ЧТЕНИЕ

SPINK5
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1H0Z, 1HDL, 1UUC, 1UVF, 1UVG
Идентификаторы
Псевдонимы	SPINK5 , LEKTI, LETKI, NETS, NS, VAKTI, serine peptidase inhibitor, Kazal type 5, serine peptidase inhibitor Kazal type 5
Внешние идентификаторы	Опустить : 605010 ; МГИ : 1919682 ; Гомологен : 4987 ; Генные карты : SPINK5 ; ОМА : SPINK5 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	148,137,382 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 18 (mouse)
End	44,155,568 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	vulva; ; gums; ; skin of thigh; ; gingival epithelium; ; oral cavity; ; mucosa of pharynx; ; human penis; ; skin of hip; ; skin of arm; ; body of tongue;
	Top expressed in
	skin of abdomen; ; esophagus; ; skin of external ear; ; lip; ; skin of back; ; prostate; ; lobe of prostate; ; belly cord; ; left lung lobe; ; stomach;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	peptidase inhibitor activity; serine-type endopeptidase inhibitor activity;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; endoplasmic reticulum membrane; cell cortex; endoplasmic reticulum; perinuclear region of cytoplasm; epidermal lamellar body; extracellular region; intracellular membrane-bounded organelle;
Biological process	epidermal cell differentiation; negative regulation of proteolysis; negative regulation of serine-type peptidase activity; negative regulation of peptidase activity; epithelial cell differentiation; hair cell differentiation; extracellular matrix organization; negative regulation of antibacterial peptide production; negative regulation of immune response; regulation of cell adhesion; negative regulation of angiogenesis; negative regulation of serine-type endopeptidase activity; regulation of T cell differentiation; cornification; regulation of timing of anagen;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	11005
	72432
	ENSG00000133710
	ENSMUSG00000055561
	Q9NQ38
	Q148R4
	НМ_001127698 ; НМ_001127699 ; НМ_006846
	НМ_001081180
	НП_001121170 ; НП_001121171 ; НП_006837
	НП_001074649
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Лимфоэпителиальный ингибитор Казал-типа (LEKTI), также известный как ингибитор сериновой протеазы Казал-типа 5 (SPINK5), представляет собой белок , который у людей кодируется SPINK5 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Структура и функции

LEKTI представляет собой крупный мультидоменный сериновой протеазы, ингибитор экспрессируемый в многослойной эпителиальной ткани. Он состоит из 15 доменов, которые расщепляются на более мелкие функциональные фрагменты протеазой фурином . Только два из этих доменов (2 и 15) содержат 6 равномерно расположенных цистеинов, ответственных за 3 внутримолекулярные дисульфидные связи, характерные для ингибиторов, родственных Казаль-типу . Остальные домены содержат по 4 цистеина. ^{[ 7 ]} Эти дисульфидные связи заставляют молекулу принимать жесткую конформацию, которая позволяет белку взаимодействовать с целевой протеазой через расширенный бета-лист . Все домены (кроме 1, 2 и 15) содержат аргинин в точке P1, что указывает на то, что вероятными мишенями являются трипсиноподобные протеазы. ^{[ 7 ]}

В эпидермисе LEKTI участвует в регуляции десквамации благодаря своей способности избирательно ингибировать KLK5 , KLK7 и KLK14 . ^{[ 8 ]} Рекомбинантный полноразмерный LEKTI ингибирует экзогенные сериновые протеазы трипсин , плазмин , субтилизин А , катепсин G нейтрофилов человека и эластазу . ^{[ 9 ]}

ЛЕКТИ может играть роль в морфогенезе кожи и волос, а также в противовоспалительной и/или антимикробной защите слизистого эпителия. ^{[ 6 ]}

Ген

SPINK5 является членом кластера семейства генов, расположенного на хромосоме 5q32 . ^{[ 10 ]} которые кодируют ингибиторы сериновых протеаз. Сюда входят и другие эпидермальные белки SPINK6 и LEKTI-2 ( SPINK9 ). Ген SPINK5 имеет длину 61 т.п.н. и содержит 33 экзона. ^{[ 7 ]} Альтернативный процессинг SPINK5 приводит к образованию трех различных генных продуктов, которые были идентифицированы в дифференцированных кератиноцитах. ^{[ 11 ]}

Клиническое значение

Мутации в гене SPINK5 приводят к синдрому Нетертона — заболеванию, характеризующемуся ихтиозом и специфическими дефектами иммунной системы. ^{[ 6 ]}

См. также

Домен ингибитора сериновой протеазы Казаль-типа

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000133710 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000055561 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Магерт Х.Дж., Стендкер Л., Кройцманн П., Цухт Х.Д., Райнеке М., Зоммерхофф К.П., Фриц Х., Форссманн В.Г. (август 1999 г.). «LEKTI, новый 15-доменный тип ингибитора сериновых протеиназ человека» . J Биол Хим . 274 (31): 21499–502. дои : 10.1074/jbc.274.31.21499 . ПМИД 10419450 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с «Ген Энтрез: ингибитор сериновой пептидазы SPINK5, Казал тип 5» .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Фурио Л., Овнанян А (ноябрь 2011 г.). «Когда активность требует распада: каскад протеолитической активации LEKTI для специфического ингибирования протеиназ» . Джей Инвест Дерматол . 131 (11): 2169–73. дои : 10.1038/jid.2011.295 . ПМИД 21997416 .
^ Дересон С, Боннарт С, Лопес Ф, Бессон С, Робинсон Р, Джаякумар А, Вагберг Ф, Братцанд М, Хачем Дж. П., Леонардссон Г, Овнанян А (сентябрь 2007 г.). «Фрагменты LEKTI специфически ингибируют KLK5, KLK7 и KLK14 и контролируют шелушение посредством pH-зависимого взаимодействия» . Мол. Биол. Клетка . 18 (9): 3607–19. дои : 10.1091/mbc.E07-02-0124 . ЧВК 1951746 . ПМИД 17596512 .
^ Мицудо К., Джаякумар А., Хендерсон Ю., Фредерик М.Дж., Кан Ю., Ван М., Эль-Наггар А.К., Клейман Г.Л. (апрель 2003 г.). «Ингибирование сериновых протеиназ плазмина, трипсина, субтилизина А, катепсина G и эластазы с помощью LEKTI: кинетический анализ». Биохимия . 42 (13): 3874–81. дои : 10.1021/bi027029v . ПМИД 12667078 .
^ «Ингибитор сериновой пептидазы SPINK5, Казал тип 5 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» .
^ Тарталья-Польчини А, Боннарт С, Микелони А, Чианфарани Ф, Андре А, Замбруно Г, Овнанян А, Д'Алессио М (февраль 2006 г.). «SPINK5, дефектный ген синдрома Нетертона, кодирует несколько изоформ LEKTI, полученных в результате альтернативного процессинга пре-мРНК» . Джей Инвест Дерматол . 126 (2): 315–24. дои : 10.1038/sj.jid.5700015 . ПМИД 16374478 .

