Катепсин С

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Домен исключения катепсина C
Домен исключения катепсина C
	повторное определение нативной структуры дипептидилпептидазы i человека (катепсина с)
Идентификаторы
Символ	КатепсинC_exc
Пфам	PF08773
ИнтерПро	ИПР014882
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2	1к3б / СКОПе / СУПФАМ
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

КТСК
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4OEM, 1K3B, 2DJF, 2DJG, 3PDF, 4CDC, 4CDD, 4CDE, 4CDF, 4OEL
Идентификаторы
Псевдонимы	CTSC , CPPI, DPP-I, DPP1, DPPI, HMS, JP, JPD, PALS, PDON1, PLS, катепсин C
Внешние идентификаторы	Опустить : 602365 ; МГИ : 109553 ; Гомологен : 1373 ; GeneCards : CTSC ; ОМА : CTSC — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	88,359,684 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	87,960,096 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	palpebral conjunctiva; ; epithelium of nasopharynx; ; stromal cell of endometrium; ; gallbladder; ; appendix; ; bronchial epithelial cell; ; lymph node; ; rectum; ; monocyte; ; granulocyte;
	Top expressed in
	left lung lobe; ; right lung lobe; ; hair follicle; ; stroma of bone marrow; ; carotid body; ; yolk sac; ; parotid gland; ; primitive streak; ; ciliary body; ; conjunctival fornix;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	peptidase activator activity involved in apoptotic process; phosphatase binding; cysteine-type peptidase activity; chaperone binding; protein self-association; peptidase activity; protein binding; identical protein binding; chloride ion binding; cysteine-type endopeptidase activity; serine-type endopeptidase activity; hydrolase activity;
Cellular component	Golgi apparatus; endoplasmic reticulum lumen; membrane; endoplasmic reticulum; COPII-coated ER to Golgi transport vesicle; lysosome; extracellular exosome; endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane; Golgi membrane; extracellular region; extracellular space; nucleoplasm; centrosome; azurophil granule lumen; intracellular membrane-bounded organelle; collagen-containing extracellular matrix; cytoplasm;
Biological process	human ageing; positive regulation of proteolysis involved in cellular protein catabolic process; positive regulation of apoptotic signaling pathway; response to organic substance; proteolysis; endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport; COPII vesicle coating; immune response; proteolysis involved in cellular protein catabolic process; T cell mediated cytotoxicity; apoptotic process; neutrophil degranulation; negative regulation of myelination; positive regulation of microglial cell activation;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	1075
	13032
	ENSG00000109861
	ENSMUSG00000030560
	P53634
	P97821
	НМ_148170 ; НМ_001114173 ; НМ_001814
	НМ_009982 ; НМ_001311790
	НП_001107645 ; НП_001805 ; НП_680475
	НП_001298719 ; НП_034112
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Катепсин C ( CTSC ), также известный как дипептидилпептидаза I ( DPP-I ), представляет собой лизосомальную экзоцистеиновую протеазу, пептидазы C1 принадлежащую к семейству белков , подгруппе цистеиновых катепсинов . У человека он кодируется CTSC геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Функция

Катепсин С, по-видимому, является центральным координатором активации многих сериновых протеаз в иммунных/воспалительных клетках.

Катепсин С катализирует удаление дипептидов с N-конца белковых и пептидных субстратов, за исключением случаев, когда (i) аминогруппа N-конца заблокирована, (ii) сайт расщепления находится по обе стороны от остатка пролина , ( iii) N-концевой остаток представляет собой лизин или аргинин , или (iv) структура пептида или белка предотвращает дальнейшее расщепление с N-конца.

