РНК-связывающий белок EWS

ЭВСР1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	2CPE
Идентификаторы
Псевдонимы	EWSR1 , EWS, bK984G1.4, EWS-FLI1, область точки разрыва 1 саркомы Юинга, РНК-связывающий белок EWS 1
Внешние идентификаторы	ОМИМ : 133450 ; МГИ : 99960 ; Гомологен : 136069 ; GeneCards : EWSR1 ; OMA : EWSR1 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 22 (human)
End	29,300,525 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	5,099,266 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right uterine tube; ; left testis; ; right testis; ; right hemisphere of cerebellum; ; right lobe of thyroid gland; ; right adrenal cortex; ; left adrenal cortex; ; ganglionic eminence; ; body of uterus; ; left lobe of thyroid gland;
	Top expressed in
	yolk sac; ; neural layer of retina; ; ventricular zone; ; genital tubercle; ; tail of embryo; ; superior frontal gyrus; ; primary visual cortex; ; spermatocyte; ; spermatid; ; lip;
	More reference expression data
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	metal ion binding; protein binding; calmodulin binding; identical protein binding; nucleic acid binding; RNA binding;
Cellular component	cytoplasm; plasma membrane; nucleolus; membrane; nucleus;
Biological process	regulation of transcription, DNA-templated; transcription, DNA-templated;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	2130
	14030
	ENSG00000182944
	ENSMUSG00000009079
	Q01844
	Q61545
	НМ_001163285 ; НМ_001163286 ; НМ_001163287 ; НМ_005243 ; НМ_013986
	НМ_001283061 ; НМ_001283062 ; НМ_001283063 ; НМ_007968
	НП_001156757 ; НП_001156758 ; НП_001156759 ; НП_005234 ; НП_053733
показывать NP_001269990 ; NP_001269991 ; NP_001269992 ; НП_031994 ; НП_001349541 ;
	NP_001349542; NP_001349543; NP_001349544; NP_001349545; NP_001349546; NP_001349547; NP_001349549
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

РНК-связывающий белок EWS представляет собой белок , который у человека кодируется EWSR1 геном на 22 хромосоме человека , а именно 22q12.2. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Это один из трех белков семейства белков FET . ^{[ 7 ]}

Клиническое значение

Область q22.2 хромосомы 22 кодирует N-концевой домен трансактивации белка EWS, и эта область может присоединяться к одной из нескольких других хромосом, которые кодируют различные факторы транскрипции; см. EWS/FLI и OMIM-133450. ^{[ 8 ]} Экспрессия химерного белка с доменом трансактивации EWS, слитым с ДНК-связывающей областью транскрипционного фактора, генерирует мощный онкогенный белок, вызывающий саркому Юинга и другие члены семейства опухолей Юинга . Эти транслокации могут возникать из-за хромоплексии — вспышки сложных хромосомных перестроек, наблюдаемых в раковых клетках. ^{[ 9 ]} Нормальный ген EWS кодирует РНК-связывающий белок, тесно связанный с FUS (геном) и TAF15 , каждый из которых связан с боковым амиотрофическим склерозом . ^{[ 10 ]}

Взаимодействия

Было показано, что белок EWS взаимодействует с:

