Нокардиевые

Нокардиевые
	Nocardia asteroides Колонии
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Актиномицетота
Сорт:	Актиномицетия
Заказ:	Микобактерии
Семья:	Нокардиевые ; Кастеллани и Чалмерс 1919 г. (утвержденные списки 1980 г.)
Типовой род
	Нокардия ; Тревизан 1889 г. (утвержденные списки 1980 г.)
Роды
	Альдерсония Нуиуи и др . 2018 год ; Antrihabitans Lee и др . 2020 год ; Хойоселла Хурадо и др . 2009 год ; Миллисия Содделл и др . 2006 г. ; Nocardia Trevisan 1889 (утвержденные списки 1980 г.) ; Rhodococcus Zopf 1891 (утвержденные списки 1980 г.) ; Скермания Чун и др . 1997 год ; Смарагдикоккус Адачи и др . 2007 год ; Tomitella Katayama et al . 2010 ;
Синонимы
	Hoyosellaceae Salam et al . 2020 год ; Tomitellaceae Salam et al . 2020 ;

Nocardiaceae — это семейство аэробных с , неприхотливых высоким содержанием G+C , грамположительных актиномицетов которые обычно встречаются в почве и воде. ^[3] Представители этого семейства были выделены из почв Антарктики . ^[4] Nocardiaceae представлены коккобациллами, нитчатыми или, реже, фрагментарными и палисадными формами. ^[5] и нитчатые виды растут по морфологической разветвленной схеме, подобной гифам грибов . ^[6]

Геномика

Nocardiaceae образуют монофилетическую кладу внутри Corynebacteriales как в 16S рРНК, так и в филогенетических деревьях на основе белков. ^[7]^[8] ряд консервативных сигнатурных инделей Был идентифицирован и консервативных сигнатурных белков, которые встречаются исключительно в родах Nocardia и Rhodococcus , что подтверждает тесную связь между этими двумя родами. ^[8] Недавние предложения были сделаны на основе 16S рРНК сигнатурных нуклеотидов и хемотаксономических маркеров, чтобы добавить роды Gordonia , Skermania , Williamsia , Millisia и Smaragdicoccus к семейству Nocardiaceae. ^[7]^[9] Однако не было обнаружено никаких консервативных сигнатурных инделей или белков, которые обычно являются общими для Nocardia , Rhodococcus и Gordonia , полностью секвенированных членов предлагаемой ревизии Nocardiaceae. ^[8]

Патогенный потенциал

Некоторые виды колонизируют животных, а представители родов Nocardia и Rhodococcus могут вызывать инфекцию у людей и домашнего скота. ^[10] Нокардиоз также представляет собой серьезную проблему для здоровья рыб (морских или нет). ^[11] Многие представители этого семейства интегрируют миколовые кислоты в свою клеточную стенку , и в результате Nocardia spp. могут быть ошибочно приняты за микобактерии при рассмотрении под микроскопом после кислотоустойчивого окрашивания. ^[12]

Воздействие на окружающую среду

Вспенивание сточных вод

Виды Nocardia часто ответственны за накопление пены, которая возникает в активном иле при очистке сточных вод . ^[6]^[13]^[14]^[15] Биологическое пенообразование может быть проблематичным для процесса очистки воды, а накопление пены снижается за счет добавления в сточные воды поверхностно-активных веществ. ^[16]^[17]

Биоремедиация углеводородов

Почва Nocardiaceae может разлагать углеводороды (например, нефтяные дистилляты) и была предложена в качестве агентов биоремедиации при разливах окружающей среды. ^[18]

Изменения номенклатуры

В 1980-х годах все виды Nocardiaceae, отнесенные к роду Micropolyspora, были переведены в роды Nocardia или Nonomuraea семейства Streptosporangiaceae или Saccharopolyspora в семействе Pseudonocardiaceae . ^[19] Это фактически положило конец официальному статусу этого рода, но название сохранилось в старых исследовательских статьях.

Ссылки

^ Кастеллани А., Чалмерс А.Дж. (1919). Руководство по тропической медицине (3-е изд.). Нью-Йорк, штат Нью-Йорк: Уильямс, Вуд и Ко.
^ Эузеби Ж.П., Парте AC. « Нокардиевые » . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 25 июня 2022 г.
^ Стакебрандт, Э., Рейни, Ф.А. и Н.Л. Уорд-Рейни. 1997. Предложение о новой иерархической системе классификации Actinobacteria classis nov . Межд. Дж. Сист. Бактериол., 1997, 47 :479-491. Архивировано 15 мая 2011 г. в Wayback Machine.
^ Эйслаби, Дж. Экосистемные процессы в свободных ото льда ландшафтах Антарктики . «Бактерии, разлагающие углеводороды, в загрязненных нефтью почвах возле базы Скотт, Антарктида». Страница 257.
^ Кулич, С.М. и В.А. Паскуль. Окончательный диагноз: пневмония, внутригрудной лимфаденит и сепсис, вторичный по отношению к Rhodococcus equi . Медицинский факультет Питтсбургского университета. Проверено 20 октября 2007 г.
↑ Перейти обратно: Перейти обратно: ^а ^б Биттон, Г. Микробиология сточных вод . «Пенная микробиология». страница 229 .
↑ Перейти обратно: Перейти обратно: ^а ^б Людвиг, В.; Эзеби, Ж.; Шуман, П.; Буссе, HJR; Трухильо, Мэн; Кемпфер, П.; Уитмен, ВБ (2012). «Дорожная карта типа Actinobacteria». Руководство Берджи® по систематической бактериологии . п. 1. дои : 10.1007/978-0-387-68233-4_1 . ISBN 978-0-387-95043-3 .
↑ Перейти обратно: Перейти обратно: ^а ^б ^с Гао, Б.; Гупта, Р.С. (2012). «Филогенетическая основа и молекулярные признаки основных клад типа актинобактерий» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 76 (1): 66–112. дои : 10.1128/MMBR.05011-11 . ПМЦ 3294427 . ПМИД 22390973 .
^ Чжи, Х.-Ю.; Ли, В.-Дж.; Стакебрандт, Э. (2009). «Обновление структуры и определения высших рангов класса Actinobacteria на основе последовательности гена 16S рРНК с предложением двух новых подотрядов и четырех новых семейств, а также исправленными описаниями существующих высших таксонов» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 59 (3): 589–608. дои : 10.1099/ijs.0.65780-0 . ПМИД 19244447 .
^ Кастеллани, А. и А. Дж. Чалмерс. 1919. Руководство по тропической медицине , 3-е изд., Williams Wood and Co., Нью-Йорк, с. 1040.
^ Остин, Брайан и Дон А. Остин. 2016. Аэробные грамположительные палочки и кокки - представители Nocardiaceae в бактериальных патогенах рыб , Springer International Publishing, Швейцария, стр. 125-135.
^ Нокардия: серьезная проблема для коров . Изображения для презентации взяты с сайта:ids-images.ch. Проверено 20 октября 2007 г.
^ Блэколл, Л.Л., Тандои, В., Дженкинс, Д. 1991. Непрерывные исследования культуры Nocardia amarae из активного ила и их значение для контроля пенообразования Nocardia. Архивировано 20 мая 2011 г. в Wayback Machine Res. J. Загрязнение воды, продолжение. Фед. 63 :44-50.
^ Питт, П. и Д. Дженкинс. 1990. Причины и борьба с нокардией в активном иле. Архивировано 20 мая 2011 г. в Wayback Machine . Рез. J. Загрязнение воды, продолжение. Фед. 62 :143-150.
^ Блэколл, Л.Л., 1994. Микроорганизмы в процессах активного ила и биопленок. Архивировано 20 мая 2011 г. в Wayback Machine . Наука о воде. Технол. 29 :35-44.
^ Шао, Ю. Дж., Старр, М., Капорис, К., Ким, Х. С., Дженкинс, Д. 1997. Добавление полимера как решение проблем вспенивания Nocardia . Вода Энвиро. Рез., 69 :25-27.
^ Хо, К.Ф., Дженкинс, Д. 1991. Влияние поверхностно-активных веществ на вспенивание Nocardia в активном иле. Архивировано 20 мая 2011 г. в Wayback Machine . Наука о воде. Тех. 23 :879-887.
^ Эйслаби Дж., МакЛеод М. и Р. Фрейзер. Потенциал биоразложения углеводородов в почве Зависимости Росса, Антарктида . Прил. Микробиол. Биотехнология. 49 :210-214.
^ Микрополиспора в LPSN ; Парте, Эйдан К.; Сарда Карбасс, Хоаким; Мейер-Колтхофф, Ян П.; Реймер, Лоренц К.; Гёкер, Маркус (1 ноября 2020 г.). «Список названий прокариот, имеющих номенклатурное положение (ЛПСН), перемещается в ДСМЗ» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (11): 5607–5612. дои : 10.1099/ijsem.0.004332 .

[1] Кастеллани А., Чалмерс А.Дж. (1919). Руководство по тропической медицине (3-е изд.). Нью-Йорк, штат Нью-Йорк: Уильямс, Вуд и Ко.

[LPSN-2] Эузеби Ж.П., Парте AC. « Нокардиевые » . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 25 июня 2022 г.

