Atribacterota
| Atribacterota | |
|---|---|
| |
| Морфология и мембранная структура в атрибактере Ламинат (тип штамм RT761) | |
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| Суперфилум: | |
| Филум: | Atribacterota Катаяма 2021 [ 1 ]
|
| Синонимы | |
| |
Atribacterota представляет собой тип бактерий , который распространен в аноксических отложениях , богатых метаном . Они распределены по всему миру, а в некоторых случаях обильны в анаэробных морских отложениях, геотермальных источниках и отложениях нефти . Генетический анализ предполагает гетеротрофический метаболизм , который дает рост продуктов ферментации , таких как ацетат , этанол и CO 2 . Эти продукты, в свою очередь, могут поддерживать метаногены в микробном сообществе отложений и объяснять частое возникновение атрибактероты в богатых метановых аноксических отложениях. [ 2 ] [ 3 ] Согласно филогенетическому анализу, Atribacterota, по -видимому, связана с несколькими термофильными филами в террарабактериях [ 4 ] или может быть в основе грациликутов . [ 5 ] Согласно исследованию, Atribacterota показывает закономерности экспрессии генов, которые состоит из ферментативного ацетогенного метаболизма. Эти выражения позволяют Atribacterota создавать катаболические и анаболические функции, которые необходимы для генерации клеточного воспроизведения, даже когда уровни энергии ограничены из -за истощения растворенного кислорода в областях морских вод, свежих вод или грунтовых вод. [ 6 ]
Таксономия
[ редактировать ]Национальный центр информации о биотехнологии (NCBI) [ 7 ] Таксономия и список прокариотических имен с стоянием в номенклатуре (LPSN) [ 8 ] были использованы в качестве основного таксономического органа для установления приоритетов именования. Также Annotree , сайт [ 9 ] который использует выпуск GTDB 06-RS202. [ 10 ] консультировался.
- Класс Atribacteria Katayama et al. 2021
- Порядок Atribacterales Katayama et al. 2021
- Семейство Atribacteraceae Katayama et al. 2021
- Класс Attribacter Katayama et al. 2021
- Виды A. Laminatus Katayama et al. 2021
- Класс Attribacter Katayama et al. 2021
- Семейство " Caldatribacteriaceae "
- Род " Candidatus caldatribacterium " Dodsworth et al. 2013
- Вид " Ca. C. Californiense" Corrig. Dodsworth et al. 2013
- Виды " Ca. C. Saccharofermentans" Dodsworth et al. 2013
- Род " Candidatus caldatribacterium " Dodsworth et al. 2013
- Семейство Atribacteraceae Katayama et al. 2021
- Порядок Atribacterales Katayama et al. 2021
Смотрите также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Орен А, Гаррити Г.М. (2021). «Действительная публикация названий сорока двух фил прокариот» . Int J Syst Evol Microbiol . 71 (10): 5056. doi : 10.1099/ijsem.0.005056 . PMID 34694987 . S2CID 239887308 .
- ^ Nobu, MK, Dodsworth, JA, Murugapiran, SK, Rinke, C., Gies, EA, Webster, G., ... & Jørgensen, BB (2016) Филогения и физиология кандидата Phylum 'Atribacteria' (Op9/JS1 ) выводится из независимой от культивирования геномики . Журнал ISME, 10 (2), 273-286.
- ^ Carr, SA, Orcutt, BN, Mandernack, KW, & Spear, Jr (2015). Обильные атрибактерии в глубоких морских отложениях из бассейна Адели, Антарктида . Границы в микробиологии, 6.
- ^ Кристиан Ринке и др. 2013. Понимание филогения и потенциала кодирования микробной темной материи. Природа Том: 499, Страницы: 431–437 doi: 10.1038/nature12352
- ^ Hug, La et al. 2016, новый взгляд на дерево жизни . Природная микробиология, 1, 16048.
- ^ Vuillemin, Aurèle; Варгас, Серхио; Coskun, ömer K.; Покални, Роберт; Мюррей, Ричард В.; Смит, Дэвид С.; Д'Андт, Стивен; Орси, Уильям Д. (2020-07-11). «Atribacteria, размножаясь за миллионы лет в подводной подводной подводной области Атлантического абиссала» . Мбио . 11 (5). Biorxiv 10.1101/2020.07.10.198200 . doi : 10.1128/mbio.01937-20 . PMC 7542362 . PMID 33024037 .
- ^ Sayers; и др. "Atribacterota" . Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) База данных таксономии . Получено 2021-03-20 .
- ^ JP Euzéby. "Atribacterota" . Список прокариотических имен с стоянием в номенклатуре (LPSN) . Получено 2021-06-27 .
- ^ Мендлер, К; Чен, ч; Парки, DH; Объятие, LA; Доксей, AC (2019). «Annotree: визуализация и исследование функционально аннотированного микробного дерева жизни» . Исследование нуклеиновых кислот . 47 (9): 4442–4448. doi : 10.1093/nar/gkz246 . PMC 6511854 . PMID 31081040 . Архивировано из оригинала 2021-04-23 . Получено 2021-07-15 .
- ^ "GTDB Release 06-RS202" . База данных таксономии генома .
 | Эта статья, связанная с бактериями, является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |