . 29 (4): 389–99. doi : 10.1046/j.1365-2990.2003.00476.x . PMID   12887599 . S2CID   21401126 .
• Xie T, Rowen L, Aguado B, Ahearn Me, Madan A, Qin S, et al. (Декабрь 2003 г.). «Анализ генной области основной гистосовместимости комплексной области класса III и ее сравнения с мышей» . Исследование генома . 13 (12): 2621–36. doi : 10.1101/gr.1736803 . PMC   403804 . PMID   14656967 .
• Ohsawa K, Imai Y, Sasaki Y, Kohsaka S (февраль 2004 г.). «Microglia/Macrophage-специфический белок IBA1 связывается с фимбрином и усиливает его актиновую активность». Журнал нейрохимии . 88 (4): 844–56. doi : 10.1046/j.1471-4159.2003.02213.x . PMID   14756805 . S2CID   25092822 .
• Chen X, Kelemen SE, Atieri MV (июль 2004 г.). «Экспрессия AIF-1 модулирует пролиферацию клеток гладких мышц сосудов человека путем аутокринной экспрессии G-CSF» . Артериосклероз, тромбоз и сосудистая биология . 24 (7): 1217–22. doi : 10.1161/01.atv.0000130024.50058.de . PMID   15117732 .
• Арванит Д.А., Флайрис Г.А., Спандидос Д.А. (2005). «Геномные перестройки на VCAM1, SELE, APEG1 и локусы AIF1 в атеросклерозе» . Журнал клеточной и молекулярной медицины . 9 (1): 153–9. doi : 10.1111/j.1582-4934.2005.tb00345.x . PMC   6741330 . PMID   15784173 .
• Atieri MV, Chen X (июль 2005 г.). «Способность AIF-1 активировать клетки гладких мышц сосудистых мышц человека теряется мутациями в области связывания кальция EF-рука». Экспериментальные исследования клеток . 307 (1): 204–11. doi : 10.1016/j.yexcr.2005.03.002 . PMID   15922740 .

Внешние ссылки

• Местоположение генома человека AIF1 и страница детали гена AIF1 в браузере генома UCSC .
• PDBE-KB предоставляет обзор всей информации о структуре, доступной в PDB для воспалительного фактора аллотрансплантата человека 1