НДУФА10

НДУФА10
Идентификаторы
Псевдонимы	NDUFA10 , CI-42KD, CI-42k, НАДН: субъединица убихиноноксидоредуктазы A10, MC1DN22
Внешние идентификаторы	Опустить : 603835 ; МГИ : 1914523 ; Гомологен : 15342 ; Генные карты : NDUFA10 ; ОМА : NDUFA10 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	240,025,743 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 1 (mouse)
End	92,401,582 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	apex of heart; ; left ventricle; ; right auricle; ; mucosa of transverse colon; ; right ventricle; ; right adrenal gland; ; left adrenal gland; ; left adrenal cortex; ; right adrenal cortex; ; rectum;
	Top expressed in
	right ventricle; ; digastric muscle; ; sternocleidomastoid muscle; ; triceps brachii muscle; ; temporal muscle; ; right kidney; ; muscle of thigh; ; vastus lateralis muscle; ; facial motor nucleus; ; anterior horn of spinal cord;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	NADH dehydrogenase (ubiquinone) activity;
Cellular component	mitochondrial inner membrane; myelin sheath; mitochondrial matrix; respirasome; mitochondrion; mitochondrial respiratory chain complex I; cytoplasm;
Biological process	mitochondrial electron transport, NADH to ubiquinone; mitochondrial respiratory chain complex I assembly;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	4705
	67273
	ENSG00000130414
	ENSMUSG00000026260
	О95299
	Q99LC3
	НМ_004544 ; НМ_001322019 ; НМ_001322020
	НМ_024197
	НП_001308948 ; НП_001308949 ; НП_004535
	НП_077159
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Субъединица 10 субкомплекса НАДН-дегидрогеназы [убихинон] 1 альфа представляет собой фермент , который у человека кодируется NDUFA10 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]} Белок NDUFA10 представляет собой субъединицу НАДН-дегидрогеназы (убихинона) , которая расположена во внутренней мембране митохондрий и является крупнейшим из пяти комплексов цепи переноса электронов . ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]} Мутации в субъединицах НАДН-дегидрогеназы (убихинон), также известной как Комплекс I , часто приводят к сложным нейродегенеративным заболеваниям, таким как синдром Ли . ^{[ 5 ]} Кроме того, снижение уровня экспрессии NDUFA10 из-за FOXM1 -направленного гиперметилирования связано с плоскоклеточной карциномой человека и может быть связано с другими формами рака. ^{[ 9 ]}

Структура

Ген NDUFA10 расположен на q-плече хромосомы 2 в положении 37,3 и охватывает 68 031 пару оснований. ^{[ 5 ]} Ген производит белок массой 41 кДа, состоящий из 355 аминокислот . ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]} NDUFA10 — субъединица фермента НАДН-дегидрогеназы (убихинона) , крупнейшего из дыхательных комплексов. Структура имеет L-образную форму с длинным гидрофобным трансмембранным доменом и гидрофильным доменом периферического плеча, который включает все известные окислительно-восстановительные центры и сайт связывания НАДН. ^{[ 7 ]} Было отмечено, что N-концевой гидрофобный домен может сворачиваться в альфа-спираль, охватывающую внутреннюю мембрану митохондрий , с C-концевым гидрофильным доменом, взаимодействующим с глобулярными субъединицами Комплекса I. Высококонсервативная двухдоменная структура предполагает, что эта особенность имеет решающее значение для функции белка и то, что гидрофобный домен действует как якорь для комплекса НАДН-дегидрогеназы (убихинон) на внутренней стороне. митохондриальная мембрана. NDUFA10 является одной из примерно 31 гидрофобной субъединицы, образующей трансмембранную область Комплекса I, но это вспомогательная субъединица, которая, как полагают, не участвует в катализе. ^{[ 12 ]} Предсказанная вторичная структура представляет собой в основном альфа-спираль, но карбокси-концевая половина белка имеет высокий потенциал принять форму спиральной спирали. Аминоконцевая часть содержит предполагаемый бета-лист, богатый гидрофобными аминокислотами, которые могут служить сигналом импорта в митохондрии. ^{[ 5 ]}^{[ 8 ]}^{[ 13 ]}

Функция

Ген NDUFA10 человека кодирует субъединицу комплекса I дыхательной цепи , которая переносит электроны от НАДН к убихинону . ^{[ 5 ]} НАДН связывается с Комплексом I и переносит два электрона на изоаллоксазиновое кольцо протезного плеча флавинмононуклеотида (FMN) с образованием FMNH ₂ . Электроны передаются через серию железо-серных кластеров (Fe-S) в протезной руке и, наконец, к коферменту Q10 (CoQ), который восстанавливается до убихинола (CoQH ₂ ). Поток электронов изменяет окислительно-восстановительное состояние белка, что приводит к конформационному изменению и сдвигу p K ионизируемой боковой цепи, которая выкачивает четыре иона водорода из митохондриального матрикса . ^{[ 7 ]}

Клиническое значение

NDUFA10 продемонстрировал значительное снижение уровня экспрессии мРНК при плоскоклеточной карциноме человека из-за гиперметилирования, индуцированного FOXM1 . FOXM1 — известный онкоген, который участвует во всех типах рака человека. Он действует, ингибируя гены- супрессоры опухолей посредством гиперметилирования промотора, среди других механизмов. ^{[ 9 ]} Мутации в NDUFA10 также связаны с болезнью Ли, возникающей в результате дефицита комплекса I. ^{[ 14 ]}

Взаимодействия

Было показано, что NDUFA10 имеет 56 бинарных белок-белковых взаимодействий, включая 55 кокомплексных взаимодействий. NDUFA10, по-видимому, взаимодействует с RAB8A . ^{[ 15 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000130414 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026260 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и «Ген Энтреза: NDUFA10 НАДН-дегидрогеназа (убихинон) 1 альфа-субкомплекс, 10» .
^ Леффен Дж.Л., Трипельс Р.Х., ван ден Хеувел Л.П., Шуэльке М., Бушенс К.А., Смитс Р.Дж., Трийбелс Дж.М., Смейтинк Дж.А. (декабрь 1998 г.). «КДНК восьми ядерно-кодируемых субъединиц НАДН:убихиноноксидоредуктазы: завершена характеристика кДНК человеческого комплекса I». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 253 (2): 415–22. дои : 10.1006/bbrc.1998.9786 . ПМИД 9878551 .
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с Voet D , Voet JG , Пратт CW (2013). «Глава 18». Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (4-е изд.). Хобокен, Нью-Джерси: Уайли. стр. 581–620. ISBN 978-0-470-54784-7 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Эмахазион Т., Бесков А., Гилленстен У., Брукс А.Дж. (ноябрь 1998 г.). «Радиационное гибридное картирование на основе интронов 15 генов комплекса I цепи переноса электронов человека». Цитогенетика и клеточная генетика . 82 (1–2): 115–9. doi : 10.1159/000015082 (неактивен 8 июня 2024 г.). ПМИД 9763677 . S2CID 46818955 . {{cite journal}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на июнь 2024 г. ( ссылка )
^ Перейти обратно: ^а ^б Тех М.Т., Геменетзидис Э., Патель Д., Тарик Р., Надир А., Бахта А.В., Васим А., Хатчисон И.Л. (2012). «FOXM1 индуцирует глобальную сигнатуру метилирования, которая имитирует эпигеном рака при плоскоклеточном раке головы и шеи» . ПЛОС ОДИН . 7 (3): e34329. Бибкод : 2012PLoSO...734329T . дои : 10.1371/journal.pone.0034329 . ПМК 3312909 . ПМИД 22461910 .
^ Зонг NC, Ли Х, Ли Х, Лам МП, Хименес Р.К., Ким С.С., Денг Н., Ким АК, Чой Дж.Х., Селайя И., Лием Д., Мейер Д., Одеберг Дж., Фанг С., Лу Х.Дж., Сюй Т., Вайс Дж. , Дуан Х., Улен М., Йейтс-младший, Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний» . Исследование кровообращения . 113 (9): 1043–53. дои : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151 . ПМК 4076475 . ПМИД 23965338 .
^ «NDUFA10 - НАДН-дегидрогеназа [убихинон] 1 альфа-подкомплекс, субъединица 10» . База знаний Атласа органических белков сердца (COPaKB) .
^ «NDUFA10 - НАДН-дегидрогеназа [убихинон] 1 альфа-подкомплекс, субъединица 10» . UniProt.org . Консорциум UniProt.
^ Тон С., Хван Д.М., Демпси А.А., Лью CC (декабрь 1997 г.). «Идентификация и первичная структура пяти субъединиц НАДН-убихинон оксидоредуктазы человека». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 241 (2): 589–94. дои : 10.1006/bbrc.1997.7707 . ПМИД 9425316 .
^ Хофс С.Дж., ван Спронсен Ф.Дж., Ленссен Э.В., Нийтманс Л.Г., Роденбург Р.Дж., Смейтинк Дж.А., ван ден Хеувел Л.П. (март 2011 г.). «Мутации NDUFA10 вызывают дефицит комплекса I у пациента с болезнью Ли» . Европейский журнал генетики человека . 19 (3): 270–4. дои : 10.1038/ejhg.2010.204 . ПМК 3061993 . ПМИД 21150889 .
^ «По поисковому запросу NDUFA10 найдено 56 бинарных взаимодействий» . База данных молекулярных взаимодействий IntAct . ЭМБЛ-ЭБИ . Проверено 25 августа 2018 г.

