Джей Данлэп
![]() | Эту статью может потребовать очистки Википедии , чтобы она соответствовала стандартам качества . Конкретная проблема: несколько ссылок на одну и ту же цель ( MOS:REPEATLINK ), включая как минимум Frequency (gen) . ( Август 2021 г. ) |
Джей Данлэп | |
---|---|
Рожденный | 9 мая 1952 г. Ладлоу, Массачусетс |
Альма-матер | Вашингтонский университет , бакалавр и бакалавр наук, 1974 г. Гарвардский университет, AM 1975 г., доктор философии Гарвардского университета, 1979 г. Калифорнийский университет, Санта-Крус, доктор философии, 1979–1983 гг. |
Известный | Нейроспора Циркадные ритмы |
Награды | Международная премия Хонма за исследования биологических ритмов (1991 г.) , Премия Роберта Л. Метценберга Американского генетического общества (2005 г.) Медаль Джорджа Бидла, Американское генетическое общество (2009 г.) , член AAAS (2010 г.) , член Американской академии микробиологии (2010 г.) , Национальная академия наук (2009 г.) |
Научная карьера | |
Поля | Биохимия , Генетика , Хронобиология |
Учреждения | Кафедра генетики Дартмутской медицинской школы |
Веб-сайт | Гейзельмед |
Джей Данлэп — американский хронобиолог и фотобиолог , внесший значительный вклад в область хронобиологии, исследуя основные механизмы циркадных систем Neurospora , гриба, обычно используемого в качестве модельного организма в биологии, а также на моделях клеточных культур мышей и млекопитающих. Основные вклады Джея Данлэпа включают его работу по исследованию роли генов часов frq и wc в циркадной ритмичности, а также его лидерство в координации всей коллекции нокаутированных геномов Neurospora . В настоящее время он является профессором молекулярной и системной биологии Натана Смита в Медицинской школе Гейзеля в Дартмуте . Он и его коллега Дженнифер Лорос были наставниками многочисленных студентов и докторантов, многие из которых в настоящее время занимают должности в различных академических учреждениях.
Ранняя жизнь и образование
[ редактировать ]Джей Данлэп родился 9 мая 1952 года в Ладлоу, штат Массачусетс , и вырос в Йорке, штат Пенсильвания , будучи третьим из четырех детей. [ 1 ] Данлэп заинтересовался биохимической океанографией во время летней программы в средней школе и решил продолжить этот интерес в колледже. степенью бакалавра океанографии и бакалавра химии со В 1974 году он окончил Вашингтонский университет . [ 1 ]
Изначально Данлэп планировал изучать океанографию в аспирантуре. Однако после встречи с Джоном Вудлендом Гастингсом , изучавшим циркадную регуляцию биолюминесценции морских организмов, Данлэп решил изучать биологию в аспирантуре Гарвардского университета . Во время учебы у Гастингса Данлэп сменил сферу своих исследований на циркадную биологию . [ 1 ] [ 2 ]
Карьера и исследования
[ редактировать ]Во время своей постдокторской стажировки Данлэп учился в Калифорнийском университете в Санта-Крусе и начал работать с Джерри Фельдманом, который успешно изолировал мутанты часового гена в Neurospora , которые имеют аномально длинные или короткие периоды циркадных колебаний . Данлэп не смог клонировать частоту , ген, который играет важную роль в петле отрицательной обратной связи транскрипции-трансляции (TTFL) , которая управляет циркадными ритмами у Neurospora , поскольку в лаборатории Санта-Крус не было молекулярных инструментов, необходимых для изучения Neurospora. молекулярной биологии в глубину. [ 3 ] Данлэп изучил основные молекулярные методы, работая вместе с другими аспирантами-биологами в других лабораториях. В какой-то момент Данлэп работал с Гарри Ф. Ноллером , известным биохимиком, чья лаборатория «неофициально приняла» Данлэпа. [ 3 ]
В 1984 году Данлэп получил должность младшего преподавателя на кафедре биохимии Медицинской школы Гейзеля в Дартмуте . Он стал профессором биохимии в 1994 году, а в 1999 году был назначен первым заведующим кафедрой генетики. В 2010 году Данлэп был назначен профессором Натана Смита, а в 2016 году он был назначен первым заведующим кафедрой молекулярной и системной биологии, которая отнесены к генетическому и другим факультетам. [ 4 ]
Работая в тесном сотрудничестве с лабораторией Дженнифер Лорос , исследования Данлэпа в первую очередь были сосредоточены на молекулярной основе циркадных ритмов, используя Neurospora в качестве модельной системы для дальнейшего понимания циркадных часов млекопитающих. Хотя мутации часового гена были также выявлены у дрозофилы и хламидомонады . [ 1 ] Данлэп изучал Neurospora в своей постдокторской работе, поскольку в то время к этому виду был применим более широкий спектр биохимических и генетических инструментов. [ 3 ] Нейроспора была простым модельным организмом и мощным инструментом для изучения молекулярной генетики; тогда еще неизвестные молекулярные часы предоставили прекрасную возможность для исследований. [ 4 ]
Идентификация Neurospora компонентов и механизмов часов
[ редактировать ]Основываясь на работе Данлэпа и других, сегодня считается, что часовые гены кодируют белки, которые участвуют в самоподдерживающейся петле отрицательной обратной связи : активаторы транскрипции управляют экспрессией специфических мРНК часовых генов , которые транслируются в часовые белки, которые попадают в ядро и действуют. подавлять активность активаторов транскрипции, управляющих экспрессией часовых генов. [ 5 ] Однако гены часов еще не были клонированы, когда Данлэп начал свои исследования в качестве доцента в 1984 году. Данлэп правильно предсказал, что отдельные клетки, включая клетки млекопитающих, могут действовать как автономные осцилляторы со своими собственными циркадными ритмами. [ 6 ]
Данлэп расшифровал циркадную систему, сформулировав и решив три проблемы клеточного метаболизма:
- Как устроены часы: каковы шестеренки и винтики, как они взаимодействуют, что их регулирует и как они регулируют друг друга, чтобы совокупный результат представлял собой молекулярный/биохимический цикл со всеми циркадными характеристиками?
- Как резкие и кратковременные изменения окружающей среды , главным образом окружающего освещения или температуры, сбрасывают фазу часов и выравнивают внутренние часы организма с внешним временем?
- Как внутриклеточный молекулярный цикл используется для регулирования поведения клетки? [ 3 ]
До принятия транскрипционных репортеров, таких как люцифераза , в исследованиях циркадных часов Neurospora использовалось ритмическое развитие бесполых спор (конидий) , анализируемое с использованием гоночной пробирки. [ 7 ] Пик продукции конидий приходится на субъективную ночь — поведенческий фенотип, отсутствующий у аритмичных штаммов. Во время своей дипломной работы Дженнифер Лорос наблюдала мутантную частоту. 9 как рецессивный, аритмичный и фенотипически нулевой аллель гена frq . [ 8 ] Ее наблюдения в сочетании со способностью трансформировать Neurospora экзогенной ДНК обеспечили основу для новой стратегии клонирования frq , а именно путем спасения на основе трансформации нулевого мутантного поведенческого фенотипа. Используя двунаправленный маршрут хромосомы, начинающийся с oli , гена в той же группе сцепления, что и frq , Данлэп и его коллеги прошли более 200 КБ по frq . [ 3 ] Местоположение frq было проверено в 1986 году путем трансформации космид . в frq 9 и спасая циркадный ритм. Таким образом, frq стал вторым клонированным часовым геном после Drosophila per . Кроме того, лаборатория вручную секвенировала примерно 9 КБ и провела картирование транскриптов в геномной области frq ; результаты были опубликованы в журнале Nature в 1989 году. [ 3 ] В последующей работе Данлэп и его коллеги показали, что frq экспрессируется ритмично и способны манипулировать экспрессией frq в достаточной степени, чтобы создать нулевой мутант . Они внедрили систему, в которой гетерологичный промотор , индуцированный способом, не влияющим на часы, можно было использовать для управления регулируемой экспрессией frq . Используя эту систему, они продемонстрировали, что продукт frq подавляет собственный синтез; это была авторегуляция . Данлэп и его коллеги заметили, что постоянная сверхэкспрессия frq приводит к аритмичности, и определили фазу часового ритма как время, когда клетка возвращается к нормальному уровню экспрессии frq . В статье Science в 1994 году они пришли к выводу, что основной кардиостимулятор часов Neurospora регулируется посредством отрицательной обратной связи с помощью часовых белков, а frq определяет свою собственную экспрессию посредством саморегуляции посредством отрицательной обратной связи, демонстрируя, что внутриклеточная авторегуляторная отрицательная обратная связь является основой циркадного осциллятора. [ 9 ] [ 10 ]
Работа Данлэпа над механизмом авторегуляции включала моделирование петли отрицательной обратной связи циркадных часов и обнаружение роли и связей между активаторами (которые он идентифицировал как белки с доменами PAS ) и репрессорами (продуктами часовых генов). [ 11 ] Кроме того, Данлэп продемонстрировал роль фосфорилирования белков в часовом механизме и провел исследование, включающее роль этих белков (а именно казеин-киназы 2 ) в механизме температурной компенсации. В 2009 году Данлэп и его коллеги показали, что белок FRQ фосфорилируется более чем в 100 сайтах с высокой воспроизводимостью и в зависимости от времени суток. [ 12 ] и что казеинкиназа 2 устанавливает и поддерживает температурную компенсацию в циркадных часах. [ 13 ] Четыре года спустя, в 2013 году, Данлэп и его коллеги обнаружили, что FRQ представляет собой внутренне неупорядоченный белок , стабильность которого определяется его взаимодействием с белком-партнером FRH. Кроме того, Данлэп и его коллеги обнаружили, что ежедневное фосфорилирование FRQ определяет его способность взаимодействовать с белками в комплексе отрицательных элементов. [ 14 ] Кинетика этих циркадных процессов, как обнаружил Данлэп, находится под сильным влиянием прогрессивного фосфорилирования FRQ. [ 15 ]
Механизм увлечения
[ редактировать ]
Идентифицировав frq как часовой ген, количество продуктов которого имеет тенденцию быть переменным и ритмичным, Данлэп, Лорос и коллеги показали, как регуляция его экспрессии в окружающей среде привела к пониманию молекулярной основы циркадного вовлечения индукцию экспрессии frq света: через свет. [ 16 ]
В 1995 году Лорос и Данлэп работали над раскрытием молекулярной основы, лежащей в основе того, как свет сбрасывает часы - механизм, который, как позже было показано в совместной работе с Хитоши Окамурой, сохраняется у млекопитающих. [ 17 ] Суточный цикл уровней транскриптов frq в сочетании со способностью света резко индуцировать экспрессию frq объясняет перезагрузку света (успехи и задержки, наблюдаемые на кривой фазового отклика ). Если бы свет был обеспечен и индуцировал frq -мРНК, когда она поднималась до пиковых уровней (поздняя субъективная ночь), свет быстро довел бы уровни frq -мРНК до пиковых значений, что привело бы к прогрессу. Если бы свет индуцировал frq -мРНК , когда ее уровни падали (ранняя субъективная ночь), frq -мРНК быстро возвращалась бы к пиковым уровням, вызывая фазовую задержку. Результаты этого исследования привели к выводу, что световая индукция frq ответственна за фазовые опережения и задержки, наблюдаемые у Neurospora , и дали общее объяснение того, как однонаправленный ответ компонента часов на сигнал окружающей среды (свет) может приводят к двунаправленной реакции часов, специфичной для времени суток (ускорение или задержка): основа циркадного смещения. [ 2 ] Эти эксперименты в конечном итоге привели к всеобщему признанию вовлечения посредством вызванных светом изменений в определенной переменной циркадного осциллятора, что позже наблюдалось у дрозофилы и млекопитающих.
Идентификация гетеродимеров PAS-PAS как активаторов циркадной петли обратной связи.
[ редактировать ]Механизм, посредством которого frq индуцируется светом, был неизвестен в то время, когда объяснялось увлечение, а исследования, направленные на идентификацию белков, ответственных за световую индукцию frq , привели к идентификации белых воротничков-1 и белых воротничков-2 как компонентов циркадный активаторный комплекс. [ 18 ] Работа Джузеппе Мачино показала, что «белые воротнички-1» связываются через домены PAS с «белыми воротничками-2» , образуя комплекс «белых воротничков»; Данлэп, Лорос и коллеги показали, что этот гетеродимерный комплекс является фактором транскрипции, который действует в темноте, управляя экспрессией frq , тем самым действуя как активатор циркадной петли отрицательной обратной связи. Это наблюдение связало специфическую биохимическую активность, связывание ДНК и активацию транскрипции с известными часовыми белками, что позволило сформулировать осциллятор как одноэтапную петлю отрицательной обратной связи транскрипции-трансляции. [ 18 ] Позже, в 1997 году, было показано, что первый часовой ген млекопитающих ( CLOCK ) кодирует белок, аналогично имеющий домены PAS , а позже связывается через домены PAS с другим белком, BMAL1, снова образуя гетеродимерный белковый комплекс, который действует как транскрипционный активатор; подобные белки были идентифицированы в 1998 году у дрозофилы . отрицательной обратной связи транскрипции-трансляции Это подтвердило общую модель петель у грибов и животных: положительный элемент, состоящий из двух разных белков, взаимодействующих через домены PAS, стимулирует экспрессию отрицательных элементов, таких как FRQ или PER , которые в сочетании с другими белками подавляют активность гетеродимерных активаторов: отрицательная обратная связь. [ 19 ] Эти наблюдения способствовали тому, что «Циркадные ритмы» были названы первым, занявшим второе место в номинации «Прорыв года» журнала Science в 1997 году.
Идентификация циркадного фоторецептора
[ редактировать ]
Хотя было установлено, что гетеродимерный транскрипционный фактор WC-1 / WC-2 необходим для световой индукции frq , исследователи считали, что WC-1 и WC-2 не играют прямой роли в процессе фоторецепции . WC-1 / WC-2 Вместо этого предполагалось, что фактор транскрипции является конечной мишенью каскада передачи сигнала, инициируемого действием света на отдельный фоторецептор синего света . В 2002 году Данлэп и его коллеги биохимически изучили WC-1 / WC-2 in vitro, чтобы показать, что WC-1 связывает FAD в качестве кофактора (также независимо показано И Лю), а также анализ связывания с ДНК с помощью WC-1 / WC. Комплекс -2 показал, что свет приводит к структурным изменениям в гетеродимере. Реакция на дозу и спектр действия для этого структурного изменения in vitro в WC-1 были FAD -зависимыми и соответствовали in vivo реакции на дозу и спектру действия для подавления циркадных ритмов, определенных Бриггсом и его коллегами в 1967 году. Эти результаты показали, что WC-1 -1 синего света представляет собой фоторецептор и циркадный фоторецептор; Каскад передачи сигнала от фоторецептора к фактору транскрипции происходит внутри одного и того же белка. [ 21 ] [ 15 ] WC-1 является основателем семейства фоторецепторов синего света, общих для всех грибов . [ 22 ] Позже циркадные фоторецепторы были идентифицированы у животных и зеленых растений и показали, что они отличаются от WC-1 .
Циркадный выход
[ редактировать ]В 1989 году работа Данлэпа с Дженнифер Лорос привела к первому целенаправленному скринингу генов, регулируемых циркадными часами, открыв путь для систематического анализа путей вывода часов. [ 23 ] В этом исследовании был придуман термин «гены с часовым управлением» (CCG). CCG определяются как гены, уровень экспрессии которых регулируется циркадными часами , но чья деятельность не влияет на их работу. В настоящее время широко распространено мнение, что циркадный контроль экспрессии генов является основным средством, с помощью которого часы контролируют биологию клеток, в которых они работают. Последующие работы расширили спектр CCG в Neurospora , а затем и в млекопитающих . клетках [ 24 ] и выявили связь между циркадным и клеточным циклами, в которых часы регулируют реакцию на повреждение ДНК, которая, в свою очередь, может регулировать часы. [ 25 ] Поиск CCG, наконец, завершился полным описанием циркадного транскриптома Neurospora , где до 40% генома ежедневно контролируется часами. [ 26 ]
Исследования биолюминесценции
[ редактировать ]Выпускная работа Джея Данлэпа в Гарварде с Дж. У. Гастингсом была посвящена биолюминесценции морского организма Gonyulax . Их работа раскрыла структуру Gonyulax люциферина . Очистив люциферазу , они определили, что она регулируется посредством ежедневного синтеза и разрушения. [ 3 ] Это был один из первых ферментов с часовой регуляцией, метод регуляции которого был определен в экспериментальных условиях. Одна часть механизма заключается в том, что Гоньяулакс вырабатывает люциферин и люциферазу ночью, когда можно увидеть излучаемый свет, тогда как на рассвете выработка субстрата и белка снижается. Осознание того, что полное понимание этого биохимического процесса потребует также комбинированного генетического подхода, побудило Данлэпа начать изучение циркадных часов Neurospora . [ 2 ]
Данлэп и его коллеги позже разработали биолюминесценцию как репортер экспрессии генов в Neurospora . До использования биолюминесценции единственным методом определения ритмичности Neurospora был суточный цикл бесполого развития ( конидиация ). В результате штаммы, несущие мутации, мешающие развитию, не могли быть точно проверены на ритмичность. Данлэп вместе с Дженнифер Лорос , Аруном Мехрой и Ван Гучом адаптировали люциферазу светлячков для экспрессии в Neurospora , тем самым значительно расширив возможности анализа штаммов. [ 7 ] frq , управляемая промотором Люцифераза , является чрезвычайно чувствительным репортером для основного осциллятора, и ее использование показало, что ритмы развития, которые не требуют frq, не являются истинно циркадными . [ 27 ] и что необходимо ежедневное фосфорилирование белка FRQ, но не ежедневный оборот белка FRQ для закрытия петли отрицательной обратной связи . [ 28 ] Новый метод, использованный Данлэпом и его коллегами для характеристики и использования гена люциферазы, улучшил экспрессию на 3 логарифмических порядка и позволил исправить несколько ошибок в литературе по Neurospora . Данлэп и Лорос в сотрудничестве с Кассиусом Стевани показали, что биолюминесценция базидиомицета (гриба) Neonothopanus gardneri регулируется циркадными ритмами посредством регулируемой экспрессии люциферазы , люциферина и необходимой редуктазы . [ 29 ] N. gardneri растет под пальмами в амазонских лесах, и считается, что ночная биолюминесценция используется грибом для привлечения насекомых в ночное время и для содействия распространению спор. [ 30 ]
Технологические достижения
[ редактировать ]Данлэп и его коллеги внесли большой вклад в развитие использования технологий в области молекулярной биологии . Эти методологические достижения имели серьезные последствия как для грибной биологии, так и для хронобиологии, а также для их будущих направлений. Например, лаборатория Данлэпа разработала первую замену гена Neurospora в 1991 году. Эти технологии, а также поддержка Данлэпа внесли большой вклад в секвенирование генома Neurospora (которое было завершено в 2002 году). Впоследствии Данлэп и его команда улучшили замену генов. Он возглавил усилия по уничтожению всех 10 000 генов в геноме Neurospora высокой плотности и созданию карты однонуклеотидного полиморфизма . Наконец, Данлэп совершил революцию в роли экспрессии люциферазы , изучив смещение кодонов , и использует его значение в Neurospora и других организмах. [ 7 ]
Настоящая работа
[ редактировать ]Данлэп продолжает исследовать циркадные часы, используя Neurospora и другие организмы, такие как Aspergillus fumigatus . [ 31 ] В результате проекта генома Neurospora crassa , [ 32 ] результаты которых были опубликованы в 2003 году, а также разработка нокаутов для каждого гена, которые хранятся в Фондовом центре генетики грибов , Данлэп считает, что молекулярная основа циркадных часов Neurospora . может быть первой, которая будет полностью понята Из-за высококонсервативной природы биологических часов, часовые механизмы эволюционировали сравнительно мало раз и у разных видов схожи. Знание систем Neurospora может привести к их применению, имеющему отношение к здоровью человека. Циркадный характер клеточных процессов у человека можно использовать для более эффективного воздействия на раковые клетки и лечения нарушений сна.
Данлэп также интересуется взаимодействием биологических часов и метаболических процессов. Хотя циркадные ритмы управляют аспектами метаболизма, продукты метаболизма могут влиять на внутренние часы организма. [ 33 ] Эта форма общения может оказаться адаптивной особенностью биологических часов и обеспечить полезную реакцию на изменения в окружающей среде. Кроме того, Данлэп работает с Уильямом Кэнноном и Дженнифер Херли над разработкой математических моделей, описывающих функцию циркадных часов. В ходе этой работы будут использованы статистические методы для моделирования как реакций, происходящих в обмене веществ, так и общих часов.
Данлэп также участвовал в работе по изучению иерархической сети факторов транскрипции , которые управляют циркадными ритмами. Основной осциллятор генерирует ритмическую активность гетеродимерного циркадного активатора ( WC-1 / WC-2 или CLOCK/BMAL1), но пиковая активность ограничивается одним временем суток. у Neurospora Таким образом , основной осциллятор, генерирующий время, создает ритмическую активность гетеродимера WC-1 / WC-2 , пик которой приходится на утро. WC-1 / WC-2 находится на вершине сети факторов транскрипции , где различные уровни регуляторов работают вместе, действуя как динамический фильтр для информации о времени, превращая утренний пик активности WC-1 / WC-2 в сигнал, который может управлять циркадной экспрессией генов в любое время суток. Частью этого является фактор транскрипции ADV-1. [ 34 ] Этот фактор , обнаруженный в Neurospora , реагирует на свет и регулирует гены, участвующие в таких процессах, как рост клеток .
Недавно Данлэп изучил эволюционное сохранение циркадных часов среди видов. В частности, он обнаружил, что белки, консервативные в механизмах биологических часов у трех видов ( Drosophila melanogaster , Neurospora crassa и Mus musculus ), демонстрируют большое количество внутренних белковых нарушений. Внутренне неупорядоченные белки не имеют стабильной вторичной структуры. В течение дня эти белки имеют разную степень нарушения. Меняющиеся уровни расстройств обеспечивают стабильный циркадный ритм . Данлэп пришел к выводу, что, поскольку неупорядоченные белки настолько консервативны у разных видов, эти белки должны быть необходимы для контроля циркадных ритмов у разных видов. [ 35 ]
В своей последней работе лаборатория Данлэпа исследовала регуляторы мРНК, кодирующие белок казеин-киназы 1; одним из таких регуляторов является РНК-связывающий белок, транслированный из гена prd-2 . Они исследовали две мутации (созданные путем инверсии части гена PRD-2 ) и обнаружили, что эти мутации радикально влияют на уровень казеин-киназы . Эти мутации вызвали циркадные периоды, намного превышающие 24 часа. Он и его коллеги генетически увеличили уровни казеин-киназы 1 и обнаружили, что период восстанавливался, когда уровень казеин-киназы 1 увеличивался. Они пришли к выводу, что циркадный период зависит от уровня казеин-киназы 1. [ 36 ]
Личная жизнь
[ редактировать ]Во время пребывания Данлэпа в Санта-Крузе одной из аспирантов-биологов, с которыми он познакомился, была Дженнифер Лорос . У них сложились постоянные отношения, и 1 сентября 1984 года они поженились. У них двое детей. Когда Данлэп не занимается исследованиями, он занимается садоводством. [ 3 ]
Членство, почести и награды
[ редактировать ]Членство
[ редактировать ]Джей Данлэп в настоящее время работает в следующих организациях:
- редколлегия журнала «Биологические ритмы» (1994–2001; 2014 – настоящее время)
- редколлегия журнала G3: Гены, геномы, генетика (2011 – настоящее время)
Ранее он участвовал в:
- Президент Общества исследования биологических ритмов (1998–2000 гг.)
- Национальный консультативный совет по общим медицинским наукам (2000–2004, 2011 г.)
- Главный редактор журнала Eukaryotic Cell (ASM Press), (2001–2011 гг.)
- соредактор журнала «Достижения в области генетики» (1995–2017 гг.)
Почести и награды
[ редактировать ]- 1980 Стипендия Дэймона Раньона-Уолтера Винчелла
- 1983 года Премия Национальной исследовательской службы , НИЗ
- Международная премия Хонма 1991 года за исследования биологических ритмов
- 1992–1997 Премия старшего научного сотрудника, Национальный институт психического здоровья.
- 1998 Премия MERIT (Метод расширения исследований во времени), NIGMS
- 2005 г. (первый) лауреат премии Роберта Л. Метценберга Американского генетического общества .
- , 2009 г. Премия Джорджа Бидла , Американское генетическое общество
- В 2009 г. избран членом Национальной академии наук по секции генетики.
- В 2010 г. избран членом Американской ассоциации содействия развитию науки.
- В 2010 г. избран в Американскую академию микробиологии.
- 2013 г. - научный сотрудник, Техасского университета A&M. Институт перспективных исследований
- Вечерняя лекция 2017 г., 29-я конференция по генетике грибов, Американское генетическое общество
Ключевые публикации
[ редактировать ]Научные статьи
[ редактировать ]- Лорос, Джей-Джей; Деноме, ЮАР; Данлэп, Джей Си (1989). «Молекулярное клонирование генов под контролем циркадных часов Neurospora ». Наука . 243 : 385–388. doi : 10.1126/science.2563175 PMID 2563175
- Аронсон, Б.Д.; Джонсон, Калифорния; Лорос, Джей-Джей; Данлэп, Джей Си (1994). «Отрицательная обратная связь, определяющая циркадные часы: авторегуляция частоты часовых генов». Наука . 263(5153 ) : 1578-84. doi : 10.1126/science.8128244 PMID : 8128244
- Кростуэйт, СК; Лорос, Джей-Джей; Данлэп, Дж.К. (1995). «Светоиндуцированная перезагрузка циркадных часов опосредована быстрым увеличением частоты транскриптов». Клетка. 81(7) : 1003-12. doi : 10.1016/s0092-8674(05)80005-4 PMID : 7600569
- Кростуэйт, СК; Данлэп, Джей Си; Лорос, Джей-Джей (1997). « Neurospora wc-1 и wc-2: транскрипция, фотоответы и происхождение циркадной ритмичности». Наука . 276(5313) : 763-9. doi : 10.1126/science.276.5313.763 PMID : 9115195
- Лю, Ю.; Мерроу, М.; Лорос, Джей-Джей; Данлэп, Джей Си (1998). «Как изменения температуры сбрасывают циркадный осциллятор». Наука . 281 : 825-829. doi : 10.1126/science.281.5378.825 PMID 9694654
- Данлэп, Джей Си (1999). «Молекулярные основы циркадных часов». Клетка. 96 : 271-290. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80566-8 PMID 9988221
- Фрелих, AC; Лю, Ю.; Лорос, Джей-Джей; Данлэп, Джей Си (2002). «Белый воротничок-1, циркадный фоторецептор синего света, связывающийся с частотным промотором». Наука. 297 : 815-819. doi : 10.1126/science.1073681 PMID 12098706
- Бейкер, CL; Кеттенбах, АН; Лорос, Дж.Дж.; Гербер, С.А.; Данлэп, Джей Си (2009). «Количественная протеомика выявляет динамический интерактом и фазоспецифическое фосфорилирование в циркадных часах Neurospora ». Клетка. 34(3) : 354–63. doi : 10.1016/j.molcel.2009.04.023 PMID 19450533
- Мехра, А.; Ши, М.; Бейкер, CL; Колот, Х.В.; Лорос, Джей-Джей; Данлэп, Джей Си (2009). «Роль казеинкиназы 2 в механизме, лежащем в основе компенсации циркадной температуры». Клетка. 137(4) : 749-60. doi : 10.1016/j.cell.2009.03.019 PMID 19450520
- Ларрондо, ЛФ; Оливарес-Яньес, К.; Бейкер, CL; Лорос, Джей-Джей; Данлэп, Джей Си (2015). «Циркадные ритмы. Развязка оборота белка циркадных часов от определения циркадного периода». Наука. 347(6221) : 1257277. doi : 10.1126/science.1257277 PMID 25635104
Книги
[ редактировать ]- Данлэп, Джей Си, Лорос, Джей Джей, и ДеКурси, Пи Джей (2004). Хронобиология: Биологический хронометраж. Синауэр Ассошиэйтс. ISBN 978-0-87893-396-9
Другие работы
[ редактировать ]- В статье NPR 2015 года «Почему некоторые грибы светятся в темноте» отмечается работа, проделанная в лаборатории Данлэпа по выявлению циркадного контроля биолюминесценции грибов. [ 30 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с д Габриэльсен, Пол (24 августа 2015 г.). «Профиль Джея К. Данлэпа» . Труды Национальной академии наук . 112 (38): 11745–11747. Бибкод : 2015PNAS..11211745G . дои : 10.1073/pnas.1514590112 . ISSN 0027-8424 . ПМЦ 4586857 . ПМИД 26305970 .
- ^ Перейти обратно: а б с Белл-Педерсен Д ; Боркович К (2009). «Премия Джорджа Бидла 2009 года». Генетика . 551 : 29–30.
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж г час Данлэп Дж. (2008). «Салатные дни в торговле ритмами» . Генетика . 178 (1): 1–13. дои : 10.1534/генетика.104.86496 . ПМК 2206063 . ПМИД 18202353 .
- ^ Перейти обратно: а б «Джей К. Данлэп, доктор философии - База данных экспертизы факультета - Медицинская школа Гейзеля в Дартмуте» . Проверено 06 мая 2021 г.
- ^ Гастингс, Майкл (19 декабря 1998 г.). «Мозг, циркадные ритмы и часовые гены» . BMJ: Британский медицинский журнал . 317 (7174): 1704–1707. дои : 10.1136/bmj.317.7174.1704 . ISSN 0959-8138 . ПМЦ 1114487 . ПМИД 9857134 .
- ^ Мирский, Генри П.; Лю, Эндрю С.; Уэлш, Дэвид К.; Кей, Стив А.; Дойл, Фрэнсис Дж. (7 июля 2009 г.). «Модель клеточно-автономных циркадных часов млекопитающих» . Труды Национальной академии наук . 106 (27): 11107–11112. Бибкод : 2009PNAS..10611107M . дои : 10.1073/pnas.0904837106 . ISSN 0027-8424 . ПМК 2699375 . ПМИД 19549830 .
- ^ Перейти обратно: а б с Гуч, В.Д.; Мехра, А; Ларрондо, ЛФ; Фокс, Дж; Турутаутудис, М; Лорос, Джей-Джей; Данлэп, Джей Си (01 января 2008 г.). «Полностью оптимизированная по кодонам люцифераза раскрывает новые температурные характеристики часов Neurospora» . Эукариотная клетка . 7 (1): 28–37. дои : 10.1128/EC.00257-07 . ПМК 2224151 . ПМИД 17766461 .
- ^ Перейти обратно: а б Джей Си Данлэп (1999). «Молекулярные основы циркадных часов» . Клетка . 96 (2): 271–290. дои : 10.1177/0748730411401579 . ПМК 3207295 . ПМИД 9988221 .
- ^ Аронсон, Б.Д.; Джонсон, Калифорния; Лорос, Джей-Джей; Данлэп, Джей Си (18 марта 1994 г.). «Отрицательная обратная связь, определяющая циркадные часы: авторегуляция частоты часового гена» . Наука . 263 (5153): 1578–1584. Бибкод : 1994Sci...263.1578A . дои : 10.1126/science.8128244 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 8128244 .
- ^ Данлэп, Джей Си; Лорос, Джей-Джей; Колот, Х.В.; Мехра, А.; Белден, Вашингтон; Ши, М.; Хонг, CI; Ларрондо, ЛФ; Бейкер, CL (1 января 2007 г.). «Циркадные часы Neurospora: как гены и белки взаимодействуют, создавая устойчивый, податливый и компенсированный биологический осциллятор с периодом около суток» . Симпозиумы Колд-Спринг-Харбор по количественной биологии . 72 : 57–68. дои : 10.1101/sqb.2007.72.072 . ISSN 0091-7451 . ПМЦ 3683860 . ПМИД 18522516 .
- ^ Лорос, Джей-Джей; Данлэп, Джей Си (01 января 2001 г.). «Генетический и молекулярный анализ циркадных ритмов Neurospora» . Ежегодный обзор физиологии . 63 : 757–794. doi : 10.1146/annurev.phyol.63.1.757 . ISSN 0066-4278 . ПМИД 11181975 .
- ^ Бейкер, Кристофер Л.; Кеттенбах, Арминья Н.; Лорос, Дженнифер Дж.; Гербер, Скотт А.; Данлэп, Джей К. (15 мая 2009 г.). «Количественная протеомика выявляет динамический интерактом и фазоспецифическое фосфорилирование в циркадных часах Neurospora» . Молекулярная клетка . 34 (3): 354–363. doi : 10.1016/j.molcel.2009.04.023 . ISSN 1097-4164 . ПМК 2711022 . ПМИД 19450533 .
