Джемма Геогеган
Джемма Геогеган | |
|---|---|
| Рожденный | 1985 или 1986 (37–38 лет) |
| Альма-матер | Университет Отаго |
| Известный |
|
| Научная карьера | |
| Поля | Секвенирование генома |
| Учреждения | Университет Маккуори Университет Отаго |
| Диссертация | Моделирование отбора при мягком наследовании (2012) |
| Докторантура | Хэмиш Спенсер |
Джемма Луиза Геохеган (1985 или 1986 г.р.) [ 1 ] шотландского происхождения — эволюционный вирусолог , базирующийся в Университете Отаго , Новая Зеландия, который специализируется на исследовании новых инфекционных заболеваний и использовании метагеномики для отслеживания эволюции вирусов . Будучи руководителем нескольких финансируемых государством исследовательских проектов, Геохеган стал публичным лицом геномного секвенирования во время реакции Новой Зеландии на COVID-19 . Ее исследования способствовали дискуссии о вероятной причине COVID-19 и проблемах прогнозирования пандемий. Она была лауреатом премии Young Tall Poppy Award в 2017 году, стипендии Резерфорда за открытия в 2020 году и премии премьер-министра для молодых ученых 2021 года .
Ранняя жизнь и образование
[ редактировать ]Геохеган родился и вырос в Купаре , Шотландия. Ее приняли в Университет Стратклайда , в Глазго но в 2004 году она взяла годичный перерыв в учебе, прежде чем приступить к учебе в университете и работать преподавателем-волонтером в Баддегаме , Шри-Ланка . [ 1 ] В возрасте 18 лет она вернулась в Университет Стратклайда и в 2009 году получила степень бакалавра наук ( с отличием ) в области генетики по специальности «Судебная биология» . [ 2 ] Она получила стипендию для получения докторской степени в Университете Отаго и переехала в Новую Зеландию . Возможность защитить докторскую диссертацию ей предложил профессор Хэмиш Спенсер, который сказал, что «выбрал Геогеган на эту должность из-за ее «интересного» прошлого». [ 2 ] После получения докторской степени по эволюционной биологии в 2012 году, [ 3 ] Геогеган поехала в Нью-Йорк, где работала с группой в Нью-Йоркском университете , занимавшейся проблемой ВИЧ . В 2013 году она переехала в Австралию и с 2013 по 2017 год работала научным сотрудником в Сиднейском университете , прежде чем открыть собственную лабораторию в Университете Маккуори . [ 1 ]
Карьера
[ редактировать ]Геохеган работал преподавателем в Университете Маккуори с 2017 по 2020 год. [ 4 ] В 2017 году за свои исследования в качестве биолога-эволюциониста она получила премию Tall Young Poppy Award. [ 5 ]
С 2020 года Геохеган является старшим преподавателем кафедры Отаго Университета микробиологии и иммунологии и младшим старшим научным сотрудником Института экологических наук и исследований (ESR). В августе 2023 года ее назначили на должность заведующего семейной кафедрой вирусного патогенеза Вебстеров в Отаго. [ 6 ]
Секвенирование генома
[ редактировать ]Публичный профиль
[ редактировать ]Геохегана называют одним из «выдающихся коммуникаторов Новой Зеландии… одним из лиц, занимающихся секвенированием генома COVID-19 в этой стране». [ 1 ] В статье для The Spinoff новозеландский ученый Сьюзи Уайлс признал Геохегана «одним из людей, стоящих за невероятными усилиями Новой Зеландии по секвенированию всех штаммов вируса, которые мы получаем здесь». [ 7 ] Уайлс также рекомендовал тем, кто хочет узнать больше о секвенировании генома, ознакомиться с исследованиями, проводимыми командой, в которую входил Геохеган. [ 8 ] Статья этого исследования была позже опубликована 11 декабря 2020 года. [ 9 ] The Guardian признала Геохегана «одним из ученых, ведущих работу по анализу геномных последовательностей вируса». [ 10 ]
Когда в июле 2021 года Великобритания решила снять все ограничения общественного здравоохранения после карантина во время COVID-19, несмотря на то, что вакцинирована только половина населения, Геохеган разделил опасения Сиукси Уайлс , Эшли Блумфилд и Джули Энн Джентер , что это может привести к более опасным варианты вируса, циркулирующие по всему миру, подрывают программы вакцинации. Она сказала, что это « [обучает] вирус избегать иммунитета, вызванного вакциной», и что стране нужен более высокий порог вакцинации, чтобы справиться с вариантом Дельта . [ 11 ]
