Семейство белков FET
Семейство белков FET (также известное как семейство белков TET) [ 1 ] состоит из трех одинаково структурированных и функционирующих белков. [ 2 ] Они и гены семейства генов FET , которые их кодируют (т.е. образуют пре-мессенджерные РНК , которые преобразуются в информационные РНК, ответственные за их производство): [ 2 ] [ 3 ] 1) белок EWSR1, кодируемый геном EWSR1 (также называемый РНК-связывающим белком саркомы Юинга, РНК-связывающим белком 1 EWS или геном bK984G1.4 ), расположенный на полосе 12.2 длинного (т.е. «q») плеча хромосомы 22 ; [ 4 ] 2) белок FUS (т.е. слитый при саркоме), кодируемый геном FUS (также называемым РНК-связывающим белком FUS, TLS, asTLS, ALS6, ETM4, FUS1, POMP75, altFUS или HNRNPP2 геном ), расположенный на полосе 16 на короткой плечо хромосомы 16 ; [ 5 ] и 3) белок TAF15, кодируемый геном TAF15 (также называемый фактором 15, связанным с ТАТА-бокс-связывающим белком, Npl3, RBP56, TAF2N или геном TAFII68 ), расположенный на полосе 12 на длинном плече хромосомы 7. [ 6 ] FET в названии этого семейства белков происходит от первых букв FUS, EWSR1 и TAF15. [ 7 ]
Белки FET обильно экспрессируются практически во всех исследованных тканях. Это РНК-связывающие белки . [ 7 ] Связываясь со своими РНК- мишенями, они способствуют регуляции: а) транскрипции генов в пре-мессенджерную РНК , сплайсинга пре-мессенджерной РНК в зрелую информационную РНК и транспорта этих РНК между различными областями их родительской РНК. клетки; б) процессинг микро-РНК , которые участвуют в молчании РНК и посттранскрипционной регуляции экспрессии генов ; и 3) обнаружение и восстановление поврежденной ДНК . Посредством этих многочисленных, сложных и часто до конца не понятных действий белки семейства FET регулируют клеточную экспрессию различных генов. [ 2 ] Однако гены белков FET часто подвергаются различным типам мутаций . Хотя эти мутации и заболевания, с которыми они связаны, можно найти на страницах Википедии, посвященных этим заболеваниям, в этой статье основное внимание уделяется одному типу мутаций — мутации слитого гена . Слитые гены образуются из двух ранее независимых генов, которые объединяются в результате хромосомной транслокации , делеции некоторого генетического материала в хромосоме или хромосомной инверсии . [ 1 ] [ 8 ] Например, EWSR1-FL1 [ 9 ] слитый ген образуется в результате хромосомной транслокации, которая объединяет часть гена EWSR1, обычно расположенного на участке 12 длинного плеча (или «q») хромосомы 22, с частью FLI1 гена семейства транскрипционных факторов ETS, обычно расположенного на участке 24 длинное плечо хромосомы 11 . Слитый ген EWSR1-FLI1 кодирует химерный белок EWS-FLI1 , который обладает нерегулируемой и избыточной активностью фактора транскрипции FLI1 , что, по-видимому, способствует развитию саркомы Юинга . [ 10 ] Слитые гены FET привлекли недавний интерес, поскольку было обнаружено, что они связаны и могут способствовать развитию широкого спектра мягких тканей, новообразований происходящих из мезенхимальной ткани . клеток [ 3 ] [ 7 ] [ 11 ] Обнаружение слитого гена, содержащего ген FET, чрезвычайно полезно при диагностике типов опухолей. [ 1 ] [ 11 ] определение патогенных механизмов, с помощью которых эти слитые белки способствуют развитию нарушений, [ 3 ] [ 12 ] и тем самым идентифицировать потенциальные цели для лечения этих расстройств. [ 2 ] [ 13 ] Ниже приведены примеры ассоциации этих слитых генов со злокачественными и доброкачественными неопластическими опухолями. [ 1 ] [ 7 ]
Злокачественные новообразования