- ^ Мехра, Арун; Ши, Ми; Бейкер, Кристофер Л.; Колот, Хильдур В.; Лорос, Дженнифер Дж.; Данлэп, Джей К. (15 мая 2009 г.). «Роль казеин-киназы 2 в механизме, лежащем в основе компенсации циркадной температуры» . Клетка . 137 (4): 749–760. дои : 10.1016/j.cell.2009.03.019 . ISSN 0092-8674 . ПМК 2718715 . ПМИД 19450520 .
- ^ Херли, Дженнифер М.; Ларрондо, Луис Ф.; Лорос, Дженнифер Дж.; Данлэп, Джей К. (26 декабря 2013 г.). «Консервативная РНК-хеликаза FRH действует неферментативно, поддерживая внутренне нарушенный часовой белок нейроспоры FRQ» . Молекулярная клетка . 52 (6): 832–843. doi : 10.1016/j.molcel.2013.11.005 . ISSN 1097-4164 . ПМК 3900029 . ПМИД 24316221 .
- ^ Перейти обратно: а б Данлэп, Джей С.; Лорос, Дженнифер Дж. (19 мая 2017 г.). «Делаем время: сохранение биологических часов от грибов до животных» . Микробиологический спектр . 5 (3). doi : 10.1128/microbiolspec.FUNK-0039-2016 . ISSN 2165-0497 . ПМК 5446046 . ПМИД 28527179 .
- ^ Кростуэйт, СК; Лорос, Джей-Джей; Данлэп, Джей Си (30 июня 1995 г.). «Светоиндуцированный сброс циркадных часов опосредован быстрым увеличением частоты транскриптов» . Клетка . 81 (7): 1003–1012. дои : 10.1016/s0092-8674(05)80005-4 . ISSN 0092-8674 . ПМИД 7600569 . S2CID 16023829 .
- ^ Сигэёси, Ю.; Тагучи, К.; Ямамото, С.; Такекида, С.; Ян, Л.; Тей, Х.; Мория, Т.; Сибата, С.; Лорос, Джей-Джей (26 декабря 1997 г.). «Свет-индуцированный сброс циркадных часов млекопитающих связан с быстрой индукцией транскрипта mPer1» . Клетка . 91 (7): 1043–1053. дои : 10.1016/s0092-8674(00)80494-8 . ISSN 0092-8674 . ПМИД 9428526 . S2CID 15331897 .
- ^ Перейти обратно: а б Кростуэйт, СК; Данлэп, Джей Си; Лорос, Джей-Джей (2 мая 1997 г.). «Neurospora wc-1 и wc-2: транскрипция, фотоответы и происхождение циркадной ритмичности» . Наука . 276 (5313): 263–269. дои : 10.1126/science.276.5313.763 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 9115195 .
- ^ Данлэп, Джей (5 июня 1998 г.). «Конец в начале» . Наука . 280 (5369): 1548–1549. дои : 10.1126/science.280.5369.1548 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 9644021 . S2CID 82831287 .
- ^ Ценг, Ю-Яо; Хант, Сюзанна М.; Хайнцен, Кристиан; Кростуэйт, Сьюзен К.; Шварц, Жан-Марк (29 марта 2012 г.). «Комплексное моделирование циркадных часов Neurospora и их температурной компенсации» . PLOS Вычислительная биология . 8 (3): e1002437. Бибкод : 2012PLSCB...8E2437T . дои : 10.1371/journal.pcbi.1002437 . ISSN 1553-7358 . ПМК 3320131 . ПМИД 22496627 .
- ^ Фрелих, Аллан К.; Лю, Йи; Лорос, Дженнифер Дж.; Данлэп, Джей К. (2 августа 2002 г.). «Белый воротничок-1, циркадный фоторецептор синего света, связывающийся с частотным промотором» . Наука . 297 (5582): 815–819. Бибкод : 2002Sci...297..815F . дои : 10.1126/science.1073681 . ISSN 1095-9203 . ПМИД 12098706 . S2CID 1612170 .
- ^ Данлэп, Джей С.; Лорос, Дженнифер Дж. (24 октября 2006 г.). «Как грибы держат время: циркадная система Neurospora и других грибов» . Современное мнение в микробиологии . 9 (6): 579–587. дои : 10.1016/j.mib.2006.10.008 . ISSN 1369-5274 . ПМИД 17064954 .
- ^ Лорос, Джей-Джей; Деноме, ЮАР; Данлэп, Джей Си (20 января 1989 г.). «Молекулярное клонирование генов под контролем циркадных часов Neurospora» . Наука . 243 (4889): 385–388. Бибкод : 1989Sci...243..385L . дои : 10.1126/science.2563175 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 2563175 .
- ^ Лорос, Джей-Джей; Данлэп, Джей Си; Ларрондо, ЛФ; Ши, М.; Белден, Вашингтон; Гуч, В.Д.; Чен, Ч.-Х.; Бейкер, CL; Мехра, А. (1 января 2007 г.). «Циркадный выход, вход и внутриклеточные осцилляторы: понимание циркадных систем отдельных клеток» . Симпозиумы Колд-Спринг-Харбор по количественной биологии . 72 : 201–214. дои : 10.1101/sqb.2007.72.067 . ISSN 0091-7451 . ПМК 3671946 . ПМИД 18419278 .
- ^ Прегейру, Антониу М.; Лю, Цююнь; Бейкер, Кристофер Л.; Данлэп, Джей С.; Лорос, Дженнифер Дж. (4 августа 2006 г.). «Киназа контрольной точки 2 Neurospora: регуляторная связь между циркадным и клеточным циклами» . Наука . 313 (5787): 644–649. Бибкод : 2006Sci...313..644P . дои : 10.1126/science.1121716 . ISSN 0036-8075 . ПМИД 16809488 . S2CID 36988859 .