В январе 2022 года, когда вариант Омикрона начал распространяться в Новой Зеландии и выяснилось, что произойдет дальнейшая мутация , BA.2, [ 12 ] Геохеган отметил, что «новая мутация в основном обнаруживается посредством секвенирования генома, поскольку только определенные типы тестов ПЦР (мазок из носа) выявляют тонкие различия между Дельтой и BA.2… [но это]… люди, которые полностью вакцинированы с ускорителями были «эффективно защищены» от нового варианта. [ 13 ] К июню 2022 года стало широко распространено мнение, что Омикрон, вероятно, станет эндемиком Новой Зеландии. Учитывая последствия этого, один комментатор написал: «Единственными факторами, определяющими, сколько людей заболеет, станет инвалидом или погибнет от вируса, являются его эволюционные скачки и наши действия по формированию окружающей среды». [ 14 ] Геохеган согласился, что носитель и вирус находятся в «эволюционной гонке вооружений, в которой они продолжают меняться, пытаясь победить друг друга», но отметил, что трудно предсказать, как вирус может измениться, поскольку новые варианты пытаются уклониться от иммунитета от вакцинации или предыдущих инфекция. Она сказала, что на это могут повлиять такие факторы, как «быстрая репликация и инфицирование клеток у человека с хроническим иммунодефицитом… [или]… рекомбинация различных вариантов, возможно, у животного-хозяина». [ 14 ]
Дебаты о причинах COVID-19
[ редактировать ]В начале 2020 года, когда задавались вопросы о причинах пандемии коронавируса, Геогхегану задали вопрос на канале 7 News как учёному, чей «экспертизы сосредоточены на области, где встречаются животные и люди», если и как Covid-19 выскочил из животных людям. Она объяснила, что летучие мыши действительно содержат вирусы, похожие на COVID-19, но чтобы подтвердить, что они «генетически связаны», необходимо было посмотреть на «генетические сигнатуры» вируса. [ 15 ] В 2018 году Геохеган принял участие в исследовании, в котором использовалась метагеномная линза, чтобы посредством изучения секвенирования генома вирусов рыб как предков всех позвоночных показать, как вирус может распространяться и развиваться во времени и пространстве, подтверждая его существование в природе. и не обязательно созданные людьми. [ 16 ] Она отметила, что геном SARS-CoV-2, вируса, вызывающего COVID-19, тесно связан с другими вирусами, присутствующими в природе, и что, будучи новым вирусом SARS , коронавирус, вероятно, прошел аналогичный путь. к тому, что вызвало вспышку атипичной пневмонии в 2003 году, когда она передалась от живых животных человеку. Геохеган заключил: «Взаимодействие человека с живыми животными увеличивает вероятность прыжка хозяина, а рынки живых животных являются огромным источником этих взаимодействий». [ 17 ]
Прогнозирование вирусов
[ редактировать ]Геохеган опубликовал статью в Австралазийском научном журнале (2016), в которой исследовалась роль биологических факторов, таких как размер, структура и способ передачи вирусов, в прогнозировании риска их передачи среди людей. [ 18 ] В том же году она сотрудничала с Эдвардом Холмсом в исследовании , изучающем возможность предсказания вирусов. [ 19 ] Обсуждая исследование с Эдом Йонгом в The Atlantic , Геохеган сказал, что прогнозирование затруднено из-за огромного количества вирусов, и поддержал выводы другого ученого, Кристиана Андерсона, из Исследовательского института Скриппса , который сказал, что это «просто невозможно… » предсказать] ...может ли недавно обнаруженный вирус животных проникнуть в человека и вызвать пандемию». [ 20 ] В статье Геогхаген утверждает, что лучше всего определить «линии разлома», где взаимодействуют животные и люди. Йонг заключил: «Тот вид наблюдения, к которому призывают Геохаген, Андерсен и другие... [является] ...жизненно важным». [ 20 ] В мае 2020 года Геохеган рассказал The Sydney Morning Herald , что лучший способ получить знания о возможном прогнозировании вирусов — это финансировать наблюдение за людьми, особенно в местах, где они взаимодействуют с живыми животными, и выявлять «зоны риска». [ 21 ] Представленный Кейт Хоксби на Newstalk ZB как «эксперт по секвенированию генома», Геохеган объяснил, что, когда вирус передается от человека к человеку, он создает новую мутацию, которую можно отследить с точки зрения происхождения и возможного распространения в обществе. [ 22 ]
Птичий грипп
[ редактировать ]В августе 2023 года Геохеган стал соавтором статьи, предупреждающей, что новые штаммы птичьего гриппа (известного как птичий грипп) вызывают во всем мире панзоотию среди водных птиц с [все более частым] «переходом на нептичьих хозяев, таких как млекопитающие». [ 23 ] В статье отмечается, что по состоянию на 2023 год в Новой Зеландии не было зарегистрировано ни одного случая этого варианта, но предостерегается, что страна уязвима из-за большого количества перелетных птиц, прилетающих каждый год, некоторые из которых могут переносить бессимптомные инфекции. Авторы отметили, что в Новой Зеландии мало ведется надзор за активными вирусами в дикой природе, и предложили ряд шагов, которые страна могла бы предпринять, чтобы подготовиться к вторжениям. Они будут включать повышение осведомленности в случае неожиданной гибели животных, усиление воздействия на известные патогены и максимальное использование «возможностей вирусной геномики... созданных во время COVID-19». [ 23 ]
Избранные исследовательские проекты
[ редактировать ]Институт экологических наук и исследований
[ редактировать ]В мае 2020 года в результате сотрудничества Университета Отаго и Института экологических наук и исследований (ESR) Геогхегану было выделено 600 000 долларов из Министерства бизнеса, инноваций и занятости Фонда ускорения инноваций COVID-19 (MBIE). Ее роль заключалась в том, чтобы возглавить международную группу ученых, которые секвенировали геномы всех положительных случаев COVID-19 в Новой Зеландии и отслеживали распространение вируса по Новой Зеландии. [ 24 ] К августу 2020 года команда смогла показать геномное секвенирование, подтверждающее, что вирус в Новой Зеландии возник из-за границы и в основном распространялся внутри страны на общественных мероприятиях. [ 25 ] Когда в августе 2020 года в Окленде произошла еще одна вспышка вируса, Геохеган рассказала Кэтрин Райан в программе RNZ National , что работа, в которой она участвовала с ESR, могла бы определить, из какого карантинного объекта или пограничной заставы произошел вирус, и сравнить геномы нового вируса. от случаев из «управляемых изоляторов» или со всего мира. [ 26 ]
В подкасте Геохеган объяснил, как работает секвенирование генома и что собранные данные распространяются по всему миру в качестве быстрого ответа на COVID-19. [ 27 ] После второй вспышки вируса в сообществе Новой Зеландии в августе 2020 года Геогхеган заявил:
Крайне важно, чтобы геномика была частью этих мер реагирования, чтобы мы могли отслеживать, где могли возникнуть эти случаи, и оценивать размер и количество присутствующих кластеров... [и] ...путем сравнения геномов вирусов из этих случаев с теми, как по карантинным учреждениям, так и по населению мира, мы можем определить их вероятное происхождение и то, как долго они циркулируют в обществе. [ 28 ]
В ноябре 2020 года, когда у члена экипажа, прибывшего в Новую Зеландию из-за границы, оказался положительный результат теста, Геохеган подтвердил важность секвенирования генома, чтобы установить, связан ли вирус с местными или глобальными инфекциями, а также вероятность того, что передача случаев произошла во время полета. [ 29 ]
Стипендия Резерфорда Discovery
