Каталитическая субъединица кальпаин-2

КАПН2
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1KFU, 1KFX, 2NQA
Идентификаторы
Псевдонимы	CAPN2 , CANP2, CANPL2, CANPml, mCANP, кальпаин 2
Внешние идентификаторы	Опустить : 114230 ; МГИ : 88264 ; Гомологен : 1326 ; GeneCards : CAPN2 ; OMA : CAPN2 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 1 (human)
End	223,776,018 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 1 (mouse)
End	182,345,173 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	bronchial epithelial cell; ; nasal epithelium; ; glomerulus; ; mucosa of sigmoid colon; ; right uterine tube; ; parotid gland; ; metanephric glomerulus; ; parietal pleura; ; cartilage tissue; ; visceral pleura;
	Top expressed in
	endothelial cell of lymphatic vessel; ; genital tubercle; ; facial motor nucleus; ; gastrula; ; belly cord; ; left lung; ; tail of embryo; ; right lung; ; right lung lobe; ; cornea;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	calcium ion binding; cysteine-type peptidase activity; metal ion binding; cytoskeletal protein binding; peptidase activity; protein binding; protein heterodimerization activity; hydrolase activity; calcium-dependent cysteine-type endopeptidase activity; enzyme binding;
Cellular component	Golgi apparatus; pseudopodium; membrane; focal adhesion; perinuclear endoplasmic reticulum; intracellular anatomical structure; dendrite; endoplasmic reticulum; cortical actin cytoskeleton; membrane raft; chromatin; lysosome; extracellular exosome; nucleus; cytosol; cytoplasm; plasma membrane; mitochondrial intermembrane space; external side of plasma membrane; cell projection; neuronal cell body;
Biological process	response to hypoxia; protein autoprocessing; proteolysis; cellular response to amino acid stimulus; myoblast fusion; proteolysis involved in cellular protein catabolic process; regulation of cytoskeleton organization; blastocyst development; extracellular matrix disassembly; female pregnancy; positive regulation of cardiac muscle cell apoptotic process; regulation of interleukin-6 production; cellular response to interferon-beta; response to hydrogen peroxide; behavioral response to pain; cellular response to lipopolysaccharide; positive regulation of neuron death; positive regulation of myoblast fusion; positive regulation of phosphatidylcholine biosynthetic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	824
	12334
	ENSG00000162909
	ENSMUSG00000026509
	P17655
	О08529
	НМ_001146068 ; НМ_001748
	НМ_009794
	НП_001139540 ; НП_001739
	НП_033924
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Каталитическая субъединица кальпаина-2 представляет собой белок , который у человека кодируется CAPN2 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Кальпаины, нейтральные протеазы, активируемые кальцием, представляют собой нелизосомальные внутриклеточные цистеиновые протеазы. Кальпаины млекопитающих включают повсеместно встречающиеся белки, специфичные для желудка и мышц. Вездесущие ферменты состоят из гетеродимеров с отдельными большими каталитическими субъединицами, связанными с общей малой регуляторной субъединицей. Этот ген кодирует большую субъединицу вездесущего фермента кальпаина 2. Сообщалось о множественных гетерогенных сайтах начала транскрипции в 5'-UTR. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что CAPN2 взаимодействует с Bcl-2 . ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000162909 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000026509 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Имаджо С., Аоки К., Оно С., Эмори Ю., Кавасаки Х., Сугихара Х., Судзуки К. (1988). «Молекулярное клонирование кДНК большой субъединицы Ca2+-требующей формы человеческой Ca2+-активируемой нейтральной протеазы». Биохимия . 27 (21): 8122–8. дои : 10.1021/bi00421a022 . ПМИД 2852952 .
^ Хата А., Оно С., Акита Ю., Сузуки К. (май 1989 г.). «Тандемно повторяющиеся негативные энхансероподобные элементы регулируют транскрипцию человеческого гена большой субъединицы кальций-зависимой протеазы» . Ж. Биол. Хим . 264 (11): 6404–11. дои : 10.1016/S0021-9258(18)83364-6 . ПМИД 2539381 .
^ «Ген Энтрез: CAPN2 кальпаин 2, большая субъединица (m/II)» .
^ Хиль-Паррадо С, Фернандес-Монтальван А, Асфальг-Махляйдт И, Попп О, Бесватер Ф, Холлоски А, Кнох Т.А., Ауэрсвальд Э.А., Уэлш К., Рид Х.К., Фриц Х., Фуэнтес-Приор П., Шписс Е., Сальвесен Г.С., Махлейдт В. (июль 2002 г.). «Иономицин-активированный кальпаин запускает апоптоз. Возможная роль членов семейства Bcl-2» . Ж. Биол. Хим . 277 (30): 27217–26. дои : 10.1074/jbc.M202945200 . ПМИД 12000759 .

Дальнейшее чтение

Сузуки К., Соримачи Х., Ёсидзава Т., Кинбара К., Исиура С. (1995). «Калпаин: новые члены семьи, активация и физиологические функции». Биол. хим. Хоппе-Сейлер . 376 (9): 523–9. дои : 10.1515/bchm3.1995.376.9.523 . ПМИД 8561910 .
Коэн ГМ (1997). «Каспазы: палачи апоптоза» . Биохим. Дж . 326 (Часть 1): 1–16. дои : 10.1042/bj3260001 . ПМЦ 1218630 . ПМИД 9337844 .
Ревертер Д., Соримачи Х., Боде В. (2001). «Структура человеческого м-кальпаина, не содержащего кальция: значение для активации и функции кальция». Тенденции Кардиоваск. Мед . 11 (6): 222–9. дои : 10.1016/S1050-1738(01)00112-8 . ПМИД 11673052 .
Копп С (1976). «Воспроизводимость ответов на анкету о симптомах жевательной дисфункции». Эпидемиол полости рта Community Dent . 4 (5): 205–9. дои : 10.1111/j.1600-0528.1976.tb00985.x . ПМИД 1067155 .
Адачи Ю, Китахара-Озава А, Сугамура К, Ли В.Дж., Ёдои Дж, Маки М, Мурачи Т, Хатанака М (1992). «Экспрессия гена кальпаина II в клетках кроветворной системы человека, инфицированных вирусом Т-клеточного лейкоза человека типа I» . Ж. Биол. Хим . 267 (27): 19373–8. дои : 10.1016/S0021-9258(18)41785-1 . ПМИД 1527057 .
Оно С., Миношима С., Кудо Дж., Фукуяма Р., Симидзу Ю., Оми-Имаджо С., Симидзу Н., Судзуки К. (1990). «Четыре гена семейства кальпаинов расположены на четырех разных хромосомах человека». Цитогенет. Клеточная генетика . 53 (4): 225–9. дои : 10.1159/000132937 . ПМИД 2209092 .
Исигуро Х, Хигасияма С, Намикава С, Кунимацу М, Такано Э, Танака К, Окубо И, Мурачи Т, Сасаки М (1987). «Взаимодействие кальпаинов I и II человека с высокомолекулярными и низкомолекулярными кининогенами и их тяжелой цепью: механизм взаимодействия и роль двухвалентных катионов». Биохимия . 26 (10): 2863–70. дои : 10.1021/bi00384a030 . ПМИД 3038169 .
Шринивасула С.М., Фернандес-Алнемри Т., Зангрилли Дж., Робертсон Н., Армстронг Р.К., Ван Л., Трапани Дж.А., Томаселли К.Дж., Литвак Г., Алнемри Э.С. (1996). «Ced-3/интерлейкин 1бета-превращающий фермент, подобный гомологу Mch6, и фермент, расщепляющий ламин, Mch2alpha, являются субстратами для апоптотического медиатора CPP32» . Ж. Биол. Хим . 271 (43): 27099–106. дои : 10.1074/jbc.271.43.27099 . ПМИД 8900201 .
Корасанити М.Т., Наварра М., Катани М.В., Мелино Дж., Нистико Дж., Финацци-Агро А (1996). «NMDA и белок оболочки ВИЧ-1, GP120, вызывают некротическую, но не апоптотическую гибель клеток в культурах нейробластомы человека CHP100 посредством механизма, включающего кальпаин». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 229 (1): 299–304. дои : 10.1006/bbrc.1996.1796 . ПМИД 8954122 .
Фудзитани К., Камбаяши Дж., Сакон М., Оми С.И., Кавасима С., Юкава М., Яно Ю., Миёси Х., Икеда М., Синоки Н., Монден М. (1997). «Идентификация мю-, м-кальпаинов и кальпастатина и захват активации мю-кальпаина в эндотелиальных клетках». Дж. Селл. Биохим . 66 (2): 197–209. doi : 10.1002/(SICI)1097-4644(19970801)66:2<197::AID-JCB7>3.0.CO;2-L . ПМИД 9213221 . S2CID 85163404 .
Рок М.Т., Брукс В.Х., Розман Т.Л. (1997). «Кальций-зависимые сигнальные пути в Т-клетках. Потенциальная роль кальпаина, протеинтирозинфосфатазы 1b и p130Cas в интегрин-опосредованных сигнальных событиях» . Ж. Биол. Хим . 272 (52): 33377–83. дои : 10.1074/jbc.272.52.33377 . ПМИД 9407132 .
Уэяма Х, Кумамото Т, Фудзимото С, Мураками Т, Цуда Т (1998). «Экспрессия трех генов изоформ кальпаина в скелетных мышцах человека». Дж. Нейрол. Наука . 155 (2): 163–9. дои : 10.1016/S0022-510X(97)00309-2 . ПМИД 9562261 . S2CID 205898607 .
Штробль С., Фернандес-Каталан С., Браун М., Хубер Р., Масумото Х., Накагава К., Ири А., Соримачи Х., Буренков Г., Бартуник Х., Сузуки К., Боде В. (2000). «Кристаллическая структура человеческого м-кальпаина, не содержащего кальция, предполагает механизм электростатического переключения для активации кальцием» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 97 (2): 588–92. Бибкод : 2000PNAS...97..588S . дои : 10.1073/pnas.97.2.588 . ПМК 15374 . ПМИД 10639123 .
Масумото Х, Накагава К, Ири С, Соримачи Х, Сузуки К, Буренков Г.П., Бартуник Х, Фернандес-Каталан С, Боде В, Штробл С (2000). «Кристаллизация и предварительный рентгеноструктурный анализ рекомбинантного полноразмерного человеческого м-кальпаина». Акта Кристаллогр. Д. 56 (Часть 1): 73–5. Бибкод : 2000AcCrD..56...73M . дои : 10.1107/S0907444999013748 . ПМИД 10666632 .
Чуа Б.Т., Го К., Ли П. (2000). «Прямое расщепление кальций-активируемой протеазой кальпаин может привести к инактивации каспаз» . Ж. Биол. Хим . 275 (7): 5131–5. дои : 10.1074/jbc.275.7.5131 . ПМИД 10671558 .
Ли М.С., Квон Ю.Т., Ли М., Пэн Дж., Фридлендер Р.М., Цай Л.Х. (2000). «Нейротоксичность вызывает расщепление р35-р25 кальпаином». Природа . 405 (6784): 360–4. Бибкод : 2000Natur.405..360L . дои : 10.1038/35012636 . ПМИД 10830966 . S2CID 205006589 .

Внешние ссылки

Онлайн-база данных MEROPS Архивировано по пептидазам и их ингибиторам: C02.002. 12 апреля 2008 г. на Wayback Machine.
человека Расположение генома CAPN2 и CAPN2 страница сведений о гене в браузере генома UCSC .

статья о гене на хромосоме 1 человека незавершена Эта . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000162909 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000026509 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid2852952-5] Имаджо С., Аоки К., Оно С., Эмори Ю., Кавасаки Х., Сугихара Х., Судзуки К. (1988). «Молекулярное клонирование кДНК большой субъединицы Ca2+-требующей формы человеческой Ca2+-активируемой нейтральной протеазы». Биохимия . 27 (21): 8122–8. дои : 10.1021/bi00421a022 . ПМИД 2852952 .

[pmid2539381-6] Хата А., Оно С., Акита Ю., Сузуки К. (май 1989 г.). «Тандемно повторяющиеся негативные энхансероподобные элементы регулируют транскрипцию человеческого гена большой субъединицы кальций-зависимой протеазы» . Ж. Биол. Хим . 264 (11): 6404–11. дои : 10.1016/S0021-9258(18)83364-6 . ПМИД 2539381 .

[entrez-7] «Ген Энтрез: CAPN2 кальпаин 2, большая субъединица (m/II)» .

[pmid12000759-8] Хиль-Паррадо С, Фернандес-Монтальван А, Асфальг-Махляйдт И, Попп О, Бесватер Ф, Холлоски А, Кнох Т.А., Ауэрсвальд Э.А., Уэлш К., Рид Х.К., Фриц Х., Фуэнтес-Приор П., Шписс Е., Сальвесен Г.С., Махлейдт В. (июль 2002 г.). «Иономицин-активированный кальпаин запускает апоптоз. Возможная роль членов семейства Bcl-2» . Ж. Биол. Хим . 277 (30): 27217–26. дои : 10.1074/jbc.M202945200 . ПМИД 12000759 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

v т и Протеазы : цистеиновые протеазы ( EC 3.4.22 ).
Caspase	Caspase 1 Caspase 2 Caspase 3 Caspase 4 Caspase 5 Caspase 6 Caspase 7 Caspase 8 Caspase 9 Caspase 10 Caspase 12 Caspase 13 Caspase 14
Fruit-derived	Papain Ficain Bromelain Actinidain
Calpain	CAPN1 CAPN2 CAPN3 CAPN5 CAPN6 CAPN7 CAPN8 CAPN9 CAPN10 CAPN11 CAPN12 CAPN13 CAPN14 CAPNS1 CAPNS2
Cathepsin	B C F H K L1/L2 O S W Z
Other	Clostripain Cancer procoagulant Separase Autophagin Cruzipain 3C-like protease Gingipain R Gingipain K