Говорить

Говорить
Идентификаторы
Псевдонимы	Parl , Psarl, Psarl1, Psenip2, RHBDS1, Pro2207, Associalin Associated Rhomboid
Внешние идентификаторы	Омим : 607858 ; MGI : 1277152 ; Гомологен : 10239 ; GeneCards : Pari ; OMA : PARL - Ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 3 (human)
End	183,884,933 bp
showМестоположение гена ( мышь )
Chr.	Chromosome 16 (mouse)
End	20,121,137 bp
showРНК -паттерн экспрессии
	Top expressed in
	monocyte; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; thymus; ; apex of heart; ; muscle layer of sigmoid colon; ; body of pancreas; ; gastric mucosa; ; putamen; ; mucosa of transverse colon; ; tibial arteries;
	Top expressed in
	primary oocyte; ; embryonic cell; ; zygote; ; secondary oocyte; ; yolk sac; ; epiblast; ; otic vesicle; ; proximal tubule; ; epidermis; ; zone of skin;
	More reference expression data
	More reference expression data
showДжин Онтология
Molecular function	peptidase activity; serine-type peptidase activity; protein binding; hydrolase activity; serine-type endopeptidase activity; endopeptidase activity;
Cellular component	integral component of membrane; mitochondrial inner membrane; membrane; nucleus; mitochondrion;
Biological process	regulation of reactive oxygen species metabolic process; regulation of protein targeting to mitochondrion; regulation of proteolysis; proteolysis; membrane protein proteolysis; regulation of mitochondrion organization; mitochondrial calcium ion transmembrane transport;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	55486
	381038
	ENSG00000175193
	Ensmusg0000000033918
	Q9H300
	Q5XJY4
showNM_001037639 ; NM_001037640 ; NM_018622 ; NM_001324436 ; NM_001324437 ;
	NM_001324438
	NM_001005767
	NP_001032728 ; NP_001311365 ; NP_001311366 ; NP_001311367 ; NP_061092
	NP_001005767
	Викидид
Посмотреть/редактировать человека	Посмотреть/редактировать мышь

Ассоциированный ромбоидный белок, подобный ромбоуд, митохондриальный (PSARL), ^{[ 5 ]} Также известен как Pink1/PGAM5-ассоциированная ромбоидная протеаза (PARL), ^{[ 6 ]} является митохондриальной мембраны внутренним белком , который у людей кодируется PARL геном на хромосоме 3. ^{[ 7 ]} Он является членом семейства ромбоидов внутримембранных сериновых протеаз . ^{[ 8 ]} Этот белок участвует в передаче сигналов и апоптозе , а также нейродегенеративные заболевания и диабет 2 типа . ^{[ 7 ]}^{[ 9 ]}

Структура

Члены семьи Rhomboid имеют консервативное ядро из шести трансмембранных спиралей (TMHS), причем SER и его остатки необходимы для формирования каталитической диады, встроенной в TMH-4 и TMH-6 соответственно. Эта диада обнаружена глубоко под поверхностью мембраны, что указывает на то, что гидролиз пептидных связей происходит в гидрофобной фосфолипидной бислойной мембране. Будучи членом подсемейства PARL, PARL имеет дополнительный N-концевой TMH, который может сформировать цикл для каталитического ядра. ^{[ 10 ]}

Функция

Этот ген кодирует митохондриальный интегральный мембранный белок . После протеолитической обработки этого белка образуется небольшой пептид (P-бета) и транслоцируется в ядро. Этот ген может участвовать в передаче сигнала посредством регулируемого внутримембранного протеолиза белков-предшественников мембраны. Различия в этом геном были связаны с повышенным риском диабета 2 типа . Альтернативный сплайсинг приводит к множеству вариантов транскрипта, кодирующих различные изоформы. ^{[ 7 ]}

Кроме того, PARL участвует в апоптозе посредством его взаимодействия с митохондриальной атрофией GTPase Optic 1 ( OPA1 ) и семейством BCL -2 белком, связанным с HAX1 . OPA1 в основном регулирует слияние митохондрий во внутренней мембране митохондрий , но после протеолитического расщепления парнем ее короткая, растворимая форма способствует ингибированию апоптоза путем замедления высвобождения цитохромы С и, следовательно, проапоптотической сигнализации. Альтернативно, PARL может ингибировать апоптоз, координируя с HAX1 для активации протеазы HTRA2, что предотвращая накопление проапоптотического бакса . ^{[ 9 ]}

Клиническое значение

Было показано, что ассоциированная с презенилином P.S77N мутация ромбоидного белка не является частой причиной ранней болезни Паркинсона . ^{[ 11 ]} Изменение последовательности и/или экспрессии гена, кодирующего ромбоид-подобного белка, связанного с пресенилинами ( PSARL ), может быть важным новым фактором риска для диабета 2 типа и других компонентов метаболического синдрома . ^{[ 12 ]} Мутации в PARL также могут быть вовлечены в наследственную зрительную невропатию Лебера, нарушая нормальную функцию митохондрий , что способствует сетчатки . гибели ганглиозных клеток и нейродегенерации ^{[ 9 ]}

