Список секвенированных геномов водорослей

Этот список секвенированных геномов водорослей содержит виды водорослей, которые, как известно, имеют общедоступные полные последовательности генома, которые были собраны, аннотированы и опубликованы. Несобранные геномы не включены, как и последовательности, состоящие только из органелл. Геномы растений см. в списке секвенированных геномов растений . Для пластидных последовательностей см. список секвенированных пластомов . Для всех королевств см. список секвенированных геномов .

Динофлагелляты ( альвеолаты )

См. также Список секвенированных геномов простейших .


Организм напряжение	Тип	Актуальность	Размер генома	Число генов предсказанный	Организация	Год завершение	Сборка статус	Ссылки
Breviolum minutum ( Symbiodinium minutum ; клада B1)	Динофлагеллята	Коралловый симбионт	1,5 ГБ	47,014	Окинавский институт науки и технологий	2013 ^{[ 1 ]}	Черновик	ОИСТ Морская Геномика ^{[ 2 ]}
Cladocopium goreaui ( Symbiodinium goreaui ; клада C, тип C1)	Динофлагеллята	Коралловый симбионт	1,19 ГБ	35,913	Геномика будущего рифа (ReFuGe) 2020 / Университет Квинсленда	2018 ^{[ 3 ]}	Черновик	РЕФУГЕ 2020 ^{[ 4 ]}
Cladocopium Штамм C92 Y103 ( Symbiodinium sp. clade C; предполагаемый тип C92)	Динофлагеллята	Фораминиферовый симбионт	Неизвестно (размер сборки 0,70 Гб)	65,832	Окинавский институт науки и технологий	2018 ^{[ 5 ]}	Черновик	ОИСТ Морская Геномика ^{[ 2 ]}
Fugacium kawagutii CS156=CCMP2468 ( Symbiodinium kawagutii ; клада F1)	Динофлагеллята	Коралловый симбионт?	1,07 ГБ	26,609	Геномика будущего рифа (ReFuGe) 2020 / Университет Квинсленда	2018 ^{[ 3 ]}	Черновик	РЕФУГЕ 2020 ^{[ 4 ]}
Fugacium kawagutii CCMP2468 ( Symbiodinium kawagutii ; клада F1)	Динофлагеллята	Коралловый симбионт?	1,18 ГБ	36,850	Университет Коннектикута / Университет Сямэнь	2015 ^{[ 6 ]}	Черновик	S. kawagutii Проект генома ^{[ 7 ]}
Полярелла ледниковая CCMP1383	Динофлагеллята	Психрофил, Антарктика	3,02 Гб (диплоид), 1,48 Гб (гаплоид)	58,232	Университет Квинсленда	2020 ^{[ 8 ]}	Черновик	UQ космическое пространство ^{[ 9 ]}
Полярелла ледниковая CCMP2088	Динофлагеллята	Психрофил, Арктика	2,65 Гб (диплоид), 1,30 Гб (гаплоид)	51,713	Университет Квинсленда	2020 ^{[ 8 ]}	Черновик	UQ космическое пространство ^{[ 9 ]}
Symbiodinium microadriaticum (клад А)	Динофлагеллята	Коралловый симбионт	1,1 ГБ	49,109	Университет науки и технологий короля Абдаллы	2016 ^{[ 10 ]}	Черновик	Рифовая геномика ^{[ 11 ]}
Symbiodinium Штамм A3 Y106 ( Symbiodinium sp. clade A3)	Динофлагеллята	симбионт	Неизвестно (размер сборки 0,77 Гб)	69,018	Окинавский институт науки и технологий	2018 ^{[ 5 ]}	Черновик	ОИСТ Морская Геномика ^{[ 2 ]}

Криптомонада


Организм напряжение	Тип	Актуальность	Размер генома	Число генов предсказанный	Организация	Год завершение	Сборка статус	Ссылки
Cryptophyceae sp. CCMP2293	Нанофлагеллята	Нуклеоморф , Психрофил	534,5 Мб	33,051	Объединенный институт генома	2016 ^{[ 12 ]}		Геномный портал JGI ^{[ 13 ]}
Гильярдия тета		эукариот Эндосимбиоз	87,2 Мб	24, 840	Университет Далхаузи	2012 ^{[ 14 ]}		Теплица ^{[ 15 ]}

глаукофит


Организм напряжение	Тип	Актуальность	Геном размер	Число генов предсказанный	Организация	Год завершение	Сборка статус	Ссылки
Цианофора парадокс		Модель Организм	70,2 Мб	3,900	Университет Рутгерса	2012 ^{[ 16 ]}	Черновик v1	Теплица ^{[ 15 ]} Проект генома цианофоры ^{[ 17 ]}
Цианофора парадокс		Модель Организм	99,94 Мб	25,831	Университет Рутгерса	2019 ^{[ 18 ]}	Черновик v2	Проект генома цианофоры ^{[ 19 ]}

