CDH6

CDH6
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3LND
Идентификаторы
Псевдонимы	CDH6 , CAD6, KCAD, кадгерин 6
Внешние идентификаторы	Опустить : 603007 ; МГИ : 107435 ; Гомологен : 21027 ; Генные карты : CDH6 ; ОМА : CDH6 – ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 5 (human)
End	31,329,146 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 15 (mouse)
End	13,173,761 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	beta cell; ; kidney tubule; ; tibial arteries; ; human kidney; ; endothelial cell; ; vena cava; ; gallbladder; ; sural nerve; ; lateral nuclear group of thalamus; ; metanephric glomerulus;
	Top expressed in
	internal carotid artery; ; external carotid artery; ; hair follicle; ; ascending aorta; ; aortic valve; ; Rostral migratory stream; ; renal corpuscle; ; efferent ductule; ; ciliary body; ; iris;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	calcium ion binding; metal ion binding; cytoskeletal protein binding; protein homodimerization activity; cadherin binding;
Cellular component	integral component of membrane; plasma membrane; membrane; cell surface; catenin complex;
Biological process	Notch signaling pathway; cell adhesion; adherens junction organization; homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; cell-cell junction assembly; calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; cell-cell adhesion mediated by cadherin; cell-cell adhesion; cell morphogenesis;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	1004
	12563
	ENSG00000113361
	ENSMUSG00000039385
	P55285
	P97326
	НМ_004932 ; НМ_001362435
	НМ_007666
	НП_004923 ; НП_001349364
	НП_031692
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Кадгерин-6 — это белок , который у человека кодируется CDH6 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

типа II Этот ген кодирует классический кадгерин из суперсемейства кадгеринов. Кодируемый мембранный белок представляет собой кальций-зависимый межклеточной адгезии, гликопротеин состоящий из пяти внеклеточных повторов кадгерина, трансмембранной области и высококонсервативного цитоплазматического хвоста. Кадгерины опосредуют межклеточное связывание гомофильным образом, способствуя сортировке гетерогенных типов клеток и поддержанию упорядоченных структур, таких как эпителий . Сильная транскрипционная экспрессия этого гена наблюдалась в клеточных линиях гепатоцеллюлярной и почечной карциномы, что указывает на возможную роль в метастазировании и инвазии. ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000113361 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039385 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Симояма И., Гото М., Терасаки Т., Китадзима М., Хирохаси С. (июнь 1995 г.). «Выделение и анализ последовательности комплементарной ДНК кадгерина-6 человека на предмет полной кодирующей последовательности и ее экспрессии в клетках карциномы человека». Рак Рез . 55 (10): 2206–11. ПМИД 7743525 .
^ Чалмерс И.Дж., Хофлер Х., Аткинсон М.Дж. (июнь 1999 г.). «Картирование кластера генов кадгерина с областью хромосомы 5, подверженной частой потере аллелей при карциноме». Геномика . 57 (1): 160–3. дои : 10.1006/geno.1998.5717 . ПМИД 10191097 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: кадгерин CDH6 6, тип 2, К-кадгерин (почки плода)» .

Дальнейшее чтение

Маккалман CD, Гециос С, Чен ГТ (1998). «Кадгерины типа 2 в эндометрии и плаценте человека: их предполагаемая роль в имплантации и плацентации человека». Являюсь. Дж. Репрод. Иммунол . 39 (2): 96–107. дои : 10.1111/j.1600-0897.1998.tb00341.x . ПМИД 9506208 . S2CID 23871813 .
Сузуки С., Сано К., Танихара Х. (1991). «Разнообразие семейства кадгеринов: доказательства существования восьми новых кадгеринов в нервной ткани» . Сотовый Регул . 2 (4): 261–70. дои : 10.1091/mbc.2.4.261 . ПМК 361775 . ПМИД 2059658 .
Пол Р., Юинг К.М., Робинсон Дж.К. и др. (1997). «Кадгерин-6, молекула клеточной адгезии, специфически экспрессирующаяся в проксимальных почечных канальцах и почечно-клеточной карциноме». Рак Рез . 57 (13): 2741–8. ПМИД 9205085 .
Гециос С., Чен Г.Т., Стефенсон М.Д. и др. (1998). «Регулируемая экспрессия кадгерина-6 и кадгерина-11 в железистых эпителиальных и стромальных клетках эндометрия человека». Дев. Дин . 211 (3): 238–47. doi : 10.1002/(SICI)1097-0177(199803)211:3<238::AID-AJA5>3.0.CO;2-I . ПМИД 9520111 . S2CID 43022919 .
Креммидиотис Г., Бейкер Э., Кроуфорд Дж. и др. (1998). «Локализация генов кадгерина человека в участках хромосом, демонстрирующих потерю гетерозиготности, связанную с раком». Геномика . 49 (3): 467–71. дои : 10.1006/geno.1998.5281 . ПМИД 9615235 .
Симояма Ю., Такеда Х., Ёшихара С. и др. (1999). «Биохимическая характеристика и функциональный анализ двух классических кадгеринов типа II, кадгерина-6 и -14, и сравнение с E-кадгерином» . Ж. Биол. Хим . 274 (17): 11987–94. дои : 10.1074/jbc.274.17.11987 . ПМИД 10207020 .
Симояма Ю., Цудзимото Г., Китадзима М., Натори М. (2001). «Идентификация трех классических кадгеринов типа II человека и частые гетерофильные взаимодействия между различными подклассами классических кадгеринов типа II» . Биохим. Дж . 349 (Часть 1): 159–67. дои : 10.1042/0264-6021:3490159 . ПМЦ 1221133 . ПМИД 10861224 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте сети белок-белковых взаимодействий человека в масштабе протеома». Природа . 437 (7062): 1173–8. Бибкод : 2005Natur.437.1173R . дои : 10.1038/nature04209 . ПМИД 16189514 . S2CID 4427026 .
Лю Т, Цянь В.Дж., Гриценко М.А. и др. (2006). «Анализ N-гликопротеома плазмы человека методом иммуноаффинного вычитания, химии гидразидов и масс-спектрометрии» . J. Протеом Рез . 4 (6): 2070–80. дои : 10.1021/pr0502065 . ПМК 1850943 . ПМИД 16335952 .
Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека» . Геном Рез . 16 (1): 55–65. дои : 10.1101/гр.4039406 . ПМК 1356129 . ПМИД 16344560 .

Внешние ссылки

CDH6 Расположение человеческого гена в браузере генома UCSC .
Подробности о гене человека CDH6 в браузере генома UCSC .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 5 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000113361 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000039385 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7743525-5] Симояма И., Гото М., Терасаки Т., Китадзима М., Хирохаси С. (июнь 1995 г.). «Выделение и анализ последовательности комплементарной ДНК кадгерина-6 человека на предмет полной кодирующей последовательности и ее экспрессии в клетках карциномы человека». Рак Рез . 55 (10): 2206–11. ПМИД 7743525 .

[pmid10191097-6] Чалмерс И.Дж., Хофлер Х., Аткинсон М.Дж. (июнь 1999 г.). «Картирование кластера генов кадгерина с областью хромосомы 5, подверженной частой потере аллелей при карциноме». Геномика . 57 (1): 160–3. дои : 10.1006/geno.1998.5717 . ПМИД 10191097 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: кадгерин CDH6 6, тип 2, К-кадгерин (почки плода)» .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]