- ^ Херли, Дженнифер М.; Янковски, Миган С.; Де Лос Сантос, Ханна; Кроуэлл, Александр М.; Фордайс, Сэмюэл Б.; Цукер, Джереми Д.; Кумар, Нирадж; Пурвин, Сэмюэл О.; Робинсон, Эррол В. (26 декабря 2018 г.). «Циркадный протеомный анализ раскрывает механизмы посттранскрипционной регуляции метаболических путей» . Клеточные системы . 7 (6): 613–626.e5. дои : 10.1016/j.cels.2018.10.014 . ISSN 2405-4712 . ПМК 6433121 . ПМИД 30553726 .
- ^ Ши, Ми; Ларрондо, Луис Ф.; Лорос, Дженнифер Дж.; Данлэп, Джей К. (11 декабря 2007 г.). «Цикл развития маскирует выходную мощность циркадного осциллятора в условиях дефицита холина у Neurospora» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 104 (50): 20102–20107. Бибкод : 2007PNAS..10420102S . дои : 10.1073/pnas.0706631104 . ISSN 1091-6490 . ПМК 2148429 . ПМИД 18056807 .
- ^ Ларрондо, Луис Ф.; Оливарес-Яньес, Консуэло; Бейкер, Кристофер Л.; Лорос, Дженнифер Дж.; Данлэп, Джей К. (30 января 2015 г.). «Развязка циркадного метаболизма белка от определения циркадного периода» . Наука . 347 (6221): 1257277. doi : 10.1126/science.1257277 . ISSN 1095-9203 . ПМЦ 4432837 . ПМИД 25635104 .
- ^ Оливейра, Андерсон Г.; Стевани, Кассий В.; Вальденмайер, Ханс Э.; Вивиани, Вадим; Эмерсон, Джиллиан М.; Лорос, Дженнифер Дж.; Данлэп, Джей К. (30 марта 2015 г.). «Циркадный контроль проливает свет на грибковую биолюминесценцию» . Современная биология . 25 (7): 964–968. Бибкод : 2015CBio...25..964O . дои : 10.1016/j.cub.2015.02.021 . ISSN 0960-9822 . ПМЦ 4382382 . ПМИД 25802150 .
- ^ Перейти обратно: а б Вальденмайер, Ганс; Химик, Исследования; Пауло, Университет Сана. «Почему некоторые грибы светятся в темноте» . NPR.org . Проверено 14 апреля 2017 г.
- ^ Фуллер, Кевин К.; Крамер, Роберт А.; Зеганс, Майкл Э.; Данлэп, Джей С.; Лорос, Дженнифер Дж. (20 сентября 2016 г.). «Фотобиология Aspergillus fumigatus проливает свет на заметную гетерогенность между изолятами» . мБио . 7 (5). дои : 10.1128/mBio.01517-16 . ISSN 2150-7511 . ПМК 5030361 . ПМИД 27651362 .
- ^ «Проект генома Neurospora crassa | Институт Броуда» . www.broadinstitute.org . 14 сентября 2016 г. Проверено 14 апреля 2017 г.
- ^ Херли, Дженнифер М.; Лорос, Дженнифер Дж.; Данлэп, Джей К. (01 мая 2016 г.). «Циркадная система как организатор обмена веществ» . Грибковая генетика и биология . 90 : 39–43. дои : 10.1016/j.fgb.2015.10.002 . ПМЦ 4818683 . ПМИД 26498192 .
- ^ Декханг, Ригзин; Ву, Ченг; Смит, Кристина М.; Лэмб, Тереза М.; Петерсон, Мэтью; Бредевег, Эрин Л.; Ибарра, Онейда; Эмерсон, Джиллиан М.; Карунаратна, Нирмала (15 ноября 2016 г.). «Фактор транскрипции Neurospora ADV-1 преобразует световые сигналы и временную информацию для контроля ритмической экспрессии генов, участвующих в слиянии клеток» . G3: Гены, геномы, генетика . 7 (1): 129–142. дои : 10.1534/g3.116.034298 . ISSN 2160-1836 . ПМК 5217103 . ПМИД 27856696 .
- ^ Пелхэм, Жаклин Ф.; Данлэп, Джей С.; Херли, Дженнифер М. (11 ноября 2020 г.). «Внутреннее расстройство является важной характеристикой компонентов консервативного циркадного контура» . Сотовая связь и сигнализация . 18 (1): 181. дои : 10.1186/s12964-020-00658-y . ISSN 1478-811X . ПМЦ 7656774 . ПМИД 33176800 .
- ^ Келлихер, CM; Ламбрехтс, Р.; Сян, Ц.; Бейкер, CL; Лорос, Джей-Джей; Данлэп, Джей Си (09 декабря 2020 г.). «PRD-2 напрямую регулирует казеинкиназу I и противодействует нонсенс-опосредованному распаду циркадных часов Neurospora» . электронная жизнь . 9 . doi : 10.7554/eLife.64007 . ПМЦ 7746235 . ПМИД 33295874 .
- Хронобиологи
- 1952 года рождения
- Жители Ладлоу, Массачусетс
- Люди из Йорка, штат Пенсильвания
- Выпускники Вашингтонского университета
- Руководители американских некоммерческих организаций
- Сотрудники Калифорнийского университета в Санта-Крузе
- Живые люди
- Выпускники Гарвардского университета
- Факультет медицинской школы Гейзеля