Зеленые водоросли


Организм напряжение	Актуальность	Геном размер	Число генов предсказанный	Организация	Год завершение	Ссылки
Астерохлорис сп. Cgr/DA1pho	Фотобионт	55,8 Мб	10,025	Университет Дьюка	2011 ^{[ 20 ]}	Геномный портал JGI ^{[ 13 ]}
Ауксенохлорелла прототекоидес	Биотопливо	22,9 Мб	7,039	Университет Цинхуа	2014 ^{[ 21 ]}	Теплица ^{[ 15 ]}
Батикокк празинос	Сравнительный анализ	15,1 Мб	7,900	Объединенный институт генома	2012 ^{[ 22 ]}	Геномный портал JGI ^{[ 13 ]}
Хламидомонада Рейнхардти CC-503 cw92 мес.+	Модельный организм	111,1 Мб	17,741	Объединенный институт генома	2017 ^{[ 23 ]}	Фитозом ^{[ 24 ]} Теплица ^{[ 15 ]}
Хлорелла сорокиниана ул. 1228	Биотопливо	61,4 Мб		Национальная лаборатория Лос-Аламоса	2018 ^{[ 25 ]}	Теплица ^{[ 15 ]}
Хлорелла сорокиниана UTEX 1230	Биотопливо	58,5 Мб		Национальная лаборатория Лос-Аламоса	2018 ^{[ 26 ]}	Теплица ^{[ 15 ]}
Chlorella sorokiniana DOE1412	Биотопливо	57,8 Мб		Национальная лаборатория Лос-Аламоса	2018 ^{[ 27 ]}	Теплица ^{[ 15 ]}
Хлорелла переменная NC64A	Биотопливо	46,2 Мб	9,791		2010 ^{[ 28 ]}	Теплица ^{[ 15 ]}
Хлорелла обыкновенная	Биотопливо	37,3 Мб		Национальные возобновляемые источники энергии Энергетическая лаборатория	2015 ^{[ 29 ]}	Теплица ^{[ 15 ]}
Coccomyxa subellipsoidea сп. С-169	Биотопливо	48,8 Мб	9839	Объединенный институт генома	2012 ^{[ 30 ]}	Фитозом ^{[ 24 ]} Теплица ^{[ 15 ]}
Дуналиелла Салина CCAP19/18	галофил Биотопливо бета-каротина и глицерина Производство	343,7 Мб	16,697	Объединенный институт генома	2017 ^{[ 31 ]}	Фитозом ^{[ 24 ]}
Эудорина сп.	Многоклеточная водоросль, модельный организм	~180 Мб		Токийский университет	2018 ^{[ 32 ]}
Гониум грудной		148,81 Мб		Канзасский государственный университет	2016 ^{[ 33 ]}
Микромонас коммода NOUM17 (RCC288)	Морской фитопланктон	21,0 Мб	10,262	Научно-исследовательский институт аквариумов Монтерей-Бей	2013 ^{[ 34 ]}^{[ 35 ]}	Геномный портал JGI ^{[ 13 ]}
Микромонас Пусилла CCMP-1545	Морской фитопланктон	21,9 Мб	10,575	Микромонас Геном Консорциум	2009 ^{[ 36 ]}	Фитозом ^{[ 24 ]} Теплица ^{[ 15 ]}
Микромонас маленькая девочка РСС299/НОУМ17	Морской фитопланктон	20,9 Мб	10,056	Совместный геном институт	2009 ^{[ 36 ]}	Фитозом ^{[ 24 ]} Теплица ^{[ 15 ]}
Монорафидиум заброшенный	Биотопливо	69,7 Мб	16,755	Билефельд Университет	2013 ^{[ 37 ]}	Теплица ^{[ 15 ]}
Остреококк люцимаринус CCE9901	Маленький геном	13,2 Мб	7,603	Объединенный институт генома	2007 ^{[ 38 ]}	Фитозом ^{[ 24 ]}
Остреококк Тавр OTH95	Маленький геном	12,9 МБ	7,699	НЦРС	2014 ^{[ 39 ]}	Теплица ^{[ 15 ]}
Остреококк сп. РСС809	Маленький геном	13,3 Мб	7,492	Совместный геном институт	2009 ^{[ 40 ]}	JGI ^{[ 41 ]}
Пикохлор солоецизм ДОЭ101	Биотопливо	15,2 Мб	7,844	Лос-Аламос Национальная лаборатория	2017 ^{[ 42 ]}	Теплица ^{[ 15 ]}
Пикохлор СЕНЕВ3	Биотопливо	13,5 Мб	7,367	Университет Рутгерса	2014 ^{[ 43 ]}	Теплица ^{[ 15 ]}
Сценедесмус косой DOE0152Z	Биотопливо	210,3 Мб		Бруклинский колледж	2017 ^{[ 44 ]}	Теплица ^{[ 15 ]}
Symbiochromis reticulata (Метагеном)	Фотобионт	58,6 Мб	12,720	Объединенный институт генома	2018 ^{[ 45 ]}	Геномный портал JGI ^{[ 13 ]}
Тетрасельмис сп.	Биотопливо	228 Мб		Лос-Аламос Национальная лаборатория	2018 ^{[ 15 ]}	Теплица ^{[ 15 ]}
Пединомонас минор (Chlorophyta)		55 Мб		Новый Фитолог	2022 ^{[ 46 ]}
Вольвокс Картери	Многоклеточная водоросль, модельный организм	131,2 Мб	14,247	Совместный геном институт	2010 ^{[ 47 ]}	Фитозом ^{[ 24 ]} Теплица ^{[ 15 ]}
Гишиелла уникокка	Многоклеточная водоросль, модельный организм	~140 Мб		Токийский университет	2018 ^{[ 32 ]}

Гаптофит


Организм напряжение	Тип	Актуальность	Геном размер	Число генов предсказанный	Организация	Год завершение	Ссылки
Хризохромулина парва		Биотопливо	65,8 Мб		Лос-Аламосская национальная лаборатория	2018 ^{[ 48 ]}	Теплица ^{[ 15 ]}
Хризохромулина тобинии CCMP291		Модельный организм, Биотопливо	59,1 Мб	16,765	Вашингтонский университет	2015 ^{[ 49 ]}	Теплица ^{[ 15 ]}
Эмилиания Хаксли	Кокколитофор	Производство алкенонов, цветение водорослей	167,7 Мб	38,554	Объединенный институт генома	2013 ^{[ 50 ]}	Теплица ^{[ 15 ]}
Павловалес сп. CCMP2436		Психрофил	165,4 Мб	26,034	Объединенный институт генома	2016 ^{[ 51 ]}	Геномный портал JGI ^{[ 13 ]}

Гетероконт / Страменопилес


Организм напряжение	Тип	Актуальность	Геном размер	Число генов предсказанный	Организация	Год завершение	Ссылки
Ауреококк анофагеференс		Вредные водоросли Цвести	50,1 Мб	11,522	Объединенный институт генома	2011 ^{[ 52 ]}	Теплица ^{[ 15 ]}
Эктокарпус силикулезный	Бурые водоросли	Модельный организм	198,5 Мб	16,269	Геноскоп	2012 ^{[ 53 ]}	Теплица ^{[ 15 ]}
Фрагилариопсис цилиндрический CCMP1102		Психрофил	61,1 Мб	21,066	Университет Восточной Англии , Объединенный институт генома	2017 ^{[ 54 ]}	Геномный портал JGI ^{[ 13 ]}
Наннохлоропсис Кадис		Биотопливо	28,5 Мб	10,486	Университет Падуи	2014 ^{[ 55 ]}	Теплица ^{[ 15 ]}
Наннохлоропсис океанический		Биотопливо	31,5 Мб		Китайская академия наук , Циндаоский институт биоэнергетики и биотехнологий	2016 ^{[ 56 ]}	Теплица ^{[ 15 ]}
Наннохлоропсис Салина CCMP1766		Биотопливо	24,4 Мб		Китайская академия наук , Циндаоский институт биоэнергетики и биотехнологий	2016 ^{[ 57 ]}	Теплица ^{[ 15 ]}
Ochromonadaceae sp. CCMP2298		Психрофил	61,1 Мб	20,195	Объединенный институт генома	2016 ^{[ 58 ]}	Геномный портал JGI ^{[ 13 ]}
Pelagophyceae sp. CCMP2097		Психрофил	85,2 Мб	19,402	Объединенный институт генома	2016 ^{[ 59 ]}	Геномный портал JGI ^{[ 13 ]}
Phaeodactylum tricornutum		Модельный организм	27,5 Мб	10,408	Консорциум диатомей	2008 ^{[ 60 ]}	Теплица ^{[ 15 ]}
Псевдоницсия многосерийная CLN-47			218,7 Мб	19,703	Объединенный институт генома	2011 ^{[ 61 ]}	Геномный портал JGI ^{[ 13 ]}
Сахарина японская	Бурые водоросли	Товарная культура	543,4 Мб		Китайская академия наук , Пекинские институты наук о жизни	2015 ^{[ 62 ]}	Теплица ^{[ 15 ]}
Талассиозира океанская CCMP 1005		Модельный организм	92,2 Мб	34,642	Будущий океан	2012 ^{[ 63 ]}	Теплица ^{[ 15 ]}
Талассиозира псевдонана		модельный организм	32,4 Мб	11,673	Консорциум диатомей	2009 ^{[ 64 ]}	Теплица ^{[ 15 ]}

