Катепсин F

CTSF
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1M6D
Идентификаторы
Псевдонимы	CTSF , CATSF, CLN13, катепсин F
Внешние идентификаторы	Опустить : 603539 ; МГИ : 1861434 ; Гомологен : 31194 ; GeneCards : CTSF ; OMA : CTSF — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	66,568,879 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 19 (mouse)
End	4,910,946 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right hemisphere of cerebellum; ; left testis; ; right testis; ; right coronary artery; ; left ovary; ; right frontal lobe; ; right ovary; ; tibial nerve; ; gastric mucosa; ; ascending aorta;
	Top expressed in
	neural layer of retina; ; adrenal gland; ; right kidney; ; choroid plexus of fourth ventricle; ; lip; ; cerebellar cortex; ; primary visual cortex; ; epithelium of lens; ; superior frontal gyrus; ; dentate gyrus of hippocampal formation granule cell;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	peptidase activity; cysteine-type peptidase activity; hydrolase activity; cysteine-type endopeptidase activity;
Cellular component	extracellular vesicle; lysosome; lysosomal lumen; extracellular exosome; extracellular space; collagen-containing extracellular matrix;
Biological process	proteolysis involved in cellular protein catabolic process; antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II; proteolysis;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	8722
	56464
	ENSG00000174080
	ENSMUSG00000083282
	Q9UBX1
	Q9R013
	НМ_003793
	НМ_019861
	НП_003784
	НП_063914
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Катепсин F — белок , который у человека кодируется CTSF геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Цистеиновые катепсины представляют собой семейство цистеиновых протеаз , которые представляют собой основной компонент лизосомальной протеолитической системы. Как правило, катепсины содержат сигнальный пептид , за которым следует пропептид , а затем каталитически активная зрелая область. Очень длинная (251 аминокислотный остаток) прообласть предшественника катепсина F содержит С-концевой домен, аналогичный про-сегменту катепсин-L -подобных ферментов, гибкий линкерный пептид из 50 остатков и N-концевой предсказанный домен. принять цистатин -подобную складку. Прорегион катепсина F уникален среди цистеиновых протеаз семейства папаина тем, что он содержит этот дополнительный N-концевой сегмент, который, как предполагается, имеет структурное сходство с ингибиторами цистеиновых протеаз суперсемейства цистатина. Этот цистатин-подобный домен содержит некоторые элементы, которые, как известно, важны для ингибирующей активности. CTSF кодирует предсказанный белок из 484 аминокислот, который содержит сигнальный пептид из 19 остатков. Катепсин F содержит пять потенциальных N-гликозилирований. сайты, и он может быть направлен в эндосомальный/лизосомальный компартмент через путь рецептора маннозо-6-фосфата . Ген катепсина F экспрессируется повсеместно и картируется на хромосоме 11q13, близкой к гену, кодирующему катепсин W. ^{[ 7 ]}

У нечеловеческих видов

Иммунодиагностика Opisthorchis viverrini.

Opisthorchis viverrini , паразит, обычно обнаруживается при исследовании кала, в частности, путем подсчета яиц. Однако этот неинвазивный метод «золотого стандарта» может оказаться ненадежным при легкой инфекции и трудоемким. Анализ ELISA , который обнаруживает присутствие белка катепсина F паразита, может использоваться в качестве альтернативного способа проверки присутствия паразита. ^{[ 8 ]}

Открытие гребешка Йессо ( Mizuhopecten Yessoensis )

В 2018 году было обнаружено, что гребешок Йессо ( Mizuhopecten Yessoensis ) экспрессирует катепсин F в ответ на бактериальную инфекцию. Морской гребешок Йессо страдает от высокой смертности из-за бактериальных заболеваний. Понимание работы врожденной иммунной системы на различных стадиях эмбрионального развития может помочь соответствующей отрасли аквакультуры. ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000174080 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000083282 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Ван Б., Ши Г.П., Яо П.М., Ли З., Чепмен Х.А., Бромм Д. (декабрь 1998 г.). «Человеческий катепсин F. Молекулярное клонирование, функциональная экспрессия, тканевая локализация и ферментативная характеристика» . J Биол Хим . 273 (48): 32000–8. дои : 10.1074/jbc.273.48.32000 . ПМИД 9822672 .
^ Сантамария И., Веласко Г., Пендас А.М., Пас А., Лопес-Отин С. (июнь 1999 г.). «Молекулярное клонирование и структурная и функциональная характеристика человеческого катепсина F, новой цистеиновой протеиназы семейства папаина с длинным пропептидным доменом» . J Биол Хим . 274 (20): 13800–9. дои : 10.1074/jbc.274.20.13800 . ПМИД 10318784 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: катепсин F CTSF» .
^ Темори, Сальма; Аримацу, Юджи; Лаха, Теварах; Кьюкс, Саутхорн; Серерак, Пия; Тангаваттана, Сирикачорн; Бриндли, Пол Дж; Шрипа, Банчоб (декабрь 2015 г.). «Иммунодиагностика описторхоза с использованием паразитарного катепсина F» . Паразитологические исследования . 114 (12): 4571–4578. дои : 10.1007/s00436-015-4703-9 . ISSN 0932-0113 . ПМЦ 4917378 . ПМИД 26344868 .
^ Хаобин; Чжан, Мэйвэй; Ли, Жуоцзяо; Лу, Цзярун; Ван, Янфан (сентябрь 2018 г.). Го , yessoensis» . Иммунология рыб и моллюсков . 80 : 141–147. doi : 10.1016 j.fsi.2018.06.005 PMID 29879509 / S2CID 47014597 .