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000182944 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000009079 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Делатр О, Цукман Дж, Плугастель Б, Десмэйз С, Мелот Т, Питер М, Ковар Х, Жубер И, де Йонг П., Руло Г (октябрь 1992 г.). «Слияние генов с ДНК-связывающим доменом ETS, вызванное транслокацией хромосом в опухолях человека». Природа . 359 (6391): 162–5. Бибкод : 1992Natur.359..162D . дои : 10.1038/359162a0 . ПМИД 1522903 . S2CID 4331584 .
^ «Ген Энтрез: EWSR1 область останова 1 саркомы Юинга» .
^ Флюке У., ван Нозель М.М., Сиозопулу В., Крейтенс Д., Топс Б.Б., ван Горп Дж.М., Химке-Джива Л.С. (июнь 2021 г.). «EWSR1 — наиболее распространенный реаранжированный ген при поражениях мягких тканей, который также встречается при различных поражениях костей: обновленный обзор» . Диагностика (Базель, Швейцария) . 11 (6): 1093. doi : 10.3390/diagnostics11061093 . ПМЦ 8232650 . ПМИД 34203801 .
^ «Гены слияния семейства EWS - OMIM» .
^ Андерсон Н.Д., де Борха Р., Янг М.Д., Фулиньи Ф., Росич А., Робертс Н.Д., Хаджар С., Лайегифард М., Новокмет А., Ковальски П.Е., Анака М. (август 2018 г.). «Всплески перестройки генерируют канонические слияния генов в опухолях костей и мягких тканей» . Наука 361 (6405): eaam8419. дои : 10.1126/science.aam8419 . ПМК 6176908 . ПМИД 30166462 .
^ Кутуи Дж., Харт М.П., Эрион Р., Кинг О.Д., Диас З., Накая Т., Ибрагим Ф., Ким Х.Дж., Мойсилович-Петрович Дж., Паносян С., Ким К.Э., Фракелтон Э.К., Сольски Дж.А., Уильямс К.Л., Клэй-Фальконе Д., Элман Л., Маккласки Л., Грин Р., Хаконарсон Х., Калб Р.Г., Ли В.М., Трояновски Дж.К., Николсон Г.А., Блэр И.П., Бонини Н.М., Ван Дирлин В.М., Мурелатос З., Шортер Дж., Гитлер А.Д. (2012). «Оценка роли гена EWSR1, связанного с FUS/TLS, при боковом амиотрофическом склерозе» . Хм. Мол. Жене . 21 (13): 2899–911. дои : 10.1093/hmg/dds116 . ПМЦ 3373238 . ПМИД 22454397 .
^ Фудзимура И., Оно Т., Сиддик Х., Ли Л., Рао В.Н., Редди Э.С. (январь 1996 г.). «Ген EWS-ATF-1, участвующий в злокачественной меланоме мягких частей с транслокацией хромосомы t (12; 22), кодирует конститутивный активатор транскрипции». Онкоген . 12 (1): 159–67. ПМИД 8552387 .
^ Спан Л., Петерманн Р., Силиган С., Шмид Дж.А., Ари Д.Н., Ковар Х. (август 2002 г.). «Взаимодействие конца NH2 EWS с BARD1 связывает ген саркомы Юинга с общим путем подавления опухоли». Рак Рез . 62 (16): 4583–7. ПМИД 12183411 .
^ Оно Т., Оучида М., Ли Л., Гаталика З., Рао В.Н., Редди Э.С. (октябрь 1994 г.). «Ген EWS, участвующий в опухолях семейства Юинга, злокачественной меланоме мягких частей и десмопластических мелкокруглоклеточных опухолях, кодирует РНК-связывающий белок с новыми регуляторными доменами». Онкоген . 9 (10): 3087–97. ПМИД 8084618 .
^ Томас Г. Р., Лэтчман Д. С. (2002). «Проонкопротеин EWS (белок саркомы Юинга) взаимодействует с фактором транскрипции POU Brn-3a и ингибирует его способность активировать транскрипцию» . Рак Биол. Там . 1 (4): 428–32. дои : 10.4161/cbt.1.4.23 . ПМИД 12432261 .
^ Фелш Дж.С., Лейн В.С., Перальта Э.Г. (май 1999 г.). «Тирозинкиназа Pyk2 опосредует регуляцию связанного с G-белком рецептора РНК-связывающего белка EWS саркомы Юинга» . Курс. Биол . 9 (9): 485–8. Бибкод : 1999CBio....9..485F . дои : 10.1016/s0960-9822(99)80214-0 . ПМИД 10322114 .
^ Чжан Д., Пейли А.Дж., Чайлдс Дж. (июль 1998 г.). «Репрессор транскрипции ZFM1 взаимодействует и модулирует способность EWS активировать транскрипцию» . Ж. Биол. Хим . 273 (29): 18086–91. дои : 10.1074/jbc.273.29.18086 . ПМИД 9660765 .
^ Кнуп Л.Л., Бейкер С.Дж. (август 2000 г.). «Фактор сплайсинга U1C подавляет трансактивацию, опосредованную EWS/FLI» . Ж. Биол. Хим . 275 (32): 24865–71. дои : 10.1074/jbc.M001661200 . ПМИД 10827180 .
^ Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж, Зогби Х.И., Смоляр А, Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. ( октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .

Дальнейшее чтение

Оно Т., Рао В.Н., Редди Э.С. (декабрь 1993 г.). «Химерный белок EWS/Fli-1 является активатором транскрипции». Рак Рез . 53 (24): 5859–63. ПМИД 7503813 .
Оучида М., Оно Т., Фуджимура Ю., Рао В.Н., Редди Э.С. (сентябрь 1995 г.). «Потеря туморогенности клеток саркомы Юинга, экспрессирующих антисмысловую РНК с транскриптами слияния EWS». Онкоген . 11 (6): 1049–54. ПМИД 7566963 .
Бан Дж., Силиган С., Креппель М., Ари Д., Ковар Х. (2006). «Ews-Fli1 при саркоме Юинга: реальные цели и сопутствующий ущерб». Новые тенденции в онкологии в 21 веке . Достижения экспериментальной медицины и биологии. Том. 587. стр. 41–52. дои : 10.1007/978-1-4020-5133-3_4 . ISBN 978-1-4020-4966-8 . ПМИД 17163154 .
Мастер Х.П. (1976). «[Морфологические данные о хронических запорах в детстве]». Ежемесячный журнал по педиатрии . 124 (5): 354–6. ПМИД 934118 .
Гатри Г.М., Верстраете А., Дейнс М.М., Стерн Р.М. (1975). «Симптомы стресса в четырех обществах». Журнал социальной психологии . 95 (Вторая половина): 165–72. дои : 10.1080/00224545.1975.9918699 . ПМИД 1127890 .
Бхагират Т., Абэ С., Нодзима Т., Йошида М.К. (1995). «Молекулярный анализ транслокационного соединения at (11; 22) в случае саркомы Юинга». Гены Хромосомы Рак . 13 (2): 126–32. дои : 10.1002/gcc.2870130209 . ПМИД 7542907 . S2CID 36929552 .
Оно Т., Оучида М., Ли Л., Гаталика З., Рао В.Н., Редди Э.С. (1994). «Ген EWS, участвующий в опухолях семейства Юинга, злокачественной меланоме мягких частей и десмопластических мелкокруглоклеточных опухолях, кодирует РНК-связывающий белок с новыми регуляторными доменами». Онкоген . 9 (10): 3087–97. ПМИД 8084618 .
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Плугастель Б., Цукман Дж., Питер М., Томас Дж., Делатр О. (1994). «Геномная структура гена EWS и ее связь с EWSR1, местом опухолеассоциированной хромосомной транслокации». Геномика . 18 (3): 609–15. дои : 10.1016/S0888-7543(05)80363-5 . ПМИД 8307570 .
Цукман Дж., Делатр О., Десмейз С., Эпштейн А.Л., Стенман Г., Спелеман Ф., Флетчерс К.Д., Ауриас А., Томас Г. (1993). «Слияние генов EWS и ATF-1, индуцированное транслокацией t (12; 22) при злокачественной меланоме мягких частей». Нат. Жене . 4 (4): 341–5. дои : 10.1038/ng0893-341 . ПМИД 8401579 . S2CID 10944105 .
Броди С.Г., Стокер С.Дж., Уордлоу Дж.К., Дункан М.Х., МакКоннелл Т.С., Феддерсен Р.М., Уильямс Т.М. (1996). «Слияние генов EWS и WT-1 при десмопластической мелкокруглоклеточной опухоли брюшной полости». Хм. Патол . 26 (12): 1370–4. дои : 10.1016/0046-8177(95)90303-8 . ПМИД 8522311 .
Фудзимура И., Оно Т., Сиддик Х., Ли Л., Рао В.Н., Редди Э.С. (1996). «Ген EWS-ATF-1, участвующий в злокачественной меланоме мягких частей с транслокацией хромосомы t (12; 22), кодирует конститутивный активатор транскрипции». Онкоген . 12 (1): 159–67. ПМИД 8552387 .
Кларк Дж., Бенджамин Х., Гилл С., Сидхар С., Гудвин Дж., Крю Дж., Гастерсон Б.А., Шипли Дж., Купер К.С. (1996). «Слияние гена EWS с CHN, членом суперсемейства генов стероидных / тироидных рецепторов, при миксоидной хондросаркоме человека». Онкоген . 12 (2): 229–35. ПМИД 8570200 .
Магнаги-Жаулин Л., Масутани Х., Робин П., Липински М., Харель-Беллан А. (1996). «Элементы SRE представляют собой сайты связывания слитого белка EWS-FLI-1» . Нуклеиновые кислоты Рез . 24 (6): 1052–8. дои : 10.1093/нар/24.6.1052 . ПМЦ 145748 . ПМИД 8604338 .
Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соареш М.Б. (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геном Рез . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД 8889548 .
Аман П., Панагопулос И., Лассен С., Фиоретос Т., Менцингер М., Торессон Х., Хёглунд М., Форстер А., Рэббиттс Т.Х., Рон Д., Мандал Н., Мительман Ф. (1997). «Схемы экспрессии генов FUS и EWS, связанных с саркомой человека, и геномная структура FUS» . Геномика . 37 (1): 1–8. дои : 10.1006/geno.1996.0513 . ПМИД 8921363 .
Морохоши Ф., Арай К., Такахаши Э.И., Танигами А., Оки М. (1997). «Клонирование и картирование человеческого гена RBP56, кодирующего предполагаемый РНК-связывающий белок, аналогичный белкам FUS/TLS и EWS». Геномика . 38 (1): 51–7. дои : 10.1006/geno.1996.0591 . ПМИД 8954779 .
Зукман-Росси Дж., Легуа П., Томас Дж. (1997). «Идентификация новых членов семейств Gas2 и Ras в районе хромосомы 22q12». Геномика . 38 (3): 247–54. дои : 10.1006/geno.1996.0625 . ПМИД 8975699 .
Гинамар Р., Фужеро М., Зекингер П. (1997). «Домен SH3 тирозинкиназы Брутона взаимодействует с Vav, Sam68 и EWS». Скан. Дж. Иммунол . 45 (6): 587–95. дои : 10.1046/j.1365-3083.1997.d01-447.x . ПМИД 9201297 . S2CID 23303841 .
Делулм Дж.К., Причард Л., Делатр О., Шторм Д.Р. (1997). «Проонкопротеин EWS связывает кальмодулин и фосфорилируется протеинкиназой C через домен IQ» . Ж. Биол. Хим . 272 (43): 27369–77. дои : 10.1074/jbc.272.43.27369 . ПМИД 9341188 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .

Внешние ссылки

Область 1 контрольной точки саркомы Юинга в Атласе генетики и онкологии

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000182944 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000009079 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid1522903-5] Делатр О, Цукман Дж, Плугастель Б, Десмэйз С, Мелот Т, Питер М, Ковар Х, Жубер И, де Йонг П., Руло Г (октябрь 1992 г.). «Слияние генов с ДНК-связывающим доменом ETS, вызванное транслокацией хромосом в опухолях человека». Природа . 359 (6391): 162–5. Бибкод : 1992Natur.359..162D . дои : 10.1038/359162a0 . ПМИД 1522903 . S2CID 4331584 .

[entrez-6] «Ген Энтрез: EWSR1 область останова 1 саркомы Юинга» .

[pmid34203801-7] Флюке У., ван Нозель М.М., Сиозопулу В., Крейтенс Д., Топс Б.Б., ван Горп Дж.М., Химке-Джива Л.С. (июнь 2021 г.). «EWSR1 — наиболее распространенный реаранжированный ген при поражениях мягких тканей, который также встречается при различных поражениях костей: обновленный обзор» . Диагностика (Базель, Швейцария) . 11 (6): 1093. doi : 10.3390/diagnostics11061093 . ПМЦ 8232650 . ПМИД 34203801 .

[8] «Гены слияния семейства EWS - OMIM» .

[pmid30166462-9] Андерсон Н.Д., де Борха Р., Янг М.Д., Фулиньи Ф., Росич А., Робертс Н.Д., Хаджар С., Лайегифард М., Новокмет А., Ковальски П.Е., Анака М. (август 2018 г.). «Всплески перестройки генерируют канонические слияния генов в опухолях костей и мягких тканей» . Наука 361 (6405): eaam8419. дои : 10.1126/science.aam8419 . ПМК 6176908 . ПМИД 30166462 .

