Кальмодулин
Эта статья нуждается в дополнительных цитатах для проверки . ( декабрь 2007 г. ) |
Кальмодулин | |||
---|---|---|---|
Идентификаторы | |||
Символ | КаМ | ||
ПДБ | 1ОСА | ||
ЮниПрот | P62158 | ||
|
Кальмодулин ( CaM ) (сокращение от «кальций - модулированный белок » ) представляет собой многофункциональный промежуточный кальций-связывающий белок-мессенджер, экспрессируемый во всех эукариотических клетках . [1] Это внутриклеточная мишень вторичного мессенджера Ca. 2+ и связывание Ca 2+ необходим для активации кальмодулина. Однажды привязанный к Ка 2+ Кальмодулин действует как часть пути передачи сигнала кальция , изменяя его взаимодействие с различными белками-мишенями, такими как киназы или фосфатазы . [2] [3] [4]
Структура
[ редактировать ]Кальмодулин представляет собой небольшой высококонсервативный белок длиной 148 аминокислот (16,7 кДа). Белок имеет два примерно симметричных глобулярных домена (N- и C-домены), каждый из которых содержит пару руки EF. мотивов [5] разделены гибкой линкерной областью, всего четыре Ca 2+ сайты связывания, по два в каждом глобулярном домене. [6] В Калифорнии 2+ -свободное состояние, спирали, образующие четыре EF-руки, сжаты в компактной ориентации, а центральный линкер разупорядочен; [5] [6] [7] [8] в Калифорнии 2+ В -насыщенном состоянии спирали EF-руки принимают открытую ориентацию, примерно перпендикулярную друг другу, а центральный линкер образует протяженную альфа-спираль в кристаллической структуре, [5] [6] но остается в значительной степени неупорядоченным в решении. [9] C-домен имеет более высокую аффинность связывания с Ca. 2+ чем N-домен. [10] [11]
Кальмодулин структурно очень похож на тропонин С , еще один кальций. 2+ -связывающий белок, содержащий четыре мотива EF-hand. [5] [12] Однако тропонин C содержит дополнительную альфа-спираль на своем N-конце и конститутивно связан со своей мишенью, тропонином I. Поэтому он не демонстрирует такого же разнообразия распознавания мишеней, как кальмодулин.
Важность гибкости кальмодулина
[ редактировать ]Способность кальмодулина распознавать огромный спектр белков-мишеней во многом обусловлена его структурной гибкостью. [13] Помимо гибкости центрального линкерного домена, N- и C-домены подвергаются конформационному циклированию открыто-закрыто в Ca 2+ -связанное состояние. [9] Кальмодулин также демонстрирует большую структурную изменчивость и претерпевает значительные конформационные колебания при связывании с мишенями. [14] [15] [16] Более того, преимущественно гидрофобная природа связывания кальмодулина с большинством его мишеней позволяет распознавать широкий спектр последовательностей целевых белков. [14] [17] В совокупности эти особенности позволяют кальмодулину распознавать около 300 целевых белков. [18] демонстрирующие различные мотивы последовательности CaM-связывания.
Механизм
[ редактировать ]Связывание Ca 2+ руками EF вызывает открытие N- и C-доменов, в результате чего обнажаются гидрофобные поверхности, связывающиеся с мишенью. [6] Эти поверхности взаимодействуют с комплементарными неполярными сегментами белков-мишеней, обычно состоящими из групп объемистых гидрофобных аминокислот, разделенных 10–16 полярными и/или основными аминокислотами. [18] [14] Гибкий центральный домен кальмодулина позволяет белку обволакивать свою мишень, хотя известны альтернативные способы связывания. «Канонические» мишени кальмодулина, такие как киназы легкой цепи миозина и CaMKII , связываются только с Ca 2+ -связанный белок, тогда как некоторые белки, такие как каналы NaV и белки IQ-мотив , также связываются с кальмодулином в отсутствие Ca 2+ . [14] Связывание кальмодулина вызывает конформационные перестройки в целевом белке посредством «взаимно индуцированного соответствия». [19] что приводит к изменению функции целевого белка.
Связывание кальция кальмодулином демонстрирует значительную кооперативность . [5] [11] что делает кальмодулин необычным примером мономерного (одноцепочечного) кооперативно связывающегося белка. Кроме того, связывание с мишенью изменяет аффинность связывания кальмодулина с Ca. 2+ ионы, [20] [21] [22] что допускает сложное аллостерическое взаимодействие между Ca 2+ и целевые взаимодействия связывания. [23] Это влияние связывания мишени с Ca 2+ Считается, что сродство позволяет Ca 2+ активация белков, конститутивно связанных с кальмодулином, таких как Ca с малой проводимостью 2+ -активированные калиевые (СК) каналы. [24]
Хотя кальмодулин в основном действует как Ca 2+ связывая белок, он также координирует ионы других металлов. Например, при наличии типичных внутриклеточных концентраций Mg 2+ (0,5–1,0 мМ) и концентрации Ca в состоянии покоя. 2+ (100 нМ), Ca кальмодулина 2+ сайты связывания хотя бы частично насыщены Mg 2+ . [25] Это мг 2+ вытесняется более высокими концентрациями Ca 2+ генерируются сигнальными событиями. Аналогично, Са 2+ сам по себе может быть вытеснен ионами других металлов, такими как трехвалентные лантаноиды, которые связываются с карманами связывания кальмодулина даже сильнее, чем Ca. 2+ . [26] [27] Хотя такие ионы искажают структуру кальмодулина. [28] [29] и, как правило, не являются физиологически релевантными из-за их редкости in vivo , они, тем не менее, нашли широкое научное применение в качестве репортеров структуры и функции кальмодулина. [30] [31] [26]
Роль у животных
[ редактировать ]Кальмодулин опосредует многие важные процессы, такие как воспаление , обмен веществ , апоптоз , сокращение гладких мышц , внутриклеточное движение, кратковременную и долговременную память , а также иммунный ответ . [32] [33] Кальций участвует во внутриклеточной сигнальной системе, действуя как диффузный вторичный мессенджер для первоначальных стимулов. Он делает это путем связывания различных мишеней в клетке, включая большое количество ферментов , ионных каналов , аквапоринов и других белков. [4] Кальмодулин экспрессируется во многих типах клеток и может располагаться в различных субклеточных местах, включая цитоплазму , внутри органелл или ассоциироваться с плазмой или мембранами органелл, но он всегда обнаруживается внутриклеточно. [33] Многие из белков, с которыми связывается кальмодулин, не способны сами связывать кальций и используют кальмодулин в качестве сенсора кальция и преобразователя сигнала. Кальмодулин также может использовать запасы кальция в эндоплазматическом ретикулуме и саркоплазматическом ретикулуме . Кальмодулин может подвергаться посттрансляционным модификациям, таким как фосфорилирование , ацетилирование , метилирование и протеолитическое расщепление , каждое из которых потенциально может модулировать его действие.
Конкретные примеры
[ редактировать ]Роль в сокращении гладких мышц
[ редактировать ]Кальмодулин играет важную роль в соединении сокращений возбуждения (EC) и инициировании цикла поперечных мостиков в гладких мышцах , что в конечном итоге вызывает сокращение гладких мышц. [34] Чтобы активировать сокращение гладких мышц, головка легкой цепи миозина должна быть фосфорилирована. Это фосфорилирование осуществляется киназой легкой цепи миозина (MLC) . Эта киназа MLC активируется кальмодулином, когда она связывается с кальцием, таким образом делая сокращение гладких мышц зависимым от присутствия кальция за счет связывания кальмодулина и активации киназы MLC. [34]
Другой способ влияния кальмодулина на сокращение мышц заключается в контроле движения Са. 2+ через мембраны клетки и саркоплазматического ретикулума . Калифорния 2+ каналы , такие как рианодиновый рецептор саркоплазматического ретикулума, могут ингибироваться кальмодулином, связанным с кальцием, тем самым влияя на общий уровень кальция в клетке. [35] Кальциевые насосы выводят кальций из цитоплазмы или хранят его в эндоплазматическом ретикулуме , и этот контроль помогает регулировать многие последующие процессы.
Это очень важная функция кальмодулина, поскольку он косвенно играет роль во всех физиологических процессах, на которые влияет сокращение гладких мышц , таких как пищеварение и сокращение артерий (что помогает распределять кровь и регулировать кровяное давление ). [36]
Роль в обмене веществ
[ редактировать ]играет важную роль в активации киназы фосфорилазы , что в конечном итоге приводит к глюкозы отщеплению от гликогена гликогенфосфорилазой . Кальмодулин [37]
Кальмодулин также играет важную роль в липидном обмене, влияя на кальцитонин . Кальцитонин – полипептидный гормон, снижающий содержание кальция в крови. 2+ уровни и активирует каскады белков Gs , что приводит к выработке цАМФ. Действие кальцитонина можно блокировать путем ингибирования действия кальмодулина, что позволяет предположить, что кальмодулин играет решающую роль в активации кальцитонина. [37]
Роль в кратковременной и долговременной памяти
[ редактировать ]Что 2+ Кальмодулин-зависимая протеинкиназа II (CaMKII) играет решающую роль в типе синаптической пластичности, известном как долговременная потенциация (LTP), которая требует присутствия кальция/кальмодулина. CaMKII способствует фосфорилированию рецептора AMPA , что повышает чувствительность рецепторов AMPA. [38] Более того, исследования показывают, что ингибирование CaMKII мешает LTP. [38]
Роль в растениях
[ редактировать ]В то время как дрожжи имеют только один ген CaM, растения и позвоночные содержат эволюционно консервативную форму генов CaM. Разница между растениями и животными в Ca 2+ Сигнализация заключается в том, что растения содержат расширенное семейство CaM в дополнение к эволюционно консервативной форме. [39] Кальмодулины играют важную роль в развитии растений и адаптации к стимулам окружающей среды.
Кальций играет ключевую роль в структурной целостности клеточной стенки и мембранной системы клетки. Однако высокие уровни кальция могут быть токсичными для клеточного энергетического метаболизма растений и, следовательно, для кальция. 2+ концентрация в цитозоле поддерживается на субмикромолярном уровне за счет удаления цитозольного Ca 2+ либо в апопласт , либо в просвет внутриклеточных органелл. Калифорния 2+ импульсы, создаваемые из-за увеличения притока и оттока, действуют как клеточные сигналы в ответ на внешние раздражители, такие как гормоны, свет, гравитация, абиотические стрессовые факторы, а также взаимодействие с патогенами. [40]
CML (белки, связанные с CaM)
[ редактировать ]Растения содержат белки, родственные CaM (CML), помимо типичных белков CaM. CML имеют аминокислотное сходство с типичными CaM примерно на 15%. Arabidopsis thaliana содержит около 50 различных генов ХМЛ, что ставит вопрос о том, какой цели служат эти разнообразные белки в клеточной функции. Все виды растений демонстрируют такое разнообразие генов ХМЛ. Различные CaM и CML различаются по своей способности связывать и активировать ферменты, регулируемые CaM, in vivo . Также обнаружено, что CaM или CML расположены в разных компартментах органелл.
Рост и развитие растений
[ редактировать ]У арабидопсиса белок DWF1 играет ферментативную роль в биосинтезе брассиностероидов, стероидных гормонов растений, необходимых для роста. Взаимодействие происходит между CaM и DWF1, [ нужны разъяснения ] и DWF1, будучи неспособным связывать CaM, не способен обеспечивать фенотип регулярного роста у растений. Следовательно, CaM необходим для функции DWF1 в росте растений.
Известно также, что белки, связывающие CaM, регулируют репродуктивное развитие растений. Например, СаМ-связывающая протеинкиназа табака действует как негативный регулятор цветения. Однако эти CaM-связывающие протеинкиназы также присутствуют в апикальной меристеме побега табака, и высокая концентрация этих киназ в меристеме вызывает задержку перехода растения к цветению.
Киназа рецептора S -локуса (SRK) представляет собой еще одну протеинкиназу, которая взаимодействует с CaM. SRK участвует в реакциях самонесовместимости, вовлеченных во взаимодействие пыльцы и пестика у Brassica .
Цели CaM у Arabidopsis также участвуют в развитии пыльцы и оплодотворении. Калифорния 2+ транспортеры необходимы для роста пыльцевых трубок . Следовательно, постоянный Ca 2+ Градиент сохраняется на вершине пыльцевой трубки для удлинения в процессе оплодотворения. Точно так же CaM также важен в верхушке пыльцевой трубки, где его основная роль заключается в управлении ростом пыльцевой трубки.
