Индекс аналитического профиля

Система обнаружения API 20NE после 24 часов инкубации.

Индекс аналитического профиля , или API , представляет собой классификацию , бактерий основанную на биохимических тестах. Система была разработана для ускорения выявления клинически значимых бактерий. Его можно использовать только для идентификации известных видов по индексу. ^{[ 1 ]}

История

Индекс аналитического профиля (API) был изобретен в 1970-х годах в США Пьером Жаненом из Analytab Products Inc. ^{[ 2 ]} Тест-система API в настоящее время производится компанией bioMérieux . ^{[ 3 ]} В линейке API представлены стандартизированные и миниатюрные версии существующих методов, которые считались сложными в исполнении и трудными для чтения.

Описание

Идентификация возможна только с помощью микробиологической культуры . Тест-полоски API состоят из лунок, содержащих обезвоженные субстраты, такие как окислительно-восстановительные субстраты, электрогенные субстраты и люминогенные субстраты, для определения ферментативной активности , обычно связанной с ферментацией углеводов или катаболизмом белков или аминокислот инокулированными организмами. Бактериальную суспензию используют для регидратации каждой лунки, а стрипы инкубируют. Во время инкубации метаболизм вызывает изменения цвета, которые либо носят спонтанный характер, либо выявляются при добавлении реагентов. Например, при ферментации углеводов pH внутри лунки снижается, на что указывает изменение цвета индикатора pH. Все результаты тестов компилируются для получения номера профиля, который затем сравнивается с номерами профилей в коммерческой кодовой книге (или в Интернете) для определения вида бактерий. ^{[ 4 ]}

API-20E

Прежде чем начать тест, необходимо подтвердить, что культивируемые бактерии относятся к Enterobacteriaceae, это делается с помощью быстрого оксидазного теста на цитохром коксидазу . Энтеробактерии обычно оксидазо-отрицательны, то есть они либо не используют кислород в качестве акцептора электронов в цепи переноса электронов , либо используют другой цитохромный фермент для передачи электронов к кислороду. ^{[ 5 ]} Если культура признана оксидазо-положительной, необходимо провести альтернативные тесты для правильной идентификации вида бактерий. API-20E специфичен для дифференциации представителей грамотрицательных бактерий семейства Enterobacteriaceae . ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Другая система API, API-Staph, специфична для грамположительных бактерий , включая виды Staphylococcus , виды Micrococcus и родственные организмы. ^{[ 7 ]}

API 20E/НЭ

Система API 20E/NE — это широко используемая биохимическая тест-система, предназначенная для быстрой идентификации грамотрицательных бактерий. Он конкретно нацелен на две группы: энтеробактерии (API 20E) и неэнтеробактерии (API 20NE). Эта система особенно полезна в клинической микробиологии и исследованиях окружающей среды для идентификации бактерий на основе их биохимической активности.

Как это работает:

Тест-полоски: Система состоит из пластиковой полоски, содержащей 20 небольших реакционных пробирок (микропробирок), каждая из которых содержит различные обезвоженные субстраты.
Регидратация и инокуляция. Для проведения теста микропробирки регидратируются бактериальной суспензией. Каждая микропробирка предназначена для обнаружения специфической ферментативной активности или ферментации углеводов, характерной для тестируемых бактерий.
Инкубация: После инокуляции полоску инкубируют в течение периода, обычно 18–24 часов, при определенной температуре (часто 35–37°C). Во время инкубации бактерии взаимодействуют с субстратами, что приводит к видимым изменениям цвета в случае возникновения реакций.
Чтение результатов: После инкубации результаты интерпретируются путем наблюдения за изменениями цвета в каждой пробирке, которые указывают на положительные или отрицательные реакции. Характер реакций сравнивается со справочной базой данных для идентификации организма.
Идентификация: каждая реакция оценивается численно, а совокупный балл образует номер профиля, который затем используется для идентификации организма через базу данных или программное обеспечение для идентификации.

Приложения:

Клиническая микробиология: API 20E обычно используется в больничных лабораториях для выявления патогенов в клинических образцах, таких как моча, кровь или мазки из ран.
Экологическая микробиология: API 20NE особенно полезен для идентификации видов, не относящихся к Enterobacteriaceae, в пробах окружающей среды, таких как вода или почва.

Преимущества:

Скорость: система позволяет быстро идентифицировать бактерии, часто в течение 24 часов.
Простота использования: процесс прост, что делает его доступным для лабораторий без специального оборудования.
Стандартизация: система обеспечивает стандартизированные процедуры и результаты, обеспечивая согласованность результатов в разных лабораториях.

Ограничения:

Ограниченная область применения: система предназначена для определенных групп бактерий (грамотрицательных) и может не подходить для идентификации грамположительных бактерий или других микроорганизмов.
Зависимость от базы данных: Точная идентификация зависит от качества и полноты справочной базы данных.
Интерпретация: Некоторые результаты могут быть неоднозначными, требующими опытного персонала или дополнительных подтверждающих тестов.

Ссылки

^ «Поиск тестов API | Индекс аналитического профиля | BacDive» . bacdive.dsmz.de . Проверено 8 марта 2024 г.
^ http://patft.uspto.gov/netacgi/nph-Parser?Sect1=PTO1&Sect2=HITOFF&d=PALL&p=1&u=%2Fnetahtml%2FPTO%2Fsrchnum.htm&r=1&f=G&l=50&s1=3936356.PN.&OS=PN/ 3936356&RS=PN/3936356 ^{[ постоянная мертвая ссылка ]}
^ «Полоски API® – Инновация – Клиническая диагностика bioMérieux» . Архивировано из оригинала 25 мая 2009 г. Проверено 9 ноября 2009 г.
^ Танкешвар, Ачарья (28 февраля 2024 г.). «API и RAPID ID для идентификации микробов • Microbe Online» . Микроб Онлайн . Проверено 8 марта 2024 г.
^ Октавия, Софи; Лан, Руитинг (2014). «Семейство энтеробактерий» . Прокариоты : 225–286. дои : 10.1007/978-3-642-38922-1_167 . ISBN 978-3-642-38921-4 .
^ Холмс, Б; Уиллкокс, WR; Лапаж, СП (1 января 1978 г.). «Идентификация энтеробактерий системой API 20E» . Журнал клинической патологии . 31 (1): 22–30. дои : 10.1136/jcp.31.1.22 . ISSN 0021-9746 . ПМК 476713 . ПМИД 342546 .
^ Jump up to: ^а ^б «Справочное руководство по API V7» (PDF) . Биомерье . 2019.

Дальнейшее чтение

Патентное ведомство США, номер патента 3936356 [1]
Система API: многопробирный микрометод для идентификации энтеробактерий, П. Б. Смит, К. М. Томфорде, Д. Л. Роден и А. Балоуз, Центр контроля заболеваний, Атланта, Джорджия, 30333 [2]

[1] «Поиск тестов API | Индекс аналитического профиля | BacDive» . bacdive.dsmz.de . Проверено 8 марта 2024 г.

[2] ttp://patft.uspto.gov/netacgi/nph-Parser?Sect1=PTO1&Sect2=HITOFF&d=PALL&p=1&u=%2Fnetahtml%2FPTO%2Fsrchnum.htm&r=1&f=G&l=50&s1=3936356.PN.&OS=PN/ 3936356&RS=PN/3936356 ^{[ постоянная мертвая ссылка ]}

[3] «Полоски API® – Инновация – Клиническая диагностика bioMérieux» . Архивировано из оригинала 25 мая 2009 г. Проверено 9 ноября 2009 г.

[4] Танкешвар, Ачарья (28 февраля 2024 г.). «API и RAPID ID для идентификации микробов • Microbe Online» . Микроб Онлайн . Проверено 8 марта 2024 г.

[5] Октавия, Софи; Лан, Руитинг (2014). «Семейство энтеробактерий» . Прокариоты : 225–286. дои : 10.1007/978-3-642-38922-1_167 . ISBN 978-3-642-38921-4 .

[6] Холмс, Б; Уиллкокс, WR; Лапаж, СП (1 января 1978 г.). «Идентификация энтеробактерий системой API 20E» . Журнал клинической патологии . 31 (1): 22–30. дои : 10.1136/jcp.31.1.22 . ISSN 0021-9746 . ПМК 476713 . ПМИД 342546 .

[:0-7] Jump up to: ^а ^б «Справочное руководство по API V7» (PDF) . Биомерье . 2019.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]