Структура

кДНК, кодирующие крысиный, человеческий, мышиный, бычий, собачий и два катепсина C шистосом , были клонированы и секвенированы, и они показывают, что фермент высококонсервативен. ^{[ 7 ]} кДНК катепсина C человека и крысы кодируют предшественники (препрокатепсина C), содержащие сигнальные пептиды из 24 остатков, прообласти из 205 (крысиный катепсин C) или 206 (катепсин C человека) остатков и каталитические домены из 233 остатков, которые содержат каталитический остатки и на 30-40% идентичны зрелым аминокислотным последовательностям папаина и ряда других катепсинов, включая B , H , K , L и S. катепсины ^{[ 8 ]}

Транслированный препрокатепсин C преобразуется в зрелую форму путем по меньшей мере четырех расщеплений полипептидной цепи. Сигнальный пептид удаляется во время транслокации или секреции профермента (прокатепсина С) и большого фрагмента N-концевой прообласти (также известного как домен исключения). ^{[ 9 ]} который сохраняется в зрелом ферменте, отделяется от каталитического домена путем вырезания незначительной С-концевой части прообласти, называемой активационным пептидом. Тяжелая цепь, состоящая примерно из 164 остатков, и легкая цепь, состоящая примерно из 69 остатков, образуются путем расщепления каталитического домена.

В отличие от других членов семейства папаина , зрелый катепсин С состоит из четырех субъединиц, каждая из которых состоит из фрагмента N-концевой прообласти, тяжелой цепи и легкой цепи. И фрагмент прообласти, и тяжелая цепь гликозилированы.

Клиническое значение

Было показано, что дефекты в кодируемом белке являются причиной болезни Папийона-Лефевра . ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]} Аутосомно-рецессивное заболевание, характеризующееся ладонно-подошвенным кератозом и пародонтитом .

Катепсин C действует как ключевой фермент в активации гранулярных сериновых пептидаз в воспалительных клетках, таких как эластаза и катепсин G в клетках нейтрофилов, а также химазы и триптазы в тучных клетках. При многих воспалительных заболеваниях, таких как ревматоидный артрит, хроническая обструктивная болезнь легких (ХОБЛ), воспалительные заболевания кишечника, астма, сепсис и муковисцидоз, значительная часть патогенеза обусловлена повышенной активностью некоторых из этих воспалительных протеаз. После активации катепсином С протеазы способны разрушать различные компоненты внеклеточного матрикса, что может привести к повреждению тканей и хроническому воспалению.

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000109861 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030560 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ген Энтрез: катепсин С CTSC» .
^ Пэрис А, Струкель Б, Пунгеркар Дж, Ренко М, Доленц И, Тюрк В (август 1995 г.). «Молекулярное клонирование и анализ последовательности препрокатепсина С человека». Письма ФЭБС . 369 (2–3): 326–30. дои : 10.1016/0014-5793(95)00777-7 . ПМИД 7649281 . S2CID 45737414 .
^ Хола-Джамриска Л., Торт Дж. Ф., Далтон Дж. П., Дэй С. Р., Фан Дж., Аасков Дж., Бриндли П. Дж. (август 1998 г.). «Катепсин C из Schistosoma japonicum - кДНК, кодирующая препрофермент, и его филогенетические взаимоотношения» . Европейский журнал биохимии . 255 (3): 527–34. дои : 10.1046/j.1432-1327.1998.2550527.x . ПМИД 9738890 .
^ Коминами Э., Исидо К., Муно Д., Сато Н. (июль 1992 г.). «Первичная структура и распределение катепсина С в тканях». Биологическая химия Хоппе-Сейлера . 373 (7): 367–73. дои : 10.1515/bchm3.1992.373.2.367 . ПМИД 1515062 .
^ Тюрк Д., Янич В., Штерн И., Подобник М., Ламба Д., Даль С.В., Лауритцен С., Педерсен Дж., Тюрк В., Тюрк Б (декабрь 2001 г.). «Структура дипептидилпептидазы I человека (катепсина С): домен исключения, добавленный к каркасу эндопептидазы, создает машину для активации гранулярных сериновых протеаз» . Журнал ЭМБО . 20 (23): 6570–82. дои : 10.1093/emboj/20.23.6570 . ПМК 125750 . ПМИД 11726493 .
^ Вани А.А., Девкар Н., Патоле М.С., Шуш Ю.С. (февраль 2006 г.). «Описание двух новых мутаций гена катепсина С у пациентов с синдромом Папийона-Лефевра». Журнал пародонтологии . 77 (2): 233–7. дои : 10.1902/jop.2006.050124 . ПМИД 16460249 .
^ Мид Дж.Л., де Винтер Э.А., Бретт П., Шариф С.М., Вудс К.Г., Маркхэм А.Ф., Кук ГП (май 2006 г.). «В семье с синдромом Папийона-Лефевра выявлена потребность в катепсине С для активации гранзима B и цитолитической активности NK-клеток» . Кровь . 107 (9): 3665–8. дои : 10.1182/кровь-2005-03-1140 . ПМИД 16410452 .

Дальнейшее чтение

МакГуайр М.Дж., Липски П.Е., Тиле Д.Л. (июнь 1992 г.). «Очистка и характеристика дипептидилпептидазы I из селезенки человека». Архив биохимии и биофизики . 295 (2): 280–8. дои : 10.1016/0003-9861(92)90519-3 . ПМИД 1586157 .
Пэрис А, Струкель Б, Пунгеркар Дж, Ренко М, Доленц И, Тюрк В (август 1995 г.). «Молекулярное клонирование и анализ последовательности препрокатепсина С человека». Письма ФЭБС . 369 (2–3): 326–30. дои : 10.1016/0014-5793(95)00777-7 . ПМИД 7649281 . S2CID 45737414 .
Доленц И, Турк Б, Пунгерчич Г, Ритонья А, Турк В (сентябрь 1995 г.). «Олигомерная структура и субстрат вызывают ингибирование катепсина С человека» . Журнал биологической химии . 270 (37): 21626–31. дои : 10.1074/jbc.270.37.21626 . ПМИД 7665576 .
Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Рао Н.В., Рао Г.В., Хойдал-младший (апрель 1997 г.). «Человеческая дипептидилпептидаза I. Характеристика, локализация и экспрессия генов» . Журнал биологической химии . 272 (15): 10260–5. дои : 10.1074/jbc.272.15.10260 . ПМИД 9092576 .
Фишер Дж., Бланше-Бардон С., Прюдом Ж.Ф., Павек С., Стейлен П.М., Дюбертрет Л., Вайссенбах Дж. (1997). «Картирование синдрома Папийона-Лефевра с областью хромосомы 11q14». Европейский журнал генетики человека . 5 (3): 156–60. дои : 10.1159/000484751 . hdl : 2066/24363 . ПМИД 9272739 .
Сузуки Ю, Ёситомо-Накагава К, Маруяма К, Суяма А, Сугано С (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по всей длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Чигич Б, Кризай И, Краль Б, Турк В, Пейн Р.Х. (январь 1998 г.). «Стехиометрия и гетерогенность цепи прообласти тетрамерного человеческого катепсина C». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Структура белка и молекулярная энзимология . 1382 (1): 143–50. дои : 10.1016/S0167-4838(97)00173-8 . ПМИД 9507095 .
Тумс С, Джеймс Дж, Вуд ЭйДжей, Ву КЛ, Маккормик Д, Ленч Н, Хьюитт С, Мойнихан Л, Робертс Э, Вудс КГ, Маркхэм А, Вонг М, Видмер Р, Гаффар К.А., Пембертон М, Хусейн И.Р., Темтами С.А. , Дэвис Р., Рид А.П., Слоан П., Диксон М.Дж., Таккер Н.С. (декабрь 1999 г.). «Мутации потери функции в гене катепсина С приводят к заболеваниям пародонта и ладонно-подошвенному кератозу» . Природная генетика . 23 (4): 421–4. дои : 10.1038/70525 . ПМИД 10581027 . S2CID 11433166 .
Харт Т.К., Харт П.С., Боуден Д.В., Михалек М.Д., Каллисон С.А., Уокер С.Дж., Чжан Ю., Фиратли Э. (декабрь 1999 г.). «Мутации гена катепсина С ответственны за синдром Папийона-Лефевра» . Журнал медицинской генетики . 36 (12): 881–7. дои : 10.1136/jmg.36.12.881 . ПМЦ 1734286 . ПМИД 10593994 .
Харт Т.К., Харт П.С., Михалек М.Д., Чжан Ю., Фиратли Е., Ван Дайк Т.Е., Стабхольц А., Злотогорский А., Шапира Л., Соскольне В.А., Злогорский А. (февраль 2000 г.). «Синдром Хаима-Мунка и синдром Папийона-Лефевра представляют собой аллельные мутации катепсина С» . Журнал медицинской генетики . 37 (2): 88–94. дои : 10.1136/jmg.37.2.88 . ПМК 1734521 . ПМИД 10662807 .