Дальнейшее чтение

Норгетт Э.Э., Келселл Д.П. (2002). «SPINK5: как редкое, так и распространенное заболевание кожи». Тенденции молекулярной медицины . 8 (1): 7. дои : 10.1016/S1471-4914(01)02228-6 . ПМИД 11796258 .
Мэгерт Х.Дж., Кройцманн П., Стендкер Л. и др. (2002). «LEKTI: многодоменный ингибитор сериновых протеиназ, имеющий патофизиологическое значение». Межд. Дж. Биохим. Клеточная Биол . 34 (6): 573–6. дои : 10.1016/S1357-2725(01)00179-0 . ПМИД 11943586 .
Уолден М., Кройцманн П., Дрогемюллер К. и др. (2003). «Биохимические особенности, молекулярная биология и клиническая значимость 15-доменного ингибитора сериновой протеиназы человека LEKTI». Биол. Хим . 383 (7–8): 1139–41. дои : 10.1515/BC.2002.124 . ПМИД 12437098 . S2CID 26084613 .
Чаванас С., Гарнер С., Бодемер С. и др. (2000). «Локализация гена синдрома Нетертона на хромосоме 5q32 путем анализа сцепления и картирования гомозиготности» . Являюсь. Дж. Хум. Жене . 66 (3): 914–21. дои : 10.1086/302824 . ПМК 1288172 . ПМИД 10712206 .
Чаванас С., Бодемер С., Роша А. и др. (2000). «Мутации в SPINK5, кодирующем ингибитор сериновой протеазы, вызывают синдром Нетертона». Нат. Жене . 25 (2): 141–2. дои : 10.1038/75977 . ПМИД 10835624 . S2CID 40421711 .
Спречер Э., Чаванас С., ДиДжованна Дж.Дж. и др. (2001). «Спектр патогенных мутаций SPINK5 в 19 семьях с синдромом Нетертона: значение для выявления мутаций и первого случая пренатальной диагностики» . Дж. Инвест. Дерматол . 117 (2): 179–87. дои : 10.1046/j.1523-1747.2001.01389.x . ПМИД 11511292 .
Уолли А.Дж., Чаванас С., Моффатт М.Ф. и др. (2001). «Генный полиморфизм в Нетертоне и распространенной атопической болезни». Нат. Жене . 29 (2): 175–8. дои : 10.1038/ng728 . ПМИД 11544479 . S2CID 20292050 .
Ахмед А., Кандола П., Зиада Г., Паренто Н. (2002). «Очистка и частичная аминокислотная последовательность белков из среды, кондиционированной эпидермальными кератиноцитами человека». J. Протеиновая химия . 20 (4): 273–8. дои : 10.1023/A:1010902815953 . ПМИД 11594460 . S2CID 11877191 .
Битун Э., Чаванас С., Ирвин А.Д. и др. (2002). «Синдром Нетертона: выражение заболевания и спектр мутаций SPINK5 в 21 семье» . Дж. Инвест. Дерматол . 118 (2): 352–61. дои : 10.1046/j.1523-1747.2002.01603.x . ПМИД 11841556 .
Комацу Н., Таката М., Оцуки Н. и др. (2002). «Повышенная гидролитическая активность рогового слоя при синдроме Нетертона предполагает ингибирующую регуляцию десквамации с помощью пептидов, полученных из SPINK5» . Дж. Инвест. Дерматол . 118 (3): 436–43. дои : 10.1046/j.0022-202x.2001.01663.x . hdl : 2297/15796 . ПМИД 11874482 .
Битун Э., Микелони А., Ламант Л. и др. (2004). «Протеолитический процесс LEKTI в первичных кератиноцитах человека, распределение тканей и дефектная экспрессия при синдроме Нетертона» . Хм. Мол. Жене . 12 (19): 2417–30. дои : 10.1093/hmg/ddg247 . ПМИД 12915442 .
Нисио Ю., Ногучи Э., Сибасаки М. и др. (2004). «Связь между полиморфизмом гена SPINK5 и атопическим дерматитом у японцев» . Гены Иммунитет . 4 (7): 515–7. дои : 10.1038/sj.gene.6363889 . ПМИД 14551605 .
Рагунат М., Тонциду Л., Оджи В. и др. (2004). «SPINK5 и синдром Нетертона: новые мутации, демонстрация отсутствия LEKTI и дифференциальная экспрессия трансглутаминаз» . Дж. Инвест. Дерматол . 123 (3): 474–83. дои : 10.1111/j.0022-202X.2004.23220.x . ПМИД 15304086 .
Тидоу Х., Лаубер Т., Витцитум К. и др. (2004). «Структура раствора химерного домена LEKTI обнаруживает последовательность хамелеона» (PDF) . Биохимия . 43 (35): 11238–47. дои : 10.1021/bi0492399 . ПМИД 15366933 .
Ян Т., Лян Д., Кох П.Дж. и др. (2004). «Отслойка эпидермиса, диссоциация десмосом и дестабилизация корнеодесмозина у мышей Spink5-/-» . Генс Дев . 18 (19): 2354–8. дои : 10.1101/gad.1232104 . ПМК 522985 . ПМИД 15466487 .
Исида-Ямамото А., Дерасон С., Боннарт С. и др. (2005). «LEKTI локализуется в пластинчатых гранулах, отделенных от KLK5 и KLK7, и секретируется во внеклеточные пространства поверхностного зернистого слоя» . Дж. Инвест. Дерматол . 124 (2): 360–6. дои : 10.1111/j.0022-202X.2004.23583.x . ПМИД 15675955 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q9NQ38 (ингибитор сериновой протеазы Kazal-тип 5) на PDBe-KB .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 5 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000133710 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000055561 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10419450-5] Магерт Х.Дж., Стендкер Л., Кройцманн П., Цухт Х.Д., Райнеке М., Зоммерхофф К.П., Фриц Х., Форссманн В.Г. (август 1999 г.). «LEKTI, новый 15-доменный тип ингибитора сериновых протеиназ человека» . J Биол Хим . 274 (31): 21499–502. дои : 10.1074/jbc.274.31.21499 . ПМИД 10419450 .