[ редактировать ]22 октября 2020 года Королевское общество Те Апаранги объявило, что Геохеган получил финансируемую государством стипендию Резерфорда за открытия . Стипендия в размере 800 000 долларов пойдет на финансирование исследования Геохегана под названием « Экологические барьеры и движущие силы появления вирусов» . Его цель состояла в том, чтобы показать, «как вирусы эволюционируют, чтобы перейти к новому виду-хозяину , путем секвенирования РНК различных видов животных в Новой Зеландии и анализа любых присутствующих вирусов». Геохеган назвал это важным в контексте пандемии COVID-19 и станет «первым исследованием, изучающим экологию и эволюцию вируса такого масштаба в этой стране». [ 30 ] [ 31 ]
В 2021 году работа Геохегана продолжилась и первоначально была сосредоточена на британском варианте вируса, который вспыхнул в Новой Зеландии. Она сказала, что этот вариант действительно содержал «несколько мутаций, которые, вероятно, увеличивали скорость передачи… [но]... самым большим фактором распространения вируса является население, у которого нет никакого иммунитета, а это, по сути, все Новая Зеландия." [ 32 ]
Награды
[ редактировать ]В 2017 году Геогеган получил премию Young Tall Poppy Award, присуждаемую Австралийским институтом политики и науки (AIPS). Геогеган сказала, что она с большим энтузиазмом стремилась донести результаты исследований до более широкого сообщества, и эта награда дала ей возможность стать более квалифицированной в этой области. [ 33 ]
Геогеган получил премию Алана Уилтона от Австралийского общества генетиков в знак признания выдающегося вклада австралийских ученых в область генетических исследований в начале их карьеры в 2017 году. [ 34 ]
В 2017 году она выиграла премию факультета науки и техники Университета Маккуори за выдающиеся достижения в области исследований в области ранней карьеры. [ 35 ]
В мае 2022 года Геохеган был награжден премией премьер-министра для молодых ученых 2021 года в размере 200 000 долларов. [ 36 ] В North & South журнале Пол Горман написал, что «сотни, если не тысячи новозеландцев все еще живы благодаря Геохегану и его коллегам, отслеживающим вспышки варианта Дельта на этапе ликвидации пандемии. Некоторые современники полагают, что она помогла спасти миллионы людей». жизней во всем мире благодаря тому, что люди избегают вируса». [ 2 ] Геохеган признала, что, получив награду, она бросила вызов стигматизации женщин в науке и «планировала использовать средства от премии для поддержки дальнейших исследований и обучения студентов». [ 37 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с д Новости UNI (2 декабря 2020 г.). «Современный исследователь: доктор Джемма Геогеган» . Университет Отаго. Бюллетень Отаго. Архивировано из оригинала 3 декабря 2020 года . Проверено 29 марта 2021 г.
- ^ Jump up to: а б с Горман, Пол (октябрь 2022 г.). «Охотник за вирусами» . Север и Юг . Архивировано из оригинала 27 октября 2022 года . Проверено 27 октября 2022 г.
- ^ Геохеган, Джемма (2013), Моделирование выбора при мягком наследовании (докторская диссертация), OUR Archive, hdl : 10523/3718 , Wikidata Q111965714
- ^ «МИКРОБИОЛОГИЯ И ИММУНОЛОГИЯ Te Tari Moromoroiti me te Ārai Mate – доктор Джемма Геохеган» . micro.otago.ac.nz . Архивировано из оригинала 5 марта 2022 года . Проверено 29 марта 2021 г.
- ^ «Маккуори хорошо выращивает наши высокие маки: награждена биолог-эволюционист доктор Джемма Геохеган» . Университет Маккуори. Отдел новостей. 21 августа 2017 года. Архивировано из оригинала 24 августа 2017 года . Проверено 29 марта 2021 г.
- ^ «Новая престижная роль профессора Джеммы Геогеган» . Университет Отаго . Архивировано из оригинала 7 августа 2023 года . Проверено 7 августа 2023 г.
- ^ Уайлс, Сиукси (23 ноября 2020 г.). «Боли в самолете: обнаружены новые данные о передаче Covid в полете» . Спинофф. Архивировано из оригинала 22 ноября 2020 года . Проверено 29 марта 2021 г.
- ^ Уайлс, Сиукси (13 августа 2020 г.). «Как секвенирование генома может раскрыть дело о возвращении новозеландского Covid» . Университет Окленда. Архивировано из оригинала 19 августа 2020 года . Проверено 4 апреля 2021 г.