Красные водоросли (родофиты)


Организм напряжение	Актуальность	Геном размер	Число генов предсказанный	Организация	Год завершение	Ссылки
Хрустящая скорлупа	Производство каррагинана , модельный организм	105 Мб	9,606	Геноскоп	2013	Теплица ^{[ 15 ]}
Цианидиошизон мерола 10D	Модель организм	16,5 Мб	4,775	Национальный институт генетики , Япония	2007 ^{[ 65 ]}	Теплица ^{[ 15 ]}
Галдиерия серная	экстремофил	12,1 Мб		Йоркский университет	2016 ^{[ 66 ]}	Теплица ^{[ 15 ]}
Грацилариопсис хорда	Мезофил	92,1 Мб	10,806	Университет Сунгюнкван	2018 ^{[ 67 ]}
Фиолетовый порфир	Мезофил	19,7 Мб	8,355	Университет Рутгерса	2013 ^{[ 68 ]}
Пупочная порфира	Марикультура	87,6 Мб	13,360	Университет штата Мэн	2017 ^{[ 69 ]}	Фитозом ^{[ 24 ]}
Пиропия йезоенсис	Марикультура	43,5 Мб	10,327	Национальный научно-исследовательский институт рыбного хозяйства	2013 ^{[ 70 ]}

Ризария


Организм напряжение	Тип	Актуальность	Геном размер	Число генов предсказанный	Организация	Год завершение	Сборка статус	Ссылки
Бигеловелла плавание		Модельный организм	94. Мб	21,708	Университет Далхаузи	2012 ^{[ 14 ]}		Теплица ^{[ 15 ]}