Дальнейшее чтение

Нэглер Д.К., Сулеа Т., Минар Р. (1999). «Полноразмерная кДНК катепсина F человека предсказывает наличие цистатинового домена на N-конце зимогена цистеиновой протеазы». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 257 (2): 313–8. дои : 10.1006/bbrc.1999.0461 . ПМИД 10198209 .
Векс Т., Леви Б., Векс Х., Бромме Д. (1999). «Человеческие катепсины F и W: новая подгруппа катепсинов». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 259 (2): 401–7. дои : 10.1006/bbrc.1999.0700 . ПМИД 10362521 .
Векс Т., Векс Х., Бромме Д. (2000). «Ген катепсина F человека - продукт слияния предкового катепсина и гена цистатина». Биол. Хим . 380 (12): 1439–42. дои : 10.1515/BC.1999.185 . ПМИД 10661872 . S2CID 28469574 .
Ши Г.П., Брайант Р.А., Ризе Р. и др. (2000). «Роль катепсина F в процессинге инвариантной цепи и загрузке пептидов класса II главного комплекса гистосовместимости макрофагами» . Дж. Эксп. Мед . 191 (7): 1177–86. дои : 10.1084/jem.191.7.1177 . ПМК 2193169 . ПМИД 10748235 .
Дойссинг Дж., Тисляр К., Папазоглу А., Петерс С. (2000). «Мышиный катепсин F: клонирование кДНК, геномная организация и хромосомное распределение гена». Джин . 251 (2): 165–73. дои : 10.1016/S0378-1119(00)00196-7 . ПМИД 10876093 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Оёрни К., Снек М., Бромме Д. и др. (2004). «Цистеиновая протеаза катепсин F экспрессируется в атеросклеротических поражениях человека, секретируется культивируемыми макрофагами и модифицирует частицы липопротеинов низкой плотности in vitro» . Ж. Биол. Хим . 279 (33): 34776–84. дои : 10.1074/jbc.M310814200 . ПМИД 15184381 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Васкес-Ортис Г., Пина-Санчес П., Васкес К. и др. (2006). «Сверхэкспрессия катепсина F, матриксных металлопротеиназ 11 и 12 при раке шейки матки» . БМК Рак . 5 (1): 68. дои : 10.1186/1471-2407-5-68 . ПМК 1175083 . ПМИД 15989693 .
Каакинен Р., Линдстедт К.А., Снек М. и др. (2007). «Ангиотензин II увеличивает экспрессию и секрецию катепсина F в культивируемых макрофагах, полученных из моноцитов человека: эффект, опосредованный рецептором ангиотензина II типа 2». Атеросклероз . 192 (2): 323–7. doi : 10.1016/j.atherosclerosis.2006.08.001 . ПМИД 16963053 .

Внешние ссылки

Онлайн-база данных MEROPS . по пептидазам и их ингибиторам: C01.018

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 11 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000174080 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000083282 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9822672-5] Ван Б., Ши Г.П., Яо П.М., Ли З., Чепмен Х.А., Бромм Д. (декабрь 1998 г.). «Человеческий катепсин F. Молекулярное клонирование, функциональная экспрессия, тканевая локализация и ферментативная характеристика» . J Биол Хим . 273 (48): 32000–8. дои : 10.1074/jbc.273.48.32000 . ПМИД 9822672 .

[pmid10318784-6] Сантамария И., Веласко Г., Пендас А.М., Пас А., Лопес-Отин С. (июнь 1999 г.). «Молекулярное клонирование и структурная и функциональная характеристика человеческого катепсина F, новой цистеиновой протеиназы семейства папаина с длинным пропептидным доменом» . J Биол Хим . 274 (20): 13800–9. дои : 10.1074/jbc.274.20.13800 . ПМИД 10318784 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: катепсин F CTSF» .

[8] Темори, Сальма; Аримацу, Юджи; Лаха, Теварах; Кьюкс, Саутхорн; Серерак, Пия; Тангаваттана, Сирикачорн; Бриндли, Пол Дж; Шрипа, Банчоб (декабрь 2015 г.). «Иммунодиагностика описторхоза с использованием паразитарного катепсина F» . Паразитологические исследования . 114 (12): 4571–4578. дои : 10.1007/s00436-015-4703-9 . ISSN 0932-0113 . ПМЦ 4917378 . ПМИД 26344868 .

[9] Хаобин; Чжан, Мэйвэй; Ли, Жуоцзяо; Лу, Цзярун; Ван, Янфан (сентябрь 2018 г.). Го , yessoensis» . Иммунология рыб и моллюсков . 80 : 141–147. doi : 10.1016 j.fsi.2018.06.005 PMID 29879509 / S2CID 47014597 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

v т и Протеазы : цистеиновые протеазы ( EC 3.4.22 ).
Caspase	Caspase 1 Caspase 2 Caspase 3 Caspase 4 Caspase 5 Caspase 6 Caspase 7 Caspase 8 Caspase 9 Caspase 10 Caspase 12 Caspase 13 Caspase 14
Fruit-derived	Papain Ficain Bromelain Actinidain
Calpain	CAPN1 CAPN2 CAPN3 CAPN5 CAPN6 CAPN7 CAPN8 CAPN9 CAPN10 CAPN11 CAPN12 CAPN13 CAPN14 CAPNS1 CAPNS2
Cathepsin	B C F H K L1/L2 O S W Z
Other	Clostripain Cancer procoagulant Separase Autophagin Cruzipain 3C-like protease Gingipain R Gingipain K

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)