Молекула клеточной адгезии 1

КАДМ1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	3BIN, 4H5S
Идентификаторы
Псевдонимы	CADM1 , BL2, IGSF4, IGSF4A, NECL2, Necl-2, RA175, ST17, SYNCAM, TSLC1, sTSLC-1, sgIGSF, synCAM1, молекула клеточной адгезии 1
Внешние идентификаторы	Опустить : 605686 ; МГИ : 1889272 ; Гомологен : 8641 ; Генные карты : CADM1 ; ОМА : CADM1 — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	115,504,957 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 9 (mouse)
End	47,858,115 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	paraflocculus of cerebellum; ; pons; ; periodontal fiber; ; Achilles tendon; ; caput epididymis; ; corpus callosum; ; visceral pleura; ; islet of Langerhans; ; spinal ganglia; ; beta cell;
	Top expressed in
	epithelium of lens; ; otic placode; ; ciliary body; ; subiculum; ; otic vesicle; ; iris; ; CA3 field; ; saccule; ; neural layer of retina; ; amygdala;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	PDZ domain binding; protein homodimerization activity; protein binding; signaling receptor binding; cell adhesion molecule binding;
Cellular component	integral component of membrane; membrane; cell-cell junction; synapse; integral component of plasma membrane; cell junction; basolateral plasma membrane; plasma membrane;
Biological process	cell differentiation; heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; activated T cell proliferation; immune system process; multicellular organism development; cell adhesion; spermatogenesis; adherens junction organization; T cell mediated cytotoxicity; homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; apoptotic process; susceptibility to natural killer cell mediated cytotoxicity; positive regulation of natural killer cell mediated cytotoxicity; detection of stimulus; cell recognition; viral process;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	23705
	54725
	ENSG00000182985
	ENSMUSG00000032076
	Q9BY67
	Q8R5M8
	НМ_001098517 ; НМ_001301043 ; НМ_001301044 ; НМ_001301045 ; НМ_014333
	НМ_001025600 ; НМ_018770 ; НМ_207675 ; НМ_207676 ; НМ_001310841
	НП_001091987 ; НП_001287972 ; НП_001287973 ; НП_001287974 ; НП_055148
	НП_001020771 ; НП_001297770 ; НП_061240 ; НП_997558 ; НП_997559
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Молекула клеточной адгезии 1 представляет собой белок , который у человека кодируется CADM1 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что молекула клеточной адгезии 1 взаимодействует с EPB41L3 . ^{[ 7 ]}

Исследования ассоциаций

Полногеномные исследования ассоциации выявили связь между индексом массы тела и двумя локусами рядом с генами CADM1 и CADM2 . ^{[ 8 ]} Экспериментальные результаты другого исследования показали, что у мышей, страдающих ожирением, наблюдалась избыточная экспрессия генов CADM1 и CADM2 , и что потеря CADM1 защищала мышей от ожирения, способствуя отрицательному энергетическому балансу и потере веса. ^{[ 9 ]} Кроме того, исследование GWAS 2019 года выявило связь между нервной анорексией и CADM1 . ^{[ 10 ]} В мозге эти гены опосредуют сборку синапсов, а мутации в CADM1 также связаны с расстройствами аутистического спектра . ^{[ 11 ]}

См. также

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000182985 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032076 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Гомио Х., Араи Ю., Танигами А., Мураками Ю., Хаттори М., Хосода Ф., Араи К., Айкава Ю., Цуда Х., Хирохаси С., Асакава С., Симидзу Н., Соэда Е., Сакаки Ю., Оки М. (февраль 2000 г.). «Готовая карта контигов размером 2 МБ и новый ген суперсемейства иммуноглобулинов IGSF4 в области LOH хромосомы 11q23.2». Геномика . 62 (2): 139–46. дои : 10.1006/geno.1999.6001 . ПМИД 10610705 .
^ «Ген Энтрез: молекула клеточной адгезии CADM1 1» .
^ Ягета, Мика; Масуда Мари; Фукухара Хироши; Сибуя Масабуми (сентябрь 2002 г.) «Прямая связь TSLC1 и DAL-1, двух различных белков-супрессоров рака» . Рез . 62 (18): 5129–33 ISSN 0008-5472 . .PMID 12234973 .
^ Спелиотес Е.К., Уиллер С.Дж., Берндт С.И., Монда К.Л., Торлейфссон Г., Джексон А.У. и др. (ноябрь 2010 г.). «Ассоциативный анализ 249 796 человек выявил 18 новых локусов, связанных с индексом массы тела» . Природная генетика . 42 (11): 937–48. дои : 10.1038/ng.686 . ПМК 3014648 . ПМИД 20935630 .
^ Ратьен Т., Ян Х, Кононенко Н.Л., Ку М.К., Сонг К., Феррарезе Л. и др. (август 2017 г.). «Регуляция массы тела и энергетического гомеостаза с помощью молекулы адгезии нейрональных клеток 1» . Природная неврология . 20 (8): 1096–1103. дои : 10.1038/nn.4590 . ПМЦ 5533218 . ПМИД 28628102 .
^ Уотсон Х.Дж., Йилмаз З., Торнтон Л.М., Хюбель С., Коулман Дж.Р., Гаспар Х.А. и др. (август 2019 г.). «Полногеномное исследование ассоциаций идентифицирует восемь локусов риска и предполагает метабо-психиатрическое происхождение нервной анорексии» . Природная генетика . 51 (8): 1207–1214. дои : 10.1038/s41588-019-0439-2 . ПМК 6779477 . ПМИД 31308545 .
^ Фудзита Э., Танабе Ю., Имхоф Б.А., Момои М.Ю., Момои Т. (декабрь 2012 г.). «Комплекс молекулы синаптической адгезии CADM1, молекулы, связанной с расстройством аутистического спектра, с MUPP1 в мозжечке» . Дж. Нейрохем . 123 (5): 886–94. дои : 10.1111/jnc.12022 . ПМИД 22994563 .

Дальнейшее чтение

Ватабе К., Ито А., Кома Й.И., Китамура Й. (2004). «IGSF4: новая молекула межклеточной адгезии, называемая тремя именами: TSLC1, SgIGSF и SynCAM, в силу ее разнообразных функций». Гистол. Гистопатол . 18 (4): 1321–9. ПМИД 12973698 .
Курамочи М., Фукухара Х., Нобукуни Т. и др. (2001). «TSLC1 представляет собой ген-супрессор опухолей при немелкоклеточном раке легких человека» (PDF) . Нат. Жене . 27 (4): 427–30. дои : 10.1038/86934 . hdl : 2241/1028 . ПМИД 11279526 . S2CID 9773234 .
Масуда М., Ягета М., Фукухара Х. и др. (2002). «Белок-супрессор опухоли TSLC1 участвует в межклеточной адгезии» . Ж. Биол. Хим . 277 (34): 31014–9. дои : 10.1074/jbc.M203620200 . ПМИД 12050160 .
Фукухара Х., Курамочи М., Фуками Т. и др. (2003). «Метилирование промотора TSLC1 и подавление опухоли с помощью продукта его гена при раке простаты человека» . Япония. Дж. Рак Рез . 93 (6): 605–9. дои : 10.1111/j.1349-7006.2002.tb01297.x . ПМЦ 5927049 . ПМИД 12079507 .
Аллинен М., Пери Л., Куджала С. и др. (2002). «Анализ потери 11q21-24 генов-кандидатов-мишеней гетерозиготности при раке молочной железы: признаки гиперметилирования промотора TSLC1». Гены Хромосомы Рак . 34 (4): 384–9. дои : 10.1002/gcc.10079 . ПМИД 12112527 . S2CID 396701 .
Бидерер Т., Сара Ю., Можаева М. и др. (2002). «SynCAM, молекула синаптической адгезии, которая управляет сборкой синапсов». Наука . 297 (5586): 1525–31. Бибкод : 2002Sci...297.1525B . дои : 10.1126/science.1072356 . ПМИД 12202822 . S2CID 14529914 .
Ягета М., Курамочи М., Масуда М. и др. (2002). «Прямая ассоциация TSLC1 и DAL-1, двух различных белков-супрессоров опухоли при раке легких». Рак Рез . 62 (18): 5129–33. ПМИД 12234973 .
Янсен М., Фукусима Н., Рости С. и др. (2003). «Аберрантное метилирование 5' CpG-островка TSLC1 часто встречается при аденокарциноме протоков поджелудочной железы и впервые проявляется при PanlNs высокой степени злокачественности» . Рак Биол. Там . 1 (3): 293–6. дои : 10.4161/cbt.84 . ПМИД 12432281 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Хонда Т., Тамура Г., Ваки Т. и др. (2003). «Гиперметилирование промотора гена TSLC1 при первичном раке желудка и клеточных линиях рака желудка» . Япония. Дж. Рак Рез . 93 (8): 857–60. дои : 10.1111/j.1349-7006.2002.tb01329.x . ПМЦ 5927103 . ПМИД 12716461 .
Шингаи Т., Икеда В., Какунага С. и др. (2003). «Влияние нектиноподобной молекулы-2/IGSF4/RA175/SgIGSF/TSLC1/SynCAM1 на межклеточную адгезию и трансмембранную локализацию белка в эпителиальных клетках» . Ж. Биол. Химия 278 (37):35421–7. дои : 10.1074/jbc.M305387200 . ПМИД 12826663 .
Ито А., Окада М., Учино К. и др. (2003). «Экспрессия молекулы адгезии TSLC1 в легочном эпителии и ее подавление при аденокарциноме легких, кроме бронхиолоальвеолярной карциномы» . Лаб. Инвестируйте . 83 (8): 1175–83. дои : 10.1097/01.LAB.0000081391.28136.80 . ПМИД 12920246 .
Фуками Т., Фукухара Х., Курамочи М. и др. (2003). «Метилирование промотора гена TSLC1 при распространенных опухолях легких и различных линиях раковых клеток» . Межд. Дж. Рак . 107 (1): 53–9. дои : 10.1002/ijc.11348 . ПМИД 12925956 . S2CID 26363429 .
Учино К., Ито А., Вакаяма Т. и др. (2003). «Клиническое значение и прогностическое значение гена-супрессора опухоли TSLC1, обнаруженного при аденокарциноме легкого» . Рак . 98 (5): 1002–7. дои : 10.1002/cncr.11599 . ПМИД 12942568 . S2CID 35242800 .
Кларк Х.Ф., Герни А.Л., Абая Э. и др. (2003). «Инициатива по открытию секретируемых белков (SPDI), крупномасштабная попытка идентифицировать новые секретируемые человеком и трансмембранные белки: оценка биоинформатики» . Геном Рез . 13 (10): 2265–70. дои : 10.1101/гр.1293003 . ПМЦ 403697 . ПМИД 12975309 .
Фукухара Х., Масуда М., Ягета М. и др. (2003). «Ассоциация супрессора опухоли легких TSLC1 с MPP3, человеческим гомологом супрессора опухоли Dlg у дрозофилы» . Онкоген . 22 (40): 6160–5. дои : 10.1038/sj.onc.1206744 . ПМИД 13679854 .
Ито Т., Симада Ю., Хасимото Ю. и др. (2003). «Участие TSLC1 в прогрессировании плоскоклеточного рака пищевода». Рак Рез . 63 (19): 6320–6. ПМИД 14559819 .
Мао X, Зейдлиц Э., Гош К. и др. (2004). «Цитоплазматический домен имеет решающее значение для супрессорной активности TSLC1 при немелкоклеточном раке легкого». Рак Рез . 63 (22): 7979–85. ПМИД 14633730 .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000182985 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032076 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid10610705-5] Гомио Х., Араи Ю., Танигами А., Мураками Ю., Хаттори М., Хосода Ф., Араи К., Айкава Ю., Цуда Х., Хирохаси С., Асакава С., Симидзу Н., Соэда Е., Сакаки Ю., Оки М. (февраль 2000 г.). «Готовая карта контигов размером 2 МБ и новый ген суперсемейства иммуноглобулинов IGSF4 в области LOH хромосомы 11q23.2». Геномика . 62 (2): 139–46. дои : 10.1006/geno.1999.6001 . ПМИД 10610705 .