Ссылки

^ Сёгути Э., Синдзато С., Кавасима Т., Гёджа Ф., Мунгпакди С., Коянаги Р. и др. (2013). «Проект сборки ядерного генома Symbiodinium minutum раскрывает структуру гена динофлагеллят» . Текущая биология 25 (15): 1399–1408. Бибкод : 2013CBio...23.1399S . дои : 10.1016/j.cub.2013.05.062 . ПМИД 23850284 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с «ОИСТ Морская Геномика» . Marinegenomics.oist.jp . Проверено 22 августа 2018 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б Лю Х., Стивенс Т.Г., Гонсалес-Пех Р.А., Бельтран В.Х., Лапейр Б., Бонгертс П. и др. (2018). « Геномы симбиодиниумов демонстрируют адаптивную эволюцию функций, связанных с симбиозом кораллов и динофлагеллят» . Коммуникационная биология . 1 : 95. дои : 10.1038/s42003-018-0098-3 . ПМК 6123633 . ПМИД 30271976 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Сайт данных ReFuGe 2020» . Reflection2020.reefgenomics.org . Проверено 22 августа 2018 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б Сёгути Э., Бидесси Г., Тада И., Хисата К., Кавасима Т., Такеучи Т. и др. (2018). «Два расходящихся генома Symbiodinium демонстрируют сохранение кластера генов биосинтеза солнцезащитного крема и недавно утраченных генов» . БМК Геномика . 19 (1): 458. doi : 10.1186/s12864-018-4857-9 . ПМК 6001144 . ПМИД 29898658 .
^ Линь С., Ченг С., Сонг Б., Чжун Х., Линь Х., Ли В. и др. (2015). « Геном Symbiodinium kawagutii проливает свет на экспрессию генов динофлагеллят и симбиоз кораллов» . Наука . 350 (6261): 691–4. Бибкод : 2015Sci...350..691L . дои : 10.1126/science.aad0408 . ПМИД 26542574 .
^ « S. kawagutii Сайт данных » . web.malab.cn/symka_new . Проверено 22 августа 2018 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б Стивенс Т.Г., Гонсалес-Пех Р.А., Ченг Й., Мохамед А.Р., Берт Д.В., Бхаттачарья Д. и др. (2020). «Геномы динофлагелляты Polarella glacialis кодируют тандемно повторяющиеся одноэкзонные гены с адаптивными функциями» . БМК Биология . 18 (1): 56. дои : 10.1186/s12915-020-00782-8 . ПМЦ 7245778 . ПМИД 32448240 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Стивенс, Тимоти; Рэган, Марк; Бхаттачарья, Дебашиш; Чан, Чонг Синь (2020). « Polarella Сайт данных ». дои : 10.14264/uql.2020.222 . S2CID 216542238 . {{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется |journal= ( помощь )
^ Аранда М., Ли Ю., Лью Ю.Дж., Баумгартен С., Симаков О., Уилсон М.К. и др. (2016). «Геномы коралловых динофлагеллят-симбионтов подчеркивают эволюционные адаптации, способствующие симбиотическому образу жизни» . Научные отчеты . 6 : 39734. Бибкод : 2016NatSR...639734A . дои : 10.1038/srep39734 . ПМК 5177918 . ПМИД 28004835 .
^ «Сайт данных рифовой геномики» . smic.reefgenomics.org . Проверено 22 августа 2018 г.
^ «Информация — Cryptophyceae sp. CCMP2293 v1.0» . genome.jgi.doe.gov . Проверено 31 июля 2018 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж «Водоросли» . genome.jgi.doe.gov . Проверено 31 июля 2018 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б Кертис Б.А., Танифудзи Г., Бурки Ф., Грубер А., Иримия М., Маруяма С. и др. (декабрь 2012 г.). «Геномы водорослей раскрывают эволюционный мозаицизм и судьбу нуклеоморфов» . Природа . 492 (7427): 59–65. Бибкод : 2012Natur.492...59C . дои : 10.1038/nature11681 . ПМИД 23201678 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п ^д ^р ^с ^т ^в ^v ^В ^х ^и ^С ^аа ^аб ^и ^{объявление} ^но ^из ^в ^ах ^есть ^также «Дом | Теплица» . парниковый.lanl.gov . Проверено 11 июля 2018 г.
^ Прайс Д.С., Чан С.Х., Юн Х.С., Ян Э.К., Цю Х., Вебер А.П. и др. (февраль 2012 г.). «Геном Cyanophora paradoxa объясняет происхождение фотосинтеза у водорослей и растений». Наука . 335 (6070): 843–7. Бибкод : 2012Sci...335..843P . дои : 10.1126/science.1213561 . ПМИД 22344442 . S2CID 17190180 .
^ «Проект генома цианофоры» . cyanophora.rutgers.edu . Проверено 12 июля 2018 г.
^ Прайс Д.С., Гуденаф У.В., Рот Р., Ли Дж.Х., Кариявасам Т., Мутвил М. и др. (август 2019 г.). «Анализ улучшенной сборки генома Cyanophora paradoxa » . Исследование ДНК . 26 (4): 289–299. дои : 10.1093/dnares/dsz009 . ПМК 6704402 . ПМИД 31098614 .
^ «Проект «Геном цианофоры v2»» . cyanophora.rutgers.edu/cyanophora_v2018 . Проверено 1 августа 2019 г.
^ "Информация - Asterochromis sp. Cgr/DA1pho v2.0" . genome.jgi.doe.gov . Проверено 31 июля 2018 г.
^ Гао С, Ван Ю, Шэнь Ю, Ян Д, Хэ Х, Дай Дж, Ву Ц (июль 2014 г.). «Механизмы накопления нефти маслянистой микроводоросли Chlorella protothecoides, выявленные через ее геном, транскриптомы и протеомы» . БМК Геномика . 15 (1): 582. дои : 10.1186/1471-2164-15-582 . ПМК 4111847 . ПМИД 25012212 .
^ Моро Х., Верхельст Б., Кулу А., Дерелл Э., Ромбо С., Гримсли Н. и др. (август 2012 г.). «Функциональность генов и структура генома Bathycoccus prasinos отражают клеточную специализацию, лежащую в основе зеленой линии» . Геномная биология . 13 (8): С74. дои : 10.1186/gb-2012-13-8-r74 . ПМЦ 3491373 . ПМИД 22925495 .
^ «Фитозом» . phytozome.jgi.doe.gov . Проверено 12 июля 2018 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час «Фитозом» . phytozome.jgi.doe.gov . Проверено 12 июля 2018 г.
^ «CSI_1228 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 13 июля 2018 г.
^ «ASM313072v1 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 13 июля 2018 г.
^ «ASM311615v1 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 13 июля 2018 г.
^ Блан Г., Дункан Г., Агаркова И., Бородовский М., Гурнон Дж., Куо А. и др. (сентябрь 2010 г.). «Геном Chlorella variabilis NC64A демонстрирует адаптацию к фотосимбиозу, коэволюцию с вирусами и загадочный пол» . Растительная клетка . 22 (9): 2943–55. дои : 10.1105/tpc.110.076406 . ПМЦ 2965543 . ПМИД 20852019 .
^ «ASM102112v1 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 13 июля 2018 г.
^ «Coccomyxa subellipsoidae v2.0 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 13 июля 2018 г.
^ «Dsal_v1.0 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 13 июля 2018 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б Хидеки; Тойода, Ацуши; Миягисима, Шин-я (08.03.2018). Хамаджи, Такаси; Каваи-Тойока, Харука; Судзуки, Масахиро , с уменьшенной областью, определяющей пол, в зеленых водорослях вольвоцина» . Communications Biology . 1 (1): 17. doi : 10.1038/ . ISSN 2399-3642 . PMC 6123790. . PMID 30271904 s42003-018-0019-5
^ «ASM158458v1 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 6 апреля 2022 г.
^ «Информация – Преимущества Micromonas NOUM17 (RCC 299)» . genome.jgi.doe.gov . Проверено 31 июля 2018 г.
^ Уорден А.З., Ли Дж.Х., Мок Т., Рузе П., Симмонс М.П., Аэртс А.Л. и др. (апрель 2009 г.). «Зеленая эволюция и динамические адаптации, выявленные геномами морских пикоэукариот Micromonas» . Наука . 324 (5924): 268–72. Бибкод : 2009Sci...324..268W . дои : 10.1126/science.1167222 . ОСТИ 1165274 . ПМИД 19359590 . S2CID 206516961 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Уорден А.З., Ли Дж.Х., Мок Т., Рузе П., Симмонс М.П., Аэртс А.Л. и др. (апрель 2009 г.). «Зеленая эволюция и динамические адаптации, выявленные геномами морских пикоэукариот Micromonas». Наука . 324 (5924): 268–72. Бибкод : 2009Sci...324..268W . дои : 10.1126/science.1167222 . ОСТИ 1165274 . ПМИД 19359590 . S2CID 206516961 .
