Каспаза 12

CASP12
Идентификаторы
Псевдонимы	CASP12 , CASP-12, CASP12P1, каспаза 12 (ген/псевдоген)
Внешние идентификаторы	Опустить : 608633 ; МГИ : 1312922 ; Генные карты : CASP12 ; OMA : CASP12 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	104,898,670 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 9 (mouse)
End	5,373,032 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	testicle; ; right lung; ; left ovary; ; gastric mucosa; ; ascending aorta; ; Descending thoracic aorta; ; popliteal artery; ; tibial arteries; ; left coronary artery; ; right ovary;
	Top expressed in
	temporal muscle; ; tunica media of zone of aorta; ; sternocleidomastoid muscle; ; lumbar spinal ganglion; ; triceps brachii muscle; ; intercostal muscle; ; uterus; ; carotid body; ; ascending aorta; ; semi-lunar valve;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; cysteine-type peptidase activity; cysteine-type endopeptidase activity; cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic signaling pathway;
Cellular component	NLRP3 inflammasome complex; AIM2 inflammasome complex; IPAF inflammasome complex; endoplasmic reticulum; cytoplasm;
Biological process	regulation of apoptotic process; regulation of inflammatory response; proteolysis; execution phase of apoptosis; apoptotic process; activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; apoptotic signaling pathway;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	100506742
	12364
	ENSG00000204403
	ENSMUSG00000025887
	Q6UXS9
	О08736
	НМ_001191016
	НМ_009808
	НП_001177945
	НП_033938
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Каспаза 12 — это белок , который у человека кодируется CASP12 геном . Белок принадлежит к семейству ферментов, называемых каспазами , которые расщепляют свои субстраты по С-концевым остаткам аспарагиновой кислоты . Он тесно связан с каспазой 1 и другими членами семейства каспаз, известными как воспалительные каспазы, которые обрабатывают и активируют воспалительные цитокины , такие как интерлейкин 1 и интерлейкин 18 .

Ген

Он обнаружен на хромосоме 11 у человека в локусе с другими воспалительными каспазами. ^{[ 5 ]} CASP12 Ортологи ^{[ 6 ]} были идентифицированы у многих млекопитающих , для которых доступны полные данные о геноме.

Клиническое значение

CASP12 Ген подвержен полиморфизму , который может генерировать полноразмерный белок каспазы (Csp12L) или неактивную укороченную форму (Csp12S). Функциональная форма, по-видимому, свойственна лицам африканского происхождения и связана с предрасположенностью к сепсису ; люди, несущие функциональный ген, имеют сниженную реакцию на бактериальные молекулы, такие как липополисахарид (ЛПС). ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

Исследование, проведенное в мае 2009 года Центром здоровья Университета Макгилла, показало, что эстроген может блокировать выработку каспазы-12, что приводит к более сильной воспалительной реакции на бактериальные патогены. Испытания проводились на лабораторных мышах, которым был имплантирован ген человеческой каспазы-12. ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}

Неактивная укороченная форма (Csp12S) гена CASP12 была распространена и почти зафиксирована в неафриканских популяциях благодаря положительному отбору, начавшемуся, возможно, 60–100 тысяч лет назад. Считается, что его селективным преимуществом является устойчивость к сепсису в популяциях, которые страдают от большего количества инфекционных заболеваний по мере увеличения размеров и плотности населения. ^{[ 12 ]}^{[ 13 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000204403 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025887 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Фишер Х., Кениг У., Экхарт Л., Чахлер Э. (2002). «Человеческая каспаза 12 приобрела вредные мутации». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 293 (2): 722–6. дои : 10.1016/S0006-291X(02)00289-9 . ПМИД 12054529 .
^ «Филогенетический маркер OrthoMaM: кодирующая последовательность CASP12» . ^{[ постоянная мертвая ссылка ]}
^ Салех М., Вайланкур Дж.П., Грэм Р.К., Хайк М., Сринивасула С.М., Алнемри Э.С., Стейнберг М.Х., Нолан В., Болдуин К.Т., Хотчкисс Р.С., Бухман Т.Г., Зенбауэр Б.А., Хайден М.Р., Фаррер Л.А., Рой С., Николсон Д.В. (2004) . «Дифференциальная модуляция чувствительности к эндотоксинам полиморфизмами каспазы-12 человека» . Природа . 429 (6987): 75–9. Бибкод : 2004Natur.429...75S . дои : 10.1038/nature02451 . ПМИД 15129283 .
^ Салех, Майя Мэтисон; Джон К. Волински; Мелисса К. Бенсингер; Стив Дж. Фицджеральд; Патрик Дройн; Натали Улевич; Ричард Дж. Грин; Дуглас Р. Николсон; Дональд В. (2006). «Повышение бактериального клиренса и устойчивости к сепсису у мышей с дефицитом каспазы-12». Природа . 440 (7087): 1064–1068. Бибкод : 2006Natur.440.1064S . дои : 10.1038/nature04656 . ПМИД 16625199 . S2CID 4321520 . (Ошибка: дои : 10.1038/nature04656 , ПМИД 16625199 )
^ Ерецян Г., Дойрон К., Шао В., Ливитт Б.Р., Хайден М.Р., Николсон Д.В., Салех М. (май 2009 г.). «Гендерные различия в экспрессии длинного варианта каспазы-12 человека определяют восприимчивость к инфекции Listeria monocytogenes» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 106 (22): 9016–20. Бибкод : 2009PNAS..106.9016Y . дои : 10.1073/pnas.0813362106 . ПМК 2690057 . ПМИД 19447924 .
^ «Мужской грипп: реальность или миф?» . Здоровье . Национальная служба здравоохранения Великобритании. 18 мая 2009 г. Архивировано из оригинала 16 февраля 2010 г. . Проверено 23 мая 2009 г.
^ «Женщины лучше борются с болезнями » . Здоровье . Новости Би-би-си. 13 мая 2009 года . Проверено 13 мая 2009 г.
^ Сюэ, Яли; Дейли, Аллан; Ингвадоттир, Бриндис; Лю, Мэннин; Куп, Грэм; Ким, Юсоб; Сабети, Пардис ; Чен, Юань; Сталкер, Джим; Хакл, Элизабет; Бертон, Джон; Леонард, Стивен; Роджерс, Джейн; Тайлер-Смит, Крис (2006). «Распространение неактивной формы каспазы-12 у людей обусловлено недавним положительным отбором» . Американский журнал генетики человека . 78 (4): 659–670. дои : 10.1086/503116 . ПМЦ 1424700 . ПМИД 16532395 .
^ Ван, Сяося; Грус, Венди Э.; Чжан, Цзяньчжи (2006). «Потери генов во время происхождения человека» . ПЛОС Биология . 4 (3): е52. doi : 10.1371/journal.pbio.0040052 . ПМК 1361800 . ПМИД 16464126 .

Внешние ссылки

Онлайн-база данных MEROPS Архивировано по пептидазам и их ингибиторам: C14.013. 6 сентября 2005 г. на Wayback Machine.

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000204403 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025887 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[5] Фишер Х., Кениг У., Экхарт Л., Чахлер Э. (2002). «Человеческая каспаза 12 приобрела вредные мутации». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 293 (2): 722–6. дои : 10.1016/S0006-291X(02)00289-9 . ПМИД 12054529 .

[OrthoMaM-6] «Филогенетический маркер OrthoMaM: кодирующая последовательность CASP12» . ^{[ постоянная мертвая ссылка ]}

[7] Салех М., Вайланкур Дж.П., Грэм Р.К., Хайк М., Сринивасула С.М., Алнемри Э.С., Стейнберг М.Х., Нолан В., Болдуин К.Т., Хотчкисс Р.С., Бухман Т.Г., Зенбауэр Б.А., Хайден М.Р., Фаррер Л.А., Рой С., Николсон Д.В. (2004) . «Дифференциальная модуляция чувствительности к эндотоксинам полиморфизмами каспазы-12 человека» . Природа . 429 (6987): 75–9. Бибкод : 2004Natur.429...75S . дои : 10.1038/nature02451 . ПМИД 15129283 .

[8] Салех, Майя Мэтисон; Джон К. Волински; Мелисса К. Бенсингер; Стив Дж. Фицджеральд; Патрик Дройн; Натали Улевич; Ричард Дж. Грин; Дуглас Р. Николсон; Дональд В. (2006). «Повышение бактериального клиренса и устойчивости к сепсису у мышей с дефицитом каспазы-12». Природа . 440 (7087): 1064–1068. Бибкод : 2006Natur.440.1064S . дои : 10.1038/nature04656 . ПМИД 16625199 . S2CID 4321520 . (Ошибка: дои : 10.1038/nature04656 , ПМИД 16625199 )

[pmid19447924-9] Ерецян Г., Дойрон К., Шао В., Ливитт Б.Р., Хайден М.Р., Николсон Д.В., Салех М. (май 2009 г.). «Гендерные различия в экспрессии длинного варианта каспазы-12 человека определяют восприимчивость к инфекции Listeria monocytogenes» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 106 (22): 9016–20. Бибкод : 2009PNAS..106.9016Y . дои : 10.1073/pnas.0813362106 . ПМК 2690057 . ПМИД 19447924 .

[urlNHS-10] «Мужской грипп: реальность или миф?» . Здоровье . Национальная служба здравоохранения Великобритании. 18 мая 2009 г. Архивировано из оригинала 16 февраля 2010 г. . Проверено 23 мая 2009 г.

[urlBBC-11] «Женщины лучше борются с болезнями » . Здоровье . Новости Би-би-си. 13 мая 2009 года . Проверено 13 мая 2009 г.

[12] Сюэ, Яли; Дейли, Аллан; Ингвадоттир, Бриндис; Лю, Мэннин; Куп, Грэм; Ким, Юсоб; Сабети, Пардис ; Чен, Юань; Сталкер, Джим; Хакл, Элизабет; Бертон, Джон; Леонард, Стивен; Роджерс, Джейн; Тайлер-Смит, Крис (2006). «Распространение неактивной формы каспазы-12 у людей обусловлено недавним положительным отбором» . Американский журнал генетики человека . 78 (4): 659–670. дои : 10.1086/503116 . ПМЦ 1424700 . ПМИД 16532395 .

[13] Ван, Сяося; Грус, Венди Э.; Чжан, Цзяньчжи (2006). «Потери генов во время происхождения человека» . ПЛОС Биология . 4 (3): е52. doi : 10.1371/journal.pbio.0040052 . ПМК 1361800 . ПМИД 16464126 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

v т и Протеазы : цистеиновые протеазы ( EC 3.4.22 ).
Caspase	Caspase 1 Caspase 2 Caspase 3 Caspase 4 Caspase 5 Caspase 6 Caspase 7 Caspase 8 Caspase 9 Caspase 10 Caspase 12 Caspase 13 Caspase 14
Fruit-derived	Papain Ficain Bromelain Actinidain
Calpain	CAPN1 CAPN2 CAPN3 CAPN5 CAPN6 CAPN7 CAPN8 CAPN9 CAPN10 CAPN11 CAPN12 CAPN13 CAPN14 CAPNS1 CAPNS2
Cathepsin	B C F H K L1/L2 O S W Z
Other	Clostripain Cancer procoagulant Separase Autophagin Cruzipain 3C-like protease Gingipain R Gingipain K

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)