Глобальная коалиция биоданных

Глобальная коалиция биоданных – это организация, продвигающая биокурирование и способствующая поддержке спонсоров исследований для обеспечения устойчивости ресурсов биологических данных . ^[1]^[2]^[3]

Глобальные основные ресурсы биоданных (GCBR)

Организация ведет список ресурсов, представляющих «важнейшие компоненты для обеспечения воспроизводимости и целостности исследований в области наук о жизни». ^[4]

По состоянию на 2023 год в список входят следующие организации: ^[5]

Альянс геномных ресурсов
БакДайв
BAR: Биоаналитический ресурс по биологии растений
Бги
БРЕНДА
Каталог жизни (COL)
База данных CATH
Целлозавр
ЧЭБИ
ЧЕМБЛ
CIViC: Клиническая интерпретация вариантов рака
Ресурс клинического генома (ClinGen)
Банк данных ДНК Японии (Центр DDBJ)
ЭкоЦик
Вместе
Европа ЧВК
Европейский архив нуклеотидов (ENA)
FlyBase
ГЕНКОД
Генная онтология (GO)
Глобальный информационный фонд по биоразнообразию (GBIF)
База данных агрегации геномов (gnomAD)
Архив геномных последовательностей (GSA)
Каталог NHGRI-EBI исследований ассоциаций по всему геному человека ( Каталог GWAS )
База данных экспрессии генов (GXD)
HGNC: Комитет по генной номенклатуре HUGO
человека База знаний онтологии болезней (DO-KB)
Атлас человеческого белка
IMEx: Международный консорциум молекулярного обмена
ИнтерПро
Руководство IUPHAR/BPS по ФАРМАКОЛОГИИ
ЛИПИДНЫЕ КАРТЫ
LPSN : Список названий прокариот, имеющих место в номенклатуре.
MGD: База данных генома мыши
Орфадата Наука
ПАНТЕРА
ФармГКБ : База знаний по фармакогеномике
Плантеом (включая онтологию растений )
PomBase
Банк данных белков (PDB)
Консорциум ProteomeXchange
База данных генома крыс (RGD)
Реактом
Рея
База данных геномов сахаромицетов (SGD)
СИЛЬВА
НИТЬ
Браузер генома UCSC
ЮниПрот
ВЕуПатДБ
Червячная база
ZFIN: Информационная сеть данио

Ссылки

^ Кук, Чак; Кокрейн, Гай (08 сентября 2023 г.). «Глобальная коалиция биоданных: на пути к устойчивой инфраструктуре биоданных» . Информатика и стандарты в области биоразнообразия . 7 . дои : 10.3897/biss.7.112303 . ISSN 2535-0897 . Архивировано из оригинала 11 декабря 2023 г. Проверено 11 декабря 2023 г.
^ «Глобальная коалиция по биоданным: Белая книга по стратегиям открытых данных» . РДА . 27 ноября 2023 г. Архивировано из оригинала 11 декабря 2023 г. Проверено 11 декабря 2023 г.
^ «Глобальная коалиция биоданных координирует всемирное финансирование ресурсов данных» . Genome.gov . Архивировано из оригинала 11 декабря 2023 г. Проверено 11 декабря 2023 г.
^ «GBIF назвал глобальным основным ресурсом биоданных» . www.gbif.org . Архивировано из оригинала 11 декабря 2023 г. Проверено 11 декабря 2023 г.
^ «Список текущих глобальных основных ресурсов биоданных» . Глобальная коалиция по биоданным . Архивировано из оригинала 11 декабря 2023 г. Проверено 11 декабря 2023 г.

Внешние ссылки

Официальный сайт. Архивировано 8 декабря 2023 г. на Wayback Machine.

[1] Кук, Чак; Кокрейн, Гай (08 сентября 2023 г.). «Глобальная коалиция биоданных: на пути к устойчивой инфраструктуре биоданных» . Информатика и стандарты в области биоразнообразия . 7 . дои : 10.3897/biss.7.112303 . ISSN 2535-0897 . Архивировано из оригинала 11 декабря 2023 г. Проверено 11 декабря 2023 г.

[2] «Глобальная коалиция по биоданным: Белая книга по стратегиям открытых данных» . РДА . 27 ноября 2023 г. Архивировано из оригинала 11 декабря 2023 г. Проверено 11 декабря 2023 г.

[3] «Глобальная коалиция биоданных координирует всемирное финансирование ресурсов данных» . Genome.gov . Архивировано из оригинала 11 декабря 2023 г. Проверено 11 декабря 2023 г.

[4] «GBIF назвал глобальным основным ресурсом биоданных» . www.gbif.org . Архивировано из оригинала 11 декабря 2023 г. Проверено 11 декабря 2023 г.

[5] «Список текущих глобальных основных ресурсов биоданных» . Глобальная коалиция по биоданным . Архивировано из оригинала 11 декабря 2023 г. Проверено 11 декабря 2023 г.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]