Список химических баз данных
Это список веб-сайтов, содержащих списки химических веществ или базы данных с химической информацией. Более подробная информация о содержании этих и других ресурсов содержится в Wikibook источников информации .
| аббревиатура | полное имя | оператор | выбирает | содержит | префикс идентификатора | качество | связь | записи |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| АКТЕР | Агентство по охране окружающей среды | токсикологическая информация; возникновение | «АКТоР» . | 893,280 | ||||
| Атомворк | База данных неорганических материалов | Национальный институт материаловедения | кристаллические структуры | «Атомворк» . | 82,000 | |||
| Байльштайн | База данных Beilstein | Эльзевир | органические соединения | характеристики | закрытый доступ | |||
| БИАдб | бензилизохинолиновых алкалоидов База данных | «БИАдб» . | 846 | |||||
| БиндингДБ | База данных привязки | Школа фармации и фармацевтических наук Скэггса Калифорнийского университета в Сан-Диего | нековалентная ассоциация молекул в растворе | ChEMBL SMILES Цели InChiKey | «БиндингДБ» . | |||
| ПривязкаMOAD | Связывание матери всех баз данных | белково-лигандные структуры | «ПривязкаМОАД» . | 36047 | ||||
| БМДБ | База данных метаболомов крупного рогатого скота | Совместное открытие лекарств | БМДБ | вручную выбрано и проверено | «БМДБ» . | 7859 | ||
| БРМБ | Банк данных биологического магнитного резонанса | Университет Висконсина | биологические молекулы, включая лиганды, кофакторы, пептиды, сахариды | ЯМР-спектроскопия | «БРМБ» . | |||
| БРЕНДА | Технический университет Брауншвейга | ферменты-лиганды | «БРЕНДА» . | |||||
| База данных каротиноидов | каротиноиды | ЧТО | «Каротиноиды» . | 1195 | ||||
| CCCBDB | База данных компьютерного химического сравнения и эталонных тестов | Национальный институт стандартов и технологий | молекулы газовой фазы | "CCCDBD" | 2069 | |||
| CCRIS | Информационная система исследований химического канцерогенеза | Национальная медицинская библиотека | вещества, влияющие на опухоли | CCRIS | из первичной литературы, проверенной экспертами | «Подмножество CCRIS PubChem» . | 9562 [1] [2] | |
| CDD Общественный | кандидаты на наркотики | ограниченный доступ | 3,000,000 | |||||
| КЭБ | Химические соединения, представляющие биологический интерес | ЭЛИКСИР | небольшие химические соединения | от PDBeChem ChEMBL KEGG IntEnz | «ЧЭБИ» . | 60,000 | ||
| Химия | Мерк | органические химикаты | расчет пути реакции; Beilstein CAS улыбается | собственный | 7,000,000 | |||
| ХЭМБЛ | Химикаты из Европейской лаборатории молекулярной биологии | ЭМБЛ | молекулы с лекарственными свойствами | «ЧЕМБЛ» . | 1,961,000 | |||
| cheML.io | Кафедры компьютерных наук и химии Назарбаев Университета | Молекулы de novo, созданные с помощью моделей ML | УЛЫБКИ, вычисленные свойства | искусственно созданный | "cheML.io" . [3] | 2,800,000 | ||
| Химическая база данных | химическая база данных | маленькие молекулы | «ХимДБ» . | 5,000,000 | ||||
| ХимЭкспер | Справочник химикатов Chemexper | каталог химикатов | Структура CASno SMILES | «ХимЭкспер» . | ||||
| Химическая книга | Восточно-Западный университет | коммерчески доступные соединения | CASno, поставщики, недвижимость | «Химическая книга» . | 200,000 | |||
| Химический регистр | от 20 000 продавцов | CASno в основном от крупных поставщиков | «Химический регистр» . | 1,750,000 | ||||
| ХимИДплюс | Национальная медицинская библиотека | другие базы данных NLM; регулируемые вещества | Структура CASNo UNII | https://chem.nlm.nih.gov/chemidplus/chemidlite.jsp | 400,000 | |||
| ХимическийПаук | Королевское химическое общество | из 275 источников данных | «ХимПаук» . | 88,000,000 | ||||
| ХПК | Открытая база данных кристаллографии | Вильнюсский университет | малые молекулы (с открытым исходным кодом) | кристаллическая структура координаты атомов | ХПК | куратор | «КОД» . | 478,715 |
| Общая химия | Американское химическое общество | структура CAS SMILES InCh | https://commonchemistry.cas.org/ [4] | ~500,000 | ||||
| Сборник распространенных названий пестицидов | Британский совет по растениеводству | Пестициды с ISO общими названиями | структура, CASNo, название ИЮПАК, SMILES, ИнЧИ | куратор | «Сборник распространенных названий пестицидов» . | 1,800 | ||
| КомпТокс | Панель управления CompTox Chemicals | Агентство по охране окружающей среды США | химические вещества, оцененные на предмет потенциальных рисков для здоровья | «КомпТокс» . | ||||
| Козинг | Косметические ингредиенты | Европейская комиссия | косметические ингредиенты | «КосИнг» . | ||||
| КристаллВоркс | Совет по науке и технологиям | «КристаллВоркс» . | ||||||
| ЦДЦД | Кембриджская база данных структурных данных | Кембриджский центр кристаллографических данных | «КСД» . | 1,038,250 | ||||
| ЦДББ | База данных структуры углеводов | Зелинского Институт органической химии | углеводы | ссылки на структуры | Идентификатор CSDB | «ЦДББ» . | ||
| ОТД | База данных сравнительной токсикогеномики | Департамент биологических наук Университета штата Северная Каролина | MeSH CASNo ChEBI PubChem гены, пути | «КТД» . | ||||
| ДДБ | Банк данных Дортмунда | чистые соединения, смеси, газовые гидраты | физические свойства | «ДДБ» . | ||||
| Константы диссоциации | Оцифрованный набор данных IUPAC pKa | ИЮПАК | константы диссоциации | «Константы диссоциации» . Гитхаб . | ||||
| ДЕТЕРМ | ДЫХАНИЕ | теплофизические свойства | «ДЕТЕРМ» . | 75,000 | ||||
| Лекарственный Банк | Университет Альберты | наркотики | «ДругБанк» . | |||||
| DrugCentral | фармацевтика | продукты, содержащие вещество | «НаркоЦентрал» . | |||||
| DTP/NCI | Коллекция открытых соединений DTP | Национального института рака Программа разработки терапевтических средств | Терапия рака | Номер Национального центра обслуживания химиотерапии рака | «ДТП/НЦИ» . | 250,000 | ||
| ECHA | база данных REACH | Европейское химическое агентство | ЭИНЭКС ЭЛИНКС НЛП | Пиктограммы CASNo HPhrases тоннаж | «ECHA/REACH» . | 245,000 | ||
| EAWAG-BBD | База данных биокатализа/биодеградации | Eawag: Швейцарский федеральный институт водных наук и технологий. | Пубхимические пути CAS SMILES | «ЕАВАГ-ББД» . | 1396 | |||
| Электронные молекулы | химикаты для проверки на наркотики | список поставщиков и каталожные номера | «Электронные молекулы» . | 8,000,000 [5] | ||||
| ЭНСС | Японский реестр существующих и новых химических веществ | регулируемые химикаты | «ENCS (на японском языке)» . | |||||
| Оцененные кинетические данные | ИЮПАК | константы скорости | куратор | «Оцененные кинетические данные» . | ||||
| FDA СРС | Система регистрации веществ Управления по контролю за продуктами и лекарствами | Национальная медицинская библиотека США | ингредиенты в продуктах, регулируемых FDA | UNII Инчикей | «Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США» . | 781,000 | ||
| ФЕМА | Библиотека вкусовых ингредиентов | Ассоциация производителей ароматизаторов и экстрактов | Номер CAS CFR FEMA | «ФЕМА» . | ||||
| ФудБ | База данных продуктов питания | Университет Альберты | Пищевые компоненты и добавки | «ФооДБ» . | 70926 | |||
| ГлиТуКан | международный репозиторий структур гликанов | Министерство образования, культуры, спорта, науки и технологий | гликаны | WURCS GlycoCT PubChem CID | Г | «Хранилище гликанов» . | 122194 | |
| Гмелин | база данных Гмелина | Эльзевир | неорганические и металлоорганические соединения | закрытый доступ | 1,500,000 | |||