Взаимодействие с микробами
[ редактировать ]Образование узелков
[ редактировать ]Что 2+ играет важную роль в образовании клубеньков у бобовых. Азот — важнейший элемент, необходимый растениям и многим бобовым, неспособным самостоятельно фиксировать азот, вступает в симбиотическое соединение с азотфиксирующими бактериями, восстанавливающими азот до аммиака. Для установления взаимодействия бобовых и ризобий необходим фактор Nod, который продуцируется бактериями Rhizobium . Фактор Nod распознается волосковыми клетками корня, которые участвуют в образовании клубеньков у бобовых. Калифорния 2+ В распознавании фактора Nod участвуют реакции различной природы. Есть Ка 2+ поток на кончике корневого волоса, за которым следуют повторяющиеся колебания Ca 2+ в цитозоле, а также Ca 2+ Спайк возникает вокруг ядра. DMI3, важный ген, отвечающий за сигнальные функции фактора Nod ниже Ca. 2+ пиковая подпись, возможно, узнает Ca 2+ подпись. Кроме того, несколько генов CaM и CML у Medicago и Lotus экспрессируются в клубеньках.
Защита от патогенов
[ редактировать ]Среди разнообразных стратегий защиты, которые растения используют против патогенов, Ca 2+ сигнализация очень распространена. Бесплатная Калифорния 2+ уровни в цитоплазме повышаются в ответ на патогенную инфекцию. Калифорния 2+ Сигнатуры такого рода обычно активируют защитную систему растений, индуцируя защитные гены и гиперчувствительную гибель клеток. CaM, CML и CaM-связывающие белки являются одними из недавно идентифицированных элементов сигнальных путей защиты растений. Некоторые гены ХМЛ в табаке , фасоли и томатах чувствительны к патогенам. CML43 представляет собой белок, родственный CaM, который, выделенный из гена APR134 в устойчивых к болезням листьях Arabidopsis для анализа экспрессии генов, быстро индуцируется при инокуляции листьев Pseudomonas syringae . Эти гены также обнаружены в томатах ( Solanum lycopersicum ). CML43 из APR134 также связывается с Ca. 2+ ионы in vitro, что показывает, что CML43 и APR134, следовательно, участвуют в Ca 2+ -зависимая передача сигналов при иммунном ответе растений на бактериальные патогены. [41] Экспрессия CML9 у Arabidopsis thaliana быстро индуцируется фитопатогенными бактериями, флагеллином и салициловой кислотой. [42] Экспрессия соевых SCaM4 и SCaM5 в трансгенном табаке и арабидопсисе вызывает активацию генов, связанных с устойчивостью к патогенам, а также приводит к усилению устойчивости к широкому спектру патогенных инфекций. Этого нельзя сказать о SCaM1 и SCaM2 сои, которые представляют собой высококонсервативные изоформы CaM. Белок At BAG6 представляет собой CaM-связывающий белок, который связывается с CaM только в отсутствие CaM. 2+ и не в его присутствии. BAG6 отвечает за сверхчувствительную реакцию запрограммированной гибели клеток с целью предотвращения распространения патогенной инфекции или ограничения роста патогена. Мутации в белках, связывающих CaM, могут привести к серьезным последствиям для защитной реакции растений на патогенные инфекции. Циклические нуклеотидзависимые каналы (CNGC) представляют собой функциональные белковые каналы в плазматической мембране, которые имеют перекрывающиеся сайты связывания CaM, транспортирующие двухвалентные катионы, такие как Ca. 2+ . Однако точная роль позиционирования CNGC на этом пути защиты растений до сих пор неясна.
Реакция абиотического стресса у растений
[ редактировать ]Изменение внутриклеточного кальция 2+ уровни используются как признак разнообразных реакций на механические раздражители, осмотические и солевые обработки, а также холодовые и тепловые шоки. Различные типы корневых клеток демонстрируют разный Ca 2+ ответ на осмотический и солевой стресс, что подразумевает клеточную специфичность Ca 2+ узоры. В ответ на внешний стресс КаМ активирует глутаматдекарбоксилазу (GAD), которая катализирует превращение L -глутамата в ГАМК. Жесткий контроль синтеза ГАМК важен для развития растений, и, следовательно, повышенный уровень ГАМК может существенно повлиять на развитие растений. Следовательно, внешний стресс может влиять на рост и развитие растений, и КаМ участвует в этом пути, контролируя этот эффект. [ нужна ссылка ]
Примеры растений
[ редактировать ]Сорго
[ редактировать ]Растение сорго является хорошо зарекомендовавшим себя модельным организмом и может адаптироваться в жарких и засушливых условиях. По этой причине его используют в качестве модели для изучения роли кальмодулина в растениях. [43] Сорго содержит проростки, которые экспрессируют глицином богатый РНК-связывающий белок SbGRBP. Этот конкретный белок можно модулировать, используя тепло в качестве стрессора. Его уникальное расположение в ядре клетки и цитозоле демонстрирует взаимодействие с кальмодулином, требующее использования Ca. 2+ . [44] Подвергая растение различным стрессовым условиям, можно вызвать подавление различных белков , которые позволяют растительным клеткам переносить изменения окружающей среды. Показано, что эти модулированные стрессовые белки взаимодействуют с CaM. Гены CaMBP, экспрессируемые в сорго, представлены как «модельная культура» для исследования устойчивости к жаре и засухе .
Арабидопсис
[ редактировать ]В исследовании Arabidopsis thaliana сотни различных белков продемонстрировали возможность связываться с CaM в растениях. [43]
Члены семьи
[ редактировать ]- Кальмодулин 1 ( CALM1 )
- Кальмодулин 2 ( CALM2 )
- Кальмодулин 3 ( CALM3 )
- кальмодулин 1 псевдоген 1 ( CALM1P1 )
- Кальмодулинподобный 3 ( CALML3 )
- Кальмодулинподобный 4 ( CALML4 )
- Кальмодулинподобный 5 ( CALML5 )
- Кальмодулинподобный 6 ( CALML6 )
Другие кальцийсвязывающие белки
[ редактировать ]Кальмодулин принадлежит к одной из двух основных групп кальцийсвязывающих белков, называемых белками рук EF . Другая группа, называемая аннексинами , связывает кальций и фосфолипиды, такие как липокортин . Многие другие белки связывают кальций, хотя связывание кальция не считается их основной функцией в клетке.
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Стивенс (август 1983 г.). «Кальмодулин: введение». Канадский журнал биохимии и клеточной биологии . 61 (8): 906–10. дои : 10.1139/o83-115 . ПМИД 6313166 .
- ^ Чин Д., Минс АР (август 2000 г.). «Кальмодулин: прототип датчика кальция». Тенденции в клеточной биологии . 10 (8): 322–8. дои : 10.1016/S0962-8924(00)01800-6 . ПМИД 10884684 .
- ^ Первс Д., Августин Дж., Фитцпатрик Д., Холл В., ЛаМантия А.С., Уайт Л. (2012). Нейронаука . Массачусетс: Sinauer Associates. стр. 95, 147, 148. ISBN. 9780878936953 .
- ^ Jump up to: а б «CALM1 – Кальмодулин – Homo sapiens (Человек) – ген и белок CALM1» . www.uniprot.org . Проверено 23 февраля 2016 г.
- ^ Jump up to: а б с д и Гиффорд Дж.Л., член парламента Уолша, Фогель Х.Дж. (июль 2007 г.). «Структура и свойства связывания ионов металлов Ca2+-связывающих мотивов спираль-петля-спираль EF-hand». Биохимический журнал . 405 (2): 199–221. дои : 10.1042/BJ20070255 . ПМИД 17590154 .
- ^ Jump up to: а б с д Чин Д., Минс АР (август 2000 г.). «Кальмодулин: прототип датчика кальция». Тенденции в клеточной биологии . 10 (8): 322–8. дои : 10.1016/s0962-8924(00)01800-6 . ПМИД 10884684 .
- ^ Кубонива Х., Тьяндра Н., Гжесик С., Рен Х., Клее С.Б., Бакс А. (сентябрь 1995 г.). «Структура раствора безкальциевого кальмодулина». Структурная биология природы . 2 (9): 768–76. дои : 10.1038/nsb0995-768 . ПМИД 7552748 . S2CID 22220229 .
- ^ Чжан М., Танака Т., Икура М. (сентябрь 1995 г.). «Индуцированный кальцием конформационный переход, выявленный структурой раствора апокальмодулина». Структурная биология природы . 2 (9): 758–67. дои : 10.1038/nsb0995-758 . ПМИД 7552747 . S2CID 35098883 .
- ^ Jump up to: а б Чоу Дж., Ли С., Клее CB, Бакс А. (ноябрь 2001 г.). «Структура раствора Са (2+)-кальмодулина обнаруживает гибкие свойства его доменов, напоминающие руки». Структурная биология природы . 8 (11): 990–7. дои : 10.1038/nsb1101-990 . ПМИД 11685248 . S2CID 4665648 .
- ^ Ян Джей-Джей, Гоутроп А, Йе Ю (август 2003 г.). «Получение сайт-специфического сродства кальмодулина к связыванию кальция». Буквы о белках и пептидах . 10 (4): 331–45. дои : 10.2174/0929866033478852 . ПМИД 14529487 .