Харт Т.К., Харт П.С., Михалек М.Д., Чжан Ю., Маразита М.Л., Купер М., Яссин О.М., Нусиер М., Уокер С. (февраль 2000 г.). «Локализация гена препубертатного пародонтита на хромосоме 11q14 и идентификация мутации гена катепсина С» . Журнал медицинской генетики . 37 (2): 95–101. дои : 10.1136/jmg.37.2.95 . ПМК 1734516 . ПМИД 10662808 .
Сузуки Ю, Исихара Д, Сасаки М, Накагава Х, Хата Х, Цунода Т, Ватанабэ М, Комацу Т, Ота Т, Исогай Т, Суяма А, Сугано С (март 2000 г.). «Статистический анализ 5'-нетранслируемой области мРНК человека с использованием «олигокепированных» библиотек кДНК». Геномика . 64 (3): 286–97. дои : 10.1006/geno.2000.6076 . ПМИД 10756096 .
Чигич Б., Даль С.В., Пейн Р.Х. (октябрь 2000 г.). «Остаточная про-часть катепсина С соответствует критериям, необходимым для внутримолекулярного шаперона при сворачивании и стабилизации человеческого профермента». Биохимия . 39 (40): 12382–90. дои : 10.1021/bi0008837 . ПМИД 11015218 .
Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геномные исследования . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Харт П.С., Чжан Ю., Фиратли Э., Уйгур С., Лотфазар М., Михалек М.Д., Маркс Дж.Дж., Лу Х, Коутс Б.Дж., Сью В.К., Маршалл Р., Уильямс Д., Рид Дж.Б., Райт Дж.Т., Харт Т.К. (декабрь 2000 г.). «Идентификация мутаций катепсина С у этнически разнообразных пациентов с синдромом папийона-Лефевра» . Журнал медицинской генетики . 37 (12): 927–32. дои : 10.1136/jmg.37.12.927 . ПМЦ 1734492 . ПМИД 11106356 .
Чжан Ю., Лундгрен Т., Ренверт С., Татакис Д.Н., Фиратли Е., Уйгур С., Харт П.С., Горри М.К., Маркс Дж.Дж., Харт Т.К. (февраль 2001 г.). «Доказательства эффекта основателя четырех мутаций гена катепсина С у пациентов с синдромом Папийона-Лефевра» . Журнал медицинской генетики . 38 (2): 96–101. дои : 10.1136/jmg.38.2.96 . ПМЦ 1734811 . ПМИД 11158173 .
Накано А., Номура К., Накано Х., Оно Ю., ЛаФорджиа С., Пулккинен Л., Хашимото И., Уитто Дж. (февраль 2001 г.). «Синдром Папийона-Лефевра: мутации и полиморфизмы в гене катепсина С» . Журнал исследовательской дерматологии . 116 (2): 339–43. дои : 10.1046/j.1523-1747.2001.01244.x . ПМИД 11180012 .
Альенде Л.М., Гарсиа-Перес М.А., Морено А., Корелл А., Карасол М., Мартинес-Канут П., Арнаис-Вильена А. (февраль 2001 г.). «Ген катепсина C: первый сложный гетерозиготный пациент с синдромом Папийона-Лефевра и новой бессимптомной мутацией». Человеческая мутация . 17 (2): 152–3. doi : 10.1002/1098-1004(200102)17:2<152::AID-HUMU10>3.0.CO;2-# . ПМИД 11180601 . S2CID 196603893 .
Виман С, Вейль Б, Велленройтер Р, Гассенхубер Й, Глассль С, Ансорж В, Бёхер М, Блокер Х, Бауэрсахс С, Блюм Х, Лаубер Й, Дюстерхофт А, Бейер А, Кёрер К, Штрак Н, Мьюс Х.В., Оттенвальдер Б , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Пустка А. (март 2001 г.). «К каталогу человеческих генов и белков: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека» . Геномные исследования . 11 (3): 422–35. дои : 10.1101/gr.GR1547R . ПМК 311072 . ПМИД 11230166 .