^ Боген С., Аль-Дилаими А., Альберсмайер А., Вихманн Дж., Грундманн М., Рупп О. и др. (декабрь 2013 г.). «Реконструкция липидного обмена микроводоросли Monoraphidium ignoreum по последовательности ее генома выявила характеристики, подходящие для производства биотоплива» . БМК Геномика . 14 :926. дои : 10.1186/1471-2164-14-926 . ПМЦ 3890519 . ПМИД 24373495 .
^ Паленик Б., Гримвуд Дж., Аэртс А., Рузе П., Саламов А., Патнэм Н. и др. (май 2007 г.). «Крошечный эукариот Ostreococcus дает геномное представление о парадоксе видообразования планктона» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (18): 7705–10. Бибкод : 2007PNAS..104.7705P . дои : 10.1073/pnas.0611046104 . ПМК 1863510 . ПМИД 17460045 .
^ Блан-Матье Р., Верхельст Б., Дерель Э., Ромбо С., Буже Ф.Ю., Карре И. и др. (декабрь 2014 г.). «Улучшенный геном модельной морской водоросли Ostreococcus tauri раскрывается путем оценки сборок Illumina de novo» . БМК Геномика . 15 (1): 1103. дои : 10.1186/1471-2164-15-1103 . ПМК 4378021 . ПМИД 25494611 .
^ «Информация – Ostreococcus sp. RCC809» . genome.jgi.doe.gov . Проверено 16 июля 2018 г.
^ «Домой — Ostreococcus sp. RCC809» . genome.jgi.doe.gov . Проверено 26 июля 2018 г.
^ Гонсалес-Эскер ЧР, Твари С.Н., Ховде Б.Т., Штаркенбург С.Р. (январь 2018 г.). «Пикохлорум солоцецизм» . Геномные объявления . 6 (4): e01498–17. doi : 10.1128/genomeA.01498-17 . ПМЦ 5786678 . ПМИД 29371352 .
^ Фофлонкер Ф, Прайс Д.С., Цю Х, Паленик Б, Ван С, Бхаттачарья Д (февраль 2015 г.). «Геном галотолерантной зеленой водоросли Picochromum sp. раскрывает стратегии процветания в меняющихся условиях окружающей среды». Экологическая микробиология . 17 (2): 412–26. Бибкод : 2015EnvMi..17..412F . дои : 10.1111/1462-2920.12541 . ПМИД 24965277 . S2CID 23615707 .
^ Старкенбург С.Р., Полле Дж.Э., Ховде Б., Далиго Х.Э., Давенпорт К.В., Хуанг А. и др. (август 2017 г.). "Штамм Scenedesmus obliquus DOE0152z " Геномные объявления . 5 (32). doi : 10.1128/genomeA.00617-17 . ПМЦ 5552973 . ПМИД 28798164 .
^ «Информация - Symbiochromis reticulata Africa, извлеченный метагеном v1.0» . genome.jgi.doe.gov . Проверено 31 июля 2018 г.
^ Сюй, Ян; Ван, Хунли; Саху, Сунил Кумар; Ли, Линьчжоу; Лян, Хунпин; Гюнтер, Герд; Вонг, Гейн Ка-Шу; Мелконян, Барбара; Мелконян, Михаил; Лю, Хуан; Ван, Сибо (август 2022 г.). «Геном Pedinomonas major (Chlorophyta) на уровне хромосом демонстрирует адаптацию к абиотическому стрессу в быстро меняющейся среде» . Новый фитолог . 235 (4): 1409–1425. дои : 10.1111/nph.18220 . ISSN 0028-646X . ПМИД 35560066 . S2CID 248778022 .
^ Прочник С.Е., Умен Дж., Недельку А.М., Холлманн А., Миллер С.М., Ниши И. и др. (июль 2010 г.). «Геномный анализ сложности организма многоклеточной зеленой водоросли Volvox carteri» . Наука . 329 (5988): 223–6. Бибкод : 2010Sci...329..223P . дои : 10.1126/science.1188800 . ПМЦ 2993248 . ПМИД 20616280 .
^ «ASM288719v1 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 11 июля 2018 г.
^ «Ctobinv2 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 27 июля 2018 г.
^ Прочтите BA, Kegel J, Klute MJ, Kuo A, Lefebvre SC, Maumus F и др. (июль 2013 г.). «Пангеном фитопланктона Emiliania лежит в основе его глобального распространения» . Природа . 499 (7457): 209–13. Бибкод : 2013Natur.499..209. . дои : 10.1038/nature12221 . hdl : 1854/LU-4120924 . ПМИД 23760476 .
^ "Информация - Pavlovales sp. CCMP2436 v1.0" . genome.jgi.doe.gov . Проверено 31 июля 2018 г.
^ Гоблер С.Дж., Берри Д.Л., Дюрман С.Т., Вильгельм С.В., Саламов А., Лобанов А.В. и др. (март 2011 г.). «Ниша вредоносной водоросли Aureococcus anophagefferens выявлена методами экогеномики» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (11): 4352–7. Бибкод : 2011PNAS..108.4352G . дои : 10.1073/pnas.1016106108 . ПМК 3060233 . ПМИД 21368207 .
^ «ASM31002v1 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 11 июля 2018 г.
^ Мок Т., Отиллар Р.П., Штраус Дж., Макмаллан М., Пааянен П., Шмутц Дж. и др. (январь 2017 г.). «Эволюционная геномика адаптированной к холоду диатомовой водоросли Fragilariopsis cylindrus» . Природа . 541 (7638): 536–540. Бибкод : 2017Natur.541..536M . дои : 10.1038/nature20803 . hdl : 10754/622831 . ПМИД 28092920 .
^ Кортеджиани Карпинелли Е., Телатин А., Витуло Н., Форкато С., Д'Анджело М., Скьявон Р. и др. (февраль 2014 г.). «Сборка генома в хромосомном масштабе и профилирование транскриптома Nannochromopsis gaditana при истощении азота» . Молекулярный завод . 7 (2): 323–35. дои : 10.1093/mp/sst120 . ПМИД 23966634 .
^ «ASM187094v1 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 26 июля 2018 г.
^ «ASM161424v1 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 26 июля 2018 г.
^ «Информация - Ochromonadaceae sp. CCMP2298 v1.0» . genome.jgi.doe.gov . Проверено 2 августа 2018 г.
^ "Информация - Pelagophyceae sp. CCMP2097 v1.0" . genome.jgi.doe.gov . Проверено 2 августа 2018 г.
^ «Phaeodactylum tricornutum (ID 418) — Геном — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 26 июля 2018 г.
^ "Информация - Псевдоницсия многосерийная CLN-47" . genome.jgi.doe.gov . Проверено 2 августа 2018 г.
^ «SJ6.1 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 27 июля 2018 г.
^ Цзян Цз, Лю С, Ву Ю, Цзян Х, Чжоу К (2017). «Разнообразие млекопитающих Китая (2-е издание)» . Наука о биоразнообразии . 25 (8): 886–895. дои : 10.17520/biods.2017098 .
^ «ASM14940v2 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 27 июля 2018 г.
^ Нодзаки Х., Такано Х., Мисуми О., Терасава К., Мацузаки М., Маруяма С. и др. (июль 2007 г.). «100% полная последовательность обнаруживает необычайно простые геномные особенности красной водоросли из горячих источников Cyanidioschyzon merolae» . БМК Биология . 5:28 . дои : 10.1186/1741-7007-5-28 . ЧВК 1955436 . ПМИД 17623057 .
^ «ASM170485v1 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 30 июля 2018 г.
^ Ли Дж., Ян Э.К., Граф Л., Ян Дж.Х., Цю Х., Зелцион У. и др. (23 апреля 2018 г.). «Анализ проекта генома красной морской водоросли Gracilariopsis chorda дает представление об эволюции размера генома Rhodophyta» . Молекулярная биология и эволюция . 35 (8): 1869–1886. дои : 10.1093/molbev/msy081 . ПМИД 29688518 .
^ Бхаттачарья Д., Прайс Д.С., Чан С.Х., Цю Х., Роуз Н., Болл С. и др. (17 июня 2013 г.). «Геном красной водоросли Porphyridium purpureum» . Природные коммуникации . 4 (1): 1941. Бибкод : 2013NatCo...4.1941B . дои : 10.1038/ncomms2931 . ПМЦ 3709513 . ПМИД 23770768 .
^ Броули С.Х., Блуэн Н.А., Фико-Блин Е., Уиллер Г.Л., Лор М., Гудсон Х.В. и др. (август 2017 г.). «Porphyra umbilicalis (Bangiophyceae, Rhodophyta)» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 114 (31): E6361–E6370. Бибкод : 2017PNAS..114E6361B . дои : 10.1073/pnas.1703088114 . ПМЦ 5547612 . ПМИД 28716924 .
^ Накамура Ю., Сасаки Н., Кобаяши М., Одзима Н., Ясуике М., Сигенобу Ю. и др. (11 марта 2013 г.). «Первая свободная от симбионтов последовательность генома морской красной водоросли Сусабинори (Pyropia yezoensis)» . ПЛОС ОДИН . 8 (3): e57122. Бибкод : 2013PLoSO...857122N . дои : 10.1371/journal.pone.0057122 . ПМЦ 3594237 . ПМИД 23536760 .