- ^ Jump up to: а б Линсе С., Хелмерссон А., Форсен С. (май 1991 г.). «Связывание кальция с кальмодулином и его глобулярными доменами» . Журнал биологической химии . 266 (13): 8050–4. дои : 10.1016/S0021-9258(18)92938-8 . ПМИД 1902469 .
- ^ Худусс А., Лав М.Л., Домингес Р., Грабарек З., Коэн С. (декабрь 1997 г.). «Структуры четырех Ca2+-связанных тропонинов C с разрешением 2,0 А: дальнейшее понимание Ca2+-переключателя в суперсемействе кальмодулина» . Структура . 5 (12): 1695–711. дои : 10.1016/s0969-2126(97)00315-8 . ПМИД 9438870 .
- ^ Ямнюк А.П., Фогель Х.Дж. (май 2004 г.). «Гибкость кальмодулина допускает беспорядочность во взаимодействии с целевыми белками и пептидами». Молекулярная биотехнология . 27 (1): 33–57. дои : 10.1385/МБ:27:1:33 . ПМИД 15122046 . S2CID 26585744 .
- ^ Jump up to: а б с д Тидоу Х., Ниссен П. (ноябрь 2013 г.). «Структурное разнообразие связывания кальмодулина с целевыми сайтами» . Журнал ФЭБС . 280 (21): 5551–65. дои : 10.1111/февраль 12296 . ПМИД 23601118 .
- ^ Фредерик К.К., Марлоу М.С., Валентайн К.Г., Ванд А.Дж. (июль 2007 г.). «Конформационная энтропия в молекулярном узнавании белками» . Природа . 448 (7151): 325–9. Бибкод : 2007Natur.448..325F . дои : 10.1038/nature05959 . ПМК 4156320 . ПМИД 17637663 .
- ^ Гспонер Дж., Христодулу Дж., Кавалли А., Буй Дж.М., Рихтер Б., Добсон С.М., Вендрусколо М. (май 2008 г.). «Связанный механизм сдвига равновесия при передаче сигнала, опосредованной кальмодулином» . Структура . 16 (5): 736–46. дои : 10.1016/j.str.2008.02.017 . ПМК 2428103 . ПМИД 18462678 .
- ^ Исида Х., Фогель Х.Дж. (2006). «Исследования белок-пептидного взаимодействия демонстрируют универсальность связывания целевого белка кальмодулина». Буквы о белках и пептидах . 13 (5): 455–65. дои : 10.2174/092986606776819600 . ПМИД 16800798 .
- ^ Jump up to: а б «Целевая база данных кальмодулина» . Архивировано из оригинала 31 января 2023 года . Проверено 27 июля 2020 г.
- ^ Ван Ц., Чжан П., Хоффман Л., Трипати С., Хомуз Д., Лю Ю. и др. (декабрь 2013 г.). «Распознавание и отбор белков посредством конформационного и взаимно индуцированного соответствия» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 110 (51): 20545–50. Бибкод : 2013PNAS..11020545W . дои : 10.1073/pnas.1312788110 . ПМЦ 3870683 . ПМИД 24297894 .
- ^ Джонсон Дж.Д., Снайдер С., Уолш М., Флинн М. (январь 1996 г.). «Влияние киназы легкой цепи миозина и пептидов на обмен Ca2+ с N- и C-концевыми сайтами связывания Ca2+ кальмодулина» . Журнал биологической химии . 271 (2): 761–7. дои : 10.1074/jbc.271.2.761 . ПМИД 8557684 . S2CID 9746955 .
- ^ Бэйли П.М., Финдли В.А., Мартин С.Р. (июль 1996 г.). «Распознавание цели кальмодулином: анализ кинетики и аффинности взаимодействия с использованием коротких пептидных последовательностей» . Белковая наука . 5 (7): 1215–28. дои : 10.1002/pro.5560050701 . ПМК 2143466 . ПМИД 8819155 .
- ^ Теохарис Н.Т., Соренсен Б.Р., Тайзен-Тупал Дж., Ши М.А. (январь 2008 г.). «Мотив IQ нейрональных потенциал-зависимых натриевых каналов типа II снижает сродство к кальцию С-домена кальмодулина». Биохимия . 47 (1): 112–23. дои : 10.1021/bi7013129 . ПМИД 18067319 .
- ^ Стефан М.И., Эдельштейн С.Дж., Ле Новер Н. (август 2008 г.). «Аллостерическая модель кальмодулина объясняет дифференциальную активацию PP2B и CaMKII» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (31): 10768–73. Бибкод : 2008PNAS..10510768S . дои : 10.1073/pnas.0804672105 . ПМК 2504824 . ПМИД 18669651 .
- ^ Чжан М., Абрамс С., Ван Л., Гиззи А., Хэ Л., Лин Р. и др. (май 2012 г.). «Структурная основа кальмодулина как динамического сенсора кальция» . Структура . 20 (5): 911–23. дои : 10.1016/j.str.2012.03.019 . ПМК 3372094 . ПМИД 22579256 .
- ^ Грабарек З. (май 2011 г.). «Информация о модуляции передачи сигналов кальция магнием в кальмодулине, тропонине С и родственных белках EF-hand» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1813 (5): 913–21. дои : 10.1016/j.bbamcr.2011.01.017 . ПМК 3078997 . ПМИД 21262274 .
- ^ Jump up to: а б Бриттен Х.Г., Ричардсон Ф.С., Мартин Р.Б. (декабрь 1976 г.). «Эмиссия тербия (III) как зонд мест связывания кальция (II) в белках». Журнал Американского химического общества . 98 (25): 8255–60. дои : 10.1021/ja00441a060 . ПМИД 993525 .
- ^ Килхоффер MC, Демайль Дж.Г., Жерар Д. (июль 1980 г.). «Тербий как люминесцентный зонд сайтов связывания кальция с кальмодулином; домены I и II содержат сайты с высоким сродством» . Письма ФЭБС . 116 (2): 269–72. дои : 10.1016/0014-5793(80)80660-0 . ПМИД 7409149 .
- ^ Эдингтон СК, Гонсалес А., Миддендорф Т.Р., Холлинг Д.Б., Олдрич Р.В., Байз Ч.Р. (апрель 2018 г.). «Координация с ионами лантаноидов искажает конформацию сайта связывания в кальмодулине» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 115 (14): Е3126–Е3134. Бибкод : 2018PNAS..115E3126E . дои : 10.1073/pnas.1722042115 . ПМЦ 5889669 . ПМИД 29545272 .
- ^ Чао С.Х., Сузуки Ю., Зиск-младший, Чунг, Вайоминг (июль 1984 г.). «Активация кальмодулина катионами различных металлов в зависимости от ионного радиуса» . Молекулярная фармакология . 26 (1): 75–82. ПМИД 6087119 .
- ^ Хоррокс-младший WD, Судник DR (1 декабря 1981 г.). «Лантаноидные ионные люминесцентные зонды структуры биологических макромолекул». Отчеты о химических исследованиях . 14 (12): 384–392. дои : 10.1021/ar00072a004 . ISSN 0001-4842 .
- ^ Малкуин П., Тинги Дж.М., Хоррокс В.Д. (ноябрь 1985 г.). «Характеристика связывания ионов лантаноида (III) с кальмодулином с помощью люминесцентной спектроскопии». Биохимия . 24 (23): 6639–45. дои : 10.1021/bi00344a051 . ПМИД 4084548 .
- ^ «Домашняя страница Кальмодулина» . structbio.vanderbilt.edu . Проверено 23 февраля 2016 г.
- ^ Jump up to: а б Макдауэлл Дж. «Кальмодулин» . Архив протеинов InterPro . Проверено 23 февраля 2016 г.
- ^ Jump up to: а б Тэнси М.Г., Луби-Фелпс К., Камм К.Е., Сталл Дж.Т. (апрель 1994 г.). «Ca(2+)-зависимое фосфорилирование киназы легкой цепи миозина снижает чувствительность к Ca2+ фосфорилирования легкой цепи в гладкомышечных клетках» . Журнал биологической химии . 269 (13): 9912–20. дои : 10.1016/S0021-9258(17)36969-7 . ПМИД 8144585 .
- ^ Член парламента Уолша (июнь 1994 г.). «Кальмодулин и регуляция сокращения гладких мышц». Молекулярная и клеточная биохимия . 135 (1): 21–41. дои : 10.1007/bf00925958 . ПМИД 7816054 . S2CID 2304136 .
- ^ Мартинсен А., Десси С., Морель Н. (31 октября 2014 г.). «Регуляция кальциевых каналов в гладких мышцах: новый взгляд на роль киназы легкой цепи миозина» . Каналы . 8 (5): 402–13. дои : 10.4161/19336950.2014.950537 . ПМЦ 4594426 . ПМИД 25483583 .
- ^ Jump up to: а б Нисидзава Ю., Окуи Ю., Инаба М., Окуно С., Юкиока К., Мики Т. и др. (октябрь 1988 г.). «Кальций/кальмодулин-опосредованное действие кальцитонина на липидный обмен у крыс» . Журнал клинических исследований . 82 (4): 1165–72. дои : 10.1172/jci113713 . ПМК 442666 . ПМИД 2844851 .
- ^ Jump up to: а б Льедо П.М., Хьельмстад Г.О., Мукерджи С., Содерлинг Т.Р., Маленка Р.К., Николл Р.А. (ноябрь 1995 г.). «Кальций/кальмодулин-зависимая киназа II и долговременная потенциация усиливают синаптическую передачу по тому же механизму» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (24): 11175–9. Бибкод : 1995PNAS...9211175L . дои : 10.1073/pnas.92.24.11175 . ПМК 40594 . ПМИД 7479960 .
- ^ Рэнти Б., Алдон Д., Гало Дж. П. (май 2006 г.). «Растительные кальмодулины и родственные кальмодулину белки: многогранные реле для декодирования сигналов кальция» . Сигнализация и поведение растений . 1 (3): 96–104. дои : 10.4161/psb.1.3.2998 . ПМК 2635005 . ПМИД 19521489 .
- ^ Вирди, Амардип С.; Сингх, Суприт; Сингх, Прабхджит (2015). «Реакция на абиотический стресс у растений: роль белков, регулируемых кальмодулином» . Границы в науке о растениях . 6 : 809. дои : 10.3389/fpls.2015.00809 . ISSN 1664-462X . ПМК 4604306 . ПМИД 26528296 .
- ^ Чиассон Д., Экенгрен С.К., Мартин ГБ, Добни С.Л., Снедден В.А. (август 2005 г.). «Кальмодулинподобные белки арабидопсиса и томата участвуют в защите хозяина от Pseudomonas syringae pv. томата». Молекулярная биология растений . 58 (6): 887–897. дои : 10.1007/s11103-005-8395-x . ПМИД 16240180 . S2CID 1572549 .
- ^ Леба Л.Дж., Шеваль С., Ортис-Мартин И., Ранти Б., Безон Ч.Р., Гало Дж.П., Алдон Д. (сентябрь 2012 г.). «CML9, кальмодулин-подобный белок арабидопсиса, способствует врожденному иммунитету растений посредством флагеллин-зависимого сигнального пути» . Заводской журнал . 71 (6): 976–89. дои : 10.1111/j.1365-313x.2012.05045.x . ПМИД 22563930 .
- ^ Jump up to: а б Санчес А.С., Субудхи ПК, Розенов Д.Т., Нгуен Х.Т. (2002). «Картирование QTL, связанных с засухоустойчивостью сорго (Sorghum bicolor L. Moench)». Молекулярная биология растений . 48 (5–6): 713–26. дои : 10.1023/а:1014894130270 . ПМИД 11999845 . S2CID 25834614 .
- ^ Сингх С., Вирди А.С., Джасвал Р., Чавла М., Капур С., Мохапатра С.Б. и др. (июнь 2017 г.). «Ген, чувствительный к температуре в сорго, кодирует богатый глицином белок, который взаимодействует с кальмодулином». Биохимия . 137 (Приложение С): 115–123. дои : 10.1016/j.biochi.2017.03.010 . ПМИД 28322928 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- «Миелин-ассоциированный гликопротеин» . Молекула месяца . РЦСБ ПКБ. Июль 2020 г. Архивировано из оригинала 29 мая 2010 г. Проверено 19 июня 2021 г.
- Нельсон М., Чазин В. «Домашняя страница кальмодулина» . Библиотека данных EF-Hand по кальцийсвязывающим белкам . Университет Вандербильта . Проверено 22 марта 2008 г.
- Икура М (2000). «Целевая база данных кальмодулина» . Журнал структурной и функциональной геномики . 1 (1). Институт рака Онтарио, Университет Торонто: 8–14. дои : 10.1023/а:1011320027914 . ПМИД 12836676 . S2CID 23097597 . Архивировано из оригинала 27 сентября 2011 г. Проверено 22 марта 2008 г.
- Кальмодулин в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
- ИнтерПро : IPR015754
- Страница протеопедии кальмодулина и его конформационных изменений