✖


Jump to content

Список секвенированных геномов протистов

    Add links

    Этот список секвенированных геномов протистов содержит все известные виды протистов , имеющие общедоступные полные последовательности генома, которые были собраны, аннотированы и опубликованы; черновые геномы не включены, а также последовательности органелл.

    Альвеолата

    [ редактировать ]

    Alveolata — группа простейших, в которую входят Ciliophora , Apicomplexa и Dinoflagellata . Представители этой группы представляют особый интерес для науки как причина серьезных заболеваний человека и домашнего скота.

    Организм Тип Актуальность Размер генома Прогнозируемое количество генов Организация Год завершения Статус сборки Ссылки
    Бабезия Бовис Апикомплексан Возбудитель крупного рогатого скота 8,2 Мб 3,671 2007 [1]
    Breviolum minutum ( Symbiodinium minutum; клада B1) Динофлагеллята Коралловый симбионт 1,5 ГБ 47,014 Окинавский институт науки и технологий 2013 [2] Черновик ОИСТ Морская Геномика [3]
    Cladocopium goreaui ( Symbiodinium goreaui; Clade C1) Динофлагеллята Коралловый симбионт 1,19 ГБ 35,913 Геномика будущего рифа (ReFuGe) 2020 / Университет Квинсленда 2018 [4] Черновик РЕФУГЕ 2020 [5]
    Cladocopium Штамм C92 Y103 ( Symbiodinium sp. clade C; предполагаемый тип C92) Динофлагеллята Фораминиферовый симбионт Неизвестно (размер сборки 0,70 Гб) 65,832 Окинавский институт науки и технологий 2018 [6] Черновик ОИСТ Морская Геномика [3]
    Криптоспоридий манус
    Штамм: TU502     		Апикомплексан Человеческий патоген 10,4 МБ 3,994 [7] Университет Содружества Вирджинии 2004 [7]
    Криптоспоридий парвум
    Изолят C- или генотипа 2     		Апикомплексан Человеческий патоген 16,5 Мб 3,807 [8] UCSF и Университет Миннесоты 2004 [8]
    Эймерия тенелла
    Штамм Хоутона     		Апикомплексан Кишечный паразит домашней птицы 55-60 Мб [9] Институт Wellcome Trust Sanger [10] Доступно для скачивания; [10] 2007 для Chr 1 [11]
    Fugacium kawagutii CS156=CCMP2468 ( Symbiodinium kawagutii ; клада F1) Динофлагеллята Коралловый симбионт? 1,07 ГБ 26,609 Геномика будущего рифа (ReFuGe) 2020 / Университет Квинсленда 2018 [4] Черновик РЕФУГЕ 2020 [5]
    Fugacium kawagutii CCMP2468 ( Symbiodinium kawagutii ; клада F1) Динофлагеллята Коралловый симбионт? 1,18 ГБ 36,850 Университет Коннектикута / Университет Сямэнь 2015 [12] Черновик S. kawagutii Проект генома [13]
    Неоспора собачья Апикомплексан Возбудитель для крупного рогатого скота и собак. 62 Мб [14] Институт Wellcome Trust Sanger [15] Доступно для скачивания [15]
    Парамеция тетраурелия Инфузория Модельный организм 72 Мб 39,642 [16] Геноскоп 2006 [16]
    Полярелла ледниковая CCMP1383 Динофлагеллята Психрофил, Антарктика 3,02 Гб (диплоид), 1,48 Гб (гаплоид) 58,232 Университет Квинсленда 2020 [17] Черновик UQ космическое пространство [18]
    Полярелла ледниковая CCMP2088 Динофлагеллята Психрофил, Арктика 2,65 Гб (диплоид), 1,30 Гб (гаплоид) 51,713 Университет Квинсленда 2020 [17] Черновик UQ космическое пространство [18]
    Плазмодий бергейский АНКА Апикомплексан Кроличья малярия 18,5 Мб [19] 4,900; [19] 11654 (УниПрот)
    Плазмодий шабауди Апикомплексан Малярия от грызунов 19,8 Мб [20] 5,000 [20]
    Плазмодий фальципарум
    Клон: 3D7     		Апикомплексан Человеческий возбудитель ( малярия ) 22,9 Мб 5,268 [21] Консорциум проекта генома малярии 2002 [21]
    Плазмодий ноулеси Апикомплексан Возбудитель приматов (малярия) 23,5 Мб 5,188 [22] 2008 [22]
    Плазмодий вивакс Апикомплексан Человеческий патоген (малярия) 26,8 Мб 5,433 [23] 2008 [23]
    Плазмодий yoelii yoelii
    Штамм: 17XNL     		Апикомплексан Возбудитель грызунов (малярия) 23,1 Мб 5,878 [24] ТИГР и НМРЦ 2002 [24]
    Symbiodinium microadriaticum (клад А) Динофлагеллята Коралловый симбионт 1,1 ГБ 49,109 Университет науки и технологий короля Абдаллы 2016 [25] Черновик Рифовая геномика [26]
    Symbiodinium Штамм A3 Y106 ( Symbiodinium sp. clade A3) Динофлагеллята симбионт Неизвестно (размер сборки 0,77 Гб) 69,018 Окинавский институт науки и технологий 2018 [6] Черновик ОИСТ Морская Геномика [3]
    Тетрахимена термофила Инфузория Модельный организм 104 Мб 27,000 [27] 2006 [27]
    Тейлерия кольцевидная
    Анкарский клон C9     		Апикомплексан Возбудитель крупного рогатого скота 8,3 Мб 3,792 Сэнгер 2005 [28]
    Тейлерия парва
    Штамм: Мугуга     		Апикомплексан Возбудитель крупного рогатого скота ( лихорадка восточного побережья Африки ) 8,3 Мб 4,035 [29] TIGR и Международный научно-исследовательский институт животноводства 2005 [29]
    Токсоплазма гондии
    GT1, ME49, штаммы VEG     		Апикомплексан Возбудитель млекопитающих 63 МБ (RefSeq) 8100 (UniProt) – 9000 (EuPathDB) Институт Дж. Крейга Вентера, TIGR, Университет Пенсильвании. 2008 [30]

    амебозоа

    [ редактировать ]

    Амебозоа — группа подвижных амебоидных протистов, представители этой группы передвигаются или питаются посредством временных выступов, называемых псевдоподиями . Самый известный представитель этой группы — слизевика , который изучается на протяжении веков; другие члены включают Archamoebae , Tubulinea и Flabellinia . Некоторые амебозы вызывают заболевания.

    Организм Тип Актуальность Размер генома Прогнозируемое количество генов Организация Год завершения
    Диктиостелиум дискоидеум
    Штамм: AX4     		Слизистая плесень Модельный организм 34 Мб 12,500 [31] Консорциум Кельнского университета, Медицинского колледжа Бэйлора и Центра Сэнгера. 2005 [31]
    Энтамеба гистолитическая
    ХМ1:ИМСС     		Паразитические простейшие Возбудитель человека ( амебная дизентерия ) 23,8 Мб 9,938 [32] TIGR, Институт Сэнгера и Лондонская школа гигиены и тропической медицины 2005 [32]
    Полисфондилий паллидум
    Штамм: PN500     		Слизистая плесень Модельный организм 12,939, [33] 12 350 (УниПрот) Институт возрастных исследований Лейбница 2009 [33]

    Хромиста

    [ редактировать ]

    Chromista страменопилес — группа простейших, в которую входят водорослевые типы ( Heterokontophyta ) , Haptophyta и Cryptophyta . Члены этой группы в основном изучаются в целях эволюционного интереса.

    Организм Тип Актуальность Размер генома Прогнозируемое количество генов Организация Год завершения
    Альбуго лайбахии Оомицет Арабидопсис паразит, биотроф 37 Мб [34] 13,032 [34] 2011 [34]
    Ауреококк анофагеференс
    Штамм: CCMP1984     		Пелагофит Объединенный институт генома Министерства энергетики США 2011 [35]
    Бигеловелла плавание хлорарахниофит Модельный организм нуклеоморф : 0,331 Мб
    ядерная: 95 Мб     		нуклеоморф : 373 [36]
    ядерная: >21 000 [37]     		нуклеоморф : Институт Холла Австралии , Univ. Мельбурн, Университет. до нашей эры
    ядерная энергия: Университет Далхаузи, Галифакс, Новая Шотландия, Канада.     		2006, [36] 2012 [37]
    Chroomonas mesostigmatica CCMP1168 Криптофита 2012 [38]
    Криптомонада парамеция Криптофита 2010 [39]
    Эмилиания Хаксли
    CCMP1516     		Кокколитофор ( фитопланктон ) 141,7 Мб [40] 30,569 [40] Объединенный институт генома 2013 [40]
    Эмилиания Хаксли
    РСС1217     		Кокколитофор ( фитопланктон ) Доступно для скачивания [41]
    Фрагилариопсис цилиндрический Диатомовая водоросль 61,1 Мб [42] 21,066 [42] Объединенный институт генома 2017 [42]
    Гильярдия тета Криптомонада Модельный организм 0,551 Мб ( только геном нуклеоморфа )
    87 Мб (ядерный геном)     		нуклеоморф: 465 [43] 513, 598 (УниПрот)
    ядерная: >21 000 [37]     		нуклеоморф: Канадский институт перспективных исследований, Университет Филиппа в Марбурге и Университет Британской Колумбии.
    ядерная энергия: Университет Далхаузи, Галифакс, Новая Шотландия, Канада.     		2001, [43] 2012 [37]
    Hemiselmis andersenii
    CCMP7644     		Криптомонада Модельный организм 0,572 Мб
    ( нуклеоморфа только геном )     		472, [44] 502 (УниПрот) Канадский институт перспективных исследований 2007 [44]
    Гиалопероноспора арабидопсидис Оомицет облигатный биотроф , Arabidopsis возбудитель ВУГСК 2010 [45]
    Наннохлоропис гадитана
    Штамм: CCMP526     		Эстигматофит Производство липидов, биотехнологические применения Институт биоинформатики Вирджинии 2012 [46]
    Phaeodactylum tricornutum
    Штамм: CCAP1055/1.     		Диатомовая водоросль 27,4 Мб 10,402 Объединенный институт генома 2008 [47]
    Фитофтора инфестанс
    Штамм: Т30-4     		Оомицет Великого голода в Ирландии Возбудитель Броуд Институт 2009 [48]
    Фитофтора ветвистая Оомицет внезапной гибели дуба Возбудитель 65 Мб (7x) 15,743 Объединенный институт генома и др. 2006 [49]
    Фитофтора соя Оомицет Соевый возбудитель 95 Мб (9x) 19,027 Объединенный институт генома и др. 2006 [49]
    Псевдоницсия многорядная Диатомовая водоросль Объединенный институт генома
    Плазмодиофора капустная Плазмодиофорид болезни килы Возбудитель 25,5 Мб 9,730 SLU Уппсала и др. 2015 [50]
    Последняя Пифия Оомицет вездесущий патоген растений 42,8 Мб 15,290 Университет штата Мичиган и др. 2010 [51]
    Талассиозира псевдонана
    Штамм:CCMP 1335     		Диатомовая водоросль 34,5 Мб 11,242 [52] Объединенный институт генома и Вашингтонский университет 2004 [52]

    Раскопать

    [ редактировать ]

    Excavata — это группа родственных свободноживущих и симбиотических простейших; в него входят Metamonada , Loukozoa , Euglenozoa и Percolozoa . Их роль в заболеваниях человека исследуется.

    Организм Тип Актуальность Размер генома Прогнозируемое количество генов Организация Год завершения
    Giardia enterica (комплекс G. duodenalis B) Паразитические простейшие Человеческий возбудитель ( лямблиоз ) 11,7 МБ 4,470 [53] многоцентровое сотрудничество 2009 [53]
    Лямблии двенадцатиперстной кишки
    АТСС 50803
    ( Комплекс лямблий двенадцатиперстной кишки А)
    		Паразитические простейшие Человеческий возбудитель ( лямблиоз ) 11,7 МБ 6,470, [54] 7153 (УниПрот) Каролинский институт, Морская биологическая лаборатория 2007 [54]
    Лейшмания бразильская
    МХОМ/BR/75M2904     		Паразитические простейшие Человеческий возбудитель ( лейшманиоз ) 33 Мб 8,314 [55] Институт Сэнгера , Университет Сан-Паулу, Имперский колледж 2007 [55]
    Лейшмания младенцев
    JPCM5     		Паразитические простейшие Человеческий возбудитель ( висцеральный лейшманиоз ) 33 Мб 8,195 [55] Институт Сэнгера, Имперский колледж и Университет Глазго 2007 [55]
    Лейшмания большая
    Штамм: Фридлин     		Паразитические простейшие Человеческий возбудитель ( кожный лейшманиоз ) 32,8 Мб 8,272 [56] Институт Сэнгера и Институт биомедицинских исследований Сиэтла 2005 [56]
    Неглерия грубери амебофлагеллята Отделился от других эукариот более 1 миллиарда лет назад. 41 Мб [57] 15,727 [57] 2010 [57]
    Трихомонада вагинальная Паразитические простейшие Возбудитель человека ( трихомониаз ) 160 Мб 59,681 [58] TIGR 2007 [58]
    Трипаносома брусей
    Штамм: TREU927/4 GUTat10.1.     		Паразитические простейшие Человеческий возбудитель ( сонная болезнь ) 26 Мб 9,068 [59] Sanger Institute and TIGR 2005 [59]
    Трипаносома крузи
    Штамм:CL Brener TC3     		Паразитические простейшие Возбудитель человека ( болезнь Шагаса ) 34 Мб 22,570 [60] TIGR, Институт биомедицинских исследований Сиэтла и Университет Упсалы 2005 [60]

    Опистоконты, базальные

    [ редактировать ]

    Опистоконты — это группа эукариот, включающая как животных , так и грибы , а также базальные группы, не отнесенные к этим группам. Эти базальные опистоконты обоснованно относят к простейшим и включают хоанофлагелляты , которые являются сестринской или близкой к сестринской группе животных.