[entrez-6] Jump up to: ^а ^б ^с «Ген Энтрез: ингибитор сериновой пептидазы SPINK5, Казал тип 5» .

[furio-7] Jump up to: ^а ^б ^с Фурио Л., Овнанян А (ноябрь 2011 г.). «Когда активность требует распада: каскад протеолитической активации LEKTI для специфического ингибирования протеиназ» . Джей Инвест Дерматол . 131 (11): 2169–73. дои : 10.1038/jid.2011.295 . ПМИД 21997416 .

[pmid17596512-8] Дересон С, Боннарт С, Лопес Ф, Бессон С, Робинсон Р, Джаякумар А, Вагберг Ф, Братцанд М, Хачем Дж. П., Леонардссон Г, Овнанян А (сентябрь 2007 г.). «Фрагменты LEKTI специфически ингибируют KLK5, KLK7 и KLK14 и контролируют шелушение посредством pH-зависимого взаимодействия» . Мол. Биол. Клетка . 18 (9): 3607–19. дои : 10.1091/mbc.E07-02-0124 . ЧВК 1951746 . ПМИД 17596512 .

[pmid12667078-9] Мицудо К., Джаякумар А., Хендерсон Ю., Фредерик М.Дж., Кан Ю., Ван М., Эль-Наггар А.К., Клейман Г.Л. (апрель 2003 г.). «Ингибирование сериновых протеиназ плазмина, трипсина, субтилизина А, катепсина G и эластазы с помощью LEKTI: кинетический анализ». Биохимия . 42 (13): 3874–81. дои : 10.1021/bi027029v . ПМИД 12667078 .

[10] «Ингибитор сериновой пептидазы SPINK5, Казал тип 5 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» .

[tartaglia-11] Тарталья-Польчини А, Боннарт С, Микелони А, Чианфарани Ф, Андре А, Замбруно Г, Овнанян А, Д'Алессио М (февраль 2006 г.). «SPINK5, дефектный ген синдрома Нетертона, кодирует несколько изоформ LEKTI, полученных в результате альтернативного процессинга пре-мРНК» . Джей Инвест Дерматол . 126 (2): 315–24. дои : 10.1038/sj.jid.5700015 . ПМИД 16374478 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]