- ^ Геогеган, Джемма Л.; и др. (11 декабря 2020 г.). «Геномная эпидемиология выявляет закономерности и динамику передачи SARS-CoV-2 в Аотеароа, Новая Зеландия» . Природные коммуникации . 11 (6351): 6351. Бибкод : 2020NatCo..11.6351G . дои : 10.1038/s41467-020-20235-8 . ПМЦ 7733492 . ПМИД 33311501 .
- ^ МакКлюр, Тесс (3 апреля 2021 г.). «Как успех Новой Зеландии в борьбе с Covid превратил ее в лабораторию для всего мира» . Хранитель. Архивировано из оригинала 3 апреля 2021 года . Проверено 4 апреля 2021 г.
- ^ Даалдер, Марк (13 июля 2021 г.). «Ужасный эксперимент Великобритании поставит под угрозу Новую Зеландию» . Отдел новостей. Архивировано из оригинала 12 июля 2021 года . Проверено 14 июля 2021 г.
- ^ Бернштейн, Ленни (24 января 2022 г.). «Существует новая версия омикрона, но она пока не кажется более опасной» . Вашингтон Пост . Архивировано из оригинала 25 января 2022 года . Проверено 30 января 2022 г.
- ^ «Covid-19: бустерная доза эффективна против мутации Omicron BA.2 – вирусолог» . РНЗ . 28 января 2022 года. Архивировано из оригинала 28 января 2022 года . Проверено 30 января 2022 г.
- ^ Jump up to: а б Даалдер, Марк (15 июня 2022 г.). «Ковид еще не закончился, все только начинается» . Отдел новостей . Архивировано из оригинала 16 июня 2022 года . Проверено 16 июня 2022 г.
- ^ Пратт, Родни; Ку, Дженни (16 апреля 2020 г.). «Коронавирус: вирусолог объясняет, как COVID-19 перешел от животных к человеку и почему мы не можем предсказать следующую пандемию» . 7 Новости. Утреннее шоу. Архивировано из оригинала 16 апреля 2020 года . Проверено 30 марта 2021 г.
- ^ Геогеган, Джемма Л.; и др. (31 октября 2018 г.). «Скрытое разнообразие и эволюция вирусов товарной рыбы» . Эволюция вирусов . 4 (2): вей031. дои : 10.1093/ve/vey031 . ПМК 6208713 . ПМИД 30397510 . Архивировано из оригинала 20 марта 2020 года.
- ^ Лайонс, Сюзанна; Митчел, Наташа (9 апреля 2020 г.). «Как появился коронавирус? Откуда летучие мыши заразились вирусом и как он распространился на человека?» . Новости Эй-Би-Си. Архивировано из оригинала 9 апреля 2020 года . Проверено 29 марта 2021 г.
- ^ Геогеган, Джемма (2016). «Прогнозирование пандемий» . Австралазийская наука . предоставлено Guy Nolich Control Publishing Разрешение на размещение ссылки на эту статью (30 марта 2021 г.). Архивировано из оригинала 30 сентября 2016 года . Проверено 1 апреля 2021 г.
{{cite journal}}: CS1 maint: местоположение ( ссылка ) - ^ Геогеган, Джемма Л.; Холмс, Эдвард Г. (25 октября 2017 г.). «Предсказание появления вируса на фоне эволюционного шума» . Открытая биология . 7 (10). Королевское общество: 170189. doi : 10.1098/rsob.170189 . ПМК 5666085 . ПМИД 29070612 .
- ^ Jump up to: а б Йонг, Эд (26 октября 2017 г.). «Можно ли предсказать следующую пандемию?» . Атлантика. Архивировано из оригинала 31 марта 2022 года . Проверено 29 марта 2021 г.
- ^ Мэнникс, Лиам (16 мая 2020 г.). «Ученые пытались предсказать COVID-19. Вот почему они это пропустили» . Сидней Морнинг Геральд. Архивировано из оригинала 16 мая 2020 года . Проверено 30 марта 2021 г.
- ^ Хоксби, Кейт (13 апреля 2020 г.). «Как секвенирование генома может помочь отследить вспышку Covid» . Новостной канал ЗБ. Архивировано из оригинала 18 сентября 2020 года . Проверено 30 марта 2021 г.