[ редактировать ]- Саркома Юинга : Почти во всех случаях классической формы саркомы Юинга опухолевые клетки экспрессируют слитый ген, который объединяет часть гена семейства FET с частью гена семейства транскрипционных факторов ETS (т.е. FLI1 , ERG , ETV1 , ETV4 , или ВРЭ [ 14 ] ген). [ 15 ] Этими слитыми генами являются слитый ген EWSR1-FLI1 в 80-85% случаев или слитый ген EWSR1-ERG в 5-10% случаев. В редких случаях опухолевые клетки классической саркомы Юинга экспрессируют ген EWSR1 или FUS, слитый с геном ETV1, ETV4 или FEV . [ 1 ] Неопластические клетки в варианте круглоклеточной саркомы саркомы Юинга (иногда называемые саркомами с реаранжировкой NFATC2) экспрессируют слитые гены, состоящие из гена семейства FET, слитого с геном, который не является геном транскрипционного семейства ETS. Этими слитыми генами являются EWSR1- NFATC2 , FUS- NFATC2 и EWSR1- PATZ1 . [ 16 ]
- Десмопластические мелкокруглоклеточные опухоли . Неопластические клетки этих опухолей постоянно экспрессируют слитый ген EWSR1- WT1 . [ 1 ] [ 17 ]
- Миксоидная липосаркома : неопластические клетки этих опухолей экспрессируют слитый ген FUS- DDIT3 в 90% или слитый ген EWSR1-DDIT3 в редких случаях заболевания. [ 1 ] [ 18 ]
- Ангиоматоидная фиброзная гистиоцитома : неопластические клетки в этих опухолях EWSR1 - CREB1 в большинстве случаев экспрессируют слитый ген EWSR1-CREB, FUS-CREB, EWSR1 -ATF1 , FUS-ATF1, WSR1 - CREM или FUS-CREM. или в редких случаях слитый ген случаев заболевания. [ 1 ] [ 19 ]
- Внутричерепные мезенхимальные опухоли со слиянием FET-CREB: предполагается, что эти опухоли являются вариантом ангиоматоидных фиброзных опухолей гистиоцитомы. По определению, неопластические клетки во всех этих опухолях экспрессируют слитые гены FET-CREB. Из 20 зарегистрированных случаев слитыми генами в неопластических клетках этих опухолей были EWSR1-ATF1 (8 случаев), EWSR1-CREB1 (7 случаев), EWSR1-CREM (4 случая) и FUS-CREM (1 случай). [ 20 ]
- Первичная миксоидная саркома легких: среди 27 зарегистрированных случаев этих чрезвычайно редких опухолей 17 экспрессировали EWSR1-CREB1 , а 1 экспрессировал неопределенную перестройку гена EWSR1 в неопластических клетках. [ 21 ]
- Светлоклеточные саркомы : неопластические клетки этой опухоли EWSR1-ATF1 в большинстве случаев экспрессируют слитый ген или EWSR1-CREB1 , EWSR1-CREM , [ 22 ] или EWSR1-DDIT3 [ 1 ] слитый ген в небольшой группе случаев.
- Светлоклеточная саркомоподобная опухоль желудочно-кишечного тракта (также называемая желудочно-кишечной нейроэктодермальной опухолью ): неопластические клетки в этих опухолях экспрессируют слитые гены EWSR1:ATF1 или EWSR1:CREB1 в >50% или ~25% случаев соответственно. [ 1 ] [ 23 ]
- Мезотелиома : небольшая группа этих опухолей содержит неопластические клетки, которые экспрессируют слитый ген EWSR1-CREB или, в меньшем количестве случаев, слитый ген FUS-CREB . [ 1 ] [ 22 ]
- Миоэпителиома : около 50% этих опухолей содержат неопластические клетки, которые экспрессируют слитый ген, состоящий из гена EWSR1, слитого с PBX1 , PBX3 , ZNF444 , [ 24 ] Ген POU5F1 , ATF1 или KLF17 или, в менее частых случаях, ген FUS , слитый с одним из последних генов. [ 1 ]
- Склерозирующая эпителиоидная фибросаркома : неопластические клетки в этих опухолях экспрессируют слитый ген EWSR1-CREB3L1 примерно в 30%, слитый ген FUS-CREB3L2 в 12% и EWSR1 - CREB3L2 . [ 25 ] EWSR1-CREB3L3 , [ 26 ] или слитый ген EWSR1-CREM в редких случаях заболевания, [ 27 ] и другие, еще не полностью определенные реаранжировки в гене EWSR1 . [ 25 ]
- Фибромиксоидная саркома низкой степени злокачественности : неопластические клетки в этих опухолях FUS-CREB3L2 в большинстве случаев экспрессируют слитый ген или FUS-CREB3L1, [ 28 ] EWSR1-CREB3L2 или EWSR2-CREBL1 [ 1 ] слитый ген в меньшинстве случаев.
- Внескелетная миксоидная хондросаркома : неопластические клетки этих опухолей экспрессируют слитый ген EWSR1- NR4A3 в большинстве случаев или TAF15-NR4A3 в редких случаях заболевания. [ 1 ]
- EWSR1-SMAD3-положительная фибробластическая опухоль. Эти опухоли представляют собой недавно охарактеризованное новообразование с отчетливыми клинико-патологическими особенностями. [ 29 ] в настоящее время определяются экспрессией слитого гена EWSR1- SMAD3 в неопластических клетках. [ 1 ]
- Эпителиоидная и веретеноклеточная рабдомиосаркома со слиянием EWSR1/FUS-TFCP2: эти недавно описанные опухоли. [ 30 ] рассматриваются как небольшая подгруппа рабдомиосарком , которые по определению содержат неопластические клетки, экспрессирующие слитый ген EWSR1- TFCP2 или FUS-TFCP2 . [ 1 ]
Доброкачественные новообразования
[ редактировать ]- Простая костная киста (также называемая однокамерной костной кистой): часть этих опухолей содержит неопластические клетки, которые экспрессируют слитый ген FUS- NFATC2 или EWSR1-NFATC2 . [ 1 ] Недавнее исследование показало, что неопластические клетки в этих кистах экспрессируют слитый ген FUS-NFATC2 в четырех и слитый ген EWSR1-NFATC2 в двух из девяти тестовых случаев. [ 31 ]
- Гемангиома кости со слиянием EWSR1-NFATC1: эти редкие опухоли. [ 32 ] представляют собой разновидность гемангиом , которые по определению находятся в костных тканях и состоят из неопластических клеток, экспрессирующих слитый ген EWSR1- NFATC1 . [ 1 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с д и ж г час я дж к л м н тот п д р Флюк Ю, ван Нозель М.М., Сиозопулу В., Крейтенс Д., Топс Б.Б., ван Горп Дж.М., Химке-Джива Л.С. (июнь 2021 г.). «EWSR1 — наиболее распространенный реаранжированный ген при поражениях мягких тканей, который также встречается при различных поражениях костей: обновленный обзор» . Диагностика (Базель, Швейцария) . 11 (6): 1093. doi : 10.3390/diagnostics11061093 . ПМЦ 8232650 . ПМИД 34203801 .
- ^ Jump up to: а б с д Ковар Х (2011). «Доктор Джекилл и мистер Хайд: два лица семейства белков FUS/EWS/TAF15» . Саркома . 2011 : 837474. doi : 10.1155/2011/837474 . ПМК 3005952 . ПМИД 21197473 .
- ^ Jump up to: а б с Линден М, Томсен С, Грюндевик П, Йонассон Э, Андерссон Д, Руннберг Р, Долатабади С, Ваннас С, Луна Сантамария М, Фагман Х, Стольберг А, Аман П (май 2019 г.). «Слитые онкопротеины семейства FET нацелены на комплекс ремоделирования хроматина SWI / SNF» . Отчеты ЭМБО . 20 (5). дои : 10.15252/эмбр.201845766 . ПМК 6500973 . ПМИД 30962207 .
- ^ «РНК-связывающий белок 1 EWSR1 EWS [Homo sapiens (Человек)] - Ген - NCBI» .
- ^ «РНК-связывающий белок FUS FUS [Homo sapiens (Человек)] - Ген - NCBI» .
- ^ «TAF15 TATA-связывающий белок, ассоциированный с фактором 15 [Homo sapiens (Human)] - Ген - NCBI» .
- ^ Jump up to: а б с д Хоэлл Дж.И., Ларссон Э., Рунге С., Нусбаум Дж.Д., Дугимпуди С., Фарази Т.А., Хафнер М., Боркхардт А., Сандер С., Тушль Т. (ноябрь 2011 г.). «РНК-мишени белков семейства дикого типа и мутантных FET» . Структурная и молекулярная биология природы . 18 (12): 1428–31. дои : 10.1038/nsmb.2163 . ПМК 3230689 . ПМИД 22081015 .
- ^ Бун М.А., Таслим С., Кроу Дж.К., Селич-Андерсон Дж., Уотсон М., Хеппнер П., Хэмилл Дж., Вуд А.С., Лессник С.Л., Уинстенли М. (август 2021 г.). «Идентификация нового слияния FUS/ETV4 и сравнительный анализ с другими слитыми белками саркомы Юинга» . Молекулярные исследования рака . 19 (11): 1795–1801. дои : 10.1158/1541-7786.MCR-21-0354 . ПМЦ 8568690 . PMID 34465585 . S2CID 237373339 .
- ^ «Фолликулярная лимфома FL1, восприимчивость к 1 [Homo sapiens (Человек)] — Ген — NCBI» .
- ^ Сбаралья М., Риги А., Гамбаротти М., Дей Тос А.П. (январь 2020 г.). «Саркома Юинга и опухоли Юинга». Архив Вирхова . 476 (1): 109–119. дои : 10.1007/s00428-019-02720-8 . ПМИД 31802230 . S2CID 208613433 .
- ^ Jump up to: а б Кристель-Уитмор М., Тейлор М.С., Ривера М., Леннерц Дж.К., Ле Л.П., Диас-Сантагата Д., Иафрате А.Дж., Дешпанде В., Чебиб И., Нильсен Г.П., Ву КЛ, Нарди В. (ноябрь 2019 г.). «Новые и известные слияния и ассоциации гена EWSR1, идентифицированные с помощью секвенирования следующего поколения и флуоресцентной гибридизации in-situ». Патология человека . 93 : 65–73. дои : 10.1016/j.humpath.2019.08.006 . ПМИД 31430493 . S2CID 201117873 .
- ^ Агайми А (январь 2020 г.). «Что нового в эпителиоидных опухолях мягких тканей?». Архив Вирхова . 476 (1): 81–96. дои : 10.1007/s00428-019-02677-8 . ПМИД 31686193 . S2CID 207893952 .
- ^ Танака М., Накамура Т. (июль 2021 г.). «Моделирование саркомы, ассоциированной со слитыми генами: преимущества для понимания биологии и патологии саркомы». Международная патология . 71 (10): 643–654. дои : 10.1111/pin.13142 . ПМИД 34265156 . S2CID 235962562 .
- ^ «Фактор транскрипции FEV FEV, член семейства ETS [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov .
- ^ Дюрер, С.; Шейх, Х. (2021). «Саркома Юинга» . СтатПерлс . СтатПерлз. ПМИД 32644609 .
- ^ Перре Р., Эскуриоль Дж., Веласко В., Майер Л., Субейран И., Дельфур С., Обер С., Поливка М., Каранян М., Мержи А., Ле Геллек С., Вайнгертнер Н., Хеллер С., Куэндр Ж.М., Ларуссери Ф., Пьеррон Дж., Тирод. Ф, Ле Лоарер Ф (октябрь 2020 г.). «Саркомы с реаранжировкой NFATc2: клинико-патологическое, молекулярное и цитогенетическое исследование 7 случаев с доказательством использования AGGRECAN в качестве нового диагностического маркера» . Современная патология . 33 (10): 1930–1944. дои : 10.1038/s41379-020-0542-z . ПМИД 32327700 . S2CID 216085279 .
- ^ Байсах М.Р., Тивари А., Ганди Дж.С., Найк С., Шарма С.К., Бальцер Б.Л., Шарма С., Педдинти К., Джа С., Саху ПК, Прадхан Д., Геллер М., Амин М.Б., Диллон Дж., Моханти С.К. (октябрь 2020 г.). «Первичные круглоклеточные саркомы мочевого пузыря с перестройкой EWSR1: многоинституциональное исследование тринадцати случаев с обзором литературы». Патология человека . 104 : 84–95. дои : 10.1016/j.humpath.2020.08.001 . ПМИД 32798549 . S2CID 221143155 .
- ^ Оуэн И., Йи Д., Уайн Х., Пердикари Т.М., Джонсон В., Смит Дж., Кортум Р., Фавзи Н.Л., Шьюмейкер Ф (сентябрь 2021 г.). «Онкогенный фактор транскрипции FUS-CHOP может подвергаться разделению ядерной фазы жидкость-жидкость» . Журнал клеточной науки . 134 (17). дои : 10.1242/jcs.258578 . ПМЦ 8445604 . ПМИД 34357401 .
- ^ Ван З, Чжан Л, Рен Л, Лю Д, Ду Дж, Чжан М, Лу Джи, Сун Ю, Ван Ю, Ву С, Хан Джи (февраль 2021 г.). «Отличные клинико-патологические особенности первичной ангиоматоидной фиброзной гистиоцитомы легких: отчет о четырех новых случаях и обзор литературы» . Грудной рак . 12 (3): 314–323. дои : 10.1111/1759-7714.13727 . ПМЦ 7862796 . ПМИД 33314685 .
- ^ Слоан Э.А., Чианг Дж., Вильянуэва-Мейер Дж.Э., Александреску С., Эшбахер Дж.М., Ван В., Мафра М., Уд Дин Н., Карр-Бойд Э., Уотсон М., Пунсони М., Овьедо А., Гилани А., Кляйншмидт-ДеМастерс Б.К., Косс DJ, Лопес М.Б., Раффель С., Бергер М.С., Чанг С.М., Редди А., Рамани Б, Феррис С.П., Ли Дж.К., Хофманн Дж.В., Чо С.Дж., Хорвай А.Е., Пекмецчи М., Тихан Т., Боллен А.В., Родригес Ф.Дж., Эллисон Д.В., Перри А., Соломон Д.А. (июль 2021 г.). «Внутричерепная мезенхимальная опухоль со слиянием FET-CREB - объединяющий диагноз для спектра внутричерепных миксоидных мезенхимальных опухолей и ангиоматоидных фиброзных гистиоцитомоподобных новообразований» . Патология головного мозга (Цюрих, Швейцария) . 31 (4): e12918. дои : 10.1111/bpa.12918 . ПМК 8089120 . ПМИД 33141488 .
- ^ Чен З, Ян Ю, Чен Р, Нг CS, Ши Х (февраль 2020 г.). «Первичная миксоидная саркома легких со слиянием EWSR1-CREB1: описание случая и обзор литературы» . Диагностическая патология . 15 (1): 15. дои : 10.1186/s13000-020-00930-2 . ПМК 7008573 . ПМИД 32039736 .
- ^ Jump up to: а б Аргани П., Харви И., Нильсен Г.П., Такано А., Суурмейер А.Дж., Вольтаджио Л., Чжан Л., Сунг Ю.С., Стенцингер А., Мехтершаймер Г., Диксон БК, Антонеску Ч.Р. (ноябрь 2020 г.). «Слияния EWSR1/FUS-CREB определяют характерное злокачественное эпителиоидное новообразование со склонностью к образованию полостей, выстланных мезотелием» . Современная патология . 33 (11): 2233–2243. дои : 10.1038/s41379-020-0646-5 . ПМЦ 7584759 . ПМИД 32770123 .
- ^ Сивасубраманиам П., Тигс-Хейден, Калифорния, Стерджис К.Д., Хаген С.Э., Хартли С.П., Тангаиа Дж.Дж. (сентябрь 2021 г.). «Злокачественная нейроэктодермальная опухоль желудочно-кишечного тракта: цитологические, гистологические, иммуногистохимические и молекулярные ловушки». Анналы диагностической патологии . 55 : 151813. doi : 10.1016/j.anndiagpath.2021.151813 . ПМИД 34509898 . S2CID 237493040 .
- ^ «Белок 444 цинковых пальцев ZNF444 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov .
- ^ Jump up to: а б Портеус С, Ган К, Гонг Й, Пантановиц Л, Хендерсон-Джексон Э, Саид-Вафа Д, Мела Н, Петерсон Д, Ахмад Н, Ахмед А, Буй М (2020). «Склерозирующая эпителиоидная фибросаркома: цитологическая характеристика с гистологической, иммуногистологической, молекулярной и клинической корреляцией 8 случаев». Журнал Американского общества цитопатологий . 9 (6): 513–519. дои : 10.1016/j.jasc.2020.05.005 . ПМИД 32624384 . S2CID 220369922 .
- ^ «Белок 3, подобный 2, связывающий чувствительный элемент CREB3L2 цАМФ [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov .
- ^ Мартинес-Труферо Х, Кросс Джури Дж, Гомес-Матео МС, Бернабеу Д, Флория Л.Дж., Лаверниа Х, Себио А, Гарсиа Дель Муро Х, Альварес Р., Корреа Р., Эрнандес-Леон CN, Маркина Г, Хинди Н, Раунд А , Мартинес В. , Асенсио Х.М. , Мата К. , Вальверде Моралес СМ , Мартин-Брото Дж. (сентябрь 2021 г.). «Нечастые и своеобразные саркомы мягких тканей: междисциплинарный обзор и практические рекомендации по диагностике и лечению. Испанская группа по исследованию сарком (GEIS - GROUP). Часть I». Обзоры лечения рака . 99 : 102259 дои : 10.1016/j.ctrv.2021.102259 . ПМИД 34311246 .
- ^ Самбри А., Риги А., Туццато Г., Донати Д., Бьянки Г. (2018). «Фибромиксоидная саркома низкой степени злокачественности: клинико-патологическое исследование 24 случаев и обзор литературы». Польский журнал патологии . 69 (3): 219–225. дои : 10.5114/pjp.2018.79541 . hdl : 11585/667908 . ПМИД 30509048 .
- ^ Фут О, Халлин М., Джонс Р.Л., Сумати В.П., Туэй К. (апрель 2021 г.). «EWSR1-SMAD3-положительная фибробластическая опухоль». Международный журнал хирургической патологии . 29 (2): 179–181. дои : 10.1177/1066896920938124 . ПМИД 32615834 . S2CID 220326585 .
- ^ Крисингер Дж.С., Верли Б., Диксон Б.С., Фасих С., Хирбе А.С., Шульц Д.Б., Заде Г., Гупта А.А., Демикко Э.Г. (ноябрь 2020 г.). «Эпителиоидная и веретеноклеточная рабдомиосаркома со слиянием FUS-TFCP2 или EWSR1-TFCP2: отчет о двух случаях». Архив Вирхова . 477 (5): 725–732. дои : 10.1007/s00428-020-02870-0 . ПМИД 32556562 . S2CID 219872625 .
- ^ Пижем Дж, Шекоранья Д, Зупан А, Боштянчич Е, Матьяшич А, Мавчич Б, Контрерас Я., Газич Б, Мартинчич Д, Сной Ж, Лимпел Новак К.А., Салапура В (декабрь 2020 г.). «Слияния FUS-NFATC2 или EWSR1-NFATC2 присутствуют в большой части простых костных кист». Американский журнал хирургической патологии . 44 (12): 1623–1634. дои : 10.1097/PAS.0000000000001584 . ПМИД 32991339 . S2CID 222166961 .
- ^ Арбаджян Э., Магнуссон Л., Брошё О., Вейде Дж., Фольпе А.Л., Норд К.Х., Мертенс Ф. (апрель 2013 г.). «Доброкачественная сосудистая опухоль с новым слитым геном: EWSR1-NFATC1 при гемангиоме кости». Американский журнал хирургической патологии . 37 (4): 613–6. дои : 10.1097/PAS.0b013e31827ae13b . ПМИД 23480895 . S2CID 26564119 .