СЕРАК1
| СЕРАК1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | SERAC1 , сериновый активный центр, содержащий 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Опустить : 614725 ; МГИ : 2447813 ; Гомологен : 41900 ; Генные карты : SERAC1 ; ОМА : SERAC1 — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Белок 1, содержащий серин , или белок SERAC1, представляет собой белок человека, кодируемый SERAC1 геном . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] Белок, кодируемый этим геном, представляет собой белок ремоделирования фосфатидилглицерина , обнаруженный на границе митохондрий и эндоплазматической сети , где он опосредует обмен фосфолипидов . Кодируемый белок играет важную роль в функции митохондрий и внутриклеточном транспорте холестерина . Дефекты этого гена являются причиной 3-метилглутаконовой ацидурии с глухотой, энцефалопатией и синдромом Лея (MEGDEL). Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта : один кодирующий белок, а другой некодирующий белок. [ 5 ]
Структура
[ редактировать ]Ген SERAC1 расположен на q-плече хромосомы 6 в положении 25,3 и охватывает 58 776 пар оснований. [ 5 ] Ген SERAC1 производит белок массой 18,7 кДа, состоящий из 162 аминокислот . [ 8 ] [ 9 ] Структура кодируемого белка содержит С-концевой серин - липазный / эстеразный домен , содержащий консенсусный липазы мотив GxSxG, и N-концевую сигнальную последовательность. [ 10 ]
Функция
[ редактировать ]Ген SERAC1 кодирует белок, необходимый для ремоделирования фосфатидилглицерина . Ремоделирование фосфатидилглицерина представляет собой процесс изменения или ремоделирования определенного фосфолипида, называемого фосфатидилглицерином . Фосфатидилглицерин помогает вырабатывать кардиолипин , важный ингредиент, окружающий внутреннюю митохондриальную мембрану . Кардиолипин отвечает за преобразование энергии, полученной из пищи, в форму, пригодную для использования клетками и необходимую для правильного функционирования митохондрий. Благодаря кардиолипину процесс ремоделирования фосфатидилглицерина важен для функции митохондрий и внутриклеточного транспорта холестерина. [ 11 ] [ 6 ] [ 7 ]
Кроме того, SERAC1 участвует в перемещении холестерина , который представляет собой жирные восковые вещества внутри клеток. Холестерин является компонентом клеточной структуры и производит гормоны и пищеварительные кислоты . Белок также может участвовать в реакции трансацилирования-ацилирования с образованием пути биосинтеза фосфатидилглицерина -36:1 и бис( моноацилглицерин )фосфата. [ 11 ] [ 6 ] [ 7 ]
Клиническое значение
[ редактировать ]Мутации в гене SERAC1 связаны с нарушением как функции митохондрий, так и внутриклеточного транспорта холестерина . [ 10 ] Такие мутации в основном связаны с синдромом Лея и 3-метилглутаконовой ацидурией с глухотой, энцефалопатией и синдромом Ли , известным как синдром MEGDEL. [ 12 ]
МЭГДЭЛ-синдром
[ редактировать ]Мутации SERAC1 тесно связаны с синдромом MGDEL. Синдром MGDEL (3-метилглутаконовая ацидурия с глухотой, энцефалопатией и синдромом Ли) — аутосомно-рецессивное заболевание, характеризующееся началом в детстве задержки психомоторного развития или психомоторной регрессии, нейросенсорной глухотой , спастичностью или дистонией и повышенной экскрецией 3-метилглутаконовой кислоты . Снимки головного мозга показывают церебральную и мозжечковую атрофию , а также поражения базальных ганглиев, напоминающие синдром Ли . Лабораторные исследования показывают повышение в сыворотке лактата и аланина окислительного фосфорилирования митохондрий , дефекты , аномальные митохондрии , аномальные профили фосфатидилглицерина и кардиолипина в фибробластах и аномальное накопление неэтерифицированного холестерина внутри клеток. [ 7 ] [ 6 ]
Мутации гена SERAC1 , вызывающие это состояние, уменьшают количество вырабатываемого белка SERAC1 или приводят к выработке белка с незначительной функцией или без нее. В результате ремоделирование фосфатидилглицерина нарушается, что, вероятно, изменяет состав кардиолипина . Исследователи предполагают, что аномальный кардиолипин влияет на функцию митохондрий, снижая выработку клеточной энергии и приводя к неврологическим проблемам и проблемам со слухом, характерным для синдрома MEGDEL. Неясно, как мутации гена SERAC1 приводят к аномальному выделению 3-метилглутаконовой кислоты в мочу. [ 11 ] [ 5 ]
Мутация c.202C>T в этом гене была обнаружена у пациента, страдающего 3-метилглутаконовой ацидурией и связанными с ней симптомами. [ 13 ] у двух пациентов с гомозиготной трансверсией G>C в гене SERAC1 Было обнаружено, что наблюдаются симптомы синдрома MEGDEL с глухотой , энцефалопатией и синдромом Ли. [ 10 ] У другого пациента с гомозиготной делецией 4 пар оснований (1167delTCAG) наблюдались симптомы рецидивирующих инфекций, задержка в развитии , умственная отсталость , спастичность и экстрапирамидные симптомы . [ 14 ]
синдром Ли
[ редактировать ]Синдром Лея — прогрессирующее нейродегенеративное заболевание с ранним началом , характеризующееся наличием очаговых двусторонних поражений в одной или нескольких областях центральной нервной системы, включая ствол мозга , таламус, базальные ганглии , мозжечок и спинной мозг . Клинические особенности зависят от того, какие отделы центральной нервной системы поражены, и включают подострое начало психомоторной заторможенности , гипотонию , атаксию , мышечную слабость , потерю зрения, нарушения движений глаз, судороги и дисфагию . [ 15 ]
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что SERAC1 имеет белок-белковые взаимодействия со следующими. [ 16 ] [ 6 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000122335 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000015659 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Перейти обратно: а б с д «Ген Энтреза: активный сайт серина, содержащий 1» . Проверено 24 июля 2012 г.