Дальнейшее чтение

Смитинк Дж., ван ден Хевел Л. (июнь 1999 г.). «Митохондриальный комплекс человека I в норме и болезни» . Американский журнал генетики человека . 64 (6): 1505–10. дои : 10.1086/302432 . ПМЦ 1377894 . ПМИД 10330338 .
Ма Дж., Демпси А.А., Стаматиу Д., Маршалл К.В., Лью К.С. (март 2007 г.). «Идентификация закономерностей экспрессии генов лейкоцитов, связанных с уровнями липидов в плазме у людей». Атеросклероз . 191 (1): 63–72. doi : 10.1016/j.atherosclerosis.2006.05.032 . ПМИД 16806233 .
Геварт К., Готалс М., Мартенс Л., Ван Дамм Дж., Стас А., Томас Г.Р., Вандекеркхове Дж. (май 2003 г.). «Изучение протеомов и анализ обработки белков путем масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Природная биотехнология . 21 (5): 566–9. дои : 10.1038/nbt810 . ПМИД 12665801 . S2CID 23783563 .
Баенс М., Чаффане М., Эрсенс Дж., Кассиман Дж.Дж., Маринен П. (май 1994 г.). «Присвоение гена ядрышкового белка пролиферирующих клеток человека P120 (NOL1) хромосоме 12p13 путем флуоресцентной гибридизации in situ и полимеразной цепной реакции с гибридами соматических клеток». Геномика . 21 (1): 296–7. дои : 10.1006/geno.1994.1267 . ПМИД 8088812 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000130414 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026260 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д ^и «Ген Энтреза: NDUFA10 НАДН-дегидрогеназа (убихинон) 1 альфа-субкомплекс, 10» .

[pmid9878551-6] Леффен Дж.Л., Трипельс Р.Х., ван ден Хеувел Л.П., Шуэльке М., Бушенс К.А., Смитс Р.Дж., Трийбелс Дж.М., Смейтинк Дж.А. (декабрь 1998 г.). «КДНК восьми ядерно-кодируемых субъединиц НАДН:убихиноноксидоредуктазы: завершена характеристика кДНК человеческого комплекса I». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 253 (2): 415–22. дои : 10.1006/bbrc.1998.9786 . ПМИД 9878551 .

[Biochem-7] Перейти обратно: ^а ^б ^с Voet D , Voet JG , Пратт CW (2013). «Глава 18». Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (4-е изд.). Хобокен, Нью-Джерси: Уайли. стр. 581–620. ISBN 978-0-470-54784-7 .

[pmid9763677-8] Перейти обратно: ^а ^б Эмахазион Т., Бесков А., Гилленстен У., Брукс А.Дж. (ноябрь 1998 г.). «Радиационное гибридное картирование на основе интронов 15 генов комплекса I цепи переноса электронов человека». Цитогенетика и клеточная генетика . 82 (1–2): 115–9. doi : 10.1159/000015082 (неактивен 8 июня 2024 г.). ПМИД 9763677 . S2CID 46818955 . {{cite journal}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на июнь 2024 г. ( ссылка )

[pmid22461910-9] Перейти обратно: ^а ^б Тех М.Т., Геменетзидис Э., Патель Д., Тарик Р., Надир А., Бахта А.В., Васим А., Хатчисон И.Л. (2012). «FOXM1 индуцирует глобальную сигнатуру метилирования, которая имитирует эпигеном рака при плоскоклеточном раке головы и шеи» . ПЛОС ОДИН . 7 (3): e34329. Бибкод : 2012PLoSO...734329T . дои : 10.1371/journal.pone.0034329 . ПМК 3312909 . ПМИД 22461910 .

[COPaKB-10] Зонг NC, Ли Х, Ли Х, Лам МП, Хименес Р.К., Ким С.С., Денг Н., Ким АК, Чой Дж.Х., Селайя И., Лием Д., Мейер Д., Одеберг Дж., Фанг С., Лу Х.Дж., Сюй Т., Вайс Дж. , Дуан Х., Улен М., Йейтс-младший, Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний» . Исследование кровообращения . 113 (9): 1043–53. дои : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151 . ПМК 4076475 . ПМИД 23965338 .

[url_COPaKB-11] «NDUFA10 - НАДН-дегидрогеназа [убихинон] 1 альфа-подкомплекс, субъединица 10» . База знаний Атласа органических белков сердца (COPaKB) .

[12] «NDUFA10 - НАДН-дегидрогеназа [убихинон] 1 альфа-подкомплекс, субъединица 10» . UniProt.org . Консорциум UniProt.

[pmid9425316-13] Тон С., Хван Д.М., Демпси А.А., Лью CC (декабрь 1997 г.). «Идентификация и первичная структура пяти субъединиц НАДН-убихинон оксидоредуктазы человека». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 241 (2): 589–94. дои : 10.1006/bbrc.1997.7707 . ПМИД 9425316 .

[14] Хофс С.Дж., ван Спронсен Ф.Дж., Ленссен Э.В., Нийтманс Л.Г., Роденбург Р.Дж., Смейтинк Дж.А., ван ден Хеувел Л.П. (март 2011 г.). «Мутации NDUFA10 вызывают дефицит комплекса I у пациента с болезнью Ли» . Европейский журнал генетики человека . 19 (3): 270–4. дои : 10.1038/ejhg.2010.204 . ПМК 3061993 . ПМИД 21150889 .

[15] «По поисковому запросу NDUFA10 найдено 56 бинарных взаимодействий» . База данных молекулярных взаимодействий IntAct . ЭМБЛ-ЭБИ . Проверено 25 августа 2018 г.

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]