| Г-СРС | Глобальная система регистрации веществ | CAS PubChem ChEMBL ИНН ЮНИИ | «Г-СРС» . | 109,260 | ||||
| ГМД | База данных метаболома Голма | ГХ/МС метаболитов | «ГМД» . | |||||
| Путеводитель по ФАРМАКОЛОГИИ | ЮФАР | наркотики и мишени | ИНН КАС ЧЭБИ ЧЭМБЛ Аптечный Банк ПабХим | «Руководство по ФАРМАКОЛОГИИ» . | ||||
| закона Генри Константы | Институт химии Макса Планка | летучие соединения | Константы закона Генри | из литературы | «Константы закона Генри» . | 46434 | ||
| ХМДБ | База данных метаболомов человека | Геном Канады | метаболиты, обнаруженные в организме человека | биохимические данные, клинические данные | ХМДБ | «ХМДБ» . | 114,222 [6] | |
| ОгромныйМДБ | Огромная молекулярная база данных | ООО «Элегант Математика» | Малые молекулы (большинство записей содержат <100 атомов) | основные конформеры со своим 3D и удобным поиском по ним | М | хорошо коррелирует с PubChem по данным, доступным на PubChem | «Огромный МДБ» . | 102 миллиона |
| КМГС | Международные карты химической безопасности МОТ | Международная организация труда | CAS, номер EC, номер UN | «ИКСС» . | 1784 | |||
| МКУР | База данных неорганических кристаллических структур | ФИЗ Карлсруэ ГмбХ | «МКСД» . | 161,030 | ||||
| IEDB | База данных иммунных эпитопов | Национальный институт аллергии и инфекционных заболеваний | Эпитопы преимущественно пептиды и углеводы. | «ИЭДБ» . | 3002 непептида | |||
| База данных растворимости IUPAC-NIST | https://srdata.nist.gov/solubility/index.aspx | |||||||
| JECDB | Существующая база данных химических веществ Японии | CAS EINECS RTECS SDBS TSCA график количества статей в год | «ЖЭКДБ» . | |||||
| J-ГЛОБАЛЬНЫЙ | я пришел | Японское агентство науки и технологий | «Джей-Глобал» . | |||||
| КЕГГ | Киотская энциклопедия генов и геномов | Центр биоинформатики Киотского университета | Соединения Гликаны (также ферменты, реакции, пути) | CAS CHEBI CHEMBL MASSBANK NIKKAJI PubChem PDB-CCD | «КЕГГ» . | |||
| Ки iБаза данных | ПДСП | связывание лиганда | «База данных Ки» . | |||||
| РЮКЗАК | Нарский институт науки и технологий | Организмы ИнЧИ CAS SMILES | С00 | «РЮКЗАК» . | ||||
| ЛИНКС | Библиотека интегрированных сетевых сотовых подписей | маленькие молекулы | ПабХим ЧЕМБЛ СМАЙЛС ИНЧИ | ЛСМ | «ЛИНКС» . | 43,700 | ||
| ЛипидБанк | Японская конференция по биохимии липидов | липиды | «ЛипидБанк» . | 7,009 | ||||
| ЛМСД | База данных структуры LIPID MAPS | Липиды | HMDB ChEBI PubChem Inc. | ЛМФА | «ЛМСД» . | 44701 | ||
| ИЗМЕНЯТЬ | Список списков | паспорта безопасности, регламент | «ЛОЛИ» . | |||||
| Макуле | поставляемые химикаты | ИнЧИ, УЛЫБКИ, СДФ, физико-химические свойства | «Мкуле» . | 45,000,000 | ||||
| МедиаДБ | Институт системной биологии | питательная среда | «МедиаДБ» . | 288 | ||||
| Индекс Мерк | Королевское химическое общество | наркотики | «Мерк-Индекс» . | 11,500 | ||||
| МеШ | Медицинские предметные рубрики | Национальная медицинская библиотека США | биомедицинский тезаурус | иерархия дескрипторов литературы с MeSH ID | «МеШ» . | |||
| МетаЦик | НИИ Международный | метаболические пути; метаболиты | «МетаЦик» . | |||||
| МетабоЛайтс | ЭМБЛ-ЭБИ | МТБЛ | «Метаболайтс» . | |||||
| МетаНетХ | SIB Швейцарский институт биоинформатики | метаболические сети, метаболиты, биохимические реакции, клеточные компартменты | метаболические модели, SBML, InChI, InChIKey, SMILES | МНХМ | единое пространство имен для метаболитов и биохимических реакций в контексте метаболических моделей | «МетаНетХ» . | 240 метаболических моделей, 1292154 метаболитов, 74613 реакций, 44 отсека. | |