В данной статье использован текст из этого источника, находящегося в свободном доступе .
- ^ Перейти обратно: а б с д и
«Белок SERAC1» . Проверено 27 августа 2018 г.
В эту статью включен текст , доступный по лицензии CC BY 4.0 .
- ^ Перейти обратно: а б с д «UniProt: универсальная база знаний о белках» . Исследования нуклеиновых кислот . 45 (Д1): Д158–Д169. Январь 2017 г. doi : 10.1093/nar/gkw1099 . ПМК 5210571 . ПМИД 27899622 .
- ^ Зонг NC, Ли Х, Ли Х, Лам МП, Хименес Р.К., Ким С.С., Денг Н., Ким АК, Чой Дж.Х., Селайя И., Лием Д., Мейер Д., Одеберг Дж., Фанг С., Лу Х.Дж., Сюй Т., Вайс Дж. , Дуан Х., Улен М., Йейтс-младший, Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний» . Исследование кровообращения . 113 (9): 1043–53. дои : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151 . ПМК 4076475 . ПМИД 23965338 .
- ^ «Белок SERAC1» . База знаний Атласа органических белков сердца (COPaKB) . Архивировано из оригинала 28 августа 2018 г. Проверено 28 августа 2018 г.
- ^ Перейти обратно: а б с Вортманн С.Б., Ваз Ф.М., Гардейчик Т., Виссерс Л.Е., Ренкема Г.Х., Шюрс-Хоймейкерс Дж.Х., Кулик В., Ламменс М., Кристин С., Клюйтманс Л.А., Роденбург Р.Дж., Нейтманс Л.Г., Грюневальд А., Кляйн С., Герхольд Ю.М., Козич Т., ван Хасселт П.М., Харакалова М., Клоостерман В., Барич И., Проницка Е., Учар С.К., Нэсс К., Сингхал К.К., Крумина З., Гилиссен С., ван Боховен Х., Велтман Дж.А., Смейтинк Дж.А., Лефебер Д.Д., Спелбринк Дж.Н., Веверс Р.А., Морава Е., де Брауэр А.П. ( июнь 2012 г.). «Мутации в гене ремоделирования фосфолипидов SERAC1 нарушают функцию митохондрий и внутриклеточный транспорт холестерина и вызывают дистонию и глухоту». Природная генетика . 44 (7): 797–802. дои : 10.1038/ng.2325 . ПМИД 22683713 . S2CID 2447771 .
- ^ Перейти обратно: а б с «СЕРАК1» . Домашний справочник по генетике . НКБИ. В данной статье использован текст из этого источника, находящегося в свободном доступе .
- ^ Лумиш Х.С., Ян Ю, Ся Ф, Уилсон А., Чунг В.К. (2014). «Расширяющийся фенотип MEGDEL: атрофия зрительного нерва, микроцефалия и миоклоническая эпилепсия у ребенка с мутациями SERAC1» . Отчеты JIMD . 16 : 75–9. дои : 10.1007/8904_2014_322 . ISBN 978-3-662-44586-0 . ПМЦ 4221303 . ПМИД 24997715 .
- ^ Торт Ф, Гарсиа-Сильва МТ, Феррер-Кортес «Секвенирование экзома выявляет новую мутацию в SERAC1 у пациента с 3-метилглутаконовой ацидурией». Молекулярная генетика и обмен веществ . 110 (1–2): 73–7. дои : 10.1016/j.ymgme.2013.04.021 . ПМИД 23707711 .
- ^ Вортманн С., Роденбург Р.Дж., Хейзинг М., Лупатти Ф.Дж., де Конинг Т., Клюйтманс Л.А., Энгельке У., Веверс Р., Смейтинк Дж.А., Морава Е (май 2006 г.). «Ассоциация 3-метилглутаконовой ацидурии с сенсоневральной глухотой, энцефалопатией и синдромом Лея (ассоциация MEGDEL) у четырех пациентов с нарушением окислительного фосфорилирования». Молекулярная генетика и обмен веществ . 88 (1): 47–52. дои : 10.1016/j.ymgme.2006.01.013 . ПМИД 16527507 .
- ^ «Синдром Ли» . www.uniprot.org .
- ^ Мик Д.У., Деннерляйн С., Визе Х., Рейнхольд Р., Паше-Грау Д., Лоренци И., Сасарман Ф., Вераарпачай В., Шубридж Э.А., Варшайд Б., Релинг П. (декабрь 2012 г.). «MITRAC связывает транслокацию митохондриальных белков со сборкой дыхательной цепи и регуляцией трансляции» . Клетка . 151 (7): 1528–41. дои : 10.1016/j.cell.2012.11.053 . hdl : 11858/00-001M-0000-000E-DDDF-4 . ПМИД 23260140 .
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .