CDH4

CDH4
Идентификаторы
Псевдонимы	CDH4 , CAD4, R-CAD, RCAD, кадгерин 4
Внешние идентификаторы	Опустить : 603006 ; МГИ : 99218 ; Гомологен : 48044 ; Генные карты : CDH4 ; ОМА : CDH4 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 20 (human)
End	61,940,617 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 2 (mouse)
End	179,541,166 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	ventricular zone; ; ganglionic eminence; ; nucleus accumbens; ; temporal lobe; ; amygdala; ; caudate nucleus; ; anterior cingulate cortex; ; putamen; ; testicle; ; prefrontal cortex;
	Top expressed in
	Bowman's capsule; ; saccule; ; anterior amygdaloid area; ; coelomic epithelium; ; epithelium of lens; ; glomerulus; ; gastrula; ; olfactory bulb; ; ganglionic eminence; ; otic vesicle;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	calcium ion binding; metal ion binding; cytoskeletal protein binding; protein homodimerization activity; cadherin binding;
Cellular component	integral component of membrane; plasma membrane; integral component of plasma membrane; membrane; cell surface; catenin complex;
Biological process	heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; cell adhesion; positive regulation of axon extension; adherens junction organization; homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; axon guidance; cell-cell junction assembly; calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; cell-cell adhesion mediated by cadherin; cell-cell adhesion; cell morphogenesis;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	1002
	12561
	ENSG00000280641 ; ENSG00000179242
	ENSMUSG00000000305
	P55283
	P39038
	НМ_001794 ; НМ_001252338 ; НМ_001252339
	НМ_009867 ; НМ_001316723
	НП_001239267 ; НП_001239268 ; НП_001785
	НП_001303652 ; НП_033997
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Кадгерин-4 — это белок , который у человека кодируется CDH4 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Этот ген представляет собой классический кадгерин из суперсемейства кадгеринов. Кодируемый белок представляет собой кальций-зависимый межклеточной адгезии, гликопротеин состоящий из пяти внеклеточных повторов кадгерина, трансмембранной области и высококонсервативного цитоплазматического хвоста. На основании исследований на курицах и мышах считается, что этот кадгерин играет важную роль во время сегментации мозга и роста нейронов. Кроме того, указана роль в развитии почек и мышц. Особый интерес представляют исследования, демонстрирующие стабильные цис-гетеродимеры кадгеринов 2 и 4 в котрансфицированных клеточных линиях. Ранее считалось, что взаимодействие происходит исключительно гомофильно, но это первое свидетельство гетеродимеризации кадгерина. ^{[ 7 ]}

Взаимодействия

Было показано, что кадгерин-4 взаимодействует с:

ПТПму ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ENSG00000179242 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000280641, ENSG00000179242 — Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000305 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Чалмерс И.Дж., Хофлер Х., Аткинсон М.Дж. (июнь 1999 г.). «Картирование кластера генов кадгерина с областью хромосомы 5, подверженной частой потере аллелей при карциноме». Геномика . 57 (1): 160–3. дои : 10.1006/geno.1998.5717 . ПМИД 10191097 .
^ Кулс П., Ванхальст К., Ван Рой Ф. (октябрь 1999 г.). «Отнесение кадгерина-4 (R-кадгерина, CDH4) к полосе хромосомы человека 20q13.3». Цитогенетический клеточный генетик . 86 (1): 26–7. дои : 10.1159/000015423 . ПМИД 10516427 . S2CID 27578498 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: кадгерин CDH4 4, тип 1, R-кадгерин (ретиналь)» .
^ Брэйди-Калней С.М., Мортон Т., Никсон Дж.П., Питц Г.Е., Кинч М., Чен Х. и др. (1998). «Динамическое взаимодействие PTPmu с несколькими кадгеринами in vivo» . J Клеточная Биол . 141 (1): 287–96. дои : 10.1083/jcb.141.1.287 . ПМК 2132733 . ПМИД 9531566 .

Дальнейшее чтение

Тальярини Ф (1977). «[Связь между социальной защитой и криминологическими тенденциями с 1930-х годов до наших дней]». Квадратная криминологическая клиника . 18 (3): 289–352. ПМИД 798233 .
Сузуки С., Сано К., Танихара Х. (1991). «Разнообразие семейства кадгеринов: доказательства существования восьми новых кадгеринов в нервной ткани» . Сотовый Регул . 2 (4): 261–70. дои : 10.1091/mbc.2.4.261 . ПМК 361775 . ПМИД 2059658 .
Танихара Х., Сано К., Хеймарк Р.Л. и др. (1995). «Клонирование пяти человеческих кадгеринов проясняет характерные особенности внеклеточного домена кадгерина и предоставляет дополнительные доказательства существования двух структурно различных типов кадгерина». Клеточные клеи. Коммун . 2 (1): 15–26. дои : 10.3109/15419069409014199 . ПМИД 7982033 .
Шан В.С., Танака Х., Филлипс Г.Р. и др. (2000). «Функциональные цис-гетеродимеры N- и R-кадгеринов» . Дж. Клеточная Биол . 148 (3): 579–90. дои : 10.1083/jcb.148.3.579 . ПМК 2174798 . ПМИД 10662782 .
Леканда Ф., Ченг С.Л., Шин К.С. и др. (2000). «Дифференциальная регуляция кадгеринов дексаметазоном в остеобластных клетках человека». Дж. Селл. Биохим . 77 (3): 499–506. doi : 10.1002/(SICI)1097-4644(20000601)77:3<499::AID-JCB14>3.0.CO;2-0 . ПМИД 10760957 . S2CID 13331343 .
Китагава М., Натори М., Мурасе С. и др. (2000). «Мутационный анализ кадгерина-4 выявляет аминокислотные остатки EC1, важные для структуры и функции». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 271 (2): 358–63. дои : 10.1006/bbrc.2000.2636 . ПМИД 10799302 .
Делоукас П., Мэтьюз Л.Х., Ашерст Дж. и др. (2002). «Последовательность ДНК и сравнительный анализ 20-й хромосомы человека» . Природа . 414 (6866): 865–71. Бибкод : 2001Natur.414..865D . дои : 10.1038/414865a . ПМИД 11780052 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека» . Нат. Жене . 36 (1): 40–5. дои : 10.1038/ng1285 . ПМИД 14702039 .
Джонсон Э., Тайзен К.С., Джонсон К.Р., Уилок М.Дж. (2004). «R-кадгерин влияет на подвижность клеток через ГТФазы семейства Rho» . Ж. Биол. Хим . 279 (30): 31041–9. дои : 10.1074/jbc.M400024200 . ПМИД 15143071 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Миотто Э., Саббиони С., Веронезе А. и др. (2005). «Частое аберрантное метилирование промотора гена CDH4 при колоректальном раке и раке желудка у человека» . Рак Рез . 64 (22): 8156–9. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-04-3000 . ПМИД 15548679 .
Маэда М., Джонсон Э., Мандал Ш.Х. и др. (2006). «Экспрессия неподходящих кадгеринов эпителиальными опухолевыми клетками способствует эндоцитозу и деградации E-кадгерина посредством конкуренции за p120(ctn)» . Онкоген . 25 (33): 4595–604. дои : 10.1038/sj.onc.1209396 . ПМИД 16786001 .

Внешние ссылки

CDH4 Расположение человеческого гена в браузере генома UCSC .
Подробности о гене человека CDH4 в браузере генома UCSC .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 20 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с ENSG00000179242 GRCh38: выпуск Ensembl 89: ENSG00000280641, ENSG00000179242 — Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000000305 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10191097-5] Чалмерс И.Дж., Хофлер Х., Аткинсон М.Дж. (июнь 1999 г.). «Картирование кластера генов кадгерина с областью хромосомы 5, подверженной частой потере аллелей при карциноме». Геномика . 57 (1): 160–3. дои : 10.1006/geno.1998.5717 . ПМИД 10191097 .

[pmid10516427-6] Кулс П., Ванхальст К., Ван Рой Ф. (октябрь 1999 г.). «Отнесение кадгерина-4 (R-кадгерина, CDH4) к полосе хромосомы человека 20q13.3». Цитогенетический клеточный генетик . 86 (1): 26–7. дои : 10.1159/000015423 . ПМИД 10516427 . S2CID 27578498 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: кадгерин CDH4 4, тип 1, R-кадгерин (ретиналь)» .

[pmid9531566-8] Брэйди-Калней С.М., Мортон Т., Никсон Дж.П., Питц Г.Е., Кинч М., Чен Х. и др. (1998). «Динамическое взаимодействие PTPmu с несколькими кадгеринами in vivo» . J Клеточная Биол . 141 (1): 287–96. дои : 10.1083/jcb.141.1.287 . ПМК 2132733 . ПМИД 9531566 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]