| МЕТЛИН | База данных метаболитов и химических веществ | тандемная масс-спектрометрия метаболитов | «МЕТЛИН» . | 960,000 | ||||
| ШАХТЫ | Ионы металлов в нуклеиновых кислотах | Университет Цюриха | https://www.minas.uzh.ch/ | |||||
| МодельSeed | КЕГГ МетаЦик метаболические пути | цена за день | «МодельСид» . | |||||
| МолПорт | каталог химикатов | «МолПорт» . | ||||||
| МОНА | Массовый банк Северной Америки | масс-спектры | всплеск ноги chemspider pubchem chebi CAS | «МоНА» . | 200,000 | |||
| нпатлас | Атлас натуральных продуктов | Университет Саймона Фрейзера | микробные и грибковые продукты | улыбка, организм | НПА | нпатлас [7] | 33434 | |
| Карманный справочник NIOSH | Карманный справочник NIOSH по химическим опасностям | Национальный институт охраны труда и здоровья | обычно используемые химикаты | пределы воздействия | «НИОШ» . | 677 | ||
| Интернет-книга НИСТ | Интернет-книга NIST по химии | Национальный институт стандартов и технологий | спектры Энергия ионизации CAS Масс-спектр, InChI | С+CAS | «Интернет-книга НИСТ» . | |||
| НМРшифтдб | Кёльнский университет | органический | спектры ядерного магнитного резонанса | «НМРСдвигДБ» . | 43,581 | |||
| НОРМАН СЛЕ | НОРМАН Обмен списками подозреваемых | экологический мониторинг | «НОРМАН СЛЕ» . | 110,000 | ||||
| ОргСин | Органические синтезы | Органические синтезы, Inc. | Надежные химические реакции | Экспериментальные процедуры с возможностью поиска | Рецензирование | «Поиск ОргСин» . | ||
| ВВП ВВПэ | Банк данных по белкам в Европе | ЭМБЛ-ЭБИ | содержит некоторые химические вещества, а также белки | «ПДБе» . | ||||
| ПАТЕНТСКОП | ВОИС | «ПАТЕНТСКОП» . | 16,000,000 | |||||
| ПДБ | Банк данных белков RSCB | «ПДБ» . | 166,891 | |||||
| ФармГКБ | Шрирам Центр биоинженерии и Химическая инженерия | цели по борьбе с наркотиками | информация о назначении | куратор | «ФармГКБ» . | |||
| Фенол-Эксплорер | полифенолы, содержащиеся в продуктах питания | «Фенол-Эксплорер» . | 500 | |||||
| Фосцид | База данных PHOsphorylation Site | модификации белка | «Фозида» . | |||||
| ПолиИнфо | База данных полимеров | Национальный институт материаловедения | физические свойства | «ПоЛиИнфо» . | 26,000 | |||
| ППБД | База данных свойств пестицидов | Отдел исследований сельского хозяйства и окружающей среды, Университет Хартфордшира | Пестициды и их метаболиты | Химическая структура, физико-химические свойства, данные о здоровье человека и экотоксикологические данные. | куратор | «ППДБ» . | 2000 [8] | |
| ПроКарДБ | База данных прокариотических бактериальных каротиноидов | ИМТЕХ | ссылки на спектры | «ПроКарДБ» . | 1800 | |||
| ПабХим | Национальная медицинская библиотека Национальный центр биотехнологической информации | из 748 источников данных | Структуры, названия и идентификаторы, химические и физические свойства, спектральная информация, соответствующие записи, поставщики химикатов, фармакология и биохимия, использование и производство, безопасность и опасности, токсичность, литература, патенты, биомолекулярные взаимодействия и пути, результаты биологических испытаний. | «ПабХим» . | 103,000,000 | |||
| Реаксис | Эльзевир | химические соединения | Химические реакции с возможностью поиска | «О Реаксисе» . | 118,000,000 | |||
| Реф-БД | Повторно ссылающаяся база данных химических сдвигов белков | протеины от БиоМагРесБанка | Повторный сдвиг ЯМР | «Реф-БД» . | 2162 | |||
| Рея | Швейцарский институт биоинформатики | биохимические реакции | КЭБ | куратор | «Рея» . | |||
| РЁМПП | Тиме Групп | «РЁМПП» . | ||||||
| РТЭКС | Реестр токсического действия химических веществ | Дассо Системс | Токсичность, Литература | «Биовиа-РТЭКС» . | 160,000 | |||
| RxNav | Национальная медицинская библиотека США | наркотики | взаимодействия | «РксНав» . | ||||
| Научный искатель | Служба химических рефератов Американского химического общества | органические, неорганические химические вещества, белки | Номер CAS | только платный доступ | 130,000,000 | |||
| СкрабХим | взято из PubChem | «Скрабхим» . | 2,282,992 | |||||
| СДБС | Спектральная база данных для Органические соединения | Национальный институт передовых промышленных наук и технологий (AIST), Япония | Органические соединения | Спектры: ИК Рамановское рассеяние МАСС ЭПР 1 H ЯМР 13 С ЯМР | СДБС Нет | куратор | «СДБС» . | 34,000 |
| База данных метаболомов сыворотки | Инновационный центр метаболомики | содержится в сыворотке крови | «БД метаболомов сыворотки» . | 4,651 | ||||
| Инструмент выбора растворителя | Институт зеленой химии ACS | Растворители | Анализ физических свойств основных компонентов | куратор | «Инструмент выбора растворителя» . | 272 [9] | ||
| СПРЕССИ сеть | InfoChem Общество химической информации mbH | органические молекулы и реакции | органические структуры | из литературы | «Удивлён» . | 5,800,000 | ||
| SpringerМатериалы | Спрингер | твердые материалы | Физические свойства CAS InChI | из литературы | «СпрингерМатериалс» . | 155,165 + 494,942 | ||
| СТРОЧКА | ЭМБЛ | от Biocarta, BioCyc, GO, KEGG и Reactome | Химико-белковые взаимодействия | курируемый и прогнозируемый | «СТИЧ» . | 500,000 | ||
| СуперДРЮГ2 | Группа структурной биоинформатики | цели по борьбе с наркотиками | мишени, доза, побочные эффекты, Canonical SMILES, Standard InChI, Standard InChIKey, DrugBank, ChEMBL, DrugCentral, KEGG, PubChem, CASRN | СД | «СуперДРУГ2» . | 4,600 | ||
| Супер Натуральный II | химикаты из натуральных продуктов | Поставщики УЛЫБКИ | СН00 | «Супер Натуральный 2» . | 325,508 | |||
| КонечноЧЕМБЛ | Европейская лаборатория молекулярной биологии | вещества в патентах | текст патента | «УверЧЕМБЛ» . | ||||
| SwissЛипиды | Швейцарский институт биоинформатики | липиды | ОДС: | «СвиссЛипиды» . | ||||
| Цели СПТБ | Исследования тропических болезней | Лаборатория трипаносоматики | наркотики и мишени | «Цели СТБ» . | 2,000,000 | |||
| ТТД | База данных терапевтических целей | Чжэцзянский университет | наркотики и мишени | SMILES InChI CAS PubChem | «ТТД» . | 37,316 | ||
| Т3ДБ | База данных токсинов и токсинов-мишеней База данных токсичных экспосом | Университет Альберты | токсины и мишени токсинов | Т3Д | «Т3ДБ» . | 3,678 | ||
| ЮниПрот | База знаний ЮниПрот | белки | последовательность, модификации, расположение, организм, сходство | «ЮниПрот» . | ||||
| США ТОЧКА | Министерство транспорта США | Руководство по реагированию на чрезвычайные ситуации ДОТ + другие | химикаты для перевозки навалом | UNnumber Идентификационный номер Организации Объединенных Наций, руководство по реагированию на опасности | «Руководство по реагированию на чрезвычайные ситуации» (PDF) . | 3000 | ||
| Спектральный атлас УФ/ВИД | Спектральный атлас газообразных молекул, представляющих интерес для атмосферы, MPI-Mainz UV/VIS | Институт химии Макса Планка | газообразные молекулы | сечения поглощения | из литературы | «Спектральный атлас УФ/ВИС» . | 7313 | |
| ЮМДБ | База данных метаболомов дрожжей | Инновационный центр метаболомики | метаболиты дрожжей | 48 полей данных | ЮМДБ | «ЮМДБ» . | 16042 | |
| ЦИНК | ЦИНК не является коммерческим. | Калифорнийский университет, Сан-Франциско | покупные вещества | EPA DSS TOX, ChEMBL, HMDB, KEGG, PDB, SMILES | «ЦИНК» . [10] | 37 х 10 9 |
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Информационная система исследований химического канцерогенеза (CCRIS) - источник данных PubChem» . pubchem.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 7 августа 2020 г.
