Каталитическая субъединица кальпаин-1

КАПН1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	1ZCM, 2ARY
Идентификаторы
Псевдонимы	CAPN1 , CANP, CANP1, CANPL1, muCANP, muCL, SPG76, кальпаин 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 114220 ; МГИ : 88263 ; Гомологен : 3800 ; GeneCards : CAPN1 ; OMA : CAPN1 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	65,212,006 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 19 (mouse)
End	6,065,927 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	mucosa of transverse colon; ; skin of leg; ; skin of abdomen; ; minor salivary glands; ; right uterine tube; ; right lobe of thyroid gland; ; olfactory zone of nasal mucosa; ; left lobe of thyroid gland; ; gallbladder; ; ectocervix;
	Top expressed in
	granulocyte; ; lip; ; transitional epithelium of urinary bladder; ; esophagus; ; muscle of thigh; ; corneal stroma; ; lumbar spinal ganglion; ; ankle; ; triceps brachii muscle; ; knee joint;
	More reference expression data
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	cysteine-type peptidase activity; metal ion binding; peptidase activity; protein binding; hydrolase activity; endopeptidase activity; calcium ion binding; calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity;
Cellular component	membrane; focal adhesion; intracellular anatomical structure; mitochondrion; lysosome; extracellular exosome; cytosol; extracellular region; cytoplasm; plasma membrane; ficolin-1-rich granule lumen;
Biological process	extracellular matrix disassembly; receptor catabolic process; positive regulation of cell population proliferation; regulation of macroautophagy; mammary gland involution; neutrophil degranulation; regulation of catalytic activity; cornification; self proteolysis; proteolysis; regulation of NMDA receptor activity;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	823
	12333
	ENSG00000014216
	ENSMUSG00000024942
	P07384
	О35350
	НМ_001198868 ; НМ_001198869 ; НМ_005186
	НМ_001110504 ; НМ_007600
	НП_001185797 ; НП_001185798 ; НП_005177
	НП_001103974 ; НП_031626
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Каталитическая субъединица кальпаина-1 (CANP 1) представляет собой белок , который у человека кодируется CAPN1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

Кальпаины , нейтральные протеазы, активируемые кальцием, представляют собой нелизосомальные внутриклеточные цистеиновые протеазы . Кальпаины млекопитающих включают повсеместно встречающиеся белки, специфичные для желудка и мышц. Вездесущие ферменты состоят из гетеродимеров с отдельными большими каталитическими субъединицами, связанными с общей малой регуляторной субъединицей. Этот ген кодирует большую субъединицу вездесущего фермента кальпаина 1. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что CAPN1 взаимодействует с PSEN2 . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000014216 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024942 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Аоки К., Имаджо С., Оно С., Эмори Ю., Койке М., Косаки Г., Сузуки К. (октябрь 1986 г.). «Полная аминокислотная последовательность большой субъединицы формы человеческой Ca2+-активируемой нейтральной протеазы (muCANP), выведенной из ее последовательности кДНК». ФЭБС Летт . 205 (2): 313–7. дои : 10.1016/0014-5793(86)80919-X . ПМИД 3017764 . S2CID 36697759 .
^ Оно С., Миношима С., Кудо Дж., Фукуяма Р., Симидзу Ю., Оми-Имаджо С., Симидзу Н., Судзуки К. (ноябрь 1990 г.). «Четыре гена семейства кальпаинов расположены на четырех разных хромосомах человека». Цитогенетический клеточный генетик . 53 (4): 225–9. дои : 10.1159/000132937 . ПМИД 2209092 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: кальпаин 1 CAPN1, большая субъединица (mu/I)» .
^ Шинозаки К., Маруяма К., Куме Х., Томита Т., Сайдо Т.С., Ивацубо Т., Обата К. (1998). «Петлевой домен пресенилина 2 взаимодействует с С-концевой областью мю-кальпаина». Межд. Дж. Мол. Мед . 1 (5): 797–9. дои : 10.3892/ijmm.1.5.797 . ПМИД 9852298 .

Дальнейшее чтение

Сузуки К., Соримачи Х., Ёсидзава Т., Кинбара К., Исиура С. (1996). «Калпаин: новые члены семьи, активация и физиологические функции». Биол. хим. Хоппе-Сейлер . 376 (9): 523–9. дои : 10.1515/bchm3.1995.376.9.523 . ПМИД 8561910 .
Хуан Ю, Ван К.К. (2001). «Семейство кальпаинов и болезни человека». Тенденции молекулярной медицины . 7 (8): 355–62. дои : 10.1016/S1471-4914(01)02049-4 . ПМИД 11516996 .
Голл Д.Э., Томпсон В.Ф., Ли Х, Вэй В, Конг Дж (2003). «Система Кальпаин». Физиол. Преподобный . 83 (3): 731–801. doi : 10.1152/physrev.00029.2002 . ПМИД 12843408 .
Баник Н.Л., ДеВрис Г.Х., Нойбергер Т., Рассел Т., Чакрабарти А.К., Хоган Э.Л. (1991). «Активность нейтральной протеиназы, активируемой кальцием (CANP; кальпаин), в шванновских клетках: локализация иммунофлуоресценции и компартментация мю- и mCANP». Дж. Нейроски. Рез . 29 (3): 346–54. дои : 10.1002/jnr.490290310 . ПМИД 1656060 . S2CID 40120102 .
Соримачи Х., Оми С., Эмори Ю., Кавасаки Х., Сайдо Т.С., Оно С., Минами Ю., Судзуки К. (1990). «Новый член семейства кальций-зависимых цистеиновых протеаз». Биол. хим. Хоппе-Сейлер . 371 Приложение: 171–6. ПМИД 2400579 .
Харрис А.С., Кроалл Д.Э., Морроу Дж.С. (1988). «Сайт связывания кальмодулина в альфа-фодрине находится рядом с сайтом расщепления кальций-зависимой протеазой-I» . Ж. Биол. Хим . 263 (30): 15754–61. дои : 10.1016/S0021-9258(19)37652-5 . ПМИД 2844821 .
Исигуро Х, Хигасияма С, Намикава С, Кунимацу М, Такано Э, Танака К, Окубо И, Мурачи Т, Сасаки М (1987). «Взаимодействие кальпаинов I и II человека с высокомолекулярными и низкомолекулярными кининогенами и их тяжелой цепью: механизм взаимодействия и роль двухвалентных катионов». Биохимия . 26 (10): 2863–70. дои : 10.1021/bi00384a030 . ПМИД 3038169 .
Моришита Р., Накаяма Х., Исобе Т., Мацуда Т., Хашимото Ю., Окано Т., Фукада Ю., Мизуно К., Оно С., Козава О. (1996). «Первичная структура гамма-субъединицы G-белка, гамма-12, и ее фосфорилирование протеинкиназой C» . Ж. Биол. Хим . 270 (49): 29469–75. дои : 10.1074/jbc.270.49.29469 . ПМИД 7493986 .
Кавита У, Мизель С.Б. (1996). «Дифференциальная чувствительность белков-предшественников интерлейкина-1 альфа и бета к расщеплению кальпаином, кальций-зависимой протеазой» . Ж. Биол. Хим . 270 (46): 27758–65. дои : 10.1074/jbc.270.46.27758 . ПМИД 7499244 .
Ду Икс, Сайдо Т.К., Цубуки С., Индиг Ф.Е., Уильямс М.Дж., Гинзберг М.Х. (1995). «Расщепление кальпаином цитоплазматического домена субъединицы бета-3 интегрина» . Ж. Биол. Хим . 270 (44): 26146–51. дои : 10.1074/jbc.270.44.26146 . ПМИД 7592818 .
Брэдфорд Х.Н., Джеймсон Б.А., Адам А.А., Вассел Р.П., Колман Р.В. (1994). «Непрерывные сайты связывания и ингибирования кининогенов, необходимые для ингибирования кальпаина тромбоцитов» . Ж. Биол. Хим . 268 (35): 26546–51. дои : 10.1016/S0021-9258(19)74347-6 . ПМИД 8253784 .
Ода А., Одзаки К., Друкер Б.Дж., Миякава Ю., Миядзаки Х., Ханда М., Морита Х., Охаси Х., Икеда Ю. (1996). «p120c-cbl присутствует в тромбоцитах человека и по-разному участвует в передаче сигналов тромбопоэтином и тромбином» . Кровь . 88 (4): 1330–8. doi : 10.1182/blood.V88.4.1330.bloodjournal8841330 . ПМИД 8695851 .
Чжан В., Лейн Р.Д., Меллгрен Р.Л. (1996). «Основные изоферменты кальпаина представляют собой долгоживущие белки. Разработка антисмысловой стратегии истощения кальпаина в культивируемых клетках» . Ж. Биол. Хим . 271 (31): 18825–30. дои : 10.1074/jbc.271.31.18825 . ПМИД 8702541 .
Курсо А, Гросджордж Дж., Годрэ П., Паннетт А.А., Форбс С.А., Уильямсон С., Бассетт Д., Таккер Р.В., Тех Б.Т., Фарнебо Ф., Шеперд Дж., Скогсейд Б., Ларссон С., Жиро С., Чжан С.Х., Саландр Дж., Календер А. (1997). «Определение минимальной области-кандидата MEN1 на основе интегрированной карты проксимального участка 11q13 размером 5 МБ. Европейский консорциум по Men1 (GENEM 1; Groupe d'Etude des Néoplasies Endocriniennes Multiples de type 1)». Геномика . 37 (3): 354–65. дои : 10.1006/geno.1996.0570 . ПМИД 8938448 .
Корасанити М.Т., Наварра М., Катани М.В., Мелино Дж., Нистико Дж., Финацци-Агро А (1997). «NMDA и белок оболочки ВИЧ-1, GP120, вызывают некротическую, но не апоптотическую гибель клеток в культурах нейробластомы человека CHP100 посредством механизма, включающего кальпаин». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 229 (1): 299–304. дои : 10.1006/bbrc.1996.1796 . ПМИД 8954122 .
Стабах П.Р., Чианчи К.Д., Гланц С.Б., Чжан З., Морроу Дж.С. (1997). «Сайт-направленный мутагенез альфа-II-спектрина в кодоне 1175 модулирует его чувствительность к мю-кальпаину». Биохимия . 36 (1): 57–65. дои : 10.1021/bi962034i . ПМИД 8993318 .
Норрис Ф.А., Аткинс Р.К., Маджерус П.В. (1997). «Инозитол-полифосфат-4-фосфатаза инактивируется кальпаин-опосредованным протеолизом в стимулированных тромбоцитах человека» . Ж. Биол. Хим . 272 (17): 10987–9. дои : 10.1074/jbc.272.17.10987 . ПМИД 9110986 .

Внешние ссылки

Онлайн-база данных MEROPS 15 января 2008 по пептидазам и их ингибиторам: C02.001. Архивировано г. на Wayback Machine.
человека Расположение генома CAPN1 и CAPN1 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 11 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000014216 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000024942 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid3017764-5] Аоки К., Имаджо С., Оно С., Эмори Ю., Койке М., Косаки Г., Сузуки К. (октябрь 1986 г.). «Полная аминокислотная последовательность большой субъединицы формы человеческой Ca2+-активируемой нейтральной протеазы (muCANP), выведенной из ее последовательности кДНК». ФЭБС Летт . 205 (2): 313–7. дои : 10.1016/0014-5793(86)80919-X . ПМИД 3017764 . S2CID 36697759 .

[pmid2209092-6] Оно С., Миношима С., Кудо Дж., Фукуяма Р., Симидзу Ю., Оми-Имаджо С., Симидзу Н., Судзуки К. (ноябрь 1990 г.). «Четыре гена семейства кальпаинов расположены на четырех разных хромосомах человека». Цитогенетический клеточный генетик . 53 (4): 225–9. дои : 10.1159/000132937 . ПМИД 2209092 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтреза: кальпаин 1 CAPN1, большая субъединица (mu/I)» .

[pmid9852298-8] Шинозаки К., Маруяма К., Куме Х., Томита Т., Сайдо Т.С., Ивацубо Т., Обата К. (1998). «Петлевой домен пресенилина 2 взаимодействует с С-концевой областью мю-кальпаина». Межд. Дж. Мол. Мед . 1 (5): 797–9. дои : 10.3892/ijmm.1.5.797 . ПМИД 9852298 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

v т и Протеазы : цистеиновые протеазы ( EC 3.4.22 ).
Caspase	Caspase 1 Caspase 2 Caspase 3 Caspase 4 Caspase 5 Caspase 6 Caspase 7 Caspase 8 Caspase 9 Caspase 10 Caspase 12 Caspase 13 Caspase 14
Fruit-derived	Papain Ficain Bromelain Actinidain
Calpain	CAPN1 CAPN2 CAPN3 CAPN5 CAPN6 CAPN7 CAPN8 CAPN9 CAPN10 CAPN11 CAPN12 CAPN13 CAPN14 CAPNS1 CAPNS2
Cathepsin	B C F H K L1/L2 O S W Z
Other	Clostripain Cancer procoagulant Separase Autophagin Cruzipain 3C-like protease Gingipain R Gingipain K