Кальцийсвязывающий белок 1
| CABP1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Псевдонимы | CABP1 , CALBRAIN, HCALB_BR, кальцийсвязывающий белок 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Внешние идентификаторы | Опустить : 605563 ; МГИ : 1352750 ; Гомологен : 128292 ; GeneCards : CABP1 ; ОМА : CABP1 — ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Кальцийсвязывающий белок 1 — это белок , который у человека кодируется геном CABP1 . [ 5 ] Кальцийсвязывающий белок 1 представляет собой кальцийсвязывающий белок. [ 6 ] обнаружен в 1999 году. [ 7 ] Он имеет два мотива руки EF и экспрессируется в нейрональных клетках в таких областях, как гиппокамп , хабенулярное ядро эпиталамуса , слой клеток Пуркинье мозжечка, а также амакриновые клетки и конусные биполярные клетки сетчатки .
Кальцийсвязывающий белок 1, который является нейрон-специфичным членом суперсемейства кальмодулина (CaM), который модулирует Ca. 2+ -зависимая активность инозитолтрифосфатных рецепторов (InsP3RS). [ 8 ] L-CaBP1 также связан со структурами цитоскелета. Но S-CaBP1 расположен внутри плазматической мембраны или рядом с ней. В головном мозге CaBp1 обнаруживается в коре головного мозга и гиппокампе, а в белке Cabp1 обнаруживается в конусных биполярных и амакриновых клетках. Мы также можем сказать, что CaBP1 может регулировать Ca 2+ зависимая активность InSP3R путем содействия структурным контактам между супрессорными и коровыми доменами, но не влияет на связывание INsP3 с рецептором. CaBP1 содержит четыре EF-руки в двух отдельных доменах, а именно: EF1 и Ef2 содержатся в N-домене, тогда как Ef3 и EF4 содержатся в домене c, к которому относится CaBP1. 2+ связывает. [ 9 ] Кальцийсвязывающий белок 1 (CaBP1) располагается в просвете эндоплазматического ретикулума. Он перемещается за пределы клеток во время апоптоза и участвует в фагоцитозе апоптотических клеток. [ 10 ] СаBP1 [ 9 ] и КаМ. [ 11 ] [ 12 ] доли складываются независимо. Химеры CaBP1-CaM основаны на обмене трех элементов: N-доли, C-доли и междолькового линкера. Экспрессия CaBP1 помогает блокировать Ca 2+ -зависимое облегчение Ca P/Q-типа 2+ ток, который заметно снижает облегчение синаптической передачи.
Структура белка
[ редактировать ]Белок, отвечающий за ген CABP1, является гомодимером . Он взаимодействует с ITPR1 , ITPR2 и ITPR3 через С-конец. Связывание зависит от кальция, и взаимодействие коррелирует с концентрацией кальция. CABP1 также взаимодействует с CACNA1A в пре- и постсинаптических мембранах посредством C-концевого мотива связывания кальция. Он также взаимодействует с CACNA1C через C-концевые мотивы C и IQ. Он взаимодействует с TRPC5, а также с MAP1LC3B через C-конец и EF-руки 1 и 2 соответственно. Он взаимодействует с C9orf9 . Он также взаимодействует с NSMF через центральную область мотива, содержащую NLF. Это взаимодействие происходит кальций-зависимым образом после стимуляции синаптических рецепторов NMDA и, таким образом, предотвращает ядерный импорт NSMF . [ 13 ]
Функция
[ редактировать ]Кальцийсвязывающие белки являются важным компонентом опосредованной кальцием передачи клеточного сигнала. Этот ген кодирует белок, принадлежащий к подсемейству белков, связывающих кальций, которые имеют сходство с кальмодулином . Белок, кодируемый этим геном, регулирует открытие потенциалзависимых ионных каналов кальция. Этот белок вызывает быструю инактивацию, независимую от кальция, и не поддерживает кальций-зависимую облегчение. [ 14 ] CAbp1 подавляет инактивированный кальций-зависимый CACNA1D . он также ингибирует TRPC5 . CABP1 предотвращает клеточную дегенерацию, вызванную рецептором NMDA. Этот белок также регулирует кальций-зависимую активность инозитол-1,4,5-трифосфатных рецепторов, потенциалзависимых кальциевых каналов P/Q-типа и временного рецепторного потенциального канала TRPC5. Этот ген преимущественно экспрессируется в сетчатке и мозге. [ 5 ]
CaBP1 и CaM оба связываются с IQ-доменом в цитоплазматическом C-концевом домене. Мутации IQ-домена, которые ослабляют связывание этих двух белков, прекращают функциональный эффект CaM, но не CaBP1. Если N-концевой домен удалить, это отменяет эффект CaBP1, продлевающий Ca v 1,2 Ca. 2+ токи, но пощадил Ca 2+ -зависимый инактивируется из-за CaM [ 15 ] сверхэкспрессированный L-CaBP1 подавляет рост [Ca 2+ ] в ответ на физиологические агонисты, действующие на пуринергические рецепторы, и, таким образом, это ингибирование происходит в значительной степени за счет блокады высвобождения внутриклеточного кальция. 2+ магазины. Родственный белок нейронального датчика кальция-1 не подвергся воздействию [Ca 2+ ] ответы на стимуляцию агонистами. Измерение [Ca 2+ ] в ЭР пермеабилизированных клеток PC12 продемонстрировали, что LCaBP1 напрямую ингибирует InsP3-опосредованный Ca 2+ выпускать. Экспрессия L-CaBP1 также помогает ингибировать индуцированное гистамином [Ca 2+ ] колебания в клетках HeLa . L-CaBP1 способен специфически регулировать опосредованные рецептором InsP3 изменения в [Ca 2+ ] во время стимуляции агонистами.
