Тетранатрия трис(батофенантролиндисульфонат)рутений(II)
| |
| Идентификаторы | |
|---|---|
| Информационная карта ECHA | 100.120.143 |
| Номер ЕС |
|
Панель управления CompTox ( EPA )
|
|
| Характеристики | |
| С 72 Н 42 Н 6 Na 4 О 18 Ru S 6 | |
| Молярная масса | 1 664 .54 g·mol −1 |
Если не указано иное, данные приведены для материалов в стандартном состоянии (при 25 °C [77 °F], 100 кПа).
| |
Тетранатрия трис(батофенантролиндисульфонат)рутения(II) (Na 4 Ru(bps) 3 ) представляет собой натриевую соль координационного соединения . В этой форме это соль сульфоновой кислоты . Это соединение является продолжением фенантролина ряда координационных соединений . Трис(баттофенантролиндисульфонат) рутения(II), относящийся к анионному фрагменту, используется в качестве белкового красителя в биохимии для дифференциации и обнаружения различных белков в лабораторных условиях.
В последние годы 2-D электрофорез получил широкое признание в качестве стандартной процедуры разделения сложных смесей белков в исследованиях протеома ( протеомика ). Визуализация белков с помощью трис(батофентролина дисульфоната) рутения(II) стала прочно утвердившимся и широко используемым методом протеомного анализа. [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] [ 11 ] [ 12 ] [ 13 ] [ 14 ] [ 15 ] [ 16 ] и решающий шаг в профилировании экспрессии генов .
Для обнаружения белков выгодно использовать флуоресцентные метки, содержащие хромофоры , которые имеют большую длину волны возбуждения и длину волны излучения , чем ароматические аминокислоты . Красители, используемые на этом важном этапе, должны сочетать в себе такие свойства, как хорошее соотношение сигнал/фон (контраст), широкий линейный динамический диапазон, широкий диапазон применения, фотохимическую стабильность и совместимость с методами идентификации белков, например масс-спектрометрией (МС) или вестерн-блоттингом .
История
[ редактировать ]Первоначально рутения комплекс переходного металла , трис(4,7-дифенил-1,10-фенантролиндисульфонат) рутения(II), также известный как трис( батофентролина дисульфонат ) рутения(II) ( RuBPS ), был синтезирован Баннвартом. [ 17 ] в качестве предшественника красителя, который использовался в качестве нерадиоактивной метки для олигонуклеотидов молекулы - . [ 18 ] В течение 5 лет подобные комплексы переходных металлов были признаны эффективными реагентами для обнаружения белков. [ 19 ] и вскоре после этого европиевый аналог RuBPS был продемонстрирован как эффективный реагент для обнаружения флуоресцентных белков. [ 20 ] Первым зарегистрированным использованием RuBPS для обнаружения белков стал коммерческий выпуск запатентованного раствора для окрашивания белков Sypro Ruby в 1999 году. [ 21 ] [ 22 ] Хотя Sypro Ruby является собственностью компании и не указано, что RuBPS является его основным компонентом, утверждается, что он содержит рутений, а Rabilloud et al. синтезировали RuPBS и сравнили его с Sypro Ruby, обнаружив, что они очень похожи, хотя и не идентичны, реагенты для флуоресцентного обнаружения белков в полиакриламидных гелях . [ 21 ] [ 23 ] Примечательно, что Rabilloud et al. провели сравнение с первым составом Sypro Ruby, второй (и предположительно текущий) состав Sypro Ruby имеет те же номера продуктов (но разные номера партий) и повышенную эффективность при использовании различных фиксирующих растворов. [ 24 ] [ 25 ]
Тот факт, что RuBPS не только легко синтезировать, но и легко обрабатывать, стимулировал дальнейшие разработки в этой области.
Текущие разработки
[ редактировать ]Ламанда и др. RuBPS улучшил протокол окрашивания за счет избирательного обесцвечивания полиакриламидной матрицы, в то время как содержание белка оставалось неизмененным . Этот новый метод повлек за собой множество преимуществ, таких как сильные сигналы, улучшенное соотношение сигнал/фон, лучшая линейность и улучшенное разрешение базовой линии. [ 25 ] Совсем недавно было показано, что гетеролептические комплексы рутения (II), очень похожие на RuBPS, обладают некоторыми улучшенными свойствами, в частности, более широким диапазоном pH, в котором их можно использовать. [ 26 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Миллер, И.; Кроуфорд, Дж.; Джанацца, Э. (октябрь 2006 г.). «Белковые красители для протеомных применений: какие, когда, почему ?» . Протеомика . 6 (20): 5385–5408. дои : 10.1002/pmic.200600323 . ПМИД 16991193 . S2CID 27311378 .
- ^ Брайборн, Малин; Аднер, Микаэль; Карделл, Ларс-Олаф (2005). «Псориазин, один из нескольких новых белков, идентифицированных в промывной жидкости носа у людей с аллергией и без аллергии с помощью двумерного гель-электрофореза и масс-спектрометрии» . Респираторные исследования . 6 (1): 118. дои : 10.1186/1465-9921-6-118 . ПМЦ 1282590 . ПМИД 16236163 .
- ^ Клерк, Анджела; Каллингфорд, Тимоти Э.; Кемп, Тимоти Дж.; Кеннеди, Роберт А.; Сагден, Питер Х. (2005). «Регуляция экспрессии генов и белков при гипертрофии и апоптозе сердечных миоцитов». Достижения в регуляции ферментов . 45 (1): 94–111. дои : 10.1016/j.advenzreg.2005.02.007 . ПМИД 16084574 .
- ^ Шаллер, А.; Троллер, Р.; Молина, Д.; Галлати, С.; Эби, К.; Штуцманн Мейер, П. (январь 2006 г.). «Быстрое типирование субпопуляций Moraxella cataralis на основе белков внешней мембраны с использованием масс-спектрометрии». Протеомика . 6 (1): 172–180. дои : 10.1002/pmic.200500086 . ПМИД 16317771 . S2CID 1626277 .
- ^ Стасик Т.; Моранделл, С.; Бакри, Р.; Фейерштейн, И.; Хак, CW; Стечер, Г.; Бонн, Греция; Хубер, Луизиана (июль 2005 г.). «Количественное обнаружение фосфопротеинов путем сочетания двумерного разностного гель-электрофореза и фосфоспецифического флуоресцентного окрашивания». Электрофорез . 26 (14): 2850–2854. дои : 10.1002/elps.200500026 . ПМИД 15966015 . S2CID 21102274 .
- ^ Бергер, К.; Виссманн, Д.; Ихлинг, К.; Калькхоф, С.; Бек-Сикингер, А.; Синц, А.; Пашке, Р.; Фюрер Д. (ноябрь 2004 г.). «Количественный анализ протеома при доброкачественной узловой болезни щитовидной железы с использованием флуоресцентного окрашивания трис (баттофенантролин дисульфонатом) рутения II». Молекулярная и клеточная эндокринология . 227 (1–2): 21–30. дои : 10.1016/j.mce.2004.08.001 . ПМИД 15501581 . S2CID 1622208 .
- ^ Горг, А.; Вайс, В.; Данн, MJ (декабрь 2004 г.). «Современная технология двумерного электрофореза для протеомики». Протеомика . 4 (12): 3665–3685. дои : 10.1002/pmic.200401031 . ПМИД 15543535 . S2CID 28594824 .
- ^ Смейкал, ГБ; Робинсон, Миннесота; Лазарев А. (август 2004 г.). «Сравнение флуоресцентных окрасок: относительная фотостабильность и дифференциальное окрашивание белков в двумерных гелях». Электрофорез . 25 (15): 2511–2519. дои : 10.1002/elps.200406005 . ПМИД 15300770 . S2CID 1163843 .
- ^ Джунка, Х.; Плюмейер, И.; Хехт, HJR; Пипер, Д.Х. (декабрь 2004 г.). «Различие в кинетическом поведении вариантов катехол-2,3-диоксигеназы в загрязненной среде» . Микробиология . 150 (12): 4181–4187. дои : 10.1099/mic.0.27451-0 . ПМИД 15583170 .
- ^ Тан, HY; Спайчер, Д.В. (июнь 2005 г.). «Сложное префракционирование протеома с использованием изоэлектрофокусирования микромасштабного раствора». Экспертное обозрение по протеомике . 2 (3): 295–306. дои : 10.1586/14789450.2.3.295 . ПМИД 16000077 . S2CID 38064911 .
- ^ Пиетт, Эндрю; Деруо, Аделина; Геркенс, Паскаль; Ноенс, Эльке Э.Э.; Маццучелли, Габриэль; Вион, Себастьян; Кертен, Хенк К.; Титгемейер, Фриц; Павлин, Эдвин; Лепренс, Пьер; ван Везель, Жиль П.; Галлени, Морено; Ригали, Себастьян (2005). «От спящих к прорастающим спорам Streptomyces coelicolor A3 (2): новые перспективы от нулевого мутанта crp ». Журнал исследований протеома . 4 (5): 1699–1708. дои : 10.1021/pr050155b . hdl : 1887/3239397 . ПМИД 16212423 .
- ^ Кваглино, Даниэла; Боральди, Федерика; Бини, Лука; Вольпи, Никола (апрель 2004 г.). «Белковый профиль фибробластов: роль протеомики». Современная протеомика . 1 (2): 167. дои : 10.2174/1570164043379424 .
- ^ Хьерно, К.; Альм, Р.; Канбек, БР; Маттисен, Р.; Трайковский, К.; Бьорк, Л.; Ропсторф, П.; Эмануэльссон, К. (2006). «Понижение уровня клубничного гомологичного аллергена Bet v 1 в сочетании с путем биосинтеза флавоноидов у бесцветного мутанта клубники» . Протеомика . 6 (5): 1574–1587. дои : 10.1002/pmic.200500469 . ПМИД 16447153 . S2CID 29423198 .
- ^ Гербер, Исак Б.; Лаукенс, Крис; Уиттерс, Эрвин; Дубери, Ян А. (2006). «Липополисахарид-чувствительные фосфопротеины в клетках Nicotiana tabacum ». Физиология и биохимия растений . 44 (5–6): 369–379. дои : 10.1016/j.plaphy.2006.06.015 . ПМИД 16889970 .
- ^ Шевалле, М.; Димер, HLN; Луче, С.; Ван Дорселер, А.; Рабиллуд, Т.; Лейзе-Вагнер, Э. (2006). «Улучшенная совместимость масс-спектрометрии обеспечивается окрашиванием аммиачным серебром» . Протеомика . 6 (8): 2350–2354. arXiv : q-bio/0611083 . Бибкод : 2006q.bio....11083C . дои : 10.1002/pmic.200500567 . ПМК 2797540 . ПМИД 16548061 .
- ^ Ламанда, Андреас; Чеайб, Зейнаб; Тургут, Мелек Дилек; Лусси, Адриан (2007). Имхоф, Аксель (ред.). «Буферизация белков в модельных системах и в слюне человека» . ПЛОС ОДИН . 2 (2): е263. Бибкод : 2007PLoSO...2..263L . дои : 10.1371/journal.pone.0000263 . ПМК 1803027 . ПМИД 17327922 .
- ^ «Архивная копия» . Архивировано из оригинала 15 мая 2007 г. Проверено 26 апреля 2007 г.
{{cite web}}: CS1 maint: архивная копия в заголовке ( ссылка ) - ^ Баннварт, В.; Шмидт, Д.; Сталлард, РЛ; Хорнунг, К.; Норр, Р.; Мюллер, Ф. (декабрь 1988 г.). «Комплексы батофенантролина-рутения (II) как нерадиоактивные метки для олигонуклеотидов, которые можно измерить с помощью методов флуоресценции с временным разрешением». Helvetica Chimica Acta . 71 (8): 2085. doi : 10.1002/hlca.19880710826 .
- ^ Паттон, ВФ; Лам, Л.; Су, К.; Луи, М.; Эрдьюментбромаж, Х.; Темпст, П. (1994). «Хелаты металлов как обратимые красители для обнаружения электроблоттинговых белков: применение к микросеквенированию белков и иммуноблоттингу» . Аналитическая биохимия . 220 (2). Эльзевир Б.В.: 324–335. дои : 10.1006/abio.1994.1345 . ISSN 0003-2697 . ПМИД 7526738 . S2CID 24405621 .
- ^ Лим, Марк Дж.; Паттон, Уэйн Ф.; Лопес, Мэри Ф.; Споффорд, Кимберли Х.; Шоджаи, Негин; Шепро, Дэвид (1997). «Люминесцентный комплекс европия для чувствительного обнаружения белков и нуклеиновых кислот, иммобилизованных на мембранных носителях» . Аналитическая биохимия . 245 (2). Эльзевир Б.В.: 184–195. дои : 10.1006/abio.1996.9961 . ISSN 0003-2697 . ПМИД 9056210 .
- ^ Jump up to: а б Берггрен, Кира; Стейнберг, Томас Х.; Лаубер, Венди М.; Кэрролл, Джеймс А.; Лопес, Мэри Ф.; Чернокальская, Елена; Зиеске, Линн; Диу, Чжэньцзюнь; Хогланд, Ричард П.; Паттон, Уэйн Ф. (1999). «Люминесцентный рутениевый комплекс для сверхчувствительного обнаружения белков, иммобилизованных на мембранных носителях». Аналитическая биохимия . 276 (2). Эльзевир Б.В.: 129–143. дои : 10.1006/abio.1999.4364 . ISSN 0003-2697 . ПМИД 10603235 .
- ^ Стейнберг, Томас Х.; Чернокальская, Елена; Берггрен, Кира; Лопес, Мэри Ф.; Диу, Чжэньцзюнь; Хогланд, Ричард П.; Паттон, Уэйн Ф. (1 февраля 2000 г.). «Сверхчувствительное обнаружение флуоресцентных белков в изоэлектрофокусирующих гелях с использованием окрашивания хелатом металлического рутения». Электрофорез . 21 (3). Уайли: 486–496. doi : 10.1002/(sici)1522-2683(20000201)21:3<486::aid-elps486>3.0.co;2-q . ISSN 0173-0835 . ПМИД 10726748 . S2CID 36787237 .
- ^ «Протеом — полный текст DOI 10.1007/S102160000002» . дои : 10.1007/S102160000002 . S2CID 98713308 . Архивировано из оригинала 29 мая 2011 г. Проверено 26 апреля 2007 г.
{{cite journal}}: Для цитирования журнала требуется|journal=( помощь ) - ^ Берггрен, Кира Н.; Шуленберг, Бирте; Лопес, Мэри Ф.; Стейнберг, Томас Х.; Богданова Алла; Смейкал, Гэри; Ван, Энни; Паттон, Уэйн Ф. (2002). «Улучшенный состав гелевого геля SYPRO Ruby: сравнение с исходным составом и составом трис (дисульфоната рутения II)» . Протеомика . 2 (5). Уайли: 486–498. doi : 10.1002/1615-9861(200205)2:5<486::aid-prot486>3.0.co;2-x . ISSN 1615-9853 . ПМИД 11987123 . S2CID 23902055 .
- ^ Jump up to: а б Ламанда, А.; Зан, А.; Рёдер, Д.; Ланген, Х. (март 2004 г.). «Улучшенный протокол окрашивания и обесцвечивания трис (батофенантролиндисульфонатом) рутения II для лучшего соотношения сигнала к фону и улучшения разрешения базовой линии». Протеомика . 4 (3): 599–608. дои : 10.1002/pmic.200300587 . ПМИД 14997483 . S2CID 26442102 .
- ^ Бабак Мария Владимировна; Ле Фаудер, Полина; Тривелли, Ксавье; Венкатесан, Гопалакришнан; Беззубов Станислав Игоревич; Каджут, Мохаммед; Гущин Артем Л.; Ханиф, Мухаммед; Пуаза, Оливье; Везин, Эрве; Роландо, Кристиан (17 марта 2020 г.). «Гетеролептические комплексы рутения (II) с батофенантролином и динатриевой солью дисульфоната батофенантролина в качестве флуоресцентных красителей для окрашивания белков в геле». Неорганическая химия . 59 (7). Американское химическое общество (ACS): 4527–4535. doi : 10.1021/acs.inorgchem.9b03679 . ISSN 0020-1669 . ПМИД 32181663 . S2CID 212739460 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]Более подробную информацию об окрашивании трис(батофенантролиндисульфонатом) рутения(II) можно найти на сайте [1].