Актиномицеталы

Актиномицеталы
	Сканирующая электронная микрофотография Actinomyces israelii .
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Актиномицетота
Сорт:	Актиномицетия
Заказ:	Актиномицеталы ; Бьюкенен 1917 г. (утвержденные списки 1980 г.)
Типовой род
	Актиномицеты ; Гарц 1877 г. (утвержденные списки 1980 г.)
Семьи
	Актиномицетовые ;
Синонимы
	«Actinobacteriales» Прево, 1946 г. ; Actinomycetineae Stackebrandt, Рейни и Уорд-Рейни, 1997 г. ;

Actinomycetales — отряд Actinomycetota . Члена отряда часто называют актиномицетом . Actinomycetales обычно являются грамположительными и анаэробными и имеют мицелий в виде нитчатого и ветвящегося типа роста. Некоторые актиномицеты могут образовывать палочковидные или кокковидные формы, другие — образовывать споры на воздушных гифах . Бактерии Actinomycetales могут быть заражены бактериофагами , которые называются актинофагами. Actinomycetales могут варьироваться от безвредных бактерий до патогенов, устойчивых к антибиотикам.

Воспроизведение

Актиномицеталы имеют две основные формы размножения: образование спор и фрагментацию гиф. В процессе размножения Actinomycetales могут образовывать конидиеносцы , спорангиоспоры и оидиоспоры. При размножении посредством фрагментации гиф гифы, образуемые Actinomycetales, могут быть в пять-два раза меньше грибных гиф и нести длинные цепочки спор.

Присутствие и ассоциации

Актиномицеталы можно найти в основном в почве и разлагающихся органических веществах, а также в живых организмах, таких как люди и животные. Они образуют симбиотические азотфиксирующие ассоциации с более чем 200 видами растений, а также могут служить стимуляторами роста или агентами биоконтроля или вызывать заболевания у некоторых видов растений. Actinomycetales можно обнаружить в урогенитальном тракте человека, а также в пищеварительной системе, включая ротовую полость, горло и желудочно-кишечный тракт, в форме Helicobacter, не вызывая заболевания у хозяина. Они также имеют широкое медицинское и ботаническое применение и используются в качестве источника многих антибиотиков и пестицидов .

Антимикробные свойства

Многие виды актиномицетов продуцируют противомикробные соединения при определенных условиях и питательной среде. Стрептомицин , актиномицин и стрептотрицин являются важными с медицинской точки зрения антибиотиками, выделенными из бактерий Actinomycetes. ^[3] Почти две трети используемых в настоящее время природных противомикробных лекарственных соединений производятся различными видами актиномицетов. ^[4]

Филогения

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). ^[2] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) ^[5]

Полногеномная филогения ^[6]

на основе 16S рРНК ДП _08_2023 ^[7]^[8]^[9]

120 маркерных белков на основе GTDB 08-RS214 ^[10]^[11]^[12]

Кинеоспориалы	Кинеоспориевые [вкл. «Кинеококковые»; «Квадрисфаеровые»]

Аквипурибактерии	Аквипурибактериальные

Актиномицеталы

	Руаниевые

	Актиномицетовые [вкл. Арканобактерии ]

Микрококки

Актиномицеталы

Кинеоспории

	Кинеоспориевые

	«Кинеококковые»

«Квадрисфаеровые»

	«Ангустибактериальные»

	Дерматофильные [в т.ч. Аквипурибактериальные ; Мышьяковикокковые ; дермакокковые ; Китококковые ; орнитинимикробиевые ; Внутриспорангиевые ]

Актиномицетиновые

Демекиновые

Cellulomonadaceae [вкл. актиноталовые ; Джонсийные ; Орсковиевые ; промикромоноспоровые ; Раробактеры ; Сангвибактериальные ]

	Беутенбергиевые [вкл. Руаниевые ]

	Актиномицетовые [вкл. арканобактерии ; Богориелловые ]

Микрококцинии

Дермабактерии

	Бревибактерии

	Микрококковые [в т.ч. Яниелловые ]

	Бифидобактерии

	Микробактерии [в т.ч. Троферимовые ]