[pmid22454397-10] Кутуи Дж., Харт М.П., Эрион Р., Кинг О.Д., Диас З., Накая Т., Ибрагим Ф., Ким Х.Дж., Мойсилович-Петрович Дж., Паносян С., Ким К.Э., Фракелтон Э.К., Сольски Дж.А., Уильямс К.Л., Клэй-Фальконе Д., Элман Л., Маккласки Л., Грин Р., Хаконарсон Х., Калб Р.Г., Ли В.М., Трояновски Дж.К., Николсон Г.А., Блэр И.П., Бонини Н.М., Ван Дирлин В.М., Мурелатос З., Шортер Дж., Гитлер А.Д. (2012). «Оценка роли гена EWSR1, связанного с FUS/TLS, при боковом амиотрофическом склерозе» . Хм. Мол. Жене . 21 (13): 2899–911. дои : 10.1093/hmg/dds116 . ПМЦ 3373238 . ПМИД 22454397 .

[pmid8552387-11] Фудзимура И., Оно Т., Сиддик Х., Ли Л., Рао В.Н., Редди Э.С. (январь 1996 г.). «Ген EWS-ATF-1, участвующий в злокачественной меланоме мягких частей с транслокацией хромосомы t (12; 22), кодирует конститутивный активатор транскрипции». Онкоген . 12 (1): 159–67. ПМИД 8552387 .

[pmid12183411-12] Спан Л., Петерманн Р., Силиган С., Шмид Дж.А., Ари Д.Н., Ковар Х. (август 2002 г.). «Взаимодействие конца NH2 EWS с BARD1 связывает ген саркомы Юинга с общим путем подавления опухоли». Рак Рез . 62 (16): 4583–7. ПМИД 12183411 .

[pmid8084618-13] Оно Т., Оучида М., Ли Л., Гаталика З., Рао В.Н., Редди Э.С. (октябрь 1994 г.). «Ген EWS, участвующий в опухолях семейства Юинга, злокачественной меланоме мягких частей и десмопластических мелкокруглоклеточных опухолях, кодирует РНК-связывающий белок с новыми регуляторными доменами». Онкоген . 9 (10): 3087–97. ПМИД 8084618 .

[pmid12432261-14] Томас Г. Р., Лэтчман Д. С. (2002). «Проонкопротеин EWS (белок саркомы Юинга) взаимодействует с фактором транскрипции POU Brn-3a и ингибирует его способность активировать транскрипцию» . Рак Биол. Там . 1 (4): 428–32. дои : 10.4161/cbt.1.4.23 . ПМИД 12432261 .

[pmid10322114-15] Фелш Дж.С., Лейн В.С., Перальта Э.Г. (май 1999 г.). «Тирозинкиназа Pyk2 опосредует регуляцию связанного с G-белком рецептора РНК-связывающего белка EWS саркомы Юинга» . Курс. Биол . 9 (9): 485–8. Бибкод : 1999CBio....9..485F . дои : 10.1016/s0960-9822(99)80214-0 . ПМИД 10322114 .

[pmid9660765-16] Чжан Д., Пейли А.Дж., Чайлдс Дж. (июль 1998 г.). «Репрессор транскрипции ZFM1 взаимодействует и модулирует способность EWS активировать транскрипцию» . Ж. Биол. Хим . 273 (29): 18086–91. дои : 10.1074/jbc.273.29.18086 . ПМИД 9660765 .

[pmid10827180-17] Кнуп Л.Л., Бейкер С.Дж. (август 2000 г.). «Фактор сплайсинга U1C подавляет трансактивацию, опосредованную EWS/FLI» . Ж. Биол. Хим . 275 (32): 24865–71. дои : 10.1074/jbc.M001661200 . ПМИД 10827180 .

[pmid16189514-18] Руал Дж.Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кисикава Т., Дрико А., Ли Н., Берриз Г.Ф., Гиббонс Ф.Д., Дрез М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон С., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Г., Ли С., Альбала Дж.С., Лим Дж., Фротон С, Лламосас Е, Чевик С, Бекс С, Ламеш П, Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж, Зогби Х.И., Смоляр А, Босак С., Секерра Р., Дусетт-Стамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видал М. ( октябрь 2005 г.). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]