- ^ «Загрузить данные CCRIS (Информационная система исследований химического канцерогенеза)» . www.nlm.nih.gov . Проверено 7 августа 2020 г.
- ^ Zhumagambetov, Rustam; Kazbek, Daniyar; Shakipov, Mansur; Maksut, Daulet; Peshkov, Vsevolod A.; Fazli, Siamac (2020-12-17). "cheML.io: an online database of ML-generated molecules" . RSC Advances . 10 (73): 45189–45198. doi : 10.1039/D0RA07820D . ISSN 2046-2069 . PMC 9058596 . PMID 35516285 .
- ^ Джейкобс, Андреа; Уильямс, Дастин; Хикки, Кэтрин; Патрик, Натан; Уильямс, Энтони Дж.; Мел, Стюарт; МакИвен, Лия; Уиллигхаген, Эгон; Уокер, Мартин; Болтон, Эван; Синклер, Габриэль; Сэнфорд, Адам (13 мая 2022 г.). «Общая химия CAS в 2021 году: расширение доступа научного сообщества к достоверной химической информации» . Журнал химической информации и моделирования . 62 (11): 2737–2743. doi : 10.1021/acs.jcim.2c00268 . ПМК 9199008 . ПМИД 35559614 .
- ^ «Видение – еМолекулы» . www.emolecules.com . Проверено 27 июля 2020 г.
- ^ «База данных метаболомов человека: О базе данных метаболомов человека» . hmdb.ca. Проверено 27 июля 2020 г.
- ^ Ван Сантен, Джеффри А.; Жакоб, Грегуар; Сингх, Амрит Лин; и др. (2019). «Атлас натуральных продуктов: база знаний открытого доступа для открытия микробных натуральных продуктов» . Центральная научная служба ACS . 5 (11): 1824–1833. дои : 10.1021/accentsci.9b00806 . ПМК 6891855 . ПМИД 31807684 .
- ^ Льюис, Кэтлин А .; Циливакис, Джон; Уорнер, Дуглас Дж.; Грин, Эндрю (2016). «Международная база данных для оценки и управления риском пестицидов». Оценка человеческого и экологического риска . 22 (4): 1050–1064. дои : 10.1080/10807039.2015.1133242 . hdl : 2299/17565 . S2CID 87599872 .
- ^ Диорацио, Луи Дж.; Хоуз, Дэвид Р.Дж.; Адлингтон, Нил К. (2016). «На пути к более целостной схеме выбора растворителя» . Исследования и разработки органических процессов . 20 (4): 760–773. дои : 10.1021/acs.oprd.6b00015 .
- ^ Тингл, Бенджамин И.; Тан, Хан Г.; Кастанон, Мар; Гутьеррес, Джон Дж.; Хурелбаатар, Мункхзул; Дандарчулуун, Чинзориг; Мороз Юрий С.; Ирвин, Джон Дж. (2023). «ЦИНК-22 — бесплатная многомиллиардная база данных материальных соединений для открытия лигандов» . Журнал химической информации и моделирования . 63 (4): 1166–1176. doi : 10.1021/acs.jcim.2c01253 . ПМЦ 9976280 . ПМИД 36790087 .