См. также

Ссылки

^ Бьюкенен Р.Э. (1917). «Исследования по номенклатуре и классификации бактерий: II. Первичные подразделения шизомицетов » . J Бактериол . 2 : 155–164. дои : 10.1128/jb.2.2.155-164.1917 . ПМК 378699 . ПМИД 16558735 .
^ Jump up to: ^а ^б АС Парте; и др. «Актиномицеталы» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 9 сентября 2023 г.
^ Ваксман, Сельман А.; Шац, Альберт; Рейнольдс, Дональд М. (декабрь 2010 г.). «Продукция антибиотических веществ актиномицетами» . Анналы Нью-Йоркской академии наук . 1213 (1): 112–124. дои : 10.1111/j.1749-6632.2010.05861.x . ПМИД 21175680 .
^ Бентли, Южная Дакота; Чейтер, К.Ф.; Серденьо-Таррага, А.-М.; Чаллис, GL; Томсон, Северная Каролина; Джеймс, К.Д.; Харрис, Делавэр; Перепел, Массачусетс; Кизер, Х.; Харпер, Д.; Бейтман, А.; Браун, С.; Чандра, Г.; Чен, CW; Коллинз, М.; Кронин, А.; Фрейзер, А.; Гобл, А.; Идальго, Дж.; Хорнсби, Т.; Ховарт, С.; Хуанг, Ч.-Х.; Кизер, Т.; Ларк, Л.; Мерфи, Л.; Оливер, К.; О'Нил, С.; Раббинович, Э.; Раджандрим, Массачусетс; Резерфорд, К.; Раттер, С.; Сигер, К.; Сондерс, Д.; Шарп, С.; Квадраты, Р.; Квадраты, С.; Тейлор, К.; Уоррен, Т.; Витзоррек, А.; Вудворд, Дж.; Баррелл, Б.Г.; Паркхилл, Дж.; Хопвуд, Д.А. (9 мая 2002 г.). «Полная последовательность генома модельного актиномицета Streptomyces coelicolor A3 (2)» . Природа . 417 (6885): 141–147. дои : 10.1038/417141a . ПМИД 12000953 .
^ Сэйерс; и др. «Актиномицеталы» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 9 сентября 2023 г.
^ Нуиуи И, Карро Л., Гарсиа-Лопес М., Мейер-Колтхофф Дж.П., Войк Т., Кирпидес Н.К., Пукалл Р., Кленк Х.П., Гудфеллоу М., Маркус Гёкер М. (2018). «Геномная таксономическая классификация рода актинобактерий » . Передний. Микробиол . 9 : 2007. doi : 10.3389/fmicb.2018.02007 . ПМК 6113628 . ПМИД 30186281 .
^ «ЛТП» . Проверено 20 ноября 2023 г.
^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 20 ноября 2023 г.
^ «Примечания к выпуску LTP_08_2023» (PDF) . Проверено 20 ноября 2023 г.
^ «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
^ "bac120_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[1] Бьюкенен Р.Э. (1917). «Исследования по номенклатуре и классификации бактерий: II. Первичные подразделения шизомицетов » . J Бактериол . 2 : 155–164. дои : 10.1128/jb.2.2.155-164.1917 . ПМК 378699 . ПМИД 16558735 .

[LPSN-2] Jump up to: ^а ^б АС Парте; и др. «Актиномицеталы» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 9 сентября 2023 г.

[3] Ваксман, Сельман А.; Шац, Альберт; Рейнольдс, Дональд М. (декабрь 2010 г.). «Продукция антибиотических веществ актиномицетами» . Анналы Нью-Йоркской академии наук . 1213 (1): 112–124. дои : 10.1111/j.1749-6632.2010.05861.x . ПМИД 21175680 .

[4] Бентли, Южная Дакота; Чейтер, К.Ф.; Серденьо-Таррага, А.-М.; Чаллис, GL; Томсон, Северная Каролина; Джеймс, К.Д.; Харрис, Делавэр; Перепел, Массачусетс; Кизер, Х.; Харпер, Д.; Бейтман, А.; Браун, С.; Чандра, Г.; Чен, CW; Коллинз, М.; Кронин, А.; Фрейзер, А.; Гобл, А.; Идальго, Дж.; Хорнсби, Т.; Ховарт, С.; Хуанг, Ч.-Х.; Кизер, Т.; Ларк, Л.; Мерфи, Л.; Оливер, К.; О'Нил, С.; Раббинович, Э.; Раджандрим, Массачусетс; Резерфорд, К.; Раттер, С.; Сигер, К.; Сондерс, Д.; Шарп, С.; Квадраты, Р.; Квадраты, С.; Тейлор, К.; Уоррен, Т.; Витзоррек, А.; Вудворд, Дж.; Баррелл, Б.Г.; Паркхилл, Дж.; Хопвуд, Д.А. (9 мая 2002 г.). «Полная последовательность генома модельного актиномицета Streptomyces coelicolor A3 (2)» . Природа . 417 (6885): 141–147. дои : 10.1038/417141a . ПМИД 12000953 .

[NCBI-5] Сэйерс; и др. «Актиномицеталы» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 9 сентября 2023 г.

[Nouioui-6] Нуиуи И, Карро Л., Гарсиа-Лопес М., Мейер-Колтхофф Дж.П., Войк Т., Кирпидес Н.К., Пукалл Р., Кленк Х.П., Гудфеллоу М., Маркус Гёкер М. (2018). «Геномная таксономическая классификация рода актинобактерий » . Передний. Микробиол . 9 : 2007. doi : 10.3389/fmicb.2018.02007 . ПМК 6113628 . ПМИД 30186281 .

[LTP-7] «ЛТП» . Проверено 20 ноября 2023 г.

[8] «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 20 ноября 2023 г.

[9] «Примечания к выпуску LTP_08_2023» (PDF) . Проверено 20 ноября 2023 г.

[about-10] «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[tree-11] "bac120_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[taxon_history-12] «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]