[Shoguchi2013-1] Сёгути Э., Синдзато С., Кавасима Т., Гёджа Ф., Мунгпакди С., Коянаги Р. и др. (2013). «Проект сборки ядерного генома Symbiodinium minutum раскрывает структуру гена динофлагеллят» . Текущая биология 25 (15): 1399–1408. Бибкод : 2013CBio...23.1399S . дои : 10.1016/j.cub.2013.05.062 . ПМИД 23850284 .

[OISTMarineGenomics-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с «ОИСТ Морская Геномика» . Marinegenomics.oist.jp . Проверено 22 августа 2018 г.

[Liu2018-3] Перейти обратно: ^а ^б Лю Х., Стивенс Т.Г., Гонсалес-Пех Р.А., Бельтран В.Х., Лапейр Б., Бонгертс П. и др. (2018). « Геномы симбиодиниумов демонстрируют адаптивную эволюцию функций, связанных с симбиозом кораллов и динофлагеллят» . Коммуникационная биология . 1 : 95. дои : 10.1038/s42003-018-0098-3 . ПМК 6123633 . ПМИД 30271976 .

[ReFuGe_Site-4] Перейти обратно: ^а ^б «Сайт данных ReFuGe 2020» . Reflection2020.reefgenomics.org . Проверено 22 августа 2018 г.

[Shoguchi2018-5] Перейти обратно: ^а ^б Сёгути Э., Бидесси Г., Тада И., Хисата К., Кавасима Т., Такеучи Т. и др. (2018). «Два расходящихся генома Symbiodinium демонстрируют сохранение кластера генов биосинтеза солнцезащитного крема и недавно утраченных генов» . БМК Геномика . 19 (1): 458. doi : 10.1186/s12864-018-4857-9 . ПМК 6001144 . ПМИД 29898658 .

[Lin2015-6] Линь С., Ченг С., Сонг Б., Чжун Х., Линь Х., Ли В. и др. (2015). « Геном Symbiodinium kawagutii проливает свет на экспрессию генов динофлагеллят и симбиоз кораллов» . Наука . 350 (6261): 691–4. Бибкод : 2015Sci...350..691L . дои : 10.1126/science.aad0408 . ПМИД 26542574 .

[Skawagutii_Site-7] « S. kawagutii Сайт данных » . web.malab.cn/symka_new . Проверено 22 августа 2018 г.

[Stephens2020-8] Перейти обратно: ^а ^б Стивенс Т.Г., Гонсалес-Пех Р.А., Ченг Й., Мохамед А.Р., Берт Д.В., Бхаттачарья Д. и др. (2020). «Геномы динофлагелляты Polarella glacialis кодируют тандемно повторяющиеся одноэкзонные гены с адаптивными функциями» . БМК Биология . 18 (1): 56. дои : 10.1186/s12915-020-00782-8 . ПМЦ 7245778 . ПМИД 32448240 .

[Polarella_Site-9] Перейти обратно: ^а ^б Стивенс, Тимоти; Рэган, Марк; Бхаттачарья, Дебашиш; Чан, Чонг Синь (2020). « Polarella Сайт данных ». дои : 10.14264/uql.2020.222 . S2CID 216542238 . {{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется |journal= ( помощь )

[Aranda2016-10] Аранда М., Ли Ю., Лью Ю.Дж., Баумгартен С., Симаков О., Уилсон М.К. и др. (2016). «Геномы коралловых динофлагеллят-симбионтов подчеркивают эволюционные адаптации, способствующие симбиотическому образу жизни» . Научные отчеты . 6 : 39734. Бибкод : 2016NatSR...639734A . дои : 10.1038/srep39734 . ПМК 5177918 . ПМИД 28004835 .

[ReefGenomics-11] «Сайт данных рифовой геномики» . smic.reefgenomics.org . Проверено 22 августа 2018 г.

[12] «Информация — Cryptophyceae sp. CCMP2293 v1.0» . genome.jgi.doe.gov . Проверено 31 июля 2018 г.

[:3-13] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж «Водоросли» . genome.jgi.doe.gov . Проверено 31 июля 2018 г.

[:2-14] Перейти обратно: ^а ^б Кертис Б.А., Танифудзи Г., Бурки Ф., Грубер А., Иримия М., Маруяма С. и др. (декабрь 2012 г.). «Геномы водорослей раскрывают эволюционный мозаицизм и судьбу нуклеоморфов» . Природа . 492 (7427): 59–65. Бибкод : 2012Natur.492...59C . дои : 10.1038/nature11681 . ПМИД 23201678 .

[:0-15] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час ^я ^дж ^к ^л ^м ^н ^тот ^п ^д ^р ^с ^т ^в ^v ^В ^х ^и ^С ^аа ^аб ^и ^{объявление} ^но ^из ^в ^ах ^есть ^также «Дом | Теплица» . парниковый.lanl.gov . Проверено 11 июля 2018 г.

[16] Прайс Д.С., Чан С.Х., Юн Х.С., Ян Э.К., Цю Х., Вебер А.П. и др. (февраль 2012 г.). «Геном Cyanophora paradoxa объясняет происхождение фотосинтеза у водорослей и растений». Наука . 335 (6070): 843–7. Бибкод : 2012Sci...335..843P . дои : 10.1126/science.1213561 . ПМИД 22344442 . S2CID 17190180 .

[17] «Проект генома цианофоры» . cyanophora.rutgers.edu . Проверено 12 июля 2018 г.

[18] Прайс Д.С., Гуденаф У.В., Рот Р., Ли Дж.Х., Кариявасам Т., Мутвил М. и др. (август 2019 г.). «Анализ улучшенной сборки генома Cyanophora paradoxa » . Исследование ДНК . 26 (4): 289–299. дои : 10.1093/dnares/dsz009 . ПМК 6704402 . ПМИД 31098614 .

[19] «Проект «Геном цианофоры v2»» . cyanophora.rutgers.edu/cyanophora_v2018 . Проверено 1 августа 2019 г.

[20] "Информация - Asterochromis sp. Cgr/DA1pho v2.0" . genome.jgi.doe.gov . Проверено 31 июля 2018 г.

[21] Гао С, Ван Ю, Шэнь Ю, Ян Д, Хэ Х, Дай Дж, Ву Ц (июль 2014 г.). «Механизмы накопления нефти маслянистой микроводоросли Chlorella protothecoides, выявленные через ее геном, транскриптомы и протеомы» . БМК Геномика . 15 (1): 582. дои : 10.1186/1471-2164-15-582 . ПМК 4111847 . ПМИД 25012212 .

[22] Моро Х., Верхельст Б., Кулу А., Дерелл Э., Ромбо С., Гримсли Н. и др. (август 2012 г.). «Функциональность генов и структура генома Bathycoccus prasinos отражают клеточную специализацию, лежащую в основе зеленой линии» . Геномная биология . 13 (8): С74. дои : 10.1186/gb-2012-13-8-r74 . ПМЦ 3491373 . ПМИД 22925495 .

[23] «Фитозом» . phytozome.jgi.doe.gov . Проверено 12 июля 2018 г.

[:1-24] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г ^час «Фитозом» . phytozome.jgi.doe.gov . Проверено 12 июля 2018 г.

[25] «CSI_1228 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 13 июля 2018 г.

[26] «ASM313072v1 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 13 июля 2018 г.

[27] «ASM311615v1 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 13 июля 2018 г.

[28] Блан Г., Дункан Г., Агаркова И., Бородовский М., Гурнон Дж., Куо А. и др. (сентябрь 2010 г.). «Геном Chlorella variabilis NC64A демонстрирует адаптацию к фотосимбиозу, коэволюцию с вирусами и загадочный пол» . Растительная клетка . 22 (9): 2943–55. дои : 10.1105/tpc.110.076406 . ПМЦ 2965543 . ПМИД 20852019 .

[29] «ASM102112v1 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 13 июля 2018 г.

[30] «Coccomyxa subellipsoidae v2.0 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 13 июля 2018 г.

[31] «Dsal_v1.0 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 13 июля 2018 г.

[hamaji1-32] Перейти обратно: ^а ^б Хидеки; Тойода, Ацуши; Миягисима, Шин-я (08.03.2018). Хамаджи, Такаси; Каваи-Тойока, Харука; Судзуки, Масахиро , с уменьшенной областью, определяющей пол, в зеленых водорослях вольвоцина» . Communications Biology . 1 (1): 17. doi : 10.1038/ . ISSN 2399-3642 . PMC 6123790. . PMID 30271904 s42003-018-0019-5

[33] «ASM158458v1 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 6 апреля 2022 г.

[34] «Информация – Преимущества Micromonas NOUM17 (RCC 299)» . genome.jgi.doe.gov . Проверено 31 июля 2018 г.

[35] Уорден А.З., Ли Дж.Х., Мок Т., Рузе П., Симмонс М.П., Аэртс А.Л. и др. (апрель 2009 г.). «Зеленая эволюция и динамические адаптации, выявленные геномами морских пикоэукариот Micromonas» . Наука . 324 (5924): 268–72. Бибкод : 2009Sci...324..268W . дои : 10.1126/science.1167222 . ОСТИ 1165274 . ПМИД 19359590 . S2CID 206516961 .

[Worden_268–272-36] Перейти обратно: ^а ^б Уорден А.З., Ли Дж.Х., Мок Т., Рузе П., Симмонс М.П., Аэртс А.Л. и др. (апрель 2009 г.). «Зеленая эволюция и динамические адаптации, выявленные геномами морских пикоэукариот Micromonas». Наука . 324 (5924): 268–72. Бибкод : 2009Sci...324..268W . дои : 10.1126/science.1167222 . ОСТИ 1165274 . ПМИД 19359590 . S2CID 206516961 .

[37] Боген С., Аль-Дилаими А., Альберсмайер А., Вихманн Дж., Грундманн М., Рупп О. и др. (декабрь 2013 г.). «Реконструкция липидного обмена микроводоросли Monoraphidium ignoreum по последовательности ее генома выявила характеристики, подходящие для производства биотоплива» . БМК Геномика . 14 :926. дои : 10.1186/1471-2164-14-926 . ПМЦ 3890519 . ПМИД 24373495 .

[38] Паленик Б., Гримвуд Дж., Аэртс А., Рузе П., Саламов А., Патнэм Н. и др. (май 2007 г.). «Крошечный эукариот Ostreococcus дает геномное представление о парадоксе видообразования планктона» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (18): 7705–10. Бибкод : 2007PNAS..104.7705P . дои : 10.1073/pnas.0611046104 . ПМК 1863510 . ПМИД 17460045 .

[39] Блан-Матье Р., Верхельст Б., Дерель Э., Ромбо С., Буже Ф.Ю., Карре И. и др. (декабрь 2014 г.). «Улучшенный геном модельной морской водоросли Ostreococcus tauri раскрывается путем оценки сборок Illumina de novo» . БМК Геномика . 15 (1): 1103. дои : 10.1186/1471-2164-15-1103 . ПМК 4378021 . ПМИД 25494611 .

[40] «Информация – Ostreococcus sp. RCC809» . genome.jgi.doe.gov . Проверено 16 июля 2018 г.

[41] «Домой — Ostreococcus sp. RCC809» . genome.jgi.doe.gov . Проверено 26 июля 2018 г.

[42] Гонсалес-Эскер ЧР, Твари С.Н., Ховде Б.Т., Штаркенбург С.Р. (январь 2018 г.). «Пикохлорум солоцецизм» . Геномные объявления . 6 (4): e01498–17. doi : 10.1128/genomeA.01498-17 . ПМЦ 5786678 . ПМИД 29371352 .

[43] Фофлонкер Ф, Прайс Д.С., Цю Х, Паленик Б, Ван С, Бхаттачарья Д (февраль 2015 г.). «Геном галотолерантной зеленой водоросли Picochromum sp. раскрывает стратегии процветания в меняющихся условиях окружающей среды». Экологическая микробиология . 17 (2): 412–26. Бибкод : 2015EnvMi..17..412F . дои : 10.1111/1462-2920.12541 . ПМИД 24965277 . S2CID 23615707 .

[44] Старкенбург С.Р., Полле Дж.Э., Ховде Б., Далиго Х.Э., Давенпорт К.В., Хуанг А. и др. (август 2017 г.). "Штамм Scenedesmus obliquus DOE0152z " Геномные объявления . 5 (32). doi : 10.1128/genomeA.00617-17 . ПМЦ 5552973 . ПМИД 28798164 .

[45] «Информация - Symbiochromis reticulata Africa, извлеченный метагеном v1.0» . genome.jgi.doe.gov . Проверено 31 июля 2018 г.

[46] Сюй, Ян; Ван, Хунли; Саху, Сунил Кумар; Ли, Линьчжоу; Лян, Хунпин; Гюнтер, Герд; Вонг, Гейн Ка-Шу; Мелконян, Барбара; Мелконян, Михаил; Лю, Хуан; Ван, Сибо (август 2022 г.). «Геном Pedinomonas major (Chlorophyta) на уровне хромосом демонстрирует адаптацию к абиотическому стрессу в быстро меняющейся среде» . Новый фитолог . 235 (4): 1409–1425. дои : 10.1111/nph.18220 . ISSN 0028-646X . ПМИД 35560066 . S2CID 248778022 .

[47] Прочник С.Е., Умен Дж., Недельку А.М., Холлманн А., Миллер С.М., Ниши И. и др. (июль 2010 г.). «Геномный анализ сложности организма многоклеточной зеленой водоросли Volvox carteri» . Наука . 329 (5988): 223–6. Бибкод : 2010Sci...329..223P . дои : 10.1126/science.1188800 . ПМЦ 2993248 . ПМИД 20616280 .

[48] «ASM288719v1 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 11 июля 2018 г.

[49] «Ctobinv2 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 27 июля 2018 г.

[50] Прочтите BA, Kegel J, Klute MJ, Kuo A, Lefebvre SC, Maumus F и др. (июль 2013 г.). «Пангеном фитопланктона Emiliania лежит в основе его глобального распространения» . Природа . 499 (7457): 209–13. Бибкод : 2013Natur.499..209. . дои : 10.1038/nature12221 . hdl : 1854/LU-4120924 . ПМИД 23760476 .

[51] "Информация - Pavlovales sp. CCMP2436 v1.0" . genome.jgi.doe.gov . Проверено 31 июля 2018 г.

[52] Гоблер С.Дж., Берри Д.Л., Дюрман С.Т., Вильгельм С.В., Саламов А., Лобанов А.В. и др. (март 2011 г.). «Ниша вредоносной водоросли Aureococcus anophagefferens выявлена методами экогеномики» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (11): 4352–7. Бибкод : 2011PNAS..108.4352G . дои : 10.1073/pnas.1016106108 . ПМК 3060233 . ПМИД 21368207 .

[53] «ASM31002v1 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 11 июля 2018 г.

[54] Мок Т., Отиллар Р.П., Штраус Дж., Макмаллан М., Пааянен П., Шмутц Дж. и др. (январь 2017 г.). «Эволюционная геномика адаптированной к холоду диатомовой водоросли Fragilariopsis cylindrus» . Природа . 541 (7638): 536–540. Бибкод : 2017Natur.541..536M . дои : 10.1038/nature20803 . hdl : 10754/622831 . ПМИД 28092920 .

[55] Кортеджиани Карпинелли Е., Телатин А., Витуло Н., Форкато С., Д'Анджело М., Скьявон Р. и др. (февраль 2014 г.). «Сборка генома в хромосомном масштабе и профилирование транскриптома Nannochromopsis gaditana при истощении азота» . Молекулярный завод . 7 (2): 323–35. дои : 10.1093/mp/sst120 . ПМИД 23966634 .

[56] «ASM187094v1 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 26 июля 2018 г.

[57] «ASM161424v1 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 26 июля 2018 г.

[58] «Информация - Ochromonadaceae sp. CCMP2298 v1.0» . genome.jgi.doe.gov . Проверено 2 августа 2018 г.

[59] "Информация - Pelagophyceae sp. CCMP2097 v1.0" . genome.jgi.doe.gov . Проверено 2 августа 2018 г.

[60] «Phaeodactylum tricornutum (ID 418) — Геном — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 26 июля 2018 г.

[61] "Информация - Псевдоницсия многосерийная CLN-47" . genome.jgi.doe.gov . Проверено 2 августа 2018 г.

[62] «SJ6.1 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 27 июля 2018 г.

[63] Цзян Цз, Лю С, Ву Ю, Цзян Х, Чжоу К (2017). «Разнообразие млекопитающих Китая (2-е издание)» . Наука о биоразнообразии . 25 (8): 886–895. дои : 10.17520/biods.2017098 .

[64] «ASM14940v2 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 27 июля 2018 г.

[65] Нодзаки Х., Такано Х., Мисуми О., Терасава К., Мацузаки М., Маруяма С. и др. (июль 2007 г.). «100% полная последовательность обнаруживает необычайно простые геномные особенности красной водоросли из горячих источников Cyanidioschyzon merolae» . БМК Биология . 5:28 . дои : 10.1186/1741-7007-5-28 . ЧВК 1955436 . ПМИД 17623057 .

[66] «ASM170485v1 — Геном — Сборка — NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 30 июля 2018 г.

[67] Ли Дж., Ян Э.К., Граф Л., Ян Дж.Х., Цю Х., Зелцион У. и др. (23 апреля 2018 г.). «Анализ проекта генома красной морской водоросли Gracilariopsis chorda дает представление об эволюции размера генома Rhodophyta» . Молекулярная биология и эволюция . 35 (8): 1869–1886. дои : 10.1093/molbev/msy081 . ПМИД 29688518 .

[68] Бхаттачарья Д., Прайс Д.С., Чан С.Х., Цю Х., Роуз Н., Болл С. и др. (17 июня 2013 г.). «Геном красной водоросли Porphyridium purpureum» . Природные коммуникации . 4 (1): 1941. Бибкод : 2013NatCo...4.1941B . дои : 10.1038/ncomms2931 . ПМЦ 3709513 . ПМИД 23770768 .

[69] Броули С.Х., Блуэн Н.А., Фико-Блин Е., Уиллер Г.Л., Лор М., Гудсон Х.В. и др. (август 2017 г.). «Porphyra umbilicalis (Bangiophyceae, Rhodophyta)» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 114 (31): E6361–E6370. Бибкод : 2017PNAS..114E6361B . дои : 10.1073/pnas.1703088114 . ПМЦ 5547612 . ПМИД 28716924 .

[70] Накамура Ю., Сасаки Н., Кобаяши М., Одзима Н., Ясуике М., Сигенобу Ю. и др. (11 марта 2013 г.). «Первая свободная от симбионтов последовательность генома морской красной водоросли Сусабинори (Pyropia yezoensis)» . ПЛОС ОДИН . 8 (3): e57122. Бибкод : 2013PLoSO...857122N . дои : 10.1371/journal.pone.0057122 . ПМЦ 3594237 . ПМИД 23536760 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

[ 30 ]

[ 31 ]

[ 32 ]

[ 33 ]

[ 34 ]

[ 35 ]

[ 36 ]

[ 37 ]

[ 38 ]

[ 39 ]

[ 40 ]

[ 41 ]

[ 42 ]

[ 43 ]

[ 44 ]

[ 45 ]

[ 46 ]

[ 47 ]

[ 48 ]

[ 49 ]

[ 50 ]

[ 51 ]

[ 52 ]

[ 53 ]

[ 54 ]

[ 55 ]

[ 56 ]

[ 57 ]

[ 58 ]

[ 59 ]

[ 60 ]

[ 61 ]

[ 62 ]

[ 63 ]

[ 64 ]

[ 65 ]

[ 66 ]

[ 67 ]

[ 68 ]

[ 69 ]

[ 70 ]