Внешние ссылки

Онлайн-база данных MEROPS . по пептидазам и их ингибиторам: C01.070
Катепсин + C в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000109861 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030560 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] «Ген Энтрез: катепсин С CTSC» .

[pmid7649281-6] Пэрис А, Струкель Б, Пунгеркар Дж, Ренко М, Доленц И, Тюрк В (август 1995 г.). «Молекулярное клонирование и анализ последовательности препрокатепсина С человека». Письма ФЭБС . 369 (2–3): 326–30. дои : 10.1016/0014-5793(95)00777-7 . ПМИД 7649281 . S2CID 45737414 .

[pmid9738890-7] Хола-Джамриска Л., Торт Дж. Ф., Далтон Дж. П., Дэй С. Р., Фан Дж., Аасков Дж., Бриндли П. Дж. (август 1998 г.). «Катепсин C из Schistosoma japonicum - кДНК, кодирующая препрофермент, и его филогенетические взаимоотношения» . Европейский журнал биохимии . 255 (3): 527–34. дои : 10.1046/j.1432-1327.1998.2550527.x . ПМИД 9738890 .

[pmid1515062-8] Коминами Э., Исидо К., Муно Д., Сато Н. (июль 1992 г.). «Первичная структура и распределение катепсина С в тканях». Биологическая химия Хоппе-Сейлера . 373 (7): 367–73. дои : 10.1515/bchm3.1992.373.2.367 . ПМИД 1515062 .

[pmid11726493-9] Тюрк Д., Янич В., Штерн И., Подобник М., Ламба Д., Даль С.В., Лауритцен С., Педерсен Дж., Тюрк В., Тюрк Б (декабрь 2001 г.). «Структура дипептидилпептидазы I человека (катепсина С): домен исключения, добавленный к каркасу эндопептидазы, создает машину для активации гранулярных сериновых протеаз» . Журнал ЭМБО . 20 (23): 6570–82. дои : 10.1093/emboj/20.23.6570 . ПМК 125750 . ПМИД 11726493 .

[pmid16460249-10] Вани А.А., Девкар Н., Патоле М.С., Шуш Ю.С. (февраль 2006 г.). «Описание двух новых мутаций гена катепсина С у пациентов с синдромом Папийона-Лефевра». Журнал пародонтологии . 77 (2): 233–7. дои : 10.1902/jop.2006.050124 . ПМИД 16460249 .

[pmid16410452-11] Мид Дж.Л., де Винтер Э.А., Бретт П., Шариф С.М., Вудс К.Г., Маркхэм А.Ф., Кук ГП (май 2006 г.). «В семье с синдромом Папийона-Лефевра выявлена потребность в катепсине С для активации гранзима B и цитолитической активности NK-клеток» . Кровь . 107 (9): 3665–8. дои : 10.1182/кровь-2005-03-1140 . ПМИД 16410452 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)