CDH16

CDH16
Идентификаторы
Псевдонимы	CDH16 , кадгерин 16
Внешние идентификаторы	Опустить : 603118 ; МГИ : 106671 ; Гомологен : 2997 ; Генные карты : CDH16 ; ОМА : CDH16 – ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 16 (human)
End	66,918,917 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 8 (mouse)
End	105,351,028 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	renal medulla; ; kidney tubule; ; left lobe of thyroid gland; ; right lobe of thyroid gland; ; glomerulus; ; metanephric glomerulus; ; human kidney; ; muscle of thigh; ; caput epididymis; ; gonad;
	Top expressed in
	human kidney; ; right kidney; ; medullary collecting duct; ; proximal tubule; ; efferent ductule; ; vas deferens; ; renal corpuscle; ; left lung lobe; ; renal pelvis; ; trachea;
	More reference expression data
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	calcium ion binding; metal ion binding;
Cellular component	integral component of membrane; plasma membrane; extracellular exosome; membrane; integral component of plasma membrane; basolateral plasma membrane;
Biological process	calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; cell adhesion; homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; cell-cell signaling; nervous system development;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	1014
	12556
	ENSG00000166589
	ENSMUSG00000031881
	О75309
	О88338
	НМ_001204744 ; НМ_001204745 ; НМ_001204746 ; НМ_004062
	НМ_001252627 ; НМ_001252628 ; НМ_007663
	НП_001191673 ; НП_001191674 ; НП_001191675 ; НП_004053
	НП_001239556 ; НП_001239557 ; НП_031689
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Кадгерин-16 — это белок, который у человека кодируется геном CDH16 . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Этот ген является членом суперсемейства кадгеринов , генов, кодирующих кальций-зависимые, мембраносвязанные гликопротеины . Картированный с ранее идентифицированным кластером генов кадгерина на хромосоме 16q 22.1, ген локализуется среди членов суперсемейства CDH1 , CDH3 , CDH5 , CDH8 и CDH11 . Белок состоит из внеклеточного домена , содержащего 6 доменов кадгерина, трансмембранной области и укороченного цитоплазматического домена, но не имеет пропоследовательности и последовательности распознавания адгезии трипептида HAV, типичной для большинства классических кадгеринов. Экспрессия происходит исключительно в почках, где белок действует как основной медиатор гомотипического клеточного распознавания, играя роль в морфогенном направлении развития тканей. ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000166589 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031881 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Томсон Р.Б., Уорд, округ Колумбия, Кваггин С.Е., Игараши П., Маклер З.Е., Аронсон П.С. (октябрь 1998 г.). «Клонирование кДНК и хромосомная локализация изоформ Ksp-кадгерина человека и мыши» . Геномика . 51 (3): 445–51. дои : 10.1006/geno.1998.5402 . ПМИД 9721215 .
^ Томсон Р.Б., Игараси П., Бимесдерфер Д., Ким Р., Абу-Альфа А., Сулеймани М., Аронсон П.С. (август 1995 г.). «Выделение и клонирование кДНК Ksp-кадгерина, нового специфического для почек члена мультигенного семейства кадгеринов» . J Биол Хим . 270 (29): 17594–601. дои : 10.1074/jbc.270.29.17594 . ПМИД 7615566 .
^ Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: CDH16-кадгерин 16, KSP-кадгерин» .

Дальнейшее чтение

Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэпирование: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Джин . 138 (1–2): 171–4. дои : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . ПМИД 8125298 .
Сузуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика библиотеки кДНК, обогащенной по полной длине и по 5'-концу». Джин . 200 (1–2): 149–56. дои : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . ПМИД 9373149 .
Томсон Р.Б., Аронсон П.С. (1999). «Иммунолокализация Ksp-кадгерина в почках взрослого и развивающегося кролика». Являюсь. Дж. Физиол . 277 (1 часть 2): F146–56. дои : 10.1152/ajprenal.1999.277.1.F146 . ПМИД 10409308 .
Бодри Д., Жанпьер С. (2000). «Присвоение E-кадгерина (CDH1) и KSP-кадгерина (CDH16) хромосоме 16q22.1 с помощью радиационного гибридного картирования». Цитогенет. Клеточная генетика . 88 (3–4): 253–4. дои : 10.1159/000015531 . ПМИД 10828602 . S2CID 83989085 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Томсон Р.Б., Ментон С., Ким Р. и др. (2003). «Гистопатологический анализ кистозного эпителия почек на мышиной модели ADPKD Pkd2WS25/-». Являюсь. Дж. Физиол. Почечная физиол . 285 (5): F870–80. дои : 10.1152/ajprenal.00153.2003 . ПМИД 12851251 .
Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретируемых белков (SPDI), крупномасштабная попытка идентифицировать новые секретируемые и трансмембранные белки человека: оценка биоинформатики» . Геном Рез . 13 (10): 2265–70. дои : 10.1101/гр.1293003 . ПМЦ 403697 . ПМИД 12975309 .
Венделер М.В., Праус М., Юнг Р. и др. (2004). «Ksp-кадгерин представляет собой функциональную молекулу межклеточной адгезии, родственную LI-кадгерину». Эксп. Сотовый Res . 294 (2): 345–55. дои : 10.1016/j.yexcr.2003.11.022 . ПМИД 15023525 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Хишикава К., Марумо Т., Миура С. и др. (2005). «Фактор, ингибирующий лейкемию, индуцирует многолинейную дифференцировку взрослых стволоподобных клеток в почках посредством почечно-специфического кадгерина 16». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 328 (1): 288–91. дои : 10.1016/j.bbrc.2004.12.167 . ПМИД 15670782 .
Тедик С., Кучик М., Клингель К. и др. (2005). «Экспрессия Ksp-кадгерина во время развития почек и при почечно-клеточном раке» . Бр. Дж. Рак . 92 (11): 2010–7. дои : 10.1038/sj.bjc.6602597 . ПМК 2361784 . ПМИД 15886705 .
Кюн А., Панер Г.П., Скиннидер Б.Ф. и др. (2007). «Анализ экспрессии почечного кадгерина в широком спектре традиционных и недавно выявленных новообразований почечного эпителия: диагностические и гистогенетические значения». Являюсь. Дж. Сург. Патол . 31 (10): 1528–33. дои : 10.1097/PAS.0b013e318058818c . ПМИД 17895753 . S2CID 46401984 .

Внешние ссылки

CDH16 Расположение человеческого гена в браузере генома UCSC .
Подробности о гене человека CDH16 в браузере генома UCSC .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 16 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000166589 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031881 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid9721215-5] Томсон Р.Б., Уорд, округ Колумбия, Кваггин С.Е., Игараши П., Маклер З.Е., Аронсон П.С. (октябрь 1998 г.). «Клонирование кДНК и хромосомная локализация изоформ Ksp-кадгерина человека и мыши» . Геномика . 51 (3): 445–51. дои : 10.1006/geno.1998.5402 . ПМИД 9721215 .

[pmid7615566-6] Томсон Р.Б., Игараси П., Бимесдерфер Д., Ким Р., Абу-Альфа А., Сулеймани М., Аронсон П.С. (август 1995 г.). «Выделение и клонирование кДНК Ksp-кадгерина, нового специфического для почек члена мультигенного семейства кадгеринов» . J Биол Хим . 270 (29): 17594–601. дои : 10.1074/jbc.270.29.17594 . ПМИД 7615566 .

[entrez-7] Перейти обратно: ^а ^б «Ген Энтрез: CDH16-кадгерин 16, KSP-кадгерин» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]