ХДРБС3

ХДРБС3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	5ELR, 5ELS, 5EMO, 5ELT, 5EL3
Идентификаторы
Псевдонимы	KHDRBS3 , Etle, SALP, SLM-2, SLM2, T-STAR, TSTAR, etoile, домен KH, содержащий, связывание РНК, связанный с сигнальной трансдукцией 3, содержащий РНК-связывающий домен KH, связанный с сигнальной трансдукцией 3
Внешние идентификаторы	Опустить : 610421 ; МГИ : 1313312 ; Гомологен : 4780 ; GeneCards : KHDRBS3 ; OMA : KHDRBS3 — ортологи
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 15 (mouse)
End	68,973,060 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	middle temporal gyrus; ; prefrontal cortex; ; Brodmann area 9; ; secondary oocyte; ; Brodmann area 23; ; sperm; ; Brodmann area 46; ; cingulate gyrus; ; orbitofrontal cortex; ; amygdala;
	Top expressed in
	interventricular septum; ; neural layer of retina; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell; ; visual cortex; ; primary visual cortex; ; superior frontal gyrus; ; hippocampus proper; ; ventricular zone; ; prefrontal cortex; ; primary motor cortex;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	SH3 domain binding; protein binding; RNA binding; nucleic acid binding; protein domain specific binding; identical protein binding;
Cellular component	nucleus; nucleoplasm;
Biological process	regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated; mRNA processing; regulation of mRNA splicing, via spliceosome; protein complex oligomerization;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	10656
	13992
	н/д
	ENSMUSG00000022332
	О75525
	Q9R226
	НМ_006558
	НМ_010158
	НП_006549
	НП_034288
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Содержащий домен KH РНК-связывающий белок 3, связанный с сигнальной трансдукцией, представляет собой белок , который у человека кодируется KHDRBS3 геном . ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что KHDRBS3 взаимодействует с SIAH1 . ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

KHDRBS3 взаимодействует со сплайсинговым белком Sam68 и онкогеном метадгерином в клетках рака простаты. ^{[ 9 ]}

Клиническое значение

Было показано, что экспрессия KHDRBS3 (T-STAR) увеличивается в ткани рака простаты по сравнению с окружающей доброкачественной тканью. ^{[ 9 ]} Экспрессия KHDRBS3 коррелирует с сигналом mpMRI, измеренным с помощью системы оценки Лайкерта, аналогичной PI-RADS . ^{[ 9 ]} Хотя все еще обсуждается, сигнал мпМРТ коррелирует с более высокой степенью Глисона и размером опухоли, а также с гистопатологическими особенностями, связанными с клинически агрессивным раком простаты. ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]} Экспрессия KHDRBS3 была увеличена в пораженном миокарде человека у пациентов с сердечной недостаточностью , при этом белок KHDRBS3 взаимодействовал с несколькими важными мРНК, кодирующими компоненты саркомера, такие как актин гамма 1 ( ACTG1 ), легкая цепь 2 миозина ( MYL2 ), рианодиновый рецептор 2 ( RYR2). ), тропонин I3 ( TNNI3 ), тропонин T2 ( TNNT2 ), тропомиозин 1 ( TPM1 ), тропомиозин 2 ( TPM2 ) и тайтин ( TTN ) . ^{[ 12 ]}

В клеточных линиях рака простаты KHDRBS3, по-видимому, регулируется андрогенами, при этом снижение экспрессии мРНК происходит после добавления синтетического андрогена R1881 . к клеткам ^{[ 9 ]}

