Каспаза 7

КАСП7
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1F1J, 1GQF, 1I4O, 1I51, 1K86, 1K88, 1KMC, 1SHJ, 1SHL, 2QL5, 2QL7, 2QL9, 2QLB, 2QLF, 2QLJ, 3EDR, 3H1P, 3IBC, 3IBF, 3R5K, 4FDL, 4FEA, 4HQ0, 4HQR, 4JB8, 4JJ8, 4JR1, 4JR2, 4LSZ, 4ZVR, 4ZVQ, 4ZVO, 4ZVU, 4ZVT, 4ZVS, 4ZVP, 5IC6
Идентификаторы
Псевдонимы	CASP7 , CASP-7, CMH-1, ICE-LAP3, LICE2, MCH3, каспаза 7
Внешние идентификаторы	Опустить : 601761 ; МГИ : 109383 ; Гомологен : 11168 ; Генные карты : CASP7 ; OMA : CASP7 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 10 (human)
End	113,730,907 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 19 (mouse)
End	56,430,776 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	rectum; ; palpebral conjunctiva; ; epithelium of nasopharynx; ; jejunal mucosa; ; mucosa of transverse colon; ; duodenum; ; parotid gland; ; nasal epithelium; ; mucosa of sigmoid colon; ; mucosa of paranasal sinus;
	Top expressed in
	intestinal villus; ; Ileal epithelium; ; jejunum; ; lens; ; left colon; ; duodenum; ; submandibular gland; ; pineal gland; ; conjunctival fornix; ; choroidal fissure;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	cysteine-type peptidase activity; cysteine-type endopeptidase activity; protein binding; hydrolase activity; peptidase activity; cysteine-type endopeptidase activity involved in execution phase of apoptosis; cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; nucleus; nucleoplasm;
Biological process	proteolysis; cellular response to staurosporine; execution phase of apoptosis; apoptotic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	840
	12369
	ENSG00000165806
	ENSMUSG00000025076
	P55210
	P97864
showНМ_001227 ; НМ_001267056 ; НМ_001267057 ; НМ_001267058 ; НМ_033338 ;
	NM_033339; NM_033340; NM_001320911
	НМ_007611
showНП_001218 ; НП_001253985 ; НП_001253986 ; НП_001253987 ; НП_001307840 ;
	NP_203124; NP_203125; NP_203126
	НП_031637
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Каспаза-7, цистеиновая пептидаза, связанная с апоптозом , также известная как CASP7 , представляет собой человеческий белок, кодируемый CASP7 геном . CASP7 Ортологи ^{[ 5 ]} были идентифицированы почти у всех млекопитающих , для которых доступны полные данные о геноме. Уникальные ортологи имеются также у птиц , ящериц , лисамфибий и костистых рыб .

Функция

Каспаза-7 является членом семейства белков каспаз ( цистеин - аспартат протеазы - ) и, как было показано, является белком-исполнителем апоптоза . Последовательная активация каспаз играет центральную роль в фазе апоптоза клеток . Каспазы существуют в виде неактивных проферментов , которые подвергаются протеолитическому процессингу вышестоящими каспазами (каспаза-8, -9) по консервативным остаткам аспарагиновой кислоты с образованием двух субъединиц, большой и малой, которые димеризуются с образованием активного фермента в форме гетеротетрамера. Предшественник этой каспазы расщепляется каспазой 3 , каспазой 10 и каспазой 9 . Он активируется при стимулах гибели клеток и индуцирует апоптоз. Альтернативный сплайсинг приводит к образованию четырех вариантов транскриптов, кодирующих три различные изоформы . ^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что каспаза 7 взаимодействует с:

Каспаза 8 , ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}
Выжить ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]} и
СИАП . ^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}^{[ 13 ]}^{[ 14 ]}

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000165806 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025076 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Филогенетический маркер OrthoMaM: кодирующая последовательность CASP7» . Архивировано из оригинала 4 марта 2016 г. Проверено 20 декабря 2009 г.
^ «Ген Энтреза: каспаза 7 CASP7, цистеинпептидаза, связанная с апоптозом» .
^ Го Ю, Сринивасула С.М., Друилхе А., Фернандес-Алнемри Т., Алнемри Э.С. (апрель 2002 г.). «Каспаза-2 индуцирует апоптоз, высвобождая проапоптотические белки из митохондрий» . Ж. Биол. Хим . 277 (16): 13430–7. дои : 10.1074/jbc.M108029200 . ПМИД 11832478 .
^ Шринивасула С.М., Ахмад М., Фернандес-Алнемри Т., Литвак Г., Алнемри Э.С. (декабрь 1996 г.). «Молекулярное упорядочение пути Fas-апоптоза: протеаза Fas/APO-1 Mch5 представляет собой CrmA-ингибируемую протеазу, которая активирует несколько Ced-3/ICE-подобных цистеиновых протеаз» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 93 (25): 14486–91. Бибкод : 1996PNAS...9314486S . дои : 10.1073/pnas.93.25.14486 . ПМК 26159 . ПМИД 8962078 .
^ Тамм И., Ван Й., Сосвилл Э., Скудьеро Д.А., Винья Н., Ольтерсдорф Т., Рид Дж.К. (декабрь 1998 г.). «Белок сурвивин семейства IAP ингибирует активность каспаз и апоптоз, индуцированные Fas (CD95), Bax, каспазами и противораковыми препаратами». Рак Рез . 58 (23): 5315–20. ПМИД 9850056 .
^ Шин С., Сунг Б.Дж., Чо Ю.С., Ким Х.Дж., Ха NC, Хван Джи, Чунг К.В., Юнг Ю.К., О Б.Х. (январь 2001 г.). «Антиапоптотический белок человека сурвивин является прямым ингибитором каспаз-3 и -7». Биохимия . 40 (4): 1117–23. дои : 10.1021/bi001603q . ПМИД 11170436 .
^ Ридл С.Дж., Ренатус М., Шварценбахер Р., Чжоу К., Сунь С., Фесик С.В., Лиддингтон Р.К., Салвесен Г.С. (март 2001 г.). «Структурная основа ингибирования каспазы-3 XIAP» . Клетка . 104 (5): 791–800. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00274-4 . ПМИД 11257232 . S2CID 17915093 .
^ Рой Н., Деверо К.Л., Такахаши Р., Салвесен Г.С., Рид Дж.К. (декабрь 1997 г.). «Белки c-IAP-1 и c-IAP-2 являются прямыми ингибиторами специфических каспаз» . ЭМБО Дж . 16 (23): 6914–25. дои : 10.1093/emboj/16.23.6914 . ПМК 1170295 . ПМИД 9384571 .
^ Деверо К.Л., Такахаши Р., Салвесен Г.С., Рид Дж.К. (июль 1997 г.). «X-связанный IAP является прямым ингибитором протеаз клеточной гибели» . Природа . 388 (6639): 300–4. Бибкод : 1997Natur.388..300D . дои : 10.1038/40901 . ПМИД 9230442 . S2CID 4395885 .
^ Сузуки Ю., Накабаяши Ю., Наката К., Рид Дж.К., Такахаши Р. (июль 2001 г.). «Х-связанный ингибитор белка апоптоза (XIAP) ингибирует каспазу-3 и -7 разными способами» . Ж. Биол. Хим . 276 (29): 27058–63. дои : 10.1074/jbc.M102415200 . ПМИД 11359776 .

Дальнейшее чтение

Коэн ГМ (1997). «Каспазы: палачи апоптоза» . Биохим. Дж . 326 (Часть 1): 1–16. дои : 10.1042/bj3260001 . ПМЦ 1218630 . ПМИД 9337844 .

Внешние ссылки

Онлайн-база данных MEROPS . по пептидазам и их ингибиторам: C14.004 ^{[ постоянная мертвая ссылка ]}
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P55210 (Человеческая каспаза-7) в PDBe-KB .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 10 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000165806 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025076 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[OrthoMaM-5] «Филогенетический маркер OrthoMaM: кодирующая последовательность CASP7» . Архивировано из оригинала 4 марта 2016 г. Проверено 20 декабря 2009 г.

[6] «Ген Энтреза: каспаза 7 CASP7, цистеинпептидаза, связанная с апоптозом» .

[pmid11832478-7] Го Ю, Сринивасула С.М., Друилхе А., Фернандес-Алнемри Т., Алнемри Э.С. (апрель 2002 г.). «Каспаза-2 индуцирует апоптоз, высвобождая проапоптотические белки из митохондрий» . Ж. Биол. Хим . 277 (16): 13430–7. дои : 10.1074/jbc.M108029200 . ПМИД 11832478 .

[pmid8962078-8] Шринивасула С.М., Ахмад М., Фернандес-Алнемри Т., Литвак Г., Алнемри Э.С. (декабрь 1996 г.). «Молекулярное упорядочение пути Fas-апоптоза: протеаза Fas/APO-1 Mch5 представляет собой CrmA-ингибируемую протеазу, которая активирует несколько Ced-3/ICE-подобных цистеиновых протеаз» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 93 (25): 14486–91. Бибкод : 1996PNAS...9314486S . дои : 10.1073/pnas.93.25.14486 . ПМК 26159 . ПМИД 8962078 .

[pmid9850056-9] Тамм И., Ван Й., Сосвилл Э., Скудьеро Д.А., Винья Н., Ольтерсдорф Т., Рид Дж.К. (декабрь 1998 г.). «Белок сурвивин семейства IAP ингибирует активность каспаз и апоптоз, индуцированные Fas (CD95), Bax, каспазами и противораковыми препаратами». Рак Рез . 58 (23): 5315–20. ПМИД 9850056 .

[pmid11170436-10] Шин С., Сунг Б.Дж., Чо Ю.С., Ким Х.Дж., Ха NC, Хван Джи, Чунг К.В., Юнг Ю.К., О Б.Х. (январь 2001 г.). «Антиапоптотический белок человека сурвивин является прямым ингибитором каспаз-3 и -7». Биохимия . 40 (4): 1117–23. дои : 10.1021/bi001603q . ПМИД 11170436 .

[pmid11257232-11] Ридл С.Дж., Ренатус М., Шварценбахер Р., Чжоу К., Сунь С., Фесик С.В., Лиддингтон Р.К., Салвесен Г.С. (март 2001 г.). «Структурная основа ингибирования каспазы-3 XIAP» . Клетка . 104 (5): 791–800. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00274-4 . ПМИД 11257232 . S2CID 17915093 .

[pmid9384571-12] Рой Н., Деверо К.Л., Такахаши Р., Салвесен Г.С., Рид Дж.К. (декабрь 1997 г.). «Белки c-IAP-1 и c-IAP-2 являются прямыми ингибиторами специфических каспаз» . ЭМБО Дж . 16 (23): 6914–25. дои : 10.1093/emboj/16.23.6914 . ПМК 1170295 . ПМИД 9384571 .

[pmid9230442-13] Деверо К.Л., Такахаши Р., Салвесен Г.С., Рид Дж.К. (июль 1997 г.). «X-связанный IAP является прямым ингибитором протеаз клеточной гибели» . Природа . 388 (6639): 300–4. Бибкод : 1997Natur.388..300D . дои : 10.1038/40901 . ПМИД 9230442 . S2CID 4395885 .

[pmid11359776-14] Сузуки Ю., Накабаяши Ю., Наката К., Рид Дж.К., Такахаши Р. (июль 2001 г.). «Х-связанный ингибитор белка апоптоза (XIAP) ингибирует каспазу-3 и -7 разными способами» . Ж. Биол. Хим . 276 (29): 27058–63. дои : 10.1074/jbc.M102415200 . ПМИД 11359776 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

v т и Протеазы : цистеиновые протеазы ( EC 3.4.22 ).
Каспаза	Каспаза 1 Каспаза 2 Каспаза 3 Каспаза 4 Каспаза 5 Каспаза 6 Каспаза 7 Каспаза 8 Каспаза 9 Каспаза 10 Каспаза 12 Каспаза 13 Каспаза 14
Фруктовый	Папаин Фикаин Бромелайн актинидаин
Кальпаин	КАПН1 КАПН2 КАПН3 КАПН5 КАПН6 КАПН7 КАПН8 КАПН9 КАПН10 КАПН11 КАПН12 КАПН13 КАПН14 КАПНС1 КАПНС2
Катепсин	Б С Ф ЧАС К Л1 / Л2 ТО С В С
Другой	Клострипаин Прокоагулянт рака отдельный Аутофагин Крузипаин 3C-подобная протеаза Гингипаин Р Гингипаин К

v т и Ферменты
Активность	Активный сайт Связывающий сайт Каталитическая триада Оксианионная дырка Ферментная распущенность Фермент, ограниченный диффузией Кофактор Ферментативный катализ
Регулирование	Аллостерическая регуляция Кооперативность Ингибитор ферментов Активатор ферментов
Классификация	Номер ЕС Суперсемейство ферментов Семейство ферментов Список ферментов
Кинетика	Кинетика ферментов Диаграмма Иди – Хофсти Заговор Хейнса – Вульфа График Лайнуивера – Берка Кинетика Михаэлиса – Ментен
Типы	EC1 Оксидоредуктазы ( список ) EC2 Трансферазы ( список ) EC3 Гидролазы ( список ) EC4- лиазы ( список ) EC5 Изомеразы ( список ) EC6- лигазы ( список ) EC7 Транслоказы ( список )