- ^ Jump up to: а б Геогеган, Джемма; Френч, Найджел (18 августа 2023 г.). «Весной тысячи перелетных птиц прибудут на берег Новой Зеландии – принесут ли они с собой смертельный птичий грипп?» . Разговор . Архивировано из оригинала 22 августа 2023 года . Проверено 23 августа 2023 г.
- ^ «Доктор Джемма Геохеган получает грант в размере 600 000 долларов США для отслеживания распространения и развития COVID-19 в Новой Зеландии (опубликовано 29 мая 2020 г.)» . Микробиология и иммунология . Университет Отаго. Архивировано из оригинала 5 августа 2020 года . Проверено 28 марта 2021 г.
- ^ Мартин, Ханна (18 августа 2020 г.). «Коронавирус: новое исследование показывает, как Covid-19 попал в Новую Зеландию» . Вещи. Архивировано из оригинала 11 октября 2021 года . Проверено 28 марта 2021 г.
- ^ С девяти до полудня (13 августа 2020 г.). «Как тестирование генома может помочь выявить источник заражения Covid в сообществе» . РНЗ. Архивировано из оригинала 23 августа 2020 года . Проверено 4 апреля 2021 г.
- ^ Бретт-Келли, Шэрон (20 августа 2020 г.). «Жизненно важная работа наших ученых-геномистов» . Отдел новостей. Подкаст: Детали. Архивировано из оригинала 20 августа 2020 года . Проверено 30 марта 2021 г.
- ^ Гибб, Джон (14 августа 2020 г.). «Коронавирус Covid 19: геномное отслеживание используется для поиска источника последней вспышки» . Новозеландский Вестник. Архивировано из оригинала 11 января 2021 года . Проверено 29 марта 2021 г.
- ^ «Ученые ждут результатов о члене экипажа Air New Zealand с Covid-19» . РНЗ. 25 ноября 2020 года. Архивировано из оригинала 7 апреля 2022 года . Проверено 29 марта 2021 г.
- ^ Гибб, Джон (23 октября 2020 г.). «Научные исследователи получают поддержку стипендий» . Отаго Дейли Таймс. Архивировано из оригинала 27 ноября 2020 года . Проверено 28 марта 2021 г.
- ^ «Последние 10 стипендиатов объявлены в рамках 10-го года вручения награды Rutherford Discovery Fellowship (опубликовано 22 октября 2020 г.)» . Королевское общество . Архивировано из оригинала 1 ноября 2020 года . Проверено 28 марта 2021 г.
- ^ Маклин, Хэмиш (16 февраля 2021 г.). «Попытка секвенирования для идентификации варианта вируса» . Отаго Дейли Таймс. Архивировано из оригинала 17 февраля 2021 года . Проверено 30 марта 2021 г.
- ^ Кто есть кто (21 августа 2017 г.). «Эволюционный биолог доктор Джемма Геогеган признала это» . gettem.co.au . Архивировано из оригинала 13 апреля 2022 года . Проверено 28 марта 2021 г.
- ^ «Прошлые лауреаты премии GSA» . Генетическое общество Австралазии . Архивировано из оригинала 7 марта 2022 года . Проверено 29 марта 2021 г.
- ^ «Факультет естественных наук и инженерных наук Университета Маккуори в области исследований ранней карьеры (Джемма Геохеган - получатель 2017 г.)» . Университет Маккуори . Архивировано из оригинала 27 апреля 2020 года . Проверено 29 марта 2021 г.
- ^ «ТЕ ПУЯКИ КАЙПУТАИАО МАЭА МАКДИАРМИД, НАЧИНАЮЩИЙ УЧЕНЫЙ 2021 ГОДА | Научные премии премьер-министра» . Архивировано из оригинала 31 мая 2022 года . Проверено 31 мая 2022 г.
- ^ Льюис, Джон (1 июня 2022 г.). «Секвенатор генома Джемма Геогеган претендует на премию премьер-министра МакДиармида для новых ученых» . Отаго Дейли Таймс . Архивировано из оригинала 8 июня 2022 года . Проверено 30 октября 2022 г. - через New Zealand Herald .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