Взаимодействия

Парл был показан, с кем взаимодействует:

Pink1 , ^{[ 13 ]}
Opa1 , ^{[ 9 ]} и
Hax1 . ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000175193 - ENSEMBL , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg0000000033918 - Ensembl , май 2017 г.
^ «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .
^ «Q9H300 · Parl_human» . Uniprot . Консорциум Uniprot . Получено 8 августа 2023 года .
^ Зиберт V, Силбер М., Хетен Е., Мюл-Голл С., Лемберг М.К. (2022). «Расщепление регулятора гомеостаза митохондриального гомеостаза PGAM5 с помощью интрамембранной протеазы Парла регулируется динамикой трансмембранной спирали и олигомерным государством» . Журнал биологической химии . 298 (9). doi : 10.1016/j.jbc.2022.102321 . PMC 9436811 . PMID 35921890 . 102321.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в «Ген Entrez: Pall Presenilin Associated, Rhomboid-подобный» .
^ McQuibban GA, Saurya S, Freeman M (2003). «Реконструирование митохондриальной мембраны, регулируемое консервативной ромбоидной протеазой» . Природа . 423 (6939): 537–541. Bibcode : 2003natur.423..537M . doi : 10.1038/nature01633 . PMID 12774122 .
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и Я уверен, что это (Джон 2010). Полем Человеческая генетика 128 (1): 39–4 doi : 10.1007/ s00439-010-0821-0821-8 PMID 2040791 . 394164S2CID
^ Pellegrini L, Scorrano L (июль 2007 г.). «Сокращение до смерти: PARL и OPA1 в регуляции морфологии и апоптоза митохондрий» . Гибель клеток и дифференциация . 14 (7): 1275–84. doi : 10.1038/sj.cdd.4402145 . PMID 17464328 .
^ Heinitz S, Klein C, Джармати А (ноябрь 2011). «Мутация P.S77N, ассоциированная с пресенилином ромбоид, не является частой причиной болезни Паркинсона в раннем начале». Движение расстройства . 26 (13): 2441–2. doi : 10.1002/mds.23889 . PMID 21953724 . S2CID 45301679 .
^ Walder K, Kerr-Bayles L, Civitarian A, Jowett J, Curran J, Illliott K, Trevaskis J, Bishara N, Zimte P, Mandarin L, Ravussin E, Blangero J, Kissebah A, Kissebah A, Kissebah A, Kissebah A,, Kissebah A, Kissebah A, Kissebah A, Kissebah A, Gr Collier (Par 2005). «Rhomboid Mythochongrial Protease PSARL - новый кандидат на 2 диабета » Диабетология 48 (3): 459–68. doi : 10.1007/s00125-005-1675-9 . HDL : 10536/dro/du: 30003156 . 15729572PMID
^ Ши Дж, Ли Дж.Р., Граймс Д.А., Ракачо Л., Йе Д., Ян Х., Росс О.А., Фаррер М., МакКиббан Г.А., Булман де (май 2011). «Функциональное изменение парламента способствует дисрегуляции митохондрий при болезни Паркинсона». Молекулярная генетика человека . 20 (10): 1966–74. doi : 10.1093/hmg/ddr077 . PMID 21355049 .