[entrez-6] «Ген Энтрез: молекула клеточной адгезии CADM1 1» .

[pmid12234973-7] Ягета, Мика; Масуда Мари; Фукухара Хироши; Сибуя Масабуми (сентябрь 2002 г.) «Прямая связь TSLC1 и DAL-1, двух различных белков-супрессоров рака» . Рез . 62 (18): 5129–33 ISSN 0008-5472 . .PMID 12234973 .

[Speliotes-8] Спелиотес Е.К., Уиллер С.Дж., Берндт С.И., Монда К.Л., Торлейфссон Г., Джексон А.У. и др. (ноябрь 2010 г.). «Ассоциативный анализ 249 796 человек выявил 18 новых локусов, связанных с индексом массы тела» . Природная генетика . 42 (11): 937–48. дои : 10.1038/ng.686 . ПМК 3014648 . ПМИД 20935630 .

[Rethjen-9] Ратьен Т., Ян Х, Кононенко Н.Л., Ку М.К., Сонг К., Феррарезе Л. и др. (август 2017 г.). «Регуляция массы тела и энергетического гомеостаза с помощью молекулы адгезии нейрональных клеток 1» . Природная неврология . 20 (8): 1096–1103. дои : 10.1038/nn.4590 . ПМЦ 5533218 . ПМИД 28628102 .

[WatsonYilmaz2019-10] Уотсон Х.Дж., Йилмаз З., Торнтон Л.М., Хюбель С., Коулман Дж.Р., Гаспар Х.А. и др. (август 2019 г.). «Полногеномное исследование ассоциаций идентифицирует восемь локусов риска и предполагает метабо-психиатрическое происхождение нервной анорексии» . Природная генетика . 51 (8): 1207–1214. дои : 10.1038/s41588-019-0439-2 . ПМК 6779477 . ПМИД 31308545 .

[Fujita-11] Фудзита Э., Танабе Ю., Имхоф Б.А., Момои М.Ю., Момои Т. (декабрь 2012 г.). «Комплекс молекулы синаптической адгезии CADM1, молекулы, связанной с расстройством аутистического спектра, с MUPP1 в мозжечке» . Дж. Нейрохем . 123 (5): 886–94. дои : 10.1111/jnc.12022 . ПМИД 22994563 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]