Функция

KHDRBS3 регулирует альтернативный сплайсинг мРНК сакромерного ), что белка тайтина ( TTN приводит к удержанию интронов . Сверхэкспрессия KHDRBS3 в индуцированных кардиомиоцитах, полученных из плюрипотентных стволовых клеток (iPSC-CM), увеличивает содержание Ca ²⁺ переходную амплитуду и привело к увеличению F _max . ^{[ 12 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000022332 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Венейблс Дж.П., Вернет С., Чу С.Л., Эллиотт Д.Д., Коумидоу Р.Б., Ву Дж. и др. (июнь 1999 г.). «T-STAR/ETOILE: новый родственник SAM68, который взаимодействует с РНК-связывающим белком, участвующим в сперматогенезе» . Молекулярная генетика человека . 8 (6): 959–69. дои : 10.1093/hmg/8.6.959 . ПМИД 10332027 .
^ Ли Дж., Берр Дж.Г. (ноябрь 1999 г.). «Сальпальфа и Салпбета, замедляющие рост гомологи Sam68». Джин . 240 (1): 133–47. дои : 10.1016/S0378-1119(99)00421-7 . ПМИД 10564820 .
^ «Ген Entrez: KHDRBS3, содержащий домен KH, связывание РНК, связанная с сигнальной трансдукцией 3» .
^ Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хиродзан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н. и др. (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
^ Венейблс Дж.П., Далглиш С., Паронетто М.П., Скитт Л., Торнтон Дж.К., Сондерс П.Т. и др. (июль 2004 г.). «SIAH1 нацелен на альтернативный фактор сплайсинга T-STAR для деградации протеасомой». Молекулярная генетика человека . 13 (14): 1525–34. дои : 10.1093/hmg/ddh165 . ПМИД 15163637 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Люкстон Х.Дж., Симпсон Б.С., Миллс И.Г., Бриндл Н.Р., Ахмед З., Ставринидес В. и др. (август 2019 г.). «Онкоген метадгерин взаимодействует с известными белками сплайсинга YTHDC1, Sam68 и T-STAR и играет новую роль в альтернативном сплайсинге мРНК» . Раки . 11 (9): 1233. doi : 10.3390/cancers11091233 . ПМК 6770463 . ПМИД 31450747 .
^ Норрис Дж.М., Кармона Эчеверриа Л.М., Ботт С.Р., Браун Л.С., Бернс-Кокс Н., Даддеридж Т. и др. (май 2020 г.). «Какой тип рака простаты систематически игнорируется при многопараметрической магнитно-резонансной томографии? Анализ когорты PROMIS» . Европейская урология . 78 (2): 163–170. дои : 10.1016/j.eururo.2020.04.029 . ПМЦ 7397509 . ПМИД 32370911 .
^ Норрис Дж.М., Кармона Эчеверрия Л.М., Симпсон Б.С., Аллен С., Болл Р., Фриман А. и др. (апрель 2020 г.). «Видимость рака простаты на мультипараметрической магнитно-резонансной томографии: высокая степень Глисона и увеличенный объем опухоли — не единственные важные гистопатологические особенности» . БЖУ Интернешнл . 126 (2): 237–239. дои : 10.1111/bju.15085 . ПМИД 32319152 .
^ Jump up to: ^а ^б Бекель, Джес-Нильс; Мёбиус-Винклер, Максимилиан; Мюллер, Марион; Ребс, Сабина; Эгер, Николь; Шоппе, Лаура; Таппу, Ревати; Кокот, Каролина Э.; Кнойер, Жасмин М.; Галлия, Сюзанна; Бордало, Диана М. (15 июля 2021 г.). «SLM2 — новый фактор сердечного сплайсинга, участвующий в сердечной недостаточности из-за дилатационной кардиомиопатии» . Геномика, протеомика и биоинформатика . 20 (1): 129–146. дои : 10.1016/j.gpb.2021.01.006 . ISSN 1672-0229 . ПМЦ 9510876 . ПМИД 34273561 .

Дальнейшее чтение

Ди Фрушио М., Чен Т., Ричард С. (март 1999 г.). «Характеристика Sam68-подобных белков млекопитающих SLM-1 и SLM-2: SLM-1 является субстратом Src во время митоза» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 96 (6): 2710–5. Бибкод : 1999PNAS...96.2710D . дои : 10.1073/pnas.96.6.2710 . ПМК 15834 . ПМИД 10077576 .
Венейблс Дж.П., Эллиотт Д.Д., Макарова О.В., Макаров Е.М., Кук Х.Дж., Эперон IC (март 2000 г.). «RBMY, вероятный фактор сперматогенеза человека, и другие белки hnRNP G взаимодействуют с Tra2beta и влияют на сплайсинг» . Молекулярная генетика человека . 9 (5): 685–94. дои : 10.1093/hmg/9.5.685 . ПМИД 10749975 .
Стосс О, Ольбрих М, Хартманн А.М., Кениг Х., Меммотт Дж., Андреадис А., Стамм С. (март 2001 г.). «Белок rSLM-2 семейства STAR/GSG регулирует выбор альтернативных сайтов сплайсинга» . Журнал биологической химии . 276 (12): 8665–73. дои : 10.1074/jbc.M006851200 . ПМИД 11118435 .
Сугимото Ю., Морита Р., Амано К., Шах П.У., Паскуаль-Кастровьехо И., Хан С. и др. (август 2001 г.). «Ген T-STAR: точное картирование региона-кандидата детской абсансной эпилепсии на 8q24 и мутационный анализ у пациентов». Исследования эпилепсии . 46 (2): 139–44. дои : 10.1016/S0920-1211(01)00274-1 . ПМИД 11463515 . S2CID 28713407 .
Кул Дж., ван Заан В., ван дер Эб Эй.Дж., Терлет С. (ноябрь 2001 г.). «Понижение уровня T-STAR, белка, ингибирующего рост, после иммортализации, опосредованной SV40». Рост и дифференцировка клеток . 12 (11): 535–41. ПМИД 11714634 .
Редди Т.Р., Сухасини М., Сюй В., Йе Л.И., Ян Дж.П., Ву Дж. и др. (февраль 2002 г.). «Роль белков домена KH (Sam68-подобные белки млекопитающих и дрожащие белки) в посттранскрипционной регуляции репликации ВИЧ» . Журнал биологической химии . 277 (8): 5778–84. дои : 10.1074/jbc.M106836200 . ПМИД 11741900 .
Коте Ж, Буасвер FM, Буланже MC, Бедфорд МТ, Ричард С. (январь 2003 г.). «РНК-связывающий белок Sam68 является субстратом in vivo для белка аргинин-N-метилтрансферазы 1» . Молекулярная биология клетки . 14 (1): 274–87. doi : 10.1091/mbc.E02-08-0484 . ПМК 140244 . ПМИД 12529443 .
Венейблс Дж.П., Далглиш С., Паронетто М.П., Скитт Л., Торнтон Дж.К., Сондерс П.Т. и др. (июль 2004 г.). «SIAH1 нацелен на альтернативный фактор сплайсинга T-STAR для деградации протеасомой». Молекулярная генетика человека . 13 (14): 1525–34. дои : 10.1093/hmg/ddh165 . ПМИД 15163637 .
Коэн С.Д., Доран П.П., Блаттнер С.М., Меркл М., Ван Г.К., Шмид Х. и др. (июль 2005 г.). «Sam68-подобный белок 2 млекопитающих, идентифицированный с помощью цифрового дифференциального дисплея и экспрессируемый подоцитами, индуцируется при протеинурии и участвует в выборе места сплайсинга фактора роста эндотелия сосудов» . Журнал Американского общества нефрологов . 16 (7): 1958–65. дои : 10.1681/ASN.2005020204 . ПМИД 15901763 .
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хиродзан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н. и др. (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Чжан Л., Го Л., Пэн Ю., Чэнь Б. (июль 2006 г.). «Экспрессия гена T-STAR связана с регуляцией активности теломеразы в клеточной линии рака толстой кишки человека HCT-116» . Всемирный журнал гастроэнтерологии . 12 (25): 4056–60. дои : 10.3748/wjg.v12.i25.4056 . ПМК 4087721 . ПМИД 16810759 .
Олсен Дж.В., Благоев Б., Гнад Ф., Мачек Б., Кумар С., Мортенсен П., Манн М. (ноябрь 2006 г.). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях» . Клетка . 127 (3): 635–48. дои : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . ПМИД 17081983 . S2CID 7827573 .

Эта статья о гене человека й хромосомы незавершена 8 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCm38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000022332 – Ensembl , май 2017 г.

[2] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[3] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10332027-4] Венейблс Дж.П., Вернет С., Чу С.Л., Эллиотт Д.Д., Коумидоу Р.Б., Ву Дж. и др. (июнь 1999 г.). «T-STAR/ETOILE: новый родственник SAM68, который взаимодействует с РНК-связывающим белком, участвующим в сперматогенезе» . Молекулярная генетика человека . 8 (6): 959–69. дои : 10.1093/hmg/8.6.959 . ПМИД 10332027 .

[pmid10564820-5] Ли Дж., Берр Дж.Г. (ноябрь 1999 г.). «Сальпальфа и Салпбета, замедляющие рост гомологи Sam68». Джин . 240 (1): 133–47. дои : 10.1016/S0378-1119(99)00421-7 . ПМИД 10564820 .

[entrez-6] «Ген Entrez: KHDRBS3, содержащий домен KH, связывание РНК, связанная с сигнальной трансдукцией 3» .

[pmid16189514-7] Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хиродзан-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н. и др. (октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .

[pmid15163637-8] Венейблс Дж.П., Далглиш С., Паронетто М.П., Скитт Л., Торнтон Дж.К., Сондерс П.Т. и др. (июль 2004 г.). «SIAH1 нацелен на альтернативный фактор сплайсинга T-STAR для деградации протеасомой». Молекулярная генетика человека . 13 (14): 1525–34. дои : 10.1093/hmg/ddh165 . ПМИД 15163637 .

[:0-9] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Люкстон Х.Дж., Симпсон Б.С., Миллс И.Г., Бриндл Н.Р., Ахмед З., Ставринидес В. и др. (август 2019 г.). «Онкоген метадгерин взаимодействует с известными белками сплайсинга YTHDC1, Sam68 и T-STAR и играет новую роль в альтернативном сплайсинге мРНК» . Раки . 11 (9): 1233. doi : 10.3390/cancers11091233 . ПМК 6770463 . ПМИД 31450747 .

[10] Норрис Дж.М., Кармона Эчеверриа Л.М., Ботт С.Р., Браун Л.С., Бернс-Кокс Н., Даддеридж Т. и др. (май 2020 г.). «Какой тип рака простаты систематически игнорируется при многопараметрической магнитно-резонансной томографии? Анализ когорты PROMIS» . Европейская урология . 78 (2): 163–170. дои : 10.1016/j.eururo.2020.04.029 . ПМЦ 7397509 . ПМИД 32370911 .

[11] Норрис Дж.М., Кармона Эчеверрия Л.М., Симпсон Б.С., Аллен С., Болл Р., Фриман А. и др. (апрель 2020 г.). «Видимость рака простаты на мультипараметрической магнитно-резонансной томографии: высокая степень Глисона и увеличенный объем опухоли — не единственные важные гистопатологические особенности» . БЖУ Интернешнл . 126 (2): 237–239. дои : 10.1111/bju.15085 . ПМИД 32319152 .

[:1-12] Jump up to: ^а ^б Бекель, Джес-Нильс; Мёбиус-Винклер, Максимилиан; Мюллер, Марион; Ребс, Сабина; Эгер, Николь; Шоппе, Лаура; Таппу, Ревати; Кокот, Каролина Э.; Кнойер, Жасмин М.; Галлия, Сюзанна; Бордало, Диана М. (15 июля 2021 г.). «SLM2 — новый фактор сердечного сплайсинга, участвующий в сердечной недостаточности из-за дилатационной кардиомиопатии» . Геномика, протеомика и биоинформатика . 20 (1): 129–146. дои : 10.1016/j.gpb.2021.01.006 . ISSN 1672-0229 . ПМЦ 9510876 . ПМИД 34273561 .

[1]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]