[3] Стакебрандт, Э., Рейни, Ф.А. и Н.Л. Уорд-Рейни. 1997. Предложение о новой иерархической системе классификации Actinobacteria classis nov . Межд. Дж. Сист. Бактериол., 1997, 47 :479-491. Архивировано 15 мая 2011 г. в Wayback Machine.

[4] Эйслаби, Дж. Экосистемные процессы в свободных ото льда ландшафтах Антарктики . «Бактерии, разлагающие углеводороды, в загрязненных нефтью почвах возле базы Скотт, Антарктида». Страница 257.

[5] Кулич, С.М. и В.А. Паскуль. Окончательный диагноз: пневмония, внутригрудной лимфаденит и сепсис, вторичный по отношению к Rhodococcus equi . Медицинский факультет Питтсбургского университета. Проверено 20 октября 2007 г.

[foam-6] Перейти обратно: Перейти обратно: ^а ^б Биттон, Г. Микробиология сточных вод . «Пенная микробиология». страница 229 .

[Bergy-7] Перейти обратно: Перейти обратно: ^а ^б Людвиг, В.; Эзеби, Ж.; Шуман, П.; Буссе, HJR; Трухильо, Мэн; Кемпфер, П.; Уитмен, ВБ (2012). «Дорожная карта типа Actinobacteria». Руководство Берджи® по систематической бактериологии . п. 1. дои : 10.1007/978-0-387-68233-4_1 . ISBN 978-0-387-95043-3 .

[Gupta-8] Перейти обратно: Перейти обратно: ^а ^б ^с Гао, Б.; Гупта, Р.С. (2012). «Филогенетическая основа и молекулярные признаки основных клад типа актинобактерий» . Обзоры микробиологии и молекулярной биологии . 76 (1): 66–112. дои : 10.1128/MMBR.05011-11 . ПМЦ 3294427 . ПМИД 22390973 .

[IJSEM-9] Чжи, Х.-Ю.; Ли, В.-Дж.; Стакебрандт, Э. (2009). «Обновление структуры и определения высших рангов класса Actinobacteria на основе последовательности гена 16S рРНК с предложением двух новых подотрядов и четырех новых семейств, а также исправленными описаниями существующих высших таксонов» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 59 (3): 589–608. дои : 10.1099/ijs.0.65780-0 . ПМИД 19244447 .

[10] Кастеллани, А. и А. Дж. Чалмерс. 1919. Руководство по тропической медицине , 3-е изд., Williams Wood and Co., Нью-Йорк, с. 1040.

[11] Остин, Брайан и Дон А. Остин. 2016. Аэробные грамположительные палочки и кокки - представители Nocardiaceae в бактериальных патогенах рыб , Springer International Publishing, Швейцария, стр. 125-135.

[12] Нокардия: серьезная проблема для коров . Изображения для презентации взяты с сайта:ids-images.ch. Проверено 20 октября 2007 г.

[13] Блэколл, Л.Л., Тандои, В., Дженкинс, Д. 1991. Непрерывные исследования культуры Nocardia amarae из активного ила и их значение для контроля пенообразования Nocardia. Архивировано 20 мая 2011 г. в Wayback Machine Res. J. Загрязнение воды, продолжение. Фед. 63 :44-50.

[14] Питт, П. и Д. Дженкинс. 1990. Причины и борьба с нокардией в активном иле. Архивировано 20 мая 2011 г. в Wayback Machine . Рез. J. Загрязнение воды, продолжение. Фед. 62 :143-150.

[15] Блэколл, Л.Л., 1994. Микроорганизмы в процессах активного ила и биопленок. Архивировано 20 мая 2011 г. в Wayback Machine . Наука о воде. Технол. 29 :35-44.

[16] Шао, Ю. Дж., Старр, М., Капорис, К., Ким, Х. С., Дженкинс, Д. 1997. Добавление полимера как решение проблем вспенивания Nocardia . Вода Энвиро. Рез., 69 :25-27.

[17] Хо, К.Ф., Дженкинс, Д. 1991. Влияние поверхностно-активных веществ на вспенивание Nocardia в активном иле. Архивировано 20 мая 2011 г. в Wayback Machine . Наука о воде. Тех. 23 :879-887.

[18] Эйслаби Дж., МакЛеод М. и Р. Фрейзер. Потенциал биоразложения углеводородов в почве Зависимости Росса, Антарктида . Прил. Микробиол. Биотехнология. 49 :210-214.

[19] Микрополиспора в LPSN ; Парте, Эйдан К.; Сарда Карбасс, Хоаким; Мейер-Колтхофф, Ян П.; Реймер, Лоренц К.; Гёкер, Маркус (1 ноября 2020 г.). «Список названий прокариот, имеющих номенклатурное положение (ЛПСН), перемещается в ДСМЗ» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (11): 5607–5612. дои : 10.1099/ijsem.0.004332 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]