    Организм Тип Актуальность Размер генома Прогнозируемое количество генов Организация Год завершения
    Моносига бревиколлис Хоанофлагеллята близкий родственник многоклеточных животных 41,6 Мб 9,200 [61] Объединенный институт генома 2007 [61]

    См. также

    [ редактировать ]

    Ссылки

    [ редактировать ]
    1. ^ Брайтон К.А., Лау А.О., Херндон Д.Р., Ханник Л., Капмейер Л.С., Беренс С.Дж. и др. (октябрь 2007 г.). «Последовательность генома Babesia bovis и сравнительный анализ апикомплексных гемопростейших» . ПЛОС Патогены . 3 (10): 1401–13. дои : 10.1371/journal.ppat.0030148 . ПМК   2034396 . ПМИД   17953480 .
    2. ^ Сёгучи Э., Синдзато С., Кавасима Т., Гёджа Ф., Мунгпакди С., Коянаги Р. и др. (август 2013 г.). «Проект сборки ядерного генома Symbiodinium minutum раскрывает структуру гена динофлагеллят» . Современная биология . 23 (15): 1399–408. дои : 10.1016/j.cub.2013.05.062 . ПМИД   23850284 .
    3. ^ Перейти обратно: а б с «ОИСТ Морская Геномика» . Marinegenomics.oist.jp . Проверено 22 августа 2018 г.
    4. ^ Перейти обратно: а б Лю Х., Стивенс Т.Г., Гонсалес-Пех Р.А., Бельтран В.Х., Лапейр Б., Бонгертс П. и др. (2018). «Геномы симбиодиниумов демонстрируют адаптивную эволюцию функций, связанных с симбиозом кораллов и динофлагеллят» . Коммуникационная биология . 1 : 95. дои : 10.1038/s42003-018-0098-3 . ПМК   6123633 . ПМИД   30271976 .
    5. ^ Перейти обратно: а б «Сайт данных ReFuGe 2020» . Reflection2020.reefgenomics.org . Проверено 7 сентября 2018 г.
    6. ^ Перейти обратно: а б Сёгути Э., Бидесси Г., Тада И., Хисата К., Кавасима Т., Такеучи Т. и др. (июнь 2018 г.). «Два расходящихся генома Symbiodinium демонстрируют сохранение кластера генов биосинтеза солнцезащитного крема и недавно утраченных генов» . БМК Геномика . 19 (1): 458. doi : 10.1186/s12864-018-4857-9 . ПМК   6001144 . ПМИД   29898658 .
    7. ^ Перейти обратно: а б Сюй П., Видмер Г., Ван Й., Озаки Л.С., Алвес Дж.М., Серрано М.Г. и др. (октябрь 2004 г.). «Геном Cryptosporidium hominis» . Природа . 431 (7012): 1107–12. Бибкод : 2004Natur.431.1107X . дои : 10.1038/nature02977 . ПМИД   15510150 .
    8. ^ Перейти обратно: а б Абрахамсен М.С., Темплтон Т.Дж., Эномото С., Абраханте Дж.Е., Чжу Г., Ланкто Калифорния и др. (апрель 2004 г.). «Полная последовательность генома апикомплексана Cryptosporidium parvum». Наука . 304 (5669): 441–5. Бибкод : 2004Sci...304..441A . дои : 10.1126/science.1094786 . ПМИД   15044751 . S2CID   26434820 .
    9. ^ генедб
    10. ^ Перейти обратно: а б Сэнгер
    11. ^ Линг К.Х., Раджандрим М.А., Ривайлер П., Ивенс А., Яп С.Дж., Мадейра А.М. и др. (март 2007 г.). «Секвенирование и анализ хромосомы 1 Eimeria tenella выявили уникальную сегментарную организацию» . Геномные исследования . 17 (3): 311–9. дои : 10.1101/гр.5823007 . ПМК   1800922 . ПМИД   17284678 .
    12. ^ Линь С., Ченг С., Сонг Б., Чжун Х., Линь Х., Ли В. и др. (ноябрь 2015 г.). «Геном Symbiodinium kawagutii проливает свет на экспрессию генов динофлагеллят и симбиоз кораллов» . Наука . 350 (6261): 691–4. Бибкод : 2015Sci...350..691L . дои : 10.1126/science.aad0408 . ПМИД   26542574 .
    13. ^ « S. kawagutii Сайт данных » . web.malab.cn/symka_new . Проверено 22 августа 2018 г.
    14. ^ генедб
    15. ^ Перейти обратно: а б Сэнгер
    16. ^ Перейти обратно: а б Аури Дж.М., Жайлон О., Дюре Л., Ноэль Б., Джубин С., Порсель Б.М. и др. (ноябрь 2006 г.). «Глобальные тенденции полногеномных дупликаций, выявленные инфузорией Paramecium Tetraurelia» . Природа . 444 (7116): 171–8. Бибкод : 2006Natur.444..171A . дои : 10.1038/nature05230 . ПМИД   17086204 .
    17. ^ Перейти обратно: а б Стивенс Т.Г., Гонсалес-Пех Р.А., Ченг Й., Мохамед А.Р., Берт Д.В., Бхаттачарья Д. и др. (2020). «Геномы динофлагелляты Polarella glacialis кодируют тандемно повторяющиеся одноэкзонные гены с адаптивными функциями» . БМК Биология . 18 (1): 56. дои : 10.1186/s12915-020-00782-8 . ПМЦ   7245778 . ПМИД   32448240 .
    18. ^ Перейти обратно: а б Стивенс, Тимоти; Рэган, Марк; Бхаттачарья, Дебашиш; Чан, Чонг Синь (2020). « Polarella Сайт данных ». дои : 10.14264/uql.2020.222 . S2CID   216542238 . {{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется |journal= ( помощь )
    19. ^ Перейти обратно: а б Запись ансамбля
    20. ^ Перейти обратно: а б Запись ансамбля
    21. ^ Перейти обратно: а б Гарднер М.Дж., Холл Н., Фунг Э., Уайт О., Берриман М., Хайман Р.В. и др. (октябрь 2002 г.). «Последовательность генома малярийного паразита человека Plasmodium falciparum» . Природа . 419 (6906): 498–511. Бибкод : 2002Natur.419..498G . дои : 10.1038/nature01097 . ПМЦ   3836256 . PMID   12368864 .
    22. ^ Перейти обратно: а б Пейн А., Бёме Ю., Берри А.Е., Мангалл К., Финн Р.Д., Джексон А.П. и др. (октябрь 2008 г.). «Геном малярийного паразита обезьяны и человека Plasmodium Knowlesi» . Природа . 455 (7214): 799–803. Бибкод : 2008Natur.455..799P . дои : 10.1038/nature07306 . ПМК   2656934 . ПМИД   18843368 .
    23. ^ Перейти обратно: а б Карлтон Дж.М., Адамс Дж.Х., Сильва Дж.К., Бидвелл С.Л., Лоренци Х., Калер Э. и др. (октябрь 2008 г.). «Сравнительная геномика забытого малярийного паразита человека Plasmodium vivax» . Природа . 455 (7214): 757–63. Бибкод : 2008Natur.455..757C . дои : 10.1038/nature07327 . ПМЦ   2651158 . ПМИД   18843361 .
    24. ^ Перейти обратно: а б Карлтон Дж.М., Ангиуоли С.В., Сух Б.Б., Коой Т.В., Пертеа М., Сильва Дж.К. и др. (октябрь 2002 г.). «Последовательность генома и сравнительный анализ модельного малярийного паразита грызунов Plasmodium yoelii yoelii» . Природа . 419 (6906): 512–9. Бибкод : 2002Natur.419..512C . дои : 10.1038/nature01099 . PMID   12368865 .
    25. ^ Аранда М., Ли Ю., Лью Ю.Дж., Баумгартен С., Симаков О., Уилсон М.К. и др. (декабрь 2016 г.). «Геномы коралловых динофлагеллят-симбионтов подчеркивают эволюционные адаптации, способствующие симбиотическому образу жизни» . Научные отчеты . 6 : 39734. Бибкод : 2016NatSR...639734A . дои : 10.1038/srep39734 . ПМК   5177918 . ПМИД   28004835 .
    26. ^ «Сайт данных рифовой геномики» . smic.reefgenomics.org . Проверено 22 августа 2018 г.
    27. ^ Перейти обратно: а б Эйзен Дж.А., Койн Р.С., Ву М., Ву Д., Тиагараджан М., Вортман Дж.Р. и др. (сентябрь 2006 г.). «Макронуклеарная последовательность генома инфузории Tetrahymena thermophila, модельного эукариота» . ПЛОС Биология . 4 (9): е286. doi : 10.1371/journal.pbio.0040286 . ПМЦ   1557398 . ПМИД   16933976 .
    28. ^ Пейн А., Рено Х., Берриман М., Мерфи Л., Йейтс К.А., Вейр В. и др. (июль 2005 г.). «Геном паразита, преобразующего клетку-хозяина, Theileria annulata в сравнении с T. parva» . Наука . 309 (5731): 131–3. Бибкод : 2005Sci...309..131P . дои : 10.1126/science.1110418 . ПМИД   15994557 .
    29. ^ Перейти обратно: а б Гарднер М.Дж., Бишоп Р., Шах Т., де Вильерс Э.П., Карлтон Дж.М., Холл Н. и др. (июль 2005 г.). «Последовательность генома Theileria parva, бычьего патогена, трансформирующего лимфоциты» . Наука . 309 (5731): 134–7. Бибкод : 2005Sci...309..134G . дои : 10.1126/science.1110439 . ПМИД   15994558 .
    30. ^ Геном NCBI T. gondii ME49
    31. ^ Перейти обратно: а б Эйхингер Л., Пачебат Дж.А., Глёкнер Г., Раджандрим М.А., Сукганг Р., Берриман М. и др. (май 2005 г.). «Геном социальной амебы Dictyostelium discoideum» . Природа . 435 (7038): 43–57. Бибкод : 2005Natur.435...43E . дои : 10.1038/nature03481 . ПМЦ   1352341 . ПМИД   15875012 .
    32. ^ Перейти обратно: а б Лофтус Б., Андерсон И., Дэвис Р., Алсмарк Калифорнийский университет, Самуэльсон Дж., Амедео П. и др. (февраль 2005 г.). «Геном простейшего паразита Entamoeba histolytica» (PDF) . Природа . 433 (7028): 865–8. Бибкод : 2005Natur.433..865L . дои : 10.1038/nature03291 . ПМИД   15729342 . S2CID   14231289 .
    33. ^ Перейти обратно: а б присоединение к NCBI
    34. ^ Перейти обратно: а б с Кемен Э., Гардинер А., Шульц-Ларсен Т., Кемен А.С., Бальмут А.Л., Роберт-Сейланианц А. и др. (июль 2011 г.). Осубель FM (ред.). «Приобретение и потеря генов в ходе эволюции облигатного паразитизма у возбудителя белой ржавчины Arabidopsis thaliana» . ПЛОС Биология . 9 (7): e1001094. дои : 10.1371/journal.pbio.1001094 . ПМК   3130010 . ПМИД   21750662 .
    35. ^ Гоблер С.Дж., Берри Д.Л., Дирман С.Т., Вильгельм С.В., Саламов А., Лобанов А.В. и др. (март 2011 г.). «Ниша вредоносной водоросли Aureococcus anophagefferens выявлена ​​методами экогеномики» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (11): 4352–7. Бибкод : 2011PNAS..108.4352G . дои : 10.1073/pnas.1016106108 . ПМК   3060233 . ПМИД   21368207 .
    36. ^ Перейти обратно: а б Гилсон П.Р., Су В., Сламовиц CH, Рейт М.Е., Килинг П.Дж., Макфадден Дж.И. (июнь 2006 г.). «Полная нуклеотидная последовательность нуклеоморфа хлорарахниофита: самое маленькое ядро ​​в природе» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (25): 9566–71. Бибкод : 2006PNAS..103.9566G . дои : 10.1073/pnas.0600707103 . ПМЦ   1480447 . ПМИД   16760254 .
    37. ^ Перейти обратно: а б с д Кертис Б.А., Танифудзи Г., Бурки Ф., Грубер А., Иримия М., Маруяма С. и др. (декабрь 2012 г.). «Геномы водорослей раскрывают эволюционный мозаицизм и судьбу нуклеоморфов» . Природа . 492 (7427): 59–65. Бибкод : 2012Natur.492...59C . дои : 10.1038/nature11681 . ПМИД   23201678 .
    38. ^ Мур С.Э., Кертис Б., Миллс Т., Танифудзи Г., Арчибальд Дж.М. (2012). «Последовательность генома нуклеоморфа криптофитной водоросли Chroomonas mesostigmatica CCMP1168 демонстрирует потерю генов, специфичную для линии, и сложность генома» . Геномная биология и эволюция . 4 (11): 1162–75. дои : 10.1093/gbe/evs090 . ПМЦ   3514955 . ПМИД   23042551 .
    39. ^ Танифудзи Г., Онодера Н.Т., Уилер Т.Дж., Длутек М., Донахер Н., Арчибальд Дж.М. (2012). «Полная последовательность генома нуклеоморфов нефотосинтетической водоросли Cryptomonas paramecium раскрывает основной набор генов нуклеоморфов» . Геномная биология и эволюция . 3 : 44–54. дои : 10.1093/gbe/evq082 . ПМК   3017389 . ПМИД   21147880 .
    40. ^ Перейти обратно: а б с Прочтите BA, Kegel J, Klute MJ, Kuo A, Lefebvre SC, Maumus F и др. (июль 2013 г.). «Пангеном фитопланктона Emiliania лежит в основе его глобального распространения» . Природа . 499 (7457): 209–13. Бибкод : 2013Natur.499..209. . дои : 10.1038/nature12221 . hdl : 1854/LU-4120924 . ПМИД   23760476 .
    41. ^ Вход
    42. ^ Перейти обратно: а б с Мок Т., Отиллар Р.П., Штраус Дж., Макмаллан М., Пааянен П., Шмутц Дж. и др. (январь 2017 г.). «Эволюционная геномика адаптированной к холоду диатомовой водоросли Fragilariopsis cylindrus» . Природа . 541 (7638): 536–540. Бибкод : 2017Natur.541..536M . дои : 10.1038/nature20803 . hdl : 10754/622831 . ПМИД   28092920 .
    43. ^ Перейти обратно: а б Дуглас С., Заунер С., Фраунхольц М., Битон М., Пенни С., Денг Л.Т. и др. (апрель 2001 г.). «Сильно редуцированный геном порабощенного ядра водоросли» . Природа . 410 (6832): 1091–6. Бибкод : 2001Natur.410.1091D . дои : 10.1038/35074092 . ПМИД   11323671 .
    44. ^ Перейти обратно: а б Лейн CE, ван ден Хеувел К., Козера С., Кертис Б.А., Парсонс Б.Дж., Боуман С., Арчибальд Дж.М. (декабрь 2007 г.). «Геном нуклеоморфа Hemiselmis andersenii демонстрирует полную потерю и уплотнение интронов как движущую силу структуры и функции белка» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (50): 19908–13. Бибкод : 2007PNAS..10419908L . дои : 10.1073/pnas.0707419104 . ПМК   2148396 . ПМИД   18077423 .
    45. ^ Бакстер Л., Трипати С., Ишак Н., Бут Н., Кабрал А., Кемен Е. и др. (декабрь 2010 г.). «Признаки адаптации к облигатной биотрофии в геноме Hyaloperonospora arabidopsidis» . Наука . 330 (6010): 1549–1551. Бибкод : 2010Sci...330.1549B . дои : 10.1126/science.1195203 . ПМЦ   3971456 . ПМИД   21148394 .
    46. ^ Радаковиц Р., Джинкерсон Р.Э., Фюрстенберг С.И., Тэ Х., Сеттлейдж Р.Э., Бур Дж.Л., Посевиц М.К. (февраль 2012 г.). «Проект последовательности генома и генетическая трансформация маслянистой водоросли Nannochromopis gaditana» . Природные коммуникации . 3 (2): 686. Бибкод : 2012NatCo...3..686R . дои : 10.1038/ncomms1688 . ПМЦ   3293424 . ПМИД   22353717 .
    47. ^ Боулер С., Аллен А.Е., Бэджер Дж.Х., Гримвуд Дж., Джаббари К., Куо А. и др. (ноябрь 2008 г.). «Геодактилум раскрывает эволюционную историю геномов диатомей» . Природа . 456 (7219): 239–44. Бибкод : 2008Natur.456..239B . дои : 10.1038/nature07410 . ПМИД   18923393 .
    48. ^ Хаас Б.Дж., Камун С., Зоди МС, Цзян Р.Х., Handsaker RE, Кано Л.М. и др. (сентябрь 2009 г.). «Последовательность генома и анализ возбудителя ирландского картофельного голода Phytophthora infestans» (PDF) . Природа . 461 (7262): 393–8. Бибкод : 2009Natur.461..393H . дои : 10.1038/nature08358 . ПМИД   19741609 . S2CID   4385549 .
    49. ^ Перейти обратно: а б Тайлер Б.М., Трипати С., Чжан Х., Дехал П., Цзян Р.Х., Аэртс А. и др. (сентябрь 2006 г.). «Последовательности генома фитофторы раскрывают эволюционное происхождение и механизмы патогенеза». Наука . 313 (5791): 1261–6. Бибкод : 2006Sci...313.1261T . дои : 10.1126/science.1128796 . ПМИД   16946064 . S2CID   21287860 .
    50. ^ Швельм А., Фогельквист Дж., Кнауст А., Юльке С., Лилья Т., Бонилья-Россо Г. и др. (июнь 2015 г.). «Геном Plasmodiophora Brassicae раскрывает понимание его жизненного цикла и происхождения хитинсинтаз» . Научные отчеты . 5 : 11153. Бибкод : 2015NatSR...511153S . дои : 10.1038/srep11153 . ПМК   4471660 . ПМИД   26084520 .
    51. ^ Карбоне А., Сиу А., Патель Р. (сентябрь 2010 г.). «Детский атопический дерматит: обзор медицинского лечения». Анналы фармакотерапии . 44 (9): 1448–58. дои : 10.1345/aph.1P098 . ПМИД   20628042 . S2CID   44649671 .
    52. ^ Перейти обратно: а б Армбруст Е.В., Берджес Дж.А., Боулер С., Грин Б.Р., Мартинес Д., Патнэм Н.Х. и др. (октябрь 2004 г.). «Геном диатомовой водоросли Thalassiosira pseudonana: экология, эволюция и метаболизм». Наука . 306 (5693): 79–86. Бибкод : 2004Sci...306...79A . CiteSeerX   10.1.1.690.4884 . дои : 10.1126/science.1101156 . ПМИД   15459382 . S2CID   8593895 .
    53. ^ Перейти обратно: а б Франзен О, Йерлстрем-Хультквист Дж, Кастро Е, Шервуд Е, Анкарклев Дж, Райнер Д.С. и др. (август 2009 г.). Петри В. (ред.). «Проект секвенирования генома комплекса B изолята GS лямблий кишечной: вызван ли лямблиоз человека двумя разными видами?» . ПЛОС Патогены . 5 (8): e1000560. дои : 10.1371/journal.ppat.1000560 . ПМЦ   2723961 . ПМИД   19696920 .
    54. ^ Перейти обратно: а б Моррисон Х.Г., МакАртур А.Г., Гиллин Ф.Д., Эли С.Б., Адам Р.Д., Олсен Г.Дж. и др. (сентябрь 2007 г.). «Геномный минимализм раннего дивергентного кишечного паразита Giardia lamblia». Наука . 317 (5846): 1921–6. Бибкод : 2007Sci...317.1921M . дои : 10.1126/science.1143837 . ПМИД   17901334 . S2CID   29299317 .
    55. ^ Перейти обратно: а б с д Пикок К.С., Сигер К., Харрис Д., Мерфи Л., Руис Дж.К., Куэйл М.А. и др. (июль 2007 г.). «Сравнительный геномный анализ трех видов Leishmania, вызывающих разнообразные заболевания человека» . Природная генетика . 39 (7): 839–47. дои : 10.1038/ng2053 . ПМЦ   2592530 . ПМИД   17572675 .
    56. ^ Перейти обратно: а б Ивенс А.С., Пикок К.С., Уорти Э.А., Мерфи Л., Аггарвал Г., Берриман М. и др. (июль 2005 г.). «Геном кинетопластидного паразита Leishmania major» . Наука . 309 (5733): 436–42. Бибкод : 2005Sci...309..436I . дои : 10.1126/science.1112680 . ПМК   1470643 . ПМИД   16020728 .
    57. ^ Перейти обратно: а б с Фриц-Лэйлин Л.К., Прочник С.Е., Джинджер М.Л., Дакс Дж.Б., Карпентер М.Л., Филд М.К. и др. (март 2010 г.). «Геном Naegleria gruberi проливает свет на универсальность ранних эукариот» . Клетка . 140 (5): 631–42. дои : 10.1016/j.cell.2010.01.032 . ПМИД   20211133 . S2CID   13901186 .
    58. ^ Перейти обратно: а б Карлтон Дж.М., Хирт Р.П., Сильва Дж.К., Делчер А.Л., Шац М., Чжао К. и др. (январь 2007 г.). «Проект последовательности генома возбудителя, передающегося половым путем, Trichomonas vaginalis» . Наука . 315 (5809): 207–12. Бибкод : 2007Sci...315..207C . дои : 10.1126/science.1132894 . ПМК   2080659 . ПМИД   17218520 .
    59. ^ Перейти обратно: а б Берриман М., Гедин Э., Герц-Фаулер С., Бландин Г., Рено Х., Бартоломеу Д.С. и др. (июль 2005 г.). «Геном африканской трипаносомы Trypanosoma brucei». Наука . 309 (5733): 416–22. Бибкод : 2005Sci...309..416B . дои : 10.1126/science.1112642 . ПМИД   16020726 . S2CID   18649858 .
    60. ^ Перейти обратно: а б Эль-Сайед Н.М., Майлер П.Дж., Бартоломеу Д.К., Нильссон Д., Аггарвал Г., Тран А.Н. и др. (июль 2005 г.). «Последовательность генома Trypanosoma cruzi, этиологического агента болезни Шагаса» . Наука . 309 (5733): 409–15. Бибкод : 2005Sci...309..409E . дои : 10.1126/science.1112631 . HDL : 11336/80500 . ПМИД   16020725 . S2CID   3830267 .
    61. ^ Перейти обратно: а б Кинг Н., Уэстбрук М.Дж., Янг С.Л., Куо А., Абедин М., Чепмен Дж. и др. (февраль 2008 г.). «Геном хоанофлагелляты Monosiga brevicollis и происхождение многоклеточных животных» . Природа . 451 (7180): 783–8. Бибкод : 2008Natur.451..783K . дои : 10.1038/nature06617 . ПМК   2562698 . ПМИД   18273011 .
    Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=List_of_sequenced_protist_genomes&oldid=1193910147"
    Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
    Arc.Ask3.Ru
    Номер скриншота №: accb3221eecad6a789a78bead49ac210__1704512040
    URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/ac/10/accb3221eecad6a789a78bead49ac210.html
    Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
    List of sequenced protist genomes - Wikipedia
    Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)