Дальнейшее чтение

Jeyaraju DV, Xu L, Letellier MC, Bandaru S, Zunino R, Berg EA, McBride HM, Pellegrini L (Dec 2006). «Фосфорилирование и расщепление ромбоидного белка (PAR), ассоциированного с пресенилином (PARL), способствуют изменениям в морфологии митохондриальных» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 103 (49): 18562–7. Bibcode : 2006pnas..10318562J . doi : 10.1073/pnas.0604983103 . PMC 1693702 . PMID 17116872 .
Fawcett KA, Wareham NJ, Luan J, Syddall H, Cooper C, O'Rahilly S, Day In, Sandhu MS, Barroso I (ноябрь 2006 г.). «Parl Leu262Val не связан с уровнями инсулина натощак в популяциях Великобритании» . Диабетология . 49 (11): 2649–52. doi : 10.1007/s00125-006-0443-9 . PMC 2672784 . PMID 17019603 .
Walder K, Kerr-Bayles L, Civitarian A, Jowett J, Curran J, Illliott K, Trevaskis J, Bishara N, Zimte P, Mandarin L, Ravussin E, Blangero J, Kissebah A, Kissebah A, Kissebah A, Kissebah A,, Kissebah A, Kissebah A, Kissebah A, Kissebah A, Gr Collier (Par 2005). «Rhomboid Mythochongrial Protease PSARL - новый кандидат на 2 диабета » Диабетология 48 (3): 459–68. doi : 10.1007/s00125-005-1675-9 . HDL : 10536/dro/du: 30003156 . 15729572PMID
Сик А., прохожий Б.Дж., Кунин Э.В., Пеллегрини Л. (апрель 2004). «Саморегулируемое расщепление митохондриальной внутримембранной расщепления протеазы дает Pbeta, ядерный пептид» . Журнал биологической химии . 279 (15): 15323–9. doi : 10.1074/jbc.m313756200 . PMID 14732705 .
McQuibban GA, Saurya S, Freeman M (май 2003 г.). «Реконструирование митохондриальной мембраны, регулируемое консервативной ромбоидной протеазой» . Природа . 423 (6939): 537–41. Bibcode : 2003natur.423..537M . doi : 10.1038/nature01633 . PMID 12774122 . S2CID 4398146 .
Пеллегрини Л., прохожие Б.Дж., Канеллес М., Лефтеров И., Ганджа Дж.К., Фаулкс Б.Дж., Кунин Э.В., Д'АДАМИО Л (Апрель 2001). «PAMP и PARL, две новые предполагаемые металлопротеазы, взаимодействующие с COOH-концевым транспортом Presenilin-1 и -2». Журнал болезни Альцгеймера . 3 (2): 181–190. doi : 10.3233/JAD-2001-3203 . PMID 12214059 .

Эта статья о гене на хромосоме человека 3 является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCH38: Ensembl Release 89: ENSG00000175193 - ENSEMBL , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в GRCM38: Ensembl Release 89: Ensmusg0000000033918 - Ensembl , май 2017 г.

[3] «Человеческая PubMed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[4] «Мышь Pubmed ссылка:» . Национальный центр информации о биотехнологии, Национальная медицина США .

[5] «Q9H300 · Parl_human» . Uniprot . Консорциум Uniprot . Получено 8 августа 2023 года .

[6] Зиберт V, Силбер М., Хетен Е., Мюл-Голл С., Лемберг М.К. (2022). «Расщепление регулятора гомеостаза митохондриального гомеостаза PGAM5 с помощью интрамембранной протеазы Парла регулируется динамикой трансмембранной спирали и олигомерным государством» . Журнал биологической химии . 298 (9). doi : 10.1016/j.jbc.2022.102321 . PMC 9436811 . PMID 35921890 . 102321.

[entrez-7] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в «Ген Entrez: Pall Presenilin Associated, Rhomboid-подобный» .

[8] McQuibban GA, Saurya S, Freeman M (2003). «Реконструирование митохондриальной мембраны, регулируемое консервативной ромбоидной протеазой» . Природа . 423 (6939): 537–541. Bibcode : 2003natur.423..537M . doi : 10.1038/nature01633 . PMID 12774122 .

[pmid20407791-9] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и Я уверен, что это (Джон 2010). Полем Человеческая генетика 128 (1): 39–4 doi : 10.1007/ s00439-010-0821-0821-8 PMID 2040791 . 394164S2CID

[10] Pellegrini L, Scorrano L (июль 2007 г.). «Сокращение до смерти: PARL и OPA1 в регуляции морфологии и апоптоза митохондрий» . Гибель клеток и дифференциация . 14 (7): 1275–84. doi : 10.1038/sj.cdd.4402145 . PMID 17464328 .

[11] Heinitz S, Klein C, Джармати А (ноябрь 2011). «Мутация P.S77N, ассоциированная с пресенилином ромбоид, не является частой причиной болезни Паркинсона в раннем начале». Движение расстройства . 26 (13): 2441–2. doi : 10.1002/mds.23889 . PMID 21953724 . S2CID 45301679 .

[12] Walder K, Kerr-Bayles L, Civitarian A, Jowett J, Curran J, Illliott K, Trevaskis J, Bishara N, Zimte P, Mandarin L, Ravussin E, Blangero J, Kissebah A, Kissebah A, Kissebah A, Kissebah A,, Kissebah A, Kissebah A, Kissebah A, Kissebah A, Gr Collier (Par 2005). «Rhomboid Mythochongrial Protease PSARL - новый кандидат на 2 диабета » Диабетология 48 (3): 459–68. doi : 10.1007/s00125-005-1675-9 . HDL : 10536/dro/du: 30003156 . 15729572PMID

[13] Ши Дж, Ли Дж.Р., Граймс Д.А., Ракачо Л., Йе Д., Ян Х., Росс О.А., Фаррер М., МакКиббан Г.А., Булман де (май 2011). «Функциональное изменение парламента способствует дисрегуляции митохондрий при болезни Паркинсона». Молекулярная генетика человека . 20 (10): 1966–74. doi : 10.1093/hmg/ddr077 . PMID 21355049 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]