Клеточная экспрессия кальдендрина ограничена соматодендритным компартментом, за исключением гипоталамуса , где было обнаружено мечение аксонов . [ 16 ] CAbP1 и CAbP2 содержат консенсусную последовательность N-концевого миристоилирования. Сайты связывания факторов транскрипции, идентифицированные Qiagen в промоторе гена CABP1, включают Nkx2-5 , RSRFC4 , TAL1 и HSF1 . CaBP1 взаимодействует с рецепторами инозитол-1,4,5-трифосфата (InsP3), вызывая активацию каналов, когда InsP3 отсутствует.
Клиническое значение
[ редактировать ]При шизофрении одно исследование продемонстрировало уменьшение количества клеток, экспрессирующих CABP1, особенно в левой дорсолатеральной префронтальной коре . Однако это изменение было компенсировано в масштабе всего мозга увеличением уровня белка. [ 17 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000157782 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000029544 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Jump up to: а б «Ген Энтрез: кальцийсвязывающий белок 1» .
- ^ МакКью HV, Haynes LP, Burgoyne RD (август 2010 г.). «Разнообразие белков-сенсоров кальция в регуляции функции нейронов» . Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии . 2 (8): а004085. doi : 10.1101/cshperspect.a004085 . ПМК 2908765 . ПМИД 20668007 .
- ^ Ямагути К., Ямагути Ф., Миямото О., Сугимото К., Кониси Р., Хатасе О., Токуда М. (февраль 1999 г.). «Calbrain, новый кальцийсвязывающий белок с двумя EF, который подавляет Ca 2+ / Активность кальмодулин-зависимой протеинкиназы II в головном мозге» . Журнал биологической химии . 274 (6): 3610–6. doi : 10.1074/jbc.274.6.3610 . PMID 9920909 .
- ^ Хазелеер Ф, Сокал И, Верлинде К.Л., Эрдьюмент-Бромаж Х, Темпст П., Пронин А.Н., Бенович Дж.Л., Фарисс Р.Н., Пальчевски К. (2000). «Пять участников романа Ca 2+ Подсемейство -связывающего белка (CABP) со сходством с кальмодулином» . Журнал биологической химии . 275 (2): 1247–60. : 10.1074 /jbc.275.2.1247 . PMC 1364469. . PMID 10625670 doi
- ^ Jump up to: а б Ли С., Чан Дж., Хазелир Ф., Микошиба К., Пальчевски К., Икура М., Эймс Дж.Б. (январь 2009 г.). «Структурное понимание Ca 2+ -зависимая регуляция инозитол-1,4,5-трифосфатных рецепторов с помощью CaBP1» . Журнал биологической химии . 284 (4): 2472–81. : 10.1074 /jbc.M806513200 . PMC 2629100. . PMID 19008222 doi
- ^ «Ген Dmel\CaBP1» . ФлайБейс .
- ^ Масино Л., Мартин С.Р., Бэйли П.М. (2000). «Связывание лиганда и термодинамическая стабильность многодоменного белка кальмодулина» . Белковая наука . 9 (8): 1519–29. дои : 10.1110/ps.9.8.1519 . ПМК 2144730 . ПМИД 10975573 .
- ^ Цалкова Т.Н., Привалов П.Л. (1985). «Термодинамическое исследование доменной организации тропонина С и кальмодулина». Журнал молекулярной биологии . 181 (4): 533–44. дои : 10.1016/0022-2836(85)90425-5 . ПМИД 3999139 .
- ^ «Ген CABP1» . Генные карты .
- ^ Ли А., Вестенбрук Р.Э., Хазелеер Ф., Пальчевски К., Шойер Т., Каттералл В.А. (2002). «Дифференциальная модуляция каналов Ca(v)2.1 кальмодулином и Ca2+-связывающим белком 1» . Природная неврология . 5 (3): 210–7. дои : 10.1038/nn805 . ПМЦ 1435861 . ПМИД 11865310 .
- ^ Чжоу Х., Ю К., Маккой К.Л., Ли А. (август 2005 г.). «Молекулярный механизм дивергентной регуляции Cav1.2 Ca 2+ каналы кальмодулином и Ca 2+ -связывающий белок-1» . Журнал биологической химии . 280 (33): 29612–9. doi : 10.1074/jbc.M504167200 . PMID 15980432 .
- ^ Бернштейн Х.Г., Зайденбехер К.И., Смолла К.Х., Гундельфингер Э.Д., Богертс Б., Кройц М.Р. (август 2003 г.). «Распределение и клеточная локализация иммунореактивности кальдендрина в переднем мозге взрослого человека» . Журнал гистохимии и цитохимии . 51 (8): 1109–12. дои : 10.1177/002215540305100816 . ПМИД 12871994 .
- ^ Бернштейн Х.Г., Шахин Дж., Смолла К.Х., Гундельфингер Э.Д., Богертс Б., Кройц М.Р. (ноябрь 2007 г.). «Уменьшение количества корковых нейронов демонстрирует повышенный уровень белка кальдендрина при хронической шизофрении». Исследования шизофрении . 96 (1–3): 246–56. doi : 10.1016/j.schres.2007.05.038 . ПМИД 17719